MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 5361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021913	CCT	2	6	220102	220107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043632
3502	NC_021913	CG	3	6	220114	220119	0 %	0 %	50 %	50 %	529043632
3503	NC_021913	TC	3	6	220120	220125	0 %	50 %	0 %	50 %	529043632
3504	NC_021913	CCT	2	6	220198	220203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043632
3505	NC_021913	CTCA	3	12	220338	220349	25 %	25 %	0 %	50 %	529043633
3506	NC_021913	CTG	2	6	220433	220438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043633
3507	NC_021913	CGT	2	6	220457	220462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043633
3508	NC_021913	GCCG	2	8	220495	220502	0 %	0 %	50 %	50 %	529043633
3509	NC_021913	ACG	2	6	220523	220528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043633
3510	NC_021913	CTC	2	6	220758	220763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043634
3511	NC_021913	GAG	2	6	220764	220769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043634
3512	NC_021913	TCG	2	6	220810	220815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3513	NC_021913	CGT	2	6	220835	220840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3514	NC_021913	TGG	2	6	220852	220857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043634
3515	NC_021913	ATG	2	6	220888	220893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043634
3516	NC_021913	TCG	2	6	220897	220902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3517	NC_021913	TCG	2	6	220909	220914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3518	NC_021913	CTTC	2	8	220952	220959	0 %	50 %	0 %	50 %	529043634
3519	NC_021913	TTCG	2	8	220973	220980	0 %	50 %	25 %	25 %	529043634
3520	NC_021913	AGC	2	6	220981	220986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3521	NC_021913	TCG	2	6	220996	221001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3522	NC_021913	GCT	2	6	221014	221019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3523	NC_021913	CGT	2	6	221055	221060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3524	NC_021913	TCG	2	6	221068	221073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3525	NC_021913	GTA	2	6	221082	221087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043634
3526	NC_021913	CGA	2	6	221120	221125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3527	NC_021913	TCGA	2	8	221127	221134	25 %	25 %	25 %	25 %	529043634
3528	NC_021913	CGT	2	6	221159	221164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043634
3529	NC_021913	GGAG	2	8	221415	221422	25 %	0 %	75 %	0 %	529043635
3530	NC_021913	CG	3	6	221432	221437	0 %	0 %	50 %	50 %	529043635
3531	NC_021913	CGG	2	6	221457	221462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043635
3532	NC_021913	CGTCC	2	10	221487	221496	0 %	20 %	20 %	60 %	529043635
3533	NC_021913	CGC	2	6	221510	221515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043635
3534	NC_021913	GCTC	2	8	221537	221544	0 %	25 %	25 %	50 %	529043635
3535	NC_021913	CAC	2	6	221564	221569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043635
3536	NC_021913	TGGCG	2	10	221629	221638	0 %	20 %	60 %	20 %	529043635
3537	NC_021913	ACGC	2	8	221652	221659	25 %	0 %	25 %	50 %	529043635
3538	NC_021913	GAC	2	6	221693	221698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3539	NC_021913	CAC	2	6	221756	221761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043635
3540	NC_021913	TCGCT	2	10	221857	221866	0 %	40 %	20 %	40 %	529043635
3541	NC_021913	CGC	2	6	221897	221902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043635
3542	NC_021913	TCG	2	6	221908	221913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3543	NC_021913	TCGC	2	8	222015	222022	0 %	25 %	25 %	50 %	529043635
3544	NC_021913	TCG	2	6	222064	222069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3545	NC_021913	CTC	2	6	222078	222083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043635
3546	NC_021913	TCGG	2	8	222108	222115	0 %	25 %	50 %	25 %	529043635
3547	NC_021913	GC	3	6	222127	222132	0 %	0 %	50 %	50 %	529043635
3548	NC_021913	CTC	2	6	222138	222143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043635
3549	NC_021913	CG	3	6	222185	222190	0 %	0 %	50 %	50 %	529043635
3550	NC_021913	TCGG	2	8	222219	222226	0 %	25 %	50 %	25 %	529043635
3551	NC_021913	CT	3	6	222251	222256	0 %	50 %	0 %	50 %	529043635
3552	NC_021913	AAGG	2	8	222261	222268	50 %	0 %	50 %	0 %	529043635
3553	NC_021913	TCG	2	6	222283	222288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3554	NC_021913	GCT	2	6	222335	222340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3555	NC_021913	GCG	2	6	222344	222349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043635
3556	NC_021913	TGA	2	6	222367	222372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043635
3557	NC_021913	GTG	2	6	222381	222386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043635
3558	NC_021913	TCG	2	6	222391	222396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3559	NC_021913	GGC	2	6	222429	222434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043635
3560	NC_021913	TGT	3	9	222451	222459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043635
3561	NC_021913	ATG	2	6	222477	222482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043635
3562	NC_021913	TCGCAT	2	12	222490	222501	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	529043635
3563	NC_021913	CGGAA	2	10	222512	222521	40 %	0 %	40 %	20 %	529043635
3564	NC_021913	ACG	2	6	222546	222551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3565	NC_021913	ACA	2	6	222560	222565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043635
3566	NC_021913	GGC	2	6	222573	222578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043635
3567	NC_021913	GCTG	2	8	222584	222591	0 %	25 %	50 %	25 %	529043635
3568	NC_021913	CCA	2	6	222592	222597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043635
3569	NC_021913	TAG	2	6	222644	222649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043635
3570	NC_021913	TCG	2	6	222652	222657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3571	NC_021913	TCG	2	6	222685	222690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3572	NC_021913	TCA	2	6	222771	222776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043635
3573	NC_021913	TTC	2	6	222777	222782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043635
3574	NC_021913	CT	4	8	222950	222957	0 %	50 %	0 %	50 %	529043635
3575	NC_021913	CTA	2	6	222966	222971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043635
3576	NC_021913	TCG	2	6	222973	222978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043635
3577	NC_021913	CGAA	2	8	223065	223072	50 %	0 %	25 %	25 %	529043636
3578	NC_021913	CGA	2	6	223074	223079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3579	NC_021913	CG	3	6	223121	223126	0 %	0 %	50 %	50 %	529043636
3580	NC_021913	GAC	2	6	223136	223141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3581	NC_021913	GAC	2	6	223162	223167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3582	NC_021913	GAC	3	9	223243	223251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3583	NC_021913	TGC	2	6	223272	223277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3584	NC_021913	ACCG	2	8	223319	223326	25 %	0 %	25 %	50 %	529043636
3585	NC_021913	CCG	2	6	223367	223372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043636
3586	NC_021913	CGG	2	6	223414	223419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043636
3587	NC_021913	GCT	2	6	223465	223470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3588	NC_021913	AGA	2	6	223536	223541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043636
3589	NC_021913	CTG	2	6	223599	223604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3590	NC_021913	GCA	2	6	223619	223624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3591	NC_021913	CCGT	2	8	223629	223636	0 %	25 %	25 %	50 %	529043636
3592	NC_021913	TC	3	6	223678	223683	0 %	50 %	0 %	50 %	529043636
3593	NC_021913	TCCT	2	8	223692	223699	0 %	50 %	0 %	50 %	529043636
3594	NC_021913	GTC	2	6	223700	223705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3595	NC_021913	ACG	2	6	223737	223742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043636
3596	NC_021913	GGA	2	6	223840	223845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043636
3597	NC_021913	CGG	2	6	223977	223982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043637
3598	NC_021913	CGG	2	6	223989	223994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043637
3599	NC_021913	TCG	2	6	224022	224027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043637
3600	NC_021913	CGT	2	6	224062	224067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043637
3601	NC_021913	GGT	2	6	224146	224151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043637
3602	NC_021913	GCGTCC	2	12	224214	224225	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529043637
3603	NC_021913	CGG	2	6	224248	224253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043637
3604	NC_021913	GAG	2	6	224312	224317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043637
3605	NC_021913	CCG	2	6	224379	224384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043637
3606	NC_021913	CCAGA	2	10	224411	224420	40 %	0 %	20 %	40 %	529043637
3607	NC_021913	GCC	2	6	224472	224477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043637
3608	NC_021913	TCG	2	6	224508	224513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043637
3609	NC_021913	TCC	2	6	224574	224579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043637
3610	NC_021913	CGA	2	6	224590	224595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043637
3611	NC_021913	G	6	6	225120	225125	0 %	0 %	100 %	0 %	529043638
3612	NC_021913	GA	3	6	225140	225145	50 %	0 %	50 %	0 %	529043638
3613	NC_021913	AGG	2	6	225150	225155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043638
3614	NC_021913	CTG	2	6	225183	225188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043638
3615	NC_021913	GAC	2	6	225275	225280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043638
3616	NC_021913	TGA	2	6	225283	225288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043638
3617	NC_021913	TGT	2	6	225325	225330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043638
3618	NC_021913	CGG	2	6	225333	225338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043638
3619	NC_021913	TCA	2	6	225454	225459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043639
3620	NC_021913	GCTC	2	8	225506	225513	0 %	25 %	25 %	50 %	529043639
3621	NC_021913	CGT	2	6	225534	225539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043639
3622	NC_021913	CGT	2	6	225614	225619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043639
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3733	NC_021913	TTGGA	2	10	237032	237041	20 %	40 %	40 %	0 %	529043649
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3737	NC_021913	AGC	2	6	237315	237320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043649
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3739	NC_021913	G	6	6	237360	237365	0 %	0 %	100 %	0 %	529043649
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3863	NC_021913	TCT	2	6	245185	245190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043655
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3865	NC_021913	GC	3	6	245223	245228	0 %	0 %	50 %	50 %	529043655
3866	NC_021913	CGT	3	9	245365	245373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043655
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3981	NC_021913	ATC	2	6	252406	252411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043657
3982	NC_021913	ACC	2	6	252444	252449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043657
3983	NC_021913	GTC	2	6	252460	252465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043657
3984	NC_021913	CT	3	6	252484	252489	0 %	50 %	0 %	50 %	529043657
3985	NC_021913	GTC	2	6	252514	252519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043657
3986	NC_021913	TCG	2	6	252527	252532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043657
3987	NC_021913	ATG	2	6	252572	252577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043657
3988	NC_021913	CGA	2	6	252714	252719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043657
3989	NC_021913	CGT	2	6	252759	252764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043657
3990	NC_021913	CAC	2	6	252807	252812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043657
3991	NC_021913	CTG	2	6	252824	252829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043657
3992	NC_021913	ACGG	2	8	252836	252843	25 %	0 %	50 %	25 %	529043657
3993	NC_021913	TCG	2	6	252875	252880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043657
3994	NC_021913	ACG	2	6	253004	253009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043657
3995	NC_021913	CTC	2	6	253021	253026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043657
3996	NC_021913	GTC	2	6	253090	253095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043657
3997	NC_021913	GGT	2	6	253098	253103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043657
3998	NC_021913	GGA	2	6	253116	253121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043657
3999	NC_021913	GAA	2	6	253176	253181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043657
4000	NC_021913	GGC	2	6	253202	253207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043657

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