MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 5361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021913	ACG	2	6	156366	156371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043570
2502	NC_021913	TAC	3	9	156383	156391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043570
2503	NC_021913	CCA	2	6	156511	156516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043570
2504	NC_021913	CAAA	2	8	156567	156574	75 %	0 %	0 %	25 %	529043570
2505	NC_021913	CAGA	2	8	156602	156609	50 %	0 %	25 %	25 %	529043570
2506	NC_021913	TGA	2	6	156652	156657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043570
2507	NC_021913	TCAG	2	8	156659	156666	25 %	25 %	25 %	25 %	529043570
2508	NC_021913	GA	3	6	156766	156771	50 %	0 %	50 %	0 %	529043570
2509	NC_021913	CTC	2	6	156776	156781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043570
2510	NC_021913	CA	3	6	156931	156936	50 %	0 %	0 %	50 %	529043570
2511	NC_021913	GATC	2	8	156991	156998	25 %	25 %	25 %	25 %	529043570
2512	NC_021913	TGA	3	9	157009	157017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043570
2513	NC_021913	CGAG	2	8	157057	157064	25 %	0 %	50 %	25 %	529043570
2514	NC_021913	TCCA	2	8	157120	157127	25 %	25 %	0 %	50 %	529043570
2515	NC_021913	TCATT	2	10	157254	157263	20 %	60 %	0 %	20 %	529043571
2516	NC_021913	GAC	2	6	157270	157275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2517	NC_021913	CGA	2	6	157277	157282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2518	NC_021913	CTG	2	6	157306	157311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2519	NC_021913	CAG	2	6	157324	157329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2520	NC_021913	GAAC	2	8	157347	157354	50 %	0 %	25 %	25 %	529043571
2521	NC_021913	GAT	2	6	157381	157386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043571
2522	NC_021913	ACT	2	6	157397	157402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043571
2523	NC_021913	TTGT	2	8	157430	157437	0 %	75 %	25 %	0 %	529043571
2524	NC_021913	GA	3	6	157440	157445	50 %	0 %	50 %	0 %	529043571
2525	NC_021913	CGA	2	6	157458	157463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2526	NC_021913	CCT	2	6	157484	157489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043571
2527	NC_021913	CT	3	6	157555	157560	0 %	50 %	0 %	50 %	529043571
2528	NC_021913	CT	3	6	157584	157589	0 %	50 %	0 %	50 %	529043571
2529	NC_021913	GAA	2	6	157704	157709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043571
2530	NC_021913	TGC	2	6	157734	157739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2531	NC_021913	ACC	2	6	157772	157777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043571
2532	NC_021913	TCG	2	6	157913	157918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2533	NC_021913	GC	3	6	157988	157993	0 %	0 %	50 %	50 %	529043571
2534	NC_021913	AAGG	2	8	158070	158077	50 %	0 %	50 %	0 %	529043571
2535	NC_021913	GTA	2	6	158191	158196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043571
2536	NC_021913	CGA	2	6	158247	158252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2537	NC_021913	TCG	2	6	158276	158281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2538	NC_021913	TCG	2	6	158330	158335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2539	NC_021913	TCG	2	6	158408	158413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2540	NC_021913	TCG	2	6	158441	158446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043571
2541	NC_021913	TTC	2	6	158512	158517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043571
2542	NC_021913	TC	3	6	158544	158549	0 %	50 %	0 %	50 %	529043571
2543	NC_021913	GTT	2	6	158586	158591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043571
2544	NC_021913	AAC	2	6	158612	158617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043571
2545	NC_021913	ACA	2	6	159067	159072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043572
2546	NC_021913	CTG	2	6	159356	159361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043572
2547	NC_021913	TCC	2	6	159418	159423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043572
2548	NC_021913	TCT	2	6	159442	159447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043572
2549	NC_021913	GGA	2	6	159563	159568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043572
2550	NC_021913	CGA	2	6	159611	159616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043572
2551	NC_021913	ATCG	2	8	159630	159637	25 %	25 %	25 %	25 %	529043572
2552	NC_021913	CAAA	2	8	159650	159657	75 %	0 %	0 %	25 %	529043572
2553	NC_021913	A	6	6	159655	159660	100 %	0 %	0 %	0 %	529043572
2554	NC_021913	GCA	2	6	159692	159697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043572
2555	NC_021913	ATC	2	6	159699	159704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043572
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2557	NC_021913	AAG	2	6	159801	159806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043572
2558	NC_021913	AG	3	6	159930	159935	50 %	0 %	50 %	0 %	529043572
2559	NC_021913	TCG	2	6	159970	159975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043572
2560	NC_021913	GGC	2	6	160091	160096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043572
2561	NC_021913	AGC	2	6	160132	160137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043572
2562	NC_021913	TTC	2	6	160146	160151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043572
2563	NC_021913	GAG	2	6	160152	160157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043572
2564	NC_021913	TC	3	6	160164	160169	0 %	50 %	0 %	50 %	529043572
2565	NC_021913	GGA	2	6	160244	160249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043572
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2567	NC_021913	AGC	2	6	160324	160329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043572
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2569	NC_021913	GGC	2	6	160346	160351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043572
2570	NC_021913	A	6	6	160386	160391	100 %	0 %	0 %	0 %	529043572
2571	NC_021913	GAA	2	6	160392	160397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043572
2572	NC_021913	CGA	2	6	160412	160417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043572
2573	NC_021913	GC	3	6	160449	160454	0 %	0 %	50 %	50 %	529043572
2574	NC_021913	GCAGC	2	10	160467	160476	20 %	0 %	40 %	40 %	529043572
2575	NC_021913	GGAA	2	8	160483	160490	50 %	0 %	50 %	0 %	529043572
2576	NC_021913	TTGA	2	8	160545	160552	25 %	50 %	25 %	0 %	529043572
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2578	NC_021913	CGA	2	6	160604	160609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043572
2579	NC_021913	GGAA	2	8	160627	160634	50 %	0 %	50 %	0 %	529043572
2580	NC_021913	AGC	2	6	160726	160731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043572
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2582	NC_021913	ATC	2	6	160842	160847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043572
2583	NC_021913	GAGT	2	8	161028	161035	25 %	25 %	50 %	0 %	529043572
2584	NC_021913	AG	3	6	161057	161062	50 %	0 %	50 %	0 %	529043573
2585	NC_021913	GAA	2	6	161071	161076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043573
2586	NC_021913	CGA	2	6	161098	161103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043573
2587	NC_021913	GC	3	6	161162	161167	0 %	0 %	50 %	50 %	529043573
2588	NC_021913	GGC	2	6	161189	161194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043573
2589	NC_021913	GAT	2	6	161276	161281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043573
2590	NC_021913	TGG	2	6	161338	161343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043573
2591	NC_021913	AGG	2	6	161358	161363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043573
2592	NC_021913	TTCA	2	8	161408	161415	25 %	50 %	0 %	25 %	529043573
2593	NC_021913	AGG	2	6	161439	161444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043573
2594	NC_021913	GAG	2	6	161486	161491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043573
2595	NC_021913	CTG	2	6	161730	161735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043574
2596	NC_021913	CGA	2	6	161842	161847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043574
2597	NC_021913	GACA	2	8	161848	161855	50 %	0 %	25 %	25 %	529043574
2598	NC_021913	CAAG	2	8	162148	162155	50 %	0 %	25 %	25 %	529043574
2599	NC_021913	TTAC	2	8	162254	162261	25 %	50 %	0 %	25 %	529043574
2600	NC_021913	CCA	2	6	162263	162268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043574
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2602	NC_021913	CCA	2	6	162320	162325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043574
2603	NC_021913	CGA	2	6	162505	162510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043574
2604	NC_021913	AGA	2	6	162526	162531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043574
2605	NC_021913	GTC	2	6	162587	162592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043574
2606	NC_021913	CAC	2	6	162618	162623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043574
2607	NC_021913	TCG	2	6	162673	162678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043574
2608	NC_021913	TGA	2	6	162784	162789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043574
2609	NC_021913	CG	3	6	162876	162881	0 %	0 %	50 %	50 %	529043574
2610	NC_021913	TGA	2	6	162903	162908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043574
2611	NC_021913	TAC	2	6	162986	162991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043574
2612	NC_021913	TGC	2	6	163207	163212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043574
2613	NC_021913	GAA	2	6	163304	163309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043574
2614	NC_021913	C	6	6	163372	163377	0 %	0 %	0 %	100 %	529043574
2615	NC_021913	GCTC	2	8	163396	163403	0 %	25 %	25 %	50 %	529043574
2616	NC_021913	TGGA	2	8	163445	163452	25 %	25 %	50 %	0 %	529043574
2617	NC_021913	CTG	2	6	163476	163481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043574
2618	NC_021913	TGG	2	6	163504	163509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043574
2619	NC_021913	TCCCGA	2	12	163516	163527	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	529043574
2620	NC_021913	GAGCGA	2	12	163528	163539	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	529043574
2621	NC_021913	ACAA	2	8	163704	163711	75 %	0 %	0 %	25 %	529043574
2622	NC_021913	GA	3	6	163716	163721	50 %	0 %	50 %	0 %	529043574
2623	NC_021913	CGA	2	6	163750	163755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043574
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2626	NC_021913	AAG	2	6	163941	163946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043574
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2635	NC_021913	GAT	2	6	164246	164251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043574
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2637	NC_021913	TGTCGA	2	12	164314	164325	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529043574
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2743	NC_021913	CGTA	2	8	170196	170203	25 %	25 %	25 %	25 %	529043578
2744	NC_021913	TCGAT	2	10	170335	170344	20 %	40 %	20 %	20 %	529043578
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2748	NC_021913	GCT	2	6	170491	170496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043578
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2969	NC_021913	TCG	4	12	186106	186117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043595
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2983	NC_021913	GAC	2	6	186816	186821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043595
2984	NC_021913	GATC	2	8	186827	186834	25 %	25 %	25 %	25 %	529043595
2985	NC_021913	GAT	2	6	186924	186929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043595
2986	NC_021913	GC	3	6	187243	187248	0 %	0 %	50 %	50 %	529043596
2987	NC_021913	CGG	3	9	187284	187292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043596
2988	NC_021913	GCC	2	6	187296	187301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043596
2989	NC_021913	GAA	2	6	187356	187361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043597
2990	NC_021913	GTC	2	6	187365	187370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043597
2991	NC_021913	GGC	2	6	187419	187424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043597
2992	NC_021913	GCA	2	6	187427	187432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043597
2993	NC_021913	GGC	2	6	187469	187474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043597
2994	NC_021913	C	6	6	187476	187481	0 %	0 %	0 %	100 %	529043597
2995	NC_021913	GCG	2	6	187482	187487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043597
2996	NC_021913	GCC	2	6	187492	187497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043597
2997	NC_021913	AGC	2	6	187534	187539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043597
2998	NC_021913	ACTCG	2	10	187620	187629	20 %	20 %	20 %	40 %	529043597
2999	NC_021913	GCG	2	6	187693	187698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043597
3000	NC_021913	TCG	2	6	187723	187728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043597

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