MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 1119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_001869	ACG	2	6	97932	97937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_001869	GTC	2	6	97950	97955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_001869	CT	3	6	101406	101411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_001869	TTAG	2	8	101460	101467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_001869	TGCT	2	8	101474	101481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_001869	GT	3	6	101486	101491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_001869	AGCA	2	8	101501	101508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_001869	TC	3	6	101572	101577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_001869	CAA	2	6	101586	101591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_001869	TCG	2	6	101627	101632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_001869	CCG	2	6	101639	101644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_001869	ATC	2	6	101711	101716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_001869	CTT	2	6	101764	101769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_001869	TCG	2	6	101780	101785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_001869	CTA	2	6	101835	101840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_001869	TGA	2	6	101844	101849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_001869	GAC	2	6	101851	101856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_001869	ACC	2	6	101893	101898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_001869	CG	3	6	101925	101930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_001869	GAA	2	6	101934	101939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_001869	CAG	2	6	101988	101993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_001869	GCT	2	6	102090	102095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_001869	CAG	2	6	102151	102156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_001869	ATT	2	6	102181	102186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_001869	GTAC	2	8	102254	102261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_001869	CGC	2	6	102306	102311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_001869	ATCGA	2	10	102373	102382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
528	NC_001869	CGA	2	6	102410	102415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_001869	CTG	2	6	102442	102447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_001869	CGT	2	6	102450	102455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_001869	CTG	2	6	102463	102468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_001869	CGC	2	6	102512	102517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_001869	GGCG	2	8	102523	102530	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
534	NC_001869	TGG	3	9	102538	102546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_001869	ACC	2	6	102627	102632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_001869	GAC	2	6	102634	102639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_001869	CGG	2	6	102701	102706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_001869	GCC	2	6	102713	102718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_001869	GACAGC	2	12	102719	102730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_001869	GAG	2	6	102746	102751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_001869	CGGT	2	8	102756	102763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_001869	GACT	2	8	102795	102802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_001869	CGA	2	6	102849	102854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_001869	TAC	2	6	102896	102901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_001869	TG	3	6	102909	102914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_001869	CTT	2	6	103017	103022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_001869	GTCA	2	8	103081	103088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
548	NC_001869	GGA	2	6	103250	103255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_001869	TC	3	6	103297	103302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_001869	GATATC	2	12	103377	103388	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
551	NC_001869	TAC	2	6	103457	103462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_001869	AAT	2	6	103468	103473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_001869	TGCT	2	8	105603	105610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_001869	GT	3	6	105615	105620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_001869	AGCA	2	8	105630	105637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
556	NC_001869	TC	3	6	105701	105706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_001869	CAA	2	6	105715	105720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_001869	TCG	2	6	105756	105761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_001869	CCG	2	6	105768	105773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_001869	ATC	2	6	105840	105845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_001869	CTT	2	6	105893	105898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_001869	TCG	2	6	105909	105914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_001869	CTA	2	6	105964	105969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_001869	TGA	2	6	105973	105978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_001869	GAC	2	6	105980	105985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_001869	ACC	2	6	106022	106027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_001869	CG	3	6	106054	106059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_001869	GAA	2	6	106063	106068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_001869	CAG	2	6	106117	106122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_001869	ATC	2	6	106256	106261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_001869	CAG	2	6	106280	106285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_001869	GTAC	2	8	106383	106390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_001869	ACGG	2	8	106395	106402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_001869	ACG	2	6	106404	106409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_001869	CGC	2	6	106435	106440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_001869	ACT	2	6	106482	106487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_001869	TCGAG	2	10	106503	106512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
578	NC_001869	CGA	2	6	106539	106544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_001869	ACG	2	6	106547	106552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_001869	CTG	2	6	106571	106576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_001869	CGT	2	6	106579	106584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_001869	CTG	2	6	106592	106597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_001869	CGC	2	6	106641	106646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_001869	GGCG	2	8	106652	106659	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
585	NC_001869	TGG	3	9	106667	106675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_001869	CCG	2	6	106746	106751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_001869	CCA	2	6	106757	106762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_001869	GAC	2	6	106763	106768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_001869	CACC	2	8	106785	106792	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
590	NC_001869	CGG	2	6	106830	106835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_001869	GCC	2	6	106842	106847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_001869	GACAGC	2	12	106848	106859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_001869	CGA	2	6	106892	106897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_001869	CAC	2	6	106900	106905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_001869	AACAG	2	10	106906	106915	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
596	NC_001869	TTC	2	6	106983	106988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_001869	TTG	2	6	107007	107012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_001869	CCG	2	6	107022	107027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_001869	TTA	2	6	112550	112555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_001869	CA	3	6	112673	112678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_001869	G	6	6	112789	112794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
602	NC_001869	CCA	2	6	112877	112882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_001869	CAT	2	6	112893	112898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_001869	GCA	2	6	112948	112953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_001869	GGA	2	6	114180	114185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_001869	AAAC	2	8	114191	114198	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_001869	GCA	2	6	114233	114238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_001869	ATG	2	6	114244	114249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_001869	TCG	2	6	114270	114275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_001869	AG	3	6	114303	114308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_001869	AGA	2	6	114317	114322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_001869	GCT	2	6	114334	114339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_001869	GTT	2	6	114345	114350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_001869	AGC	2	6	114371	114376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_001869	TCC	2	6	114380	114385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_001869	GGT	2	6	114400	114405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_001869	GAG	2	6	114411	114416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_001869	TCTG	2	8	114786	114793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_001869	CCT	2	6	114846	114851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_001869	CTG	2	6	114869	114874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_001869	GGGGT	2	10	114892	114901	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
622	NC_001869	TAT	2	6	114945	114950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_001869	G	6	6	114999	115004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
624	NC_001869	AT	3	6	115048	115053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_001869	TGT	2	6	115514	115519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_001869	GACG	2	8	115543	115550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_001869	AT	3	6	115590	115595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_001869	GA	3	6	115599	115604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_001869	ACTC	2	8	115613	115620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_001869	GGC	2	6	115646	115651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_001869	TG	3	6	115690	115695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_001869	CT	3	6	115764	115769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_001869	TTC	2	6	116525	116530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_001869	CAA	2	6	116601	116606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_001869	GGC	2	6	116715	116720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_001869	GT	3	6	116739	116744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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