MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 5361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021913	TGG	2	6	103244	103249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043534
1502	NC_021913	ACCC	2	8	103265	103272	25 %	0 %	0 %	75 %	529043534
1503	NC_021913	GA	3	6	104292	104297	50 %	0 %	50 %	0 %	529043535
1504	NC_021913	CGT	2	6	104383	104388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043535
1505	NC_021913	ACG	2	6	104412	104417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043535
1506	NC_021913	TCG	3	9	104436	104444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043535
1507	NC_021913	GGT	2	6	104461	104466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043535
1508	NC_021913	CGG	2	6	104536	104541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043535
1509	NC_021913	ATC	2	6	104543	104548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043535
1510	NC_021913	GCC	2	6	104582	104587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043535
1511	NC_021913	CCG	2	6	104663	104668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043535
1512	NC_021913	GAG	2	6	104687	104692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043535
1513	NC_021913	GAA	2	6	104737	104742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043535
1514	NC_021913	CGC	2	6	104755	104760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043535
1515	NC_021913	GAG	2	6	104852	104857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043535
1516	NC_021913	CGA	2	6	104863	104868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043535
1517	NC_021913	GGAC	2	8	104928	104935	25 %	0 %	50 %	25 %	529043536
1518	NC_021913	GGAC	2	8	104948	104955	25 %	0 %	50 %	25 %	529043536
1519	NC_021913	CCT	2	6	105050	105055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043536
1520	NC_021913	CAG	2	6	105061	105066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1521	NC_021913	TCCA	2	8	105100	105107	25 %	25 %	0 %	50 %	529043536
1522	NC_021913	CGA	2	6	105117	105122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1523	NC_021913	CCG	2	6	105137	105142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043536
1524	NC_021913	CGG	2	6	105174	105179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043536
1525	NC_021913	CGA	2	6	105195	105200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1526	NC_021913	TGGA	2	8	105232	105239	25 %	25 %	50 %	0 %	529043536
1527	NC_021913	CCG	2	6	105240	105245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043536
1528	NC_021913	CG	3	6	105244	105249	0 %	0 %	50 %	50 %	529043536
1529	NC_021913	GGGT	2	8	105262	105269	0 %	25 %	75 %	0 %	529043536
1530	NC_021913	TCGA	2	8	105287	105294	25 %	25 %	25 %	25 %	529043536
1531	NC_021913	GAAC	2	8	105363	105370	50 %	0 %	25 %	25 %	529043536
1532	NC_021913	C	6	6	105402	105407	0 %	0 %	0 %	100 %	529043536
1533	NC_021913	CGA	2	6	105435	105440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1534	NC_021913	CTC	2	6	105456	105461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043536
1535	NC_021913	CGG	2	6	105474	105479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043536
1536	NC_021913	CGA	2	6	105573	105578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1537	NC_021913	TCG	2	6	105581	105586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1538	NC_021913	CCG	2	6	105596	105601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043536
1539	NC_021913	GCG	2	6	105650	105655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043536
1540	NC_021913	ATG	2	6	105715	105720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043536
1541	NC_021913	ACG	2	6	105749	105754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1542	NC_021913	CGG	2	6	105825	105830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043536
1543	NC_021913	CGA	2	6	105836	105841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1544	NC_021913	CGGG	2	8	105842	105849	0 %	0 %	75 %	25 %	529043536
1545	NC_021913	CGG	2	6	105876	105881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043536
1546	NC_021913	GGCG	2	8	105894	105901	0 %	0 %	75 %	25 %	529043536
1547	NC_021913	AGGC	2	8	106094	106101	25 %	0 %	50 %	25 %	529043536
1548	NC_021913	GAA	2	6	106134	106139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043536
1549	NC_021913	ACG	2	6	106157	106162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1550	NC_021913	CGT	2	6	106170	106175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1551	NC_021913	CGG	2	6	106176	106181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043536
1552	NC_021913	TGGA	2	8	106201	106208	25 %	25 %	50 %	0 %	529043536
1553	NC_021913	CCGG	2	8	106226	106233	0 %	0 %	50 %	50 %	529043536
1554	NC_021913	CGG	2	6	106251	106256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043536
1555	NC_021913	TCG	2	6	106286	106291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1556	NC_021913	CGA	2	6	106311	106316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1557	NC_021913	ACG	2	6	106319	106324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043536
1558	NC_021913	GAG	2	6	106390	106395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043536
1559	NC_021913	TAC	2	6	106396	106401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043536
1560	NC_021913	GCG	2	6	106464	106469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043536
1561	NC_021913	CGG	2	6	106532	106537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043537
1562	NC_021913	ACG	2	6	106642	106647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1563	NC_021913	CCA	2	6	106651	106656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043537
1564	NC_021913	CGG	2	6	106671	106676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043537
1565	NC_021913	CCGTC	2	10	106703	106712	0 %	20 %	20 %	60 %	529043537
1566	NC_021913	GCC	2	6	106791	106796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043537
1567	NC_021913	GCCA	2	8	106810	106817	25 %	0 %	25 %	50 %	529043537
1568	NC_021913	CGT	2	6	106818	106823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1569	NC_021913	G	6	6	106828	106833	0 %	0 %	100 %	0 %	529043537
1570	NC_021913	GAC	2	6	106854	106859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1571	NC_021913	TTCC	2	8	106973	106980	0 %	50 %	0 %	50 %	529043537
1572	NC_021913	CGG	2	6	106982	106987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043537
1573	NC_021913	CCG	2	6	107003	107008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043537
1574	NC_021913	CGT	2	6	107114	107119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1575	NC_021913	GAC	2	6	107142	107147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1576	NC_021913	CGA	2	6	107168	107173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1577	NC_021913	CCG	2	6	107175	107180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043537
1578	NC_021913	CGT	2	6	107201	107206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1579	NC_021913	ACCGA	2	10	107238	107247	40 %	0 %	20 %	40 %	529043537
1580	NC_021913	TTG	2	6	107296	107301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043537
1581	NC_021913	CCGT	2	8	107320	107327	0 %	25 %	25 %	50 %	529043537
1582	NC_021913	CA	3	6	107342	107347	50 %	0 %	0 %	50 %	529043537
1583	NC_021913	GCCG	2	8	107380	107387	0 %	0 %	50 %	50 %	529043537
1584	NC_021913	CTC	2	6	107424	107429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043537
1585	NC_021913	GGT	2	6	107444	107449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043537
1586	NC_021913	GAA	2	6	107472	107477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043537
1587	NC_021913	CGAG	2	8	107549	107556	25 %	0 %	50 %	25 %	529043537
1588	NC_021913	CCA	2	6	107592	107597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043537
1589	NC_021913	C	6	6	107669	107674	0 %	0 %	0 %	100 %	529043537
1590	NC_021913	GGTA	2	8	107696	107703	25 %	25 %	50 %	0 %	529043537
1591	NC_021913	CGG	2	6	107735	107740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043537
1592	NC_021913	GC	3	6	107776	107781	0 %	0 %	50 %	50 %	529043537
1593	NC_021913	GTA	2	6	107868	107873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043537
1594	NC_021913	TCG	2	6	107959	107964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1595	NC_021913	GAA	2	6	108012	108017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043537
1596	NC_021913	CGT	2	6	108044	108049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1597	NC_021913	CGC	2	6	108075	108080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043537
1598	NC_021913	GT	3	6	108083	108088	0 %	50 %	50 %	0 %	529043537
1599	NC_021913	TCG	2	6	108112	108117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043537
1600	NC_021913	AGCGCG	2	12	108124	108135	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529043537
1601	NC_021913	GGTC	2	8	108173	108180	0 %	25 %	50 %	25 %	529043537
1602	NC_021913	CTC	2	6	108195	108200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043537
1603	NC_021913	CGG	2	6	108218	108223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043537
1604	NC_021913	CCG	2	6	108262	108267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043537
1605	NC_021913	CGC	2	6	108270	108275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043537
1606	NC_021913	GCC	2	6	108283	108288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043537
1607	NC_021913	C	6	6	108287	108292	0 %	0 %	0 %	100 %	529043537
1608	NC_021913	CG	3	6	108301	108306	0 %	0 %	50 %	50 %	529043537
1609	NC_021913	CCG	2	6	108329	108334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043537
1610	NC_021913	GC	3	6	108341	108346	0 %	0 %	50 %	50 %	529043537
1611	NC_021913	CCGG	2	8	108356	108363	0 %	0 %	50 %	50 %	529043537
1612	NC_021913	CGC	2	6	108371	108376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043537
1613	NC_021913	GACCG	2	10	108412	108421	20 %	0 %	40 %	40 %	529043537
1614	NC_021913	CGCTA	2	10	108536	108545	20 %	20 %	20 %	40 %	529043538
1615	NC_021913	CG	3	6	108570	108575	0 %	0 %	50 %	50 %	529043538
1616	NC_021913	AGT	2	6	108596	108601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043538
1617	NC_021913	GTCGCC	2	12	108627	108638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529043538
1618	NC_021913	GGC	2	6	108648	108653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043538
1619	NC_021913	GC	3	6	108748	108753	0 %	0 %	50 %	50 %	529043538
1620	NC_021913	GGA	2	6	108767	108772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043538
1621	NC_021913	GGC	3	9	108807	108815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043538
1622	NC_021913	GTA	2	6	108894	108899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043538
1623	NC_021913	AG	3	6	108915	108920	50 %	0 %	50 %	0 %	529043538
1624	NC_021913	TCG	2	6	108937	108942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043538
1625	NC_021913	CG	3	6	108989	108994	0 %	0 %	50 %	50 %	529043538
1626	NC_021913	GTC	2	6	109005	109010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043538
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1635	NC_021913	GTCG	2	8	109433	109440	0 %	25 %	50 %	25 %	529043538
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1643	NC_021913	GTCG	2	8	109996	110003	0 %	25 %	50 %	25 %	529043539
1644	NC_021913	CGG	2	6	110015	110020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043539
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1651	NC_021913	GAC	2	6	110218	110223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043539
1652	NC_021913	ACT	2	6	110252	110257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043539
1653	NC_021913	CGA	2	6	110271	110276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043539
1654	NC_021913	GAG	2	6	110293	110298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043539
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1663	NC_021913	CGA	2	6	110580	110585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043539
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1742	NC_021913	CGG	2	6	116624	116629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043542
1743	NC_021913	CGTTCG	2	12	116665	116676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043542
1744	NC_021913	GCC	2	6	116732	116737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043542
1745	NC_021913	GAC	2	6	116753	116758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043542
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1747	NC_021913	GAT	2	6	116795	116800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043542
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1749	NC_021913	AGGTC	2	10	117024	117033	20 %	20 %	40 %	20 %	529043543
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1852	NC_021913	CG	3	6	121599	121604	0 %	0 %	50 %	50 %	529043546
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1857	NC_021913	TCCG	2	8	121951	121958	0 %	25 %	25 %	50 %	529043546
1858	NC_021913	CGA	2	6	121969	121974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043546
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1860	NC_021913	TCG	2	6	122141	122146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043547
1861	NC_021913	ACGT	2	8	122180	122187	25 %	25 %	25 %	25 %	529043547
1862	NC_021913	GTG	2	6	122232	122237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043547
1863	NC_021913	TCG	3	9	122273	122281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043547
1864	NC_021913	CGA	2	6	122293	122298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043547
1865	NC_021913	CGC	2	6	122352	122357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
1866	NC_021913	TCTCG	2	10	122379	122388	0 %	40 %	20 %	40 %	529043547
1867	NC_021913	CAG	2	6	122407	122412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043547
1868	NC_021913	CCG	2	6	122430	122435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
1869	NC_021913	CCG	2	6	122475	122480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
1870	NC_021913	TCA	2	6	122484	122489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043547
1871	NC_021913	CCG	2	6	122505	122510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
1872	NC_021913	CGTC	2	8	122525	122532	0 %	25 %	25 %	50 %	529043547
1873	NC_021913	CGA	2	6	122574	122579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043547
1874	NC_021913	ACG	2	6	122621	122626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043547
1875	NC_021913	CTT	2	6	122673	122678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043547
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1877	NC_021913	TCG	2	6	122753	122758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043547
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1879	NC_021913	GTC	2	6	122929	122934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043547
1880	NC_021913	CGG	2	6	122949	122954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043547
1881	NC_021913	CGC	2	6	123075	123080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043547
1882	NC_021913	GGCT	2	8	123110	123117	0 %	25 %	50 %	25 %	529043547
1883	NC_021913	AGT	2	6	123141	123146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043547
1884	NC_021913	CCCG	2	8	123172	123179	0 %	0 %	25 %	75 %	529043547
1885	NC_021913	GGGC	2	8	123225	123232	0 %	0 %	75 %	25 %	529043548
1886	NC_021913	CGG	2	6	123241	123246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043548
1887	NC_021913	TCGAG	2	10	123271	123280	20 %	20 %	40 %	20 %	529043548
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1889	NC_021913	CCG	2	6	123524	123529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043549
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1891	NC_021913	TCGGCG	2	12	123637	123648	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529043549
1892	NC_021913	CGT	2	6	123722	123727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043549
1893	NC_021913	TCG	2	6	123730	123735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043549
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1898	NC_021913	CGG	2	6	124076	124081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043549
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1967	NC_021913	GAG	2	6	126873	126878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043550
1968	NC_021913	CA	3	6	126881	126886	50 %	0 %	0 %	50 %	529043550
1969	NC_021913	CTC	2	6	126921	126926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043550
1970	NC_021913	CAC	2	6	126952	126957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043550
1971	NC_021913	CTC	2	6	126978	126983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043550
1972	NC_021913	GTC	2	6	127014	127019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043550
1973	NC_021913	CCCG	2	8	127029	127036	0 %	0 %	25 %	75 %	529043550
1974	NC_021913	TCGG	2	8	127102	127109	0 %	25 %	50 %	25 %	529043550
1975	NC_021913	GTC	2	6	127116	127121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043550
1976	NC_021913	CCG	2	6	127138	127143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043550
1977	NC_021913	GATC	2	8	127190	127197	25 %	25 %	25 %	25 %	529043550
1978	NC_021913	CGA	2	6	127405	127410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1979	NC_021913	GACCGC	2	12	127424	127435	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529043551
1980	NC_021913	ACG	2	6	127458	127463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1981	NC_021913	CGT	2	6	127468	127473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1982	NC_021913	TCG	2	6	127485	127490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1983	NC_021913	TCG	2	6	127501	127506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1984	NC_021913	CGA	2	6	127549	127554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1985	NC_021913	TCG	2	6	127632	127637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1986	NC_021913	CGT	2	6	127672	127677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1987	NC_021913	TCG	2	6	127701	127706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1988	NC_021913	GCC	2	6	127733	127738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043551
1989	NC_021913	TCC	2	6	127791	127796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043551
1990	NC_021913	TCG	2	6	127797	127802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1991	NC_021913	TCG	2	6	127881	127886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1992	NC_021913	GCCG	2	8	127892	127899	0 %	0 %	50 %	50 %	529043551
1993	NC_021913	TCG	2	6	127977	127982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1994	NC_021913	GAT	2	6	127985	127990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043551
1995	NC_021913	CGT	2	6	128035	128040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1996	NC_021913	GC	3	6	128066	128071	0 %	0 %	50 %	50 %	529043551
1997	NC_021913	CTC	2	6	128087	128092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043551
1998	NC_021913	GTC	2	6	128093	128098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043551
1999	NC_021913	CCG	2	6	128112	128117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043551
2000	NC_021913	GTA	2	6	128123	128128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043551

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