MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 5361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021913	CGA	2	6	287594	287599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043693
4502	NC_021913	CT	3	6	287601	287606	0 %	50 %	0 %	50 %	529043693
4503	NC_021913	CGC	2	6	287609	287614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043693
4504	NC_021913	GA	3	6	287656	287661	50 %	0 %	50 %	0 %	529043693
4505	NC_021913	GAT	2	6	287667	287672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043693
4506	NC_021913	CGC	2	6	287777	287782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043693
4507	NC_021913	CGA	2	6	287804	287809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043693
4508	NC_021913	TC	4	8	287841	287848	0 %	50 %	0 %	50 %	529043693
4509	NC_021913	GAC	2	6	287885	287890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043693
4510	NC_021913	CTC	2	6	287943	287948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043693
4511	NC_021913	ACG	2	6	287995	288000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043693
4512	NC_021913	CG	3	6	288013	288018	0 %	0 %	50 %	50 %	529043693
4513	NC_021913	GAC	2	6	288024	288029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043693
4514	NC_021913	GAA	2	6	288048	288053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529043693
4515	NC_021913	CGA	2	6	288113	288118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043693
4516	NC_021913	GAC	2	6	288270	288275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043693
4517	NC_021913	GC	3	6	288280	288285	0 %	0 %	50 %	50 %	529043693
4518	NC_021913	GC	3	6	288309	288314	0 %	0 %	50 %	50 %	529043693
4519	NC_021913	CTG	2	6	288327	288332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043693
4520	NC_021913	TCG	2	6	288906	288911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4521	NC_021913	CCA	2	6	288932	288937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043694
4522	NC_021913	GC	3	6	289165	289170	0 %	0 %	50 %	50 %	529043694
4523	NC_021913	GC	4	8	289172	289179	0 %	0 %	50 %	50 %	529043694
4524	NC_021913	CGA	2	6	289240	289245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4525	NC_021913	AG	4	8	289322	289329	50 %	0 %	50 %	0 %	529043694
4526	NC_021913	GTC	2	6	289382	289387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4527	NC_021913	CAG	2	6	289417	289422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4528	NC_021913	TTC	2	6	289449	289454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043694
4529	NC_021913	CGC	2	6	289468	289473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043694
4530	NC_021913	GCAG	2	8	289480	289487	25 %	0 %	50 %	25 %	529043694
4531	NC_021913	CCGT	2	8	289560	289567	0 %	25 %	25 %	50 %	529043694
4532	NC_021913	AG	3	6	289598	289603	50 %	0 %	50 %	0 %	529043694
4533	NC_021913	AGG	2	6	289669	289674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043694
4534	NC_021913	TCG	2	6	289695	289700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4535	NC_021913	TC	3	6	289713	289718	0 %	50 %	0 %	50 %	529043694
4536	NC_021913	CGA	2	6	289719	289724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4537	NC_021913	ATC	2	6	289772	289777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043694
4538	NC_021913	TGTT	2	8	289803	289810	0 %	75 %	25 %	0 %	529043694
4539	NC_021913	CTG	2	6	289829	289834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4540	NC_021913	CAG	2	6	289847	289852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4541	NC_021913	TCG	2	6	289876	289881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4542	NC_021913	GTC	2	6	289883	289888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4543	NC_021913	AGC	2	6	289889	289894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043694
4544	NC_021913	GAT	2	6	289900	289905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043694
4545	NC_021913	GCCG	2	8	289924	289931	0 %	0 %	50 %	50 %	529043694
4546	NC_021913	GGC	2	6	290007	290012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043695
4547	NC_021913	TGA	3	9	290021	290029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043695
4548	NC_021913	GCC	2	6	290086	290091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043695
4549	NC_021913	TCG	2	6	290104	290109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043695
4550	NC_021913	CCG	2	6	290124	290129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043695
4551	NC_021913	AAATCC	2	12	290241	290252	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	529043695
4552	NC_021913	CGA	2	6	290416	290421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043696
4553	NC_021913	GAC	2	6	290437	290442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043696
4554	NC_021913	TC	3	6	290485	290490	0 %	50 %	0 %	50 %	529043696
4555	NC_021913	GAC	2	6	290548	290553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043696
4556	NC_021913	CA	3	6	290578	290583	50 %	0 %	0 %	50 %	529043696
4557	NC_021913	CGTCGA	2	12	290614	290625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529043696
4558	NC_021913	TC	3	6	290636	290641	0 %	50 %	0 %	50 %	529043696
4559	NC_021913	GAG	2	6	290684	290689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043696
4560	NC_021913	CGA	2	6	290794	290799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043696
4561	NC_021913	GCA	2	6	290836	290841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043696
4562	NC_021913	A	6	6	290841	290846	100 %	0 %	0 %	0 %	529043696
4563	NC_021913	CGCA	2	8	290926	290933	25 %	0 %	25 %	50 %	529043696
4564	NC_021913	GAC	2	6	290971	290976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043696
4565	NC_021913	AC	3	6	290990	290995	50 %	0 %	0 %	50 %	529043696
4566	NC_021913	TCC	2	6	290997	291002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043696
4567	NC_021913	GTC	2	6	291005	291010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043696
4568	NC_021913	TCG	2	6	291054	291059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043696
4569	NC_021913	GAAT	2	8	291176	291183	50 %	25 %	25 %	0 %	529043696
4570	NC_021913	GTTC	2	8	291228	291235	0 %	50 %	25 %	25 %	529043697
4571	NC_021913	GTT	2	6	291294	291299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043697
4572	NC_021913	CGG	2	6	291303	291308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043697
4573	NC_021913	CGTA	2	8	291335	291342	25 %	25 %	25 %	25 %	529043697
4574	NC_021913	GCTC	2	8	291355	291362	0 %	25 %	25 %	50 %	529043697
4575	NC_021913	TTC	2	6	291379	291384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043697
4576	NC_021913	CTG	2	6	291389	291394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4577	NC_021913	CCG	2	6	291398	291403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043697
4578	NC_021913	GTC	2	6	291505	291510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4579	NC_021913	TCA	2	6	291518	291523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043697
4580	NC_021913	TCG	2	6	291614	291619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4581	NC_021913	G	6	6	291625	291630	0 %	0 %	100 %	0 %	529043697
4582	NC_021913	CTG	2	6	291651	291656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4583	NC_021913	GGT	2	6	291679	291684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043697
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4585	NC_021913	GCG	2	6	291705	291710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043697
4586	NC_021913	TCG	2	6	291767	291772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4587	NC_021913	GCC	2	6	291985	291990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043697
4588	NC_021913	CGG	2	6	292050	292055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043697
4589	NC_021913	CCT	2	6	292152	292157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043697
4590	NC_021913	TCG	2	6	292172	292177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4591	NC_021913	C	6	6	292178	292183	0 %	0 %	0 %	100 %	529043697
4592	NC_021913	GTC	2	6	292203	292208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4593	NC_021913	CTC	2	6	292225	292230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043697
4594	NC_021913	CGA	2	6	292299	292304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043697
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4596	NC_021913	CAT	2	6	292353	292358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043697
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4599	NC_021913	GTC	2	6	292468	292473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4600	NC_021913	CGC	2	6	292491	292496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043697
4601	NC_021913	GAG	2	6	292540	292545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043697
4602	NC_021913	AGTC	2	8	292565	292572	25 %	25 %	25 %	25 %	529043697
4603	NC_021913	TCG	2	6	292607	292612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4604	NC_021913	G	6	6	292614	292619	0 %	0 %	100 %	0 %	529043697
4605	NC_021913	TCG	2	6	292691	292696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4606	NC_021913	GGTC	2	8	292698	292705	0 %	25 %	50 %	25 %	529043697
4607	NC_021913	CTG	2	6	292711	292716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4608	NC_021913	GT	3	6	292727	292732	0 %	50 %	50 %	0 %	529043697
4609	NC_021913	TCG	2	6	292758	292763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043697
4610	NC_021913	CGG	2	6	292768	292773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043697
4611	NC_021913	GAG	2	6	292995	293000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043698
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4618	NC_021913	CGT	2	6	294680	294685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043699
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4733	NC_021913	ACG	3	9	300076	300084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043701
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4741	NC_021913	GATCGT	2	12	300272	300283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529043701
4742	NC_021913	CCA	2	6	300309	300314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043701
4743	NC_021913	GGC	2	6	300321	300326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043701
4744	NC_021913	GAC	2	6	300327	300332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043701
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4746	NC_021913	ACG	2	6	300457	300462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043701
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4857	NC_021913	GGTC	2	8	305781	305788	0 %	25 %	50 %	25 %	529043704
4858	NC_021913	GTC	2	6	305905	305910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043704
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4862	NC_021913	GTC	2	6	306017	306022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043704
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4977	NC_021913	CGTTC	2	10	311089	311098	0 %	40 %	20 %	40 %	529043706
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4979	NC_021913	GT	3	6	311113	311118	0 %	50 %	50 %	0 %	529043706
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4981	NC_021913	CGA	2	6	311173	311178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043706
4982	NC_021913	GTC	2	6	311186	311191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043706
4983	NC_021913	CGCT	2	8	311205	311212	0 %	25 %	25 %	50 %	529043706
4984	NC_021913	GAACTC	2	12	311276	311287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	529043706
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