MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 30317

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022130	G	7	7	221515	221521	0 %	0 %	100 %	0 %	532530696
4002	NC_022130	ATGGGC	2	12	221527	221538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532530696
4003	NC_022130	ATC	2	6	221546	221551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530696
4004	NC_022130	CCACC	2	10	221615	221624	20 %	0 %	0 %	80 %	532530696
4005	NC_022130	GTT	2	6	221704	221709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530696
4006	NC_022130	AAG	2	6	221774	221779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530697
4007	NC_022130	TTACA	2	10	221802	221811	40 %	40 %	0 %	20 %	532530697
4008	NC_022130	TGT	3	9	221861	221869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530697
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4010	NC_022130	GTT	2	6	221922	221927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530697
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4012	NC_022130	T	6	6	222109	222114	0 %	100 %	0 %	0 %	532530697
4013	NC_022130	GTG	2	6	222172	222177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530697
4014	NC_022130	T	6	6	222199	222204	0 %	100 %	0 %	0 %	532530697
4015	NC_022130	GGA	2	6	222205	222210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532530697
4016	NC_022130	TAA	2	6	222249	222254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530697
4017	NC_022130	GTT	2	6	222280	222285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530697
4018	NC_022130	T	6	6	222337	222342	0 %	100 %	0 %	0 %	532530697
4019	NC_022130	GAAAA	2	10	222411	222420	80 %	0 %	20 %	0 %	532530697
4020	NC_022130	G	7	7	222460	222466	0 %	0 %	100 %	0 %	532530697
4021	NC_022130	TGT	3	9	222515	222523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530697
4022	NC_022130	T	6	6	222525	222530	0 %	100 %	0 %	0 %	532530697
4023	NC_022130	GAAA	2	8	222540	222547	75 %	0 %	25 %	0 %	532530697
4024	NC_022130	CGG	2	6	222548	222553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530697
4025	NC_022130	GTT	2	6	222574	222579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530698
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4028	NC_022130	GAT	2	6	222798	222803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530698
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4030	NC_022130	A	6	6	222889	222894	100 %	0 %	0 %	0 %	532530698
4031	NC_022130	AAAG	2	8	222910	222917	75 %	0 %	25 %	0 %	532530698
4032	NC_022130	TTA	2	6	222937	222942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530698
4033	NC_022130	GTT	2	6	222993	222998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530698
4034	NC_022130	G	7	7	223045	223051	0 %	0 %	100 %	0 %	532530698
4035	NC_022130	AGCG	2	8	223296	223303	25 %	0 %	50 %	25 %	532530698
4036	NC_022130	TTG	3	9	223453	223461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530698
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4039	NC_022130	TGG	2	6	223542	223547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530698
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4042	NC_022130	CT	3	6	223603	223608	0 %	50 %	0 %	50 %	532530698
4043	NC_022130	AAG	2	6	223637	223642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530698
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4045	NC_022130	AAAG	2	8	223761	223768	75 %	0 %	25 %	0 %	532530699
4046	NC_022130	ATG	2	6	223822	223827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530699
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4052	NC_022130	TAATTA	2	12	224012	224023	50 %	50 %	0 %	0 %	532530699
4053	NC_022130	G	10	10	224025	224034	0 %	0 %	100 %	0 %	532530699
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4056	NC_022130	ACTTTA	2	12	224062	224073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532530700
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4058	NC_022130	A	6	6	224111	224116	100 %	0 %	0 %	0 %	532530700
4059	NC_022130	TTA	2	6	224153	224158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530700
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4062	NC_022130	TGCT	2	8	224204	224211	0 %	50 %	25 %	25 %	532530700
4063	NC_022130	G	6	6	224222	224227	0 %	0 %	100 %	0 %	532530700
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4067	NC_022130	CCTT	2	8	224293	224300	0 %	50 %	0 %	50 %	532530700
4068	NC_022130	A	6	6	224334	224339	100 %	0 %	0 %	0 %	532530700
4069	NC_022130	CTTT	2	8	224386	224393	0 %	75 %	0 %	25 %	532530700
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4072	NC_022130	ATG	2	6	224639	224644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530700
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4099	NC_022130	A	7	7	226089	226095	100 %	0 %	0 %	0 %	532530702
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4101	NC_022130	ACCC	2	8	226396	226403	25 %	0 %	0 %	75 %	532530703
4102	NC_022130	ATC	2	6	226468	226473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530703
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4105	NC_022130	TGA	2	6	226524	226529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530703
4106	NC_022130	A	6	6	226537	226542	100 %	0 %	0 %	0 %	532530703
4107	NC_022130	CGG	2	6	226580	226585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530703
4108	NC_022130	T	6	6	226602	226607	0 %	100 %	0 %	0 %	532530703
4109	NC_022130	TTAC	2	8	226628	226635	25 %	50 %	0 %	25 %	532530703
4110	NC_022130	AAG	2	6	226679	226684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530703
4111	NC_022130	AAT	2	6	226726	226731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530703
4112	NC_022130	GAA	2	6	226756	226761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530703
4113	NC_022130	CTTT	2	8	226864	226871	0 %	75 %	0 %	25 %	532530703
4114	NC_022130	GC	3	6	226874	226879	0 %	0 %	50 %	50 %	532530703
4115	NC_022130	G	6	6	226906	226911	0 %	0 %	100 %	0 %	532530703
4116	NC_022130	GTG	2	6	227065	227070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530703
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4118	NC_022130	TGATG	2	10	227115	227124	20 %	40 %	40 %	0 %	532530703
4119	NC_022130	GTG	2	6	227125	227130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530703
4120	NC_022130	CATC	2	8	227139	227146	25 %	25 %	0 %	50 %	532530703
4121	NC_022130	CGC	2	6	227226	227231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530703
4122	NC_022130	TC	3	6	227384	227389	0 %	50 %	0 %	50 %	532530703
4123	NC_022130	TTA	2	6	227424	227429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530703
4124	NC_022130	AAG	2	6	227501	227506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530704
4125	NC_022130	TCA	2	6	227543	227548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530704
4126	NC_022130	AGA	2	6	227550	227555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530704
4127	NC_022130	ATT	2	6	227662	227667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530704
4128	NC_022130	ATG	2	6	227719	227724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530704
4129	NC_022130	GA	3	6	227796	227801	50 %	0 %	50 %	0 %	532530704
4130	NC_022130	A	6	6	227831	227836	100 %	0 %	0 %	0 %	532530704
4131	NC_022130	ATG	2	6	227858	227863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530704
4132	NC_022130	A	6	6	227869	227874	100 %	0 %	0 %	0 %	532530704
4133	NC_022130	GAA	3	9	227914	227922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530704
4134	NC_022130	ATC	2	6	227923	227928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530704
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4136	NC_022130	GAA	2	6	228001	228006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530704
4137	NC_022130	ACTA	2	8	228010	228017	50 %	25 %	0 %	25 %	532530704
4138	NC_022130	TG	3	6	228046	228051	0 %	50 %	50 %	0 %	532530704
4139	NC_022130	AGG	2	6	228057	228062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532530704
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4141	NC_022130	TGG	2	6	228086	228091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530704
4142	NC_022130	AAG	2	6	228101	228106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530704
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4145	NC_022130	TGA	2	6	228225	228230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530704
4146	NC_022130	G	7	7	228259	228265	0 %	0 %	100 %	0 %	532530704
4147	NC_022130	AAAG	2	8	228286	228293	75 %	0 %	25 %	0 %	532530704
4148	NC_022130	GAT	2	6	228295	228300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530704
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4151	NC_022130	A	7	7	228620	228626	100 %	0 %	0 %	0 %	532530705
4152	NC_022130	TGA	2	6	228652	228657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530705
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4154	NC_022130	A	7	7	228878	228884	100 %	0 %	0 %	0 %	532530706
4155	NC_022130	CTT	2	6	228885	228890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530706
4156	NC_022130	AAG	2	6	228993	228998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530706
4157	NC_022130	A	6	6	229035	229040	100 %	0 %	0 %	0 %	532530706
4158	NC_022130	GAA	2	6	229067	229072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530706
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4164	NC_022130	TGGGG	2	10	229165	229174	0 %	20 %	80 %	0 %	532530706
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4166	NC_022130	TAGAT	2	10	229282	229291	40 %	40 %	20 %	0 %	532530706
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4169	NC_022130	TGAT	2	8	229380	229387	25 %	50 %	25 %	0 %	532530706
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4231	NC_022130	T	6	6	232903	232908	0 %	100 %	0 %	0 %	532530708
4232	NC_022130	ATA	2	6	232916	232921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530708
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4234	NC_022130	A	6	6	232938	232943	100 %	0 %	0 %	0 %	532530708
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4237	NC_022130	A	6	6	233035	233040	100 %	0 %	0 %	0 %	532530708
4238	NC_022130	CGG	2	6	233043	233048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530708
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4243	NC_022130	T	6	6	233457	233462	0 %	100 %	0 %	0 %	532530709
4244	NC_022130	ATTC	2	8	233478	233485	25 %	50 %	0 %	25 %	532530709
4245	NC_022130	CCA	2	6	233549	233554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530709
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4247	NC_022130	AG	3	6	233625	233630	50 %	0 %	50 %	0 %	532530709
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4250	NC_022130	CA	3	6	233710	233715	50 %	0 %	0 %	50 %	532530709
4251	NC_022130	TGA	2	6	233744	233749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530709
4252	NC_022130	A	6	6	233766	233771	100 %	0 %	0 %	0 %	532530709
4253	NC_022130	CTT	2	6	233794	233799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530709
4254	NC_022130	T	7	7	233798	233804	0 %	100 %	0 %	0 %	532530709
4255	NC_022130	TTGT	2	8	233814	233821	0 %	75 %	25 %	0 %	532530709
4256	NC_022130	GTT	2	6	233856	233861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530709
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4258	NC_022130	CTT	2	6	234089	234094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530709
4259	NC_022130	TTGA	2	8	234129	234136	25 %	50 %	25 %	0 %	532530709
4260	NC_022130	ATA	2	6	234147	234152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530709
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4262	NC_022130	CTA	2	6	234217	234222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530709
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4264	NC_022130	TTG	2	6	234264	234269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530709
4265	NC_022130	TTG	2	6	234306	234311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530709
4266	NC_022130	GTT	2	6	234440	234445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530709
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4275	NC_022130	TAA	2	6	234725	234730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530710
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4288	NC_022130	GA	3	6	235354	235359	50 %	0 %	50 %	0 %	532530710
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4290	NC_022130	A	11	11	235500	235510	100 %	0 %	0 %	0 %	532530711
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4302	NC_022130	TGCA	2	8	236193	236200	25 %	25 %	25 %	25 %	532530712
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4371	NC_022130	CCAG	2	8	239673	239680	25 %	0 %	25 %	50 %	532530716
4372	NC_022130	GTA	2	6	239696	239701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530716
4373	NC_022130	T	6	6	239780	239785	0 %	100 %	0 %	0 %	532530716
4374	NC_022130	AAT	2	6	239789	239794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530716
4375	NC_022130	GAT	2	6	239798	239803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530716
4376	NC_022130	A	6	6	239829	239834	100 %	0 %	0 %	0 %	532530716
4377	NC_022130	TGA	2	6	239887	239892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530716
4378	NC_022130	GAAA	2	8	240022	240029	75 %	0 %	25 %	0 %	532530716
4379	NC_022130	A	6	6	240077	240082	100 %	0 %	0 %	0 %	532530716
4380	NC_022130	AAG	2	6	240096	240101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530716
4381	NC_022130	GCTAGG	2	12	240113	240124	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532530716
4382	NC_022130	GAGC	2	8	240126	240133	25 %	0 %	50 %	25 %	532530716
4383	NC_022130	AAAAT	2	10	240138	240147	80 %	20 %	0 %	0 %	532530716
4384	NC_022130	A	6	6	240320	240325	100 %	0 %	0 %	0 %	532530717
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4386	NC_022130	AGA	2	6	240478	240483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530717
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4388	NC_022130	TCA	2	6	240600	240605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530717
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4393	NC_022130	GGGCG	2	10	240871	240880	0 %	0 %	80 %	20 %	532530717
4394	NC_022130	T	6	6	240899	240904	0 %	100 %	0 %	0 %	532530717
4395	NC_022130	CGG	2	6	240930	240935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530717
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4399	NC_022130	TTA	2	6	241126	241131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530718
4400	NC_022130	TTA	2	6	241182	241187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530718
4401	NC_022130	T	6	6	241199	241204	0 %	100 %	0 %	0 %	532530718
4402	NC_022130	G	6	6	241298	241303	0 %	0 %	100 %	0 %	532530718
4403	NC_022130	ATT	2	6	241324	241329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530718
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4407	NC_022130	T	6	6	241527	241532	0 %	100 %	0 %	0 %	532530718
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4410	NC_022130	TGA	2	6	241627	241632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530718
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4447	NC_022130	CG	3	6	243735	243740	0 %	0 %	50 %	50 %	532530721
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4489	NC_022130	GTTT	2	8	245819	245826	0 %	75 %	25 %	0 %	532530724
4490	NC_022130	GC	3	6	245837	245842	0 %	0 %	50 %	50 %	532530724
4491	NC_022130	CT	3	6	245864	245869	0 %	50 %	0 %	50 %	532530724
4492	NC_022130	CAA	2	6	245883	245888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530724
4493	NC_022130	CAAT	2	8	245907	245914	50 %	25 %	0 %	25 %	532530724
4494	NC_022130	GTC	2	6	245953	245958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530724
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4496	NC_022130	AGC	2	6	245984	245989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530724
4497	NC_022130	T	8	8	246013	246020	0 %	100 %	0 %	0 %	532530724
4498	NC_022130	CAC	2	6	246052	246057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530724
4499	NC_022130	ATC	2	6	246097	246102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530724
4500	NC_022130	A	6	6	246166	246171	100 %	0 %	0 %	0 %	532530724

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