MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 1119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_001869	CCGA	2	8	182123	182130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_001869	GTC	3	9	182135	182143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_001869	ACG	2	6	182209	182214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_001869	GAC	2	6	182240	182245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_001869	GA	3	6	182286	182291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_001869	CA	3	6	182292	182297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_001869	TC	3	6	182447	182452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_001869	ACC	2	6	182543	182548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_001869	TGA	2	6	182561	182566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_001869	CGAA	2	8	182592	182599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_001869	CCA	2	6	182695	182700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_001869	GGA	2	6	182797	182802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_001869	TAG	2	6	182870	182875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_001869	CCG	2	6	182911	182916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_001869	CGA	2	6	182935	182940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_001869	TTG	2	6	183553	183558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_001869	GAGT	2	8	183559	183566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_001869	TGT	2	6	183626	183631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_001869	CGA	2	6	183641	183646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_001869	TC	3	6	183654	183659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_001869	TG	3	6	183671	183676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_001869	CGA	2	6	183717	183722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_001869	CGA	2	6	183732	183737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_001869	GTC	2	6	183739	183744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_001869	GCCG	2	8	183759	183766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_001869	TGAT	2	8	183767	183774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_001869	GTA	2	6	183784	183789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_001869	TGG	2	6	183991	183996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_001869	AGC	2	6	184038	184043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_001869	CGC	2	6	184089	184094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_001869	CGC	2	6	184128	184133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_001869	ACT	2	6	184292	184297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_001869	GTAC	2	8	184431	184438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_001869	TGC	2	6	184442	184447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_001869	GTG	2	6	184473	184478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_001869	ATG	2	6	184479	184484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_001869	TC	3	6	184501	184506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_001869	GTT	2	6	184528	184533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_001869	TCA	2	6	184574	184579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_001869	CTT	2	6	184620	184625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_001869	CGC	3	9	184626	184634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_001869	CCT	2	6	184635	184640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_001869	GTT	2	6	184657	184662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_001869	GTA	2	6	184730	184735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_001869	CCT	2	6	184739	184744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_001869	TA	3	6	184758	184763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_001869	AT	3	6	184773	184778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_001869	AT	3	6	184810	184815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_001869	GCA	2	6	184817	184822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_001869	AC	3	6	184848	184853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_001869	TCAA	2	8	184899	184906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_001869	CCG	2	6	184909	184914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_001869	ATG	2	6	184986	184991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_001869	CGA	2	6	185009	185014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_001869	CACT	2	8	185038	185045	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_001869	CGA	2	6	185063	185068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_001869	CCT	2	6	185069	185074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_001869	ACC	2	6	185146	185151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_001869	AG	3	6	187410	187415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_001869	CAG	2	6	187426	187431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_001869	GT	3	6	187447	187452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_001869	CGCTCA	2	12	187479	187490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_001869	GC	3	6	187509	187514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_001869	TCA	2	6	187524	187529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_001869	CAA	2	6	187555	187560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_001869	AC	3	6	187582	187587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_001869	CGA	2	6	187618	187623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_001869	CAG	2	6	187632	187637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_001869	ACC	2	6	187674	187679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_001869	GCGA	2	8	187706	187713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_001869	CA	3	6	187792	187797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_001869	TCG	2	6	187842	187847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_001869	GCC	2	6	187862	187867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_001869	ATC	2	6	188858	188863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_001869	ACT	2	6	188940	188945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_001869	CAG	2	6	189010	189015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_001869	ATTC	2	8	189038	189045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_001869	CAAA	2	8	189058	189065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_001869	TCTGT	2	10	190000	190009	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_001869	GTC	2	6	190018	190023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_001869	GCTGTC	2	12	190057	190068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_001869	GGC	2	6	190069	190074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_001869	GCC	2	6	190080	190085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_001869	GGTG	2	8	190124	190131	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_001869	GTC	2	6	190148	190153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_001869	TGG	2	6	190154	190159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_001869	CCA	3	9	190241	190249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_001869	CGCC	2	8	190257	190264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1089	NC_001869	CGGCG	2	10	190266	190275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1090	NC_001869	CAG	2	6	190319	190324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_001869	CAC	2	6	190328	190333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_001869	CAG	2	6	190340	190345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_001869	CGT	2	6	190364	190369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_001869	GTC	2	6	190371	190376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_001869	CTCGA	2	10	190404	190413	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1096	NC_001869	AGT	2	6	190429	190434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_001869	GCG	2	6	190476	190481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_001869	TCG	2	6	190506	190511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_001869	CCGT	2	8	190514	190521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_001869	GTAC	2	8	190526	190533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_001869	CTG	2	6	190631	190636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_001869	GAT	2	6	190655	190660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_001869	CTG	2	6	190794	190799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_001869	TTC	2	6	190848	190853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_001869	CG	3	6	190857	190862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_001869	GGT	2	6	190889	190894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_001869	GTC	2	6	190931	190936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_001869	TCA	2	6	190938	190943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_001869	GTA	2	6	190946	190951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_001869	CGA	2	6	191002	191007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_001869	GAA	2	6	191017	191022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_001869	GAT	2	6	191071	191076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_001869	CGG	2	6	191143	191148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_001869	CGA	2	6	191155	191160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_001869	GTT	2	6	191195	191200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_001869	GA	3	6	191210	191215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_001869	TGCT	2	8	191279	191286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_001869	AGCA	2	8	191305	191312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_001869	CTAA	2	8	191319	191326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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