MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 3937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021913	ACG	2	6	811	816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043438
2	NC_021913	AGC	2	6	817	822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043438
3	NC_021913	TCA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043438
4	NC_021913	GAC	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043438
5	NC_021913	GCC	2	6	909	914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043438
6	NC_021913	TCC	2	6	940	945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043438
7	NC_021913	GCC	2	6	951	956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043438
8	NC_021913	CGA	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043438
9	NC_021913	TCC	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043438
10	NC_021913	AGA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043438
11	NC_021913	CGC	2	6	1063	1068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043438
12	NC_021913	CGT	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043438
13	NC_021913	ACG	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043438
14	NC_021913	GAT	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043438
15	NC_021913	GAC	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043438
16	NC_021913	ACC	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043438
17	NC_021913	TTA	2	6	1347	1352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529043438
18	NC_021913	CTA	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043439
19	NC_021913	TGC	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043439
20	NC_021913	GAG	2	6	1440	1445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043439
21	NC_021913	TTG	2	6	1631	1636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043440
22	NC_021913	CGT	2	6	1643	1648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043440
23	NC_021913	CGT	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043440
24	NC_021913	GAA	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043440
25	NC_021913	AGA	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043440
26	NC_021913	CGA	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043440
27	NC_021913	TGC	2	6	1722	1727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043440
28	NC_021913	ACG	2	6	1748	1753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043440
29	NC_021913	CGA	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043440
30	NC_021913	CGC	2	6	1790	1795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043440
31	NC_021913	ACG	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043440
32	NC_021913	ATT	2	6	1814	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529043440
33	NC_021913	CTC	2	6	1897	1902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043440
34	NC_021913	TAT	2	6	1963	1968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529043440
35	NC_021913	CGA	2	6	2010	2015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043440
36	NC_021913	GAC	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043440
37	NC_021913	GTC	2	6	2126	2131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043440
38	NC_021913	AAC	2	6	2254	2259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043440
39	NC_021913	ACG	2	6	2267	2272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043440
40	NC_021913	CGT	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043440
41	NC_021913	AAC	2	6	2566	2571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043440
42	NC_021913	TCG	2	6	2636	2641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043440
43	NC_021913	TGC	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043440
44	NC_021913	GAT	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043440
45	NC_021913	CAG	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043441
46	NC_021913	TCG	3	9	5345	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043442
47	NC_021913	TCG	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043442
48	NC_021913	GTC	2	6	5434	5439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043442
49	NC_021913	CGG	2	6	5462	5467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043442
50	NC_021913	GTT	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043442
51	NC_021913	AGG	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043442
52	NC_021913	TTG	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043442
53	NC_021913	CGT	2	6	5565	5570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043442
54	NC_021913	TCG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043442
55	NC_021913	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043442
56	NC_021913	TCT	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043442
57	NC_021913	TCC	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043443
58	NC_021913	TTC	2	6	6294	6299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043443
59	NC_021913	GTC	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043443
60	NC_021913	CGA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043443
61	NC_021913	GTT	2	6	6363	6368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043443
62	NC_021913	CTG	2	6	6437	6442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043443
63	NC_021913	GTG	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043443
64	NC_021913	GTC	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043443
65	NC_021913	TCC	2	6	6532	6537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043443
66	NC_021913	TGT	2	6	6550	6555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043443
67	NC_021913	GTG	2	6	6730	6735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043443
68	NC_021913	GGT	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043443
69	NC_021913	GAC	3	9	7289	7297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043444
70	NC_021913	GCT	2	6	7471	7476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
71	NC_021913	TCG	2	6	7563	7568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
72	NC_021913	GGC	2	6	7611	7616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043444
73	NC_021913	TCC	2	6	7617	7622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043444
74	NC_021913	TCT	2	6	7680	7685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043444
75	NC_021913	GCA	2	6	7728	7733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043444
76	NC_021913	CGC	2	6	7765	7770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043444
77	NC_021913	GTT	2	6	8080	8085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043444
78	NC_021913	GTC	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
79	NC_021913	AGT	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043444
80	NC_021913	GTT	2	6	8325	8330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043444
81	NC_021913	GTA	2	6	8370	8375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043444
82	NC_021913	GTC	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
83	NC_021913	TCG	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
84	NC_021913	GTG	3	9	8460	8468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043444
85	NC_021913	CGC	2	6	8488	8493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043444
86	NC_021913	CGC	2	6	8533	8538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043444
87	NC_021913	CGG	2	6	8641	8646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043444
88	NC_021913	CCG	2	6	8889	8894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043444
89	NC_021913	TCA	2	6	8922	8927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043444
90	NC_021913	GTC	2	6	8987	8992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
91	NC_021913	GAT	2	6	9007	9012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043444
92	NC_021913	ACC	2	6	9047	9052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043444
93	NC_021913	TCG	3	9	9072	9080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
94	NC_021913	TGC	2	6	9127	9132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
95	NC_021913	ATG	2	6	9133	9138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043444
96	NC_021913	CAC	2	6	9217	9222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043444
97	NC_021913	CGT	2	6	9265	9270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
98	NC_021913	TAG	2	6	9364	9369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043444
99	NC_021913	TAA	2	6	9427	9432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529043444
100	NC_021913	TCG	2	6	9433	9438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
101	NC_021913	CAA	2	6	9448	9453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043444
102	NC_021913	TTC	2	6	9503	9508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043444
103	NC_021913	CGT	2	6	9690	9695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043444
104	NC_021913	TTG	2	6	9807	9812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043444
105	NC_021913	CGA	2	6	9898	9903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043444
106	NC_021913	AGT	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043444
107	NC_021913	ACG	2	6	10197	10202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043444
108	NC_021913	GTC	2	6	10504	10509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043445
109	NC_021913	TTG	2	6	10538	10543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043445
110	NC_021913	CGG	2	6	10560	10565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043445
111	NC_021913	GTT	2	6	10848	10853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043445
112	NC_021913	ACC	2	6	10951	10956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043445
113	NC_021913	CGA	2	6	10974	10979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043445
114	NC_021913	ACG	2	6	11015	11020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043445
115	NC_021913	CTT	2	6	11058	11063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043445
116	NC_021913	TCG	2	6	11124	11129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043445
117	NC_021913	GCT	2	6	11148	11153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043445
118	NC_021913	TGG	2	6	11157	11162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043445
119	NC_021913	CTT	2	6	11184	11189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043445
120	NC_021913	GCT	2	6	11284	11289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043445
121	NC_021913	CCT	2	6	11295	11300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043445
122	NC_021913	GGA	2	6	11304	11309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043445
123	NC_021913	AAT	2	6	11343	11348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529043445
124	NC_021913	CTT	2	6	11385	11390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043445
125	NC_021913	CGG	2	6	11391	11396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043445
126	NC_021913	ATC	2	6	11471	11476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043445
127	NC_021913	TGT	2	6	11601	11606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043445
128	NC_021913	CTT	2	6	11763	11768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043445
129	NC_021913	GCT	2	6	11776	11781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043445
130	NC_021913	CGA	2	6	11802	11807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043445
131	NC_021913	TCG	2	6	11837	11842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043445
132	NC_021913	GTC	2	6	11875	11880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043445
133	NC_021913	TCG	2	6	12005	12010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043445
134	NC_021913	CAG	2	6	12016	12021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043445
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141	NC_021913	CAG	2	6	13454	13459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043446
142	NC_021913	TCC	2	6	13502	13507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043446
143	NC_021913	CAA	2	6	13510	13515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043446
144	NC_021913	CGG	2	6	13563	13568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043446
145	NC_021913	GGT	2	6	13624	13629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043446
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149	NC_021913	GAC	2	6	13810	13815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043446
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160	NC_021913	CGA	2	6	14519	14524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043446
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162	NC_021913	GAT	2	6	14581	14586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043446
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239	NC_021913	GAA	2	6	20176	20181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043448
240	NC_021913	GGT	2	6	20183	20188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043448
241	NC_021913	CGA	2	6	20300	20305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043448
242	NC_021913	TCA	2	6	20422	20427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043448
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244	NC_021913	CTC	2	6	20507	20512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043448
245	NC_021913	ATG	2	6	20583	20588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043448
246	NC_021913	AAG	2	6	20650	20655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043448
247	NC_021913	GCT	2	6	20714	20719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043448
248	NC_021913	CCT	2	6	20741	20746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043448
249	NC_021913	TCA	2	6	20857	20862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043448
250	NC_021913	TCT	2	6	20917	20922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043448
251	NC_021913	CAG	2	6	21008	21013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043448
252	NC_021913	CGT	2	6	21087	21092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043448
253	NC_021913	CTG	2	6	21116	21121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043448
254	NC_021913	CGC	2	6	21163	21168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043448
255	NC_021913	TCA	2	6	21175	21180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043448
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372	NC_021913	CTC	2	6	33108	33113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043461
373	NC_021913	GTT	2	6	33162	33167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043461
374	NC_021913	TCG	2	6	33295	33300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043461
375	NC_021913	CGT	2	6	33329	33334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043461
376	NC_021913	TCG	2	6	33361	33366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043461
377	NC_021913	CGT	2	6	33489	33494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043461
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393	NC_021913	CGA	2	6	34761	34766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043462
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403	NC_021913	CTC	2	6	36041	36046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043464
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490	NC_021913	GCG	3	9	40945	40953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043470
491	NC_021913	TGA	2	6	41065	41070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043471
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493	NC_021913	CGA	2	6	41158	41163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043471
494	NC_021913	GTC	2	6	41164	41169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043471
495	NC_021913	CGA	2	6	41194	41199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043471
496	NC_021913	CGG	2	6	41747	41752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043472
497	NC_021913	CGG	2	6	41817	41822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043472
498	NC_021913	GAC	2	6	41903	41908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043472
499	NC_021913	GGC	2	6	42423	42428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043473
500	NC_021913	GAG	2	6	42474	42479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043473

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