MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori UM298

Total Repeats: 1108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021882	TCCAA	2	10	4773	4782	40 %	20 %	0 %	40 %	526465358
2	NC_021882	GGCGT	2	10	6528	6537	0 %	20 %	60 %	20 %	526465360
3	NC_021882	TTTTC	2	10	6814	6823	0 %	80 %	0 %	20 %	526465360
4	NC_021882	TTTTC	2	10	9918	9927	0 %	80 %	0 %	20 %	526465363
5	NC_021882	ATTTT	2	10	10409	10418	20 %	80 %	0 %	0 %	526465363
6	NC_021882	AAACT	2	10	10515	10524	60 %	20 %	0 %	20 %	526465363
7	NC_021882	AATCA	2	10	14472	14481	60 %	20 %	0 %	20 %	526465370
8	NC_021882	ATTTT	2	10	15052	15061	20 %	80 %	0 %	0 %	526465370
9	NC_021882	AAATA	2	10	15912	15921	80 %	20 %	0 %	0 %	526465371
10	NC_021882	TAGGG	2	10	15956	15965	20 %	20 %	60 %	0 %	526465371
11	NC_021882	TGAGT	2	10	18760	18769	20 %	40 %	40 %	0 %	526465373
12	NC_021882	ATAAA	2	10	19521	19530	80 %	20 %	0 %	0 %	526465374
13	NC_021882	TGGTT	2	10	20259	20268	0 %	60 %	40 %	0 %	526466584
14	NC_021882	ATTTA	2	10	20692	20701	40 %	60 %	0 %	0 %	526466584
15	NC_021882	TTATT	2	10	22665	22674	20 %	80 %	0 %	0 %	526465377
16	NC_021882	CTTTT	2	10	23942	23951	0 %	80 %	0 %	20 %	526465379
17	NC_021882	AATCA	2	10	25469	25478	60 %	20 %	0 %	20 %	526465379
18	NC_021882	AATCA	2	10	25742	25751	60 %	20 %	0 %	20 %	526465379
19	NC_021882	TGATG	2	10	27739	27748	20 %	40 %	40 %	0 %	526465382
20	NC_021882	ATTGA	2	10	28430	28439	40 %	40 %	20 %	0 %	526465382
21	NC_021882	ATTTT	2	10	28912	28921	20 %	80 %	0 %	0 %	526465383
22	NC_021882	CGCTT	2	10	33882	33891	0 %	40 %	20 %	40 %	526466586
23	NC_021882	GGCTT	2	10	37383	37392	0 %	40 %	40 %	20 %	526465389
24	NC_021882	AAAAT	2	10	39339	39348	80 %	20 %	0 %	0 %	526466587
25	NC_021882	ATTTG	2	10	39887	39896	20 %	60 %	20 %	0 %	526466588
26	NC_021882	TCAAT	2	10	43381	43390	40 %	40 %	0 %	20 %	526465393
27	NC_021882	TCTAT	2	10	43533	43542	20 %	60 %	0 %	20 %	526465393
28	NC_021882	AGAAA	2	10	43680	43689	80 %	0 %	20 %	0 %	526465394
29	NC_021882	AACTA	2	10	43993	44002	60 %	20 %	0 %	20 %	526465394
30	NC_021882	CAACT	2	10	45612	45621	40 %	20 %	0 %	40 %	526465395
31	NC_021882	AGCCA	2	10	47239	47248	40 %	0 %	20 %	40 %	526465397
32	NC_021882	TTTAA	2	10	52122	52131	40 %	60 %	0 %	0 %	526465399
33	NC_021882	GTGTG	2	10	56758	56767	0 %	40 %	60 %	0 %	526465399
34	NC_021882	AGAAA	2	10	57345	57354	80 %	0 %	20 %	0 %	526465399
35	NC_021882	AATCA	2	10	58755	58764	60 %	20 %	0 %	20 %	526465399
36	NC_021882	AATCT	2	10	59212	59221	40 %	40 %	0 %	20 %	526465399
37	NC_021882	TGGGG	2	10	60161	60170	0 %	20 %	80 %	0 %	526465399
38	NC_021882	TTGGA	2	10	60178	60187	20 %	40 %	40 %	0 %	526465399
39	NC_021882	AGTAT	2	10	60399	60408	40 %	40 %	20 %	0 %	526466590
40	NC_021882	AATTT	2	10	64746	64755	40 %	60 %	0 %	0 %	526465402
41	NC_021882	CTAAA	2	10	65031	65040	60 %	20 %	0 %	20 %	526465403
42	NC_021882	TTGAT	2	10	66021	66030	20 %	60 %	20 %	0 %	526465403
43	NC_021882	TTCAA	2	10	73413	73422	40 %	40 %	0 %	20 %	526465408
44	NC_021882	TAAAA	2	10	74739	74748	80 %	20 %	0 %	0 %	526465409
45	NC_021882	AAAAC	2	10	75001	75010	80 %	0 %	0 %	20 %	526465409
46	NC_021882	GTGGC	2	10	75501	75510	0 %	20 %	60 %	20 %	526465410
47	NC_021882	TTGGC	2	10	79652	79661	0 %	40 %	40 %	20 %	526465413
48	NC_021882	TTGCG	2	10	79956	79965	0 %	40 %	40 %	20 %	526465413
49	NC_021882	AAAAT	2	10	83993	84002	80 %	20 %	0 %	0 %	526465416
50	NC_021882	TCATG	2	10	84855	84864	20 %	40 %	20 %	20 %	526465417
51	NC_021882	TTTTG	2	10	91752	91761	0 %	80 %	20 %	0 %	526466593
52	NC_021882	TTGAA	2	10	91801	91810	40 %	40 %	20 %	0 %	526466593
53	NC_021882	ACTCA	2	10	92477	92486	40 %	20 %	0 %	40 %	526466594
54	NC_021882	TTTAA	2	10	94605	94614	40 %	60 %	0 %	0 %	526465424
55	NC_021882	ATTTT	2	10	95362	95371	20 %	80 %	0 %	0 %	526465426
56	NC_021882	CCAAG	2	10	97602	97611	40 %	0 %	20 %	40 %	526465427
57	NC_021882	ACGAT	2	10	97781	97790	40 %	20 %	20 %	20 %	526465427
58	NC_021882	AAATC	2	10	98390	98399	60 %	20 %	0 %	20 %	526465429
59	NC_021882	GAAAA	2	10	100330	100339	80 %	0 %	20 %	0 %	526465430
60	NC_021882	CTCAG	2	10	100483	100492	20 %	20 %	20 %	40 %	526465430
61	NC_021882	AGAAA	2	10	100911	100920	80 %	0 %	20 %	0 %	526465430
62	NC_021882	ATCGT	2	10	101928	101937	20 %	40 %	20 %	20 %	526466597
63	NC_021882	GATAA	2	10	102706	102715	60 %	20 %	20 %	0 %	526466597
64	NC_021882	GCGTG	2	10	103041	103050	0 %	20 %	60 %	20 %	526465432
65	NC_021882	AAAAT	2	10	105087	105096	80 %	20 %	0 %	0 %	526465434
66	NC_021882	CATCG	2	10	105098	105107	20 %	20 %	20 %	40 %	526465434
67	NC_021882	AAGTC	2	10	105820	105829	40 %	20 %	20 %	20 %	526465435
68	NC_021882	AAAAG	2	10	106620	106629	80 %	0 %	20 %	0 %	526465435
69	NC_021882	TTTGT	2	10	108509	108518	0 %	80 %	20 %	0 %	526465436
70	NC_021882	TTTTA	2	10	109053	109062	20 %	80 %	0 %	0 %	526465436
71	NC_021882	GGCTT	2	10	110328	110337	0 %	40 %	40 %	20 %	526465437
72	NC_021882	CAAAC	2	10	110397	110406	60 %	0 %	0 %	40 %	526465437
73	NC_021882	GACTT	2	10	110682	110691	20 %	40 %	20 %	20 %	526465437
74	NC_021882	TGCGA	2	10	111296	111305	20 %	20 %	40 %	20 %	526465438
75	NC_021882	CAATT	2	10	112552	112561	40 %	40 %	0 %	20 %	526465439
76	NC_021882	CAAGC	2	10	113272	113281	40 %	0 %	20 %	40 %	526465439
77	NC_021882	TTTTA	2	10	114130	114139	20 %	80 %	0 %	0 %	526465440
78	NC_021882	ATGAA	2	10	115678	115687	60 %	20 %	20 %	0 %	526465442
79	NC_021882	GTGTG	2	10	116551	116560	0 %	40 %	60 %	0 %	526465442
80	NC_021882	TTATT	2	10	116847	116856	20 %	80 %	0 %	0 %	526465443
81	NC_021882	TGATT	2	10	117836	117845	20 %	60 %	20 %	0 %	526465444
82	NC_021882	AAGAA	2	10	118319	118328	80 %	0 %	20 %	0 %	526465444
83	NC_021882	TGCCA	2	10	119546	119555	20 %	20 %	20 %	40 %	526465445
84	NC_021882	ATGAA	2	10	119607	119616	60 %	20 %	20 %	0 %	526465445
85	NC_021882	TCTAT	2	10	121119	121128	20 %	60 %	0 %	20 %	526466598
86	NC_021882	CAAAA	2	10	121424	121433	80 %	0 %	0 %	20 %	526466598
87	NC_021882	AAAGC	2	10	122569	122578	60 %	0 %	20 %	20 %	526466598
88	NC_021882	AAAAC	2	10	123007	123016	80 %	0 %	0 %	20 %	526466598
89	NC_021882	AATCC	2	10	126027	126036	40 %	20 %	0 %	40 %	526465447
90	NC_021882	CAAAA	2	10	126495	126504	80 %	0 %	0 %	20 %	526465447
91	NC_021882	GGCGT	2	10	127054	127063	0 %	20 %	60 %	20 %	526465447
92	NC_021882	TTGGA	2	10	127082	127091	20 %	40 %	40 %	0 %	526465447
93	NC_021882	TCAAA	2	10	127166	127175	60 %	20 %	0 %	20 %	526465447
94	NC_021882	CATTT	2	10	127824	127833	20 %	60 %	0 %	20 %	526466599
95	NC_021882	GTGCA	2	10	128199	128208	20 %	20 %	40 %	20 %	526465448
96	NC_021882	TAAAA	2	10	128685	128694	80 %	20 %	0 %	0 %	526465448
97	NC_021882	TGATT	2	10	128997	129006	20 %	60 %	20 %	0 %	526465448
98	NC_021882	CCAAA	2	10	130676	130685	60 %	0 %	0 %	40 %	526465451
99	NC_021882	CGCAA	2	10	131114	131123	40 %	0 %	20 %	40 %	526465451
100	NC_021882	CATCA	2	10	133027	133036	40 %	20 %	0 %	40 %	526465452
101	NC_021882	AATTG	2	10	133527	133536	40 %	40 %	20 %	0 %	526465452
102	NC_021882	CGTTT	2	10	133917	133926	0 %	60 %	20 %	20 %	526465452
103	NC_021882	GATCG	2	10	135597	135606	20 %	20 %	40 %	20 %	526465454
104	NC_021882	AAGAT	2	10	137519	137528	60 %	20 %	20 %	0 %	526465455
105	NC_021882	TCGCT	2	10	139931	139940	0 %	40 %	20 %	40 %	526465457
106	NC_021882	TTGAT	2	10	140073	140082	20 %	60 %	20 %	0 %	526465457
107	NC_021882	GTTTG	2	10	145046	145055	0 %	60 %	40 %	0 %	526465460
108	NC_021882	ATGAA	2	10	145303	145312	60 %	20 %	20 %	0 %	526465460
109	NC_021882	CAAGG	2	10	145789	145798	40 %	0 %	40 %	20 %	526465461
110	NC_021882	GCTTT	2	10	147498	147507	0 %	60 %	20 %	20 %	526465463
111	NC_021882	GTTTT	2	10	148229	148238	0 %	80 %	20 %	0 %	526465464
112	NC_021882	GAATT	2	10	149213	149222	40 %	40 %	20 %	0 %	526465464
113	NC_021882	AAAGA	2	10	150086	150095	80 %	0 %	20 %	0 %	526465465
114	NC_021882	CGGTT	2	10	152090	152099	0 %	40 %	40 %	20 %	526465466
115	NC_021882	TTGGA	2	10	153955	153964	20 %	40 %	40 %	0 %	526465467
116	NC_021882	TCAAA	2	10	155038	155047	60 %	20 %	0 %	20 %	526465468
117	NC_021882	GTGAT	2	10	156365	156374	20 %	40 %	40 %	0 %	526465470
118	NC_021882	GGCAA	2	10	156467	156476	40 %	0 %	40 %	20 %	526465470
119	NC_021882	CATCG	2	10	158136	158145	20 %	20 %	20 %	40 %	526465470
120	NC_021882	GTGGG	2	10	159594	159603	0 %	20 %	80 %	0 %	526465472
121	NC_021882	TGAAA	2	10	162293	162302	60 %	20 %	20 %	0 %	526465473
122	NC_021882	GGAAT	2	10	163563	163572	40 %	20 %	40 %	0 %	526465474
123	NC_021882	TGGTT	2	10	163890	163899	0 %	60 %	40 %	0 %	526465474
124	NC_021882	TTCAA	2	10	165476	165485	40 %	40 %	0 %	20 %	526465475
125	NC_021882	AATCT	2	10	167965	167974	40 %	40 %	0 %	20 %	526466603
126	NC_021882	TTTTC	2	10	168728	168737	0 %	80 %	0 %	20 %	526466603
127	NC_021882	AATCA	2	10	169182	169191	60 %	20 %	0 %	20 %	526466604
128	NC_021882	CTTCG	2	10	170569	170578	0 %	40 %	20 %	40 %	526466605
129	NC_021882	GTTTT	2	10	173320	173329	0 %	80 %	20 %	0 %	526466610
130	NC_021882	GTTTT	2	10	174182	174191	0 %	80 %	20 %	0 %	526466611
131	NC_021882	ACAAA	2	10	174495	174504	80 %	0 %	0 %	20 %	526466612
132	NC_021882	ATCAA	2	10	182134	182143	60 %	20 %	0 %	20 %	526466621
133	NC_021882	GTCAA	2	10	184734	184743	40 %	20 %	20 %	20 %	526466622
134	NC_021882	CATAT	2	10	186671	186680	40 %	40 %	0 %	20 %	526465482
135	NC_021882	CTTAT	2	10	192283	192292	20 %	60 %	0 %	20 %	526465489
136	NC_021882	GGCGT	2	10	193093	193102	0 %	20 %	60 %	20 %	526465489
137	NC_021882	CCACC	2	10	196031	196040	20 %	0 %	0 %	80 %	526465490
138	NC_021882	GCCTA	2	10	196527	196536	20 %	20 %	20 %	40 %	526465490
139	NC_021882	CACTT	2	10	196670	196679	20 %	40 %	0 %	40 %	526465491
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141	NC_021882	TGCCT	2	10	199835	199844	0 %	40 %	20 %	40 %	526465493
142	NC_021882	ATTTC	2	10	200487	200496	20 %	60 %	0 %	20 %	526466625
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147	NC_021882	TATCG	2	10	207850	207859	20 %	40 %	20 %	20 %	526465498
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149	NC_021882	GATTT	2	10	210712	210721	20 %	60 %	20 %	0 %	526465500
150	NC_021882	GACAG	2	10	211626	211635	40 %	0 %	40 %	20 %	526465502
151	NC_021882	AGCGT	2	10	212195	212204	20 %	20 %	40 %	20 %	526465502
152	NC_021882	ATTGA	2	10	216218	216227	40 %	40 %	20 %	0 %	526465503
153	NC_021882	ATTTT	2	10	219725	219734	20 %	80 %	0 %	0 %	526465507
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156	NC_021882	AATTC	2	10	223051	223060	40 %	40 %	0 %	20 %	526465509
157	NC_021882	ATCAA	2	10	223417	223426	60 %	20 %	0 %	20 %	526465510
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159	NC_021882	GCCCA	2	10	230057	230066	20 %	0 %	20 %	60 %	526465517
160	NC_021882	ACAAT	2	10	230112	230121	60 %	20 %	0 %	20 %	526465517
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168	NC_021882	GGGGT	2	10	245571	245580	0 %	20 %	80 %	0 %	526465529
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172	NC_021882	TGGTA	2	10	251321	251330	20 %	40 %	40 %	0 %	526465533
173	NC_021882	TGGTT	2	10	251368	251377	0 %	60 %	40 %	0 %	526465533
174	NC_021882	TTAAT	2	10	252118	252127	40 %	60 %	0 %	0 %	526465534
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182	NC_021882	AATTG	2	10	261055	261064	40 %	40 %	20 %	0 %	526466636
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198	NC_021882	TGATT	2	10	286164	286173	20 %	60 %	20 %	0 %	526465563
199	NC_021882	CCATC	2	10	287007	287016	20 %	20 %	0 %	60 %	526465564
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211	NC_021882	GATTT	2	10	302525	302534	20 %	60 %	20 %	0 %	526465580
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214	NC_021882	TCTTA	2	10	304366	304375	20 %	60 %	0 %	20 %	526466644
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231	NC_021882	CCTTT	2	10	323587	323596	0 %	60 %	0 %	40 %	526465594
232	NC_021882	GCTTT	2	10	323715	323724	0 %	60 %	20 %	20 %	526465594
233	NC_021882	CTTTT	2	10	328207	328216	0 %	80 %	0 %	20 %	526465600
234	NC_021882	TCTAA	2	10	330332	330341	40 %	40 %	0 %	20 %	526465601
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237	NC_021882	AAACA	2	10	334130	334139	80 %	0 %	0 %	20 %	526465607
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239	NC_021882	CGCCA	2	10	335807	335816	20 %	0 %	20 %	60 %	526465608
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243	NC_021882	TCTTT	2	10	344940	344949	0 %	80 %	0 %	20 %	526466652
244	NC_021882	GTTCT	2	10	345508	345517	0 %	60 %	20 %	20 %	526466652
245	NC_021882	CAATA	2	10	348189	348198	60 %	20 %	0 %	20 %	526465616
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248	NC_021882	ATCCA	2	10	350501	350510	40 %	20 %	0 %	40 %	526465617
249	NC_021882	ACGAC	2	10	352140	352149	40 %	0 %	20 %	40 %	526465618
250	NC_021882	TATTT	2	10	352545	352554	20 %	80 %	0 %	0 %	526466653
251	NC_021882	CATTC	2	10	354603	354612	20 %	40 %	0 %	40 %	526466655
252	NC_021882	TTAAA	2	10	355574	355583	60 %	40 %	0 %	0 %	526466656
253	NC_021882	CTTTT	2	10	356576	356585	0 %	80 %	0 %	20 %	526465620
254	NC_021882	TTTTC	2	10	357299	357308	0 %	80 %	0 %	20 %	526465620
255	NC_021882	TTTGA	2	10	358461	358470	20 %	60 %	20 %	0 %	526465621
256	NC_021882	ATTTT	2	10	359297	359306	20 %	80 %	0 %	0 %	526466657
257	NC_021882	AAAGC	2	10	360634	360643	60 %	0 %	20 %	20 %	526465622
258	NC_021882	ATGGC	2	10	361330	361339	20 %	20 %	40 %	20 %	526465622
259	NC_021882	TTTTA	2	10	362901	362910	20 %	80 %	0 %	0 %	526465623
260	NC_021882	TTTTA	2	10	366155	366164	20 %	80 %	0 %	0 %	526466658
261	NC_021882	TTTTG	2	10	366658	366667	0 %	80 %	20 %	0 %	526465625
262	NC_021882	TTTTA	2	10	367516	367525	20 %	80 %	0 %	0 %	526465625
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383	NC_021882	ATGTT	2	10	515826	515835	20 %	60 %	20 %	0 %	526465757
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