MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 1305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021521	GTTAA	2	10	4911	4920	40 %	40 %	20 %	0 %	514058765
2	NC_021521	GCAAA	2	10	5754	5763	60 %	0 %	20 %	20 %	514058766
3	NC_021521	TGCCG	2	10	5892	5901	0 %	20 %	40 %	40 %	514058766
4	NC_021521	GAAAA	2	10	7213	7222	80 %	0 %	20 %	0 %	514058767
5	NC_021521	ATCAA	2	10	7803	7812	60 %	20 %	0 %	20 %	514058769
6	NC_021521	TCTAA	2	10	7813	7822	40 %	40 %	0 %	20 %	514058769
7	NC_021521	GGAAT	2	10	9923	9932	40 %	20 %	40 %	0 %	514058770
8	NC_021521	GCGTG	2	10	10565	10574	0 %	20 %	60 %	20 %	514058770
9	NC_021521	GAAAA	2	10	13201	13210	80 %	0 %	20 %	0 %	514058771
10	NC_021521	GGCGT	2	10	13431	13440	0 %	20 %	60 %	20 %	514058772
11	NC_021521	CAAAC	2	10	14447	14456	60 %	0 %	0 %	40 %	514058772
12	NC_021521	TGAAT	2	10	17115	17124	40 %	40 %	20 %	0 %	514058774
13	NC_021521	TAATC	2	10	19682	19691	40 %	40 %	0 %	20 %	514058776
14	NC_021521	TCAAC	2	10	33417	33426	40 %	20 %	0 %	40 %	514058794
15	NC_021521	AGTTC	2	10	33654	33663	20 %	40 %	20 %	20 %	514058794
16	NC_021521	TGTGA	2	10	34669	34678	20 %	40 %	40 %	0 %	514058795
17	NC_021521	TTGCG	2	10	34722	34731	0 %	40 %	40 %	20 %	514058795
18	NC_021521	TTGAG	2	10	35903	35912	20 %	40 %	40 %	0 %	514058796
19	NC_021521	TTCGC	2	10	36474	36483	0 %	40 %	20 %	40 %	514058797
20	NC_021521	ACGGT	2	10	37162	37171	20 %	20 %	40 %	20 %	514058797
21	NC_021521	TGCAT	2	10	37260	37269	20 %	40 %	20 %	20 %	514058797
22	NC_021521	ATTAC	2	10	38323	38332	40 %	40 %	0 %	20 %	514058798
23	NC_021521	GATTA	2	10	42346	42355	40 %	40 %	20 %	0 %	514058803
24	NC_021521	ATTGC	2	10	44251	44260	20 %	40 %	20 %	20 %	514058806
25	NC_021521	AACGC	2	10	47331	47340	40 %	0 %	20 %	40 %	514058809
26	NC_021521	TTGGG	2	10	48533	48542	0 %	40 %	60 %	0 %	514058810
27	NC_021521	AATTT	2	10	51696	51705	40 %	60 %	0 %	0 %	514058811
28	NC_021521	CAAAC	2	10	51854	51863	60 %	0 %	0 %	40 %	514058811
29	NC_021521	AATGC	2	10	57456	57465	40 %	20 %	20 %	20 %	514058815
30	NC_021521	TGAGA	2	10	62422	62431	40 %	20 %	40 %	0 %	514058818
31	NC_021521	TTCAT	2	10	64353	64362	20 %	60 %	0 %	20 %	514058821
32	NC_021521	TTTTA	2	10	67383	67392	20 %	80 %	0 %	0 %	514058823
33	NC_021521	TAAAA	2	10	69974	69983	80 %	20 %	0 %	0 %	514058824
34	NC_021521	TAATA	2	10	71749	71758	60 %	40 %	0 %	0 %	514058827
35	NC_021521	CAATT	2	10	73469	73478	40 %	40 %	0 %	20 %	514058828
36	NC_021521	TGATT	2	10	74633	74642	20 %	60 %	20 %	0 %	514058830
37	NC_021521	CTTAT	2	10	78421	78430	20 %	60 %	0 %	20 %	514058833
38	NC_021521	GCATT	2	10	79913	79922	20 %	40 %	20 %	20 %	514058834
39	NC_021521	CTCGG	2	10	80150	80159	0 %	20 %	40 %	40 %	514058834
40	NC_021521	CATTA	2	10	81470	81479	40 %	40 %	0 %	20 %	514058835
41	NC_021521	AAAAC	2	10	82893	82902	80 %	0 %	0 %	20 %	514058836
42	NC_021521	GTTGC	2	10	85089	85098	0 %	40 %	40 %	20 %	514058838
43	NC_021521	GTGAA	2	10	85448	85457	40 %	20 %	40 %	0 %	514058838
44	NC_021521	TGTTT	2	10	86526	86535	0 %	80 %	20 %	0 %	514058839
45	NC_021521	TTTCC	2	10	89118	89127	0 %	60 %	0 %	40 %	514058841
46	NC_021521	GCAGA	2	10	93046	93055	40 %	0 %	40 %	20 %	514058846
47	NC_021521	AAAGT	2	10	97275	97284	60 %	20 %	20 %	0 %	514058851
48	NC_021521	GTTTG	2	10	97741	97750	0 %	60 %	40 %	0 %	514058851
49	NC_021521	CACGG	2	10	99775	99784	20 %	0 %	40 %	40 %	514058854
50	NC_021521	ACGTT	2	10	100359	100368	20 %	40 %	20 %	20 %	514058854
51	NC_021521	GTGAA	2	10	100489	100498	40 %	20 %	40 %	0 %	514058854
52	NC_021521	CAATA	2	10	100770	100779	60 %	20 %	0 %	20 %	514058855
53	NC_021521	ATGTT	2	10	104458	104467	20 %	60 %	20 %	0 %	514058859
54	NC_021521	CTGCT	2	10	109569	109578	0 %	40 %	20 %	40 %	514058864
55	NC_021521	AGTAA	2	10	111210	111219	60 %	20 %	20 %	0 %	514058865
56	NC_021521	AAAAG	2	10	111500	111509	80 %	0 %	20 %	0 %	514058865
57	NC_021521	TTTCC	2	10	116617	116626	0 %	60 %	0 %	40 %	514058869
58	NC_021521	TCCAT	2	10	117672	117681	20 %	40 %	0 %	40 %	514058870
59	NC_021521	ACCGC	2	10	118771	118780	20 %	0 %	20 %	60 %	514058871
60	NC_021521	AATAA	2	10	119441	119450	80 %	20 %	0 %	0 %	514058872
61	NC_021521	GCACG	2	10	119967	119976	20 %	0 %	40 %	40 %	514058873
62	NC_021521	CTAAA	2	10	123083	123092	60 %	20 %	0 %	20 %	514058877
63	NC_021521	ATTGC	2	10	123449	123458	20 %	40 %	20 %	20 %	514058877
64	NC_021521	AAAAT	2	10	124526	124535	80 %	20 %	0 %	0 %	514058878
65	NC_021521	GGCTC	2	10	124976	124985	0 %	20 %	40 %	40 %	514058879
66	NC_021521	TCTGT	2	10	126061	126070	0 %	60 %	20 %	20 %	514058879
67	NC_021521	CTCAA	2	10	127586	127595	40 %	20 %	0 %	40 %	514058880
68	NC_021521	GACCA	2	10	128790	128799	40 %	0 %	20 %	40 %	514058881
69	NC_021521	TTTCC	2	10	130047	130056	0 %	60 %	0 %	40 %	514058882
70	NC_021521	GTGGC	2	10	132061	132070	0 %	20 %	60 %	20 %	514058884
71	NC_021521	GTGAT	2	10	134363	134372	20 %	40 %	40 %	0 %	514058885
72	NC_021521	CAGAT	2	10	139889	139898	40 %	20 %	20 %	20 %	514058889
73	NC_021521	ATTTG	2	10	140577	140586	20 %	60 %	20 %	0 %	514058889
74	NC_021521	TTAAG	2	10	144446	144455	40 %	40 %	20 %	0 %	514058892
75	NC_021521	AAGGC	2	10	145147	145156	40 %	0 %	40 %	20 %	514058893
76	NC_021521	AGCCA	2	10	148438	148447	40 %	0 %	20 %	40 %	514058897
77	NC_021521	TACCT	2	10	149324	149333	20 %	40 %	0 %	40 %	514058899
78	NC_021521	AAATC	2	10	149957	149966	60 %	20 %	0 %	20 %	514058900
79	NC_021521	GCAAG	2	10	150595	150604	40 %	0 %	40 %	20 %	514058901
80	NC_021521	AAATT	2	10	151776	151785	60 %	40 %	0 %	0 %	514058902
81	NC_021521	AACTC	2	10	155595	155604	40 %	20 %	0 %	40 %	514058904
82	NC_021521	AGCCA	2	10	157128	157137	40 %	0 %	20 %	40 %	514058905
83	NC_021521	TGCAT	2	10	158850	158859	20 %	40 %	20 %	20 %	514058907
84	NC_021521	TAAAT	2	10	159609	159618	60 %	40 %	0 %	0 %	514058907
85	NC_021521	CGGTT	2	10	160249	160258	0 %	40 %	40 %	20 %	514058908
86	NC_021521	AAATT	2	10	162758	162767	60 %	40 %	0 %	0 %	514058911
87	NC_021521	CACCG	2	10	163393	163402	20 %	0 %	20 %	60 %	514058911
88	NC_021521	GTTGG	2	10	166221	166230	0 %	40 %	60 %	0 %	514058914
89	NC_021521	GAACC	2	10	166984	166993	40 %	0 %	20 %	40 %	514058915
90	NC_021521	ACGAA	2	10	168317	168326	60 %	0 %	20 %	20 %	514058916
91	NC_021521	CCATT	2	10	168663	168672	20 %	40 %	0 %	40 %	514058916
92	NC_021521	GGTTT	2	10	168822	168831	0 %	60 %	40 %	0 %	514058916
93	NC_021521	TAAAG	2	10	170294	170303	60 %	20 %	20 %	0 %	514058918
94	NC_021521	ACGAA	2	10	171564	171573	60 %	0 %	20 %	20 %	514058919
95	NC_021521	CCATT	2	10	171671	171680	20 %	40 %	0 %	40 %	514058920
96	NC_021521	TAATT	2	10	173669	173678	40 %	60 %	0 %	0 %	514058923
97	NC_021521	TGTAA	2	10	175892	175901	40 %	40 %	20 %	0 %	514058924
98	NC_021521	ATACG	2	10	177299	177308	40 %	20 %	20 %	20 %	514058925
99	NC_021521	TGCTC	2	10	178715	178724	0 %	40 %	20 %	40 %	514058927
100	NC_021521	ATTTT	2	10	179475	179484	20 %	80 %	0 %	0 %	514058927
101	NC_021521	GCTTT	2	10	182548	182557	0 %	60 %	20 %	20 %	514058930
102	NC_021521	GGCAA	2	10	183151	183160	40 %	0 %	40 %	20 %	514058930
103	NC_021521	TTTTA	2	10	184237	184246	20 %	80 %	0 %	0 %	514058931
104	NC_021521	GGCTT	2	10	185503	185512	0 %	40 %	40 %	20 %	514058933
105	NC_021521	TTTTC	2	10	187628	187637	0 %	80 %	0 %	20 %	514058935
106	NC_021521	TGCCG	2	10	187734	187743	0 %	20 %	40 %	40 %	514058935
107	NC_021521	AAGAA	2	10	190695	190704	80 %	0 %	20 %	0 %	514058936
108	NC_021521	AAATC	2	10	193176	193185	60 %	20 %	0 %	20 %	514058938
109	NC_021521	GCGAA	2	10	194572	194581	40 %	0 %	40 %	20 %	514058939
110	NC_021521	CAAAC	2	10	196452	196461	60 %	0 %	0 %	40 %	514058940
111	NC_021521	GATGT	2	10	197299	197308	20 %	40 %	40 %	0 %	514058941
112	NC_021521	GGAAA	2	10	200016	200025	60 %	0 %	40 %	0 %	514058943
113	NC_021521	ATTAA	2	10	201807	201816	60 %	40 %	0 %	0 %	514058946
114	NC_021521	AAAGA	2	10	202172	202181	80 %	0 %	20 %	0 %	514058946
115	NC_021521	AAATC	2	10	204117	204126	60 %	20 %	0 %	20 %	514058949
116	NC_021521	AATTA	2	10	205113	205122	60 %	40 %	0 %	0 %	514058950
117	NC_021521	TTTTC	2	10	207217	207226	0 %	80 %	0 %	20 %	514058951
118	NC_021521	TAACT	2	10	210794	210803	40 %	40 %	0 %	20 %	514058957
119	NC_021521	GCTTG	2	10	213943	213952	0 %	40 %	40 %	20 %	514058963
120	NC_021521	CTGCT	2	10	215980	215989	0 %	40 %	20 %	40 %	514058966
121	NC_021521	AAAAT	2	10	219017	219026	80 %	20 %	0 %	0 %	514058971
122	NC_021521	AGCAT	2	10	219785	219794	40 %	20 %	20 %	20 %	514058972
123	NC_021521	TAATG	2	10	221506	221515	40 %	40 %	20 %	0 %	514058975
124	NC_021521	GATTT	2	10	225101	225110	20 %	60 %	20 %	0 %	514058980
125	NC_021521	TGAAG	2	10	226268	226277	40 %	20 %	40 %	0 %	514058981
126	NC_021521	AAACC	2	10	228053	228062	60 %	0 %	0 %	40 %	514058984
127	NC_021521	AATGG	2	10	228212	228221	40 %	20 %	40 %	0 %	514058984
128	NC_021521	TTCGT	2	10	228558	228567	0 %	60 %	20 %	20 %	514058984
129	NC_021521	AAGTA	2	10	233944	233953	60 %	20 %	20 %	0 %	514058989
130	NC_021521	TTGAA	2	10	235613	235622	40 %	40 %	20 %	0 %	514058991
131	NC_021521	AAGAT	2	10	237378	237387	60 %	20 %	20 %	0 %	514058993
132	NC_021521	TTGCA	2	10	241017	241026	20 %	40 %	20 %	20 %	514058997
133	NC_021521	TGTAA	2	10	241061	241070	40 %	40 %	20 %	0 %	514058997
134	NC_021521	AATGG	2	10	241402	241411	40 %	20 %	40 %	0 %	514058997
135	NC_021521	TAAGG	2	10	242283	242292	40 %	20 %	40 %	0 %	514058998
136	NC_021521	GGTTT	2	10	243822	243831	0 %	60 %	40 %	0 %	514059000
137	NC_021521	TCGAC	2	10	244038	244047	20 %	20 %	20 %	40 %	514059000
138	NC_021521	CATTT	2	10	248290	248299	20 %	60 %	0 %	20 %	514059005
139	NC_021521	TGGAA	2	10	249357	249366	40 %	20 %	40 %	0 %	514059006
140	NC_021521	GCAAT	2	10	249644	249653	40 %	20 %	20 %	20 %	514059007
141	NC_021521	AAGCA	2	10	253544	253553	60 %	0 %	20 %	20 %	514059010
142	NC_021521	TTATC	2	10	253813	253822	20 %	60 %	0 %	20 %	514059010
143	NC_021521	ACCTT	2	10	253913	253922	20 %	40 %	0 %	40 %	514059010
144	NC_021521	AAAAT	2	10	256055	256064	80 %	20 %	0 %	0 %	514059013
145	NC_021521	GCGAT	2	10	257065	257074	20 %	20 %	40 %	20 %	514059015
146	NC_021521	TGCAA	2	10	257238	257247	40 %	20 %	20 %	20 %	514059015
147	NC_021521	GATTT	2	10	257665	257674	20 %	60 %	20 %	0 %	514059016
148	NC_021521	ACGCC	2	10	265097	265106	20 %	0 %	20 %	60 %	514059023
149	NC_021521	TTATT	2	10	267018	267027	20 %	80 %	0 %	0 %	514059027
150	NC_021521	AATGT	2	10	267995	268004	40 %	40 %	20 %	0 %	514059028
151	NC_021521	GGTAC	2	10	271925	271934	20 %	20 %	40 %	20 %	514059031
152	NC_021521	GTTTG	2	10	273797	273806	0 %	60 %	40 %	0 %	514059033
153	NC_021521	CAACA	2	10	274188	274197	60 %	0 %	0 %	40 %	514059033
154	NC_021521	GATTT	2	10	274278	274287	20 %	60 %	20 %	0 %	514059033
155	NC_021521	TTTAC	2	10	274453	274462	20 %	60 %	0 %	20 %	514059033
156	NC_021521	GGAAA	2	10	274835	274844	60 %	0 %	40 %	0 %	514059033
157	NC_021521	AATGA	2	10	277927	277936	60 %	20 %	20 %	0 %	514059035
158	NC_021521	GGGTT	2	10	279605	279614	0 %	40 %	60 %	0 %	514059037
159	NC_021521	TCAAT	2	10	280413	280422	40 %	40 %	0 %	20 %	514059037
160	NC_021521	GATAG	2	10	284076	284085	40 %	20 %	40 %	0 %	514059042
161	NC_021521	ATGTG	2	10	285476	285485	20 %	40 %	40 %	0 %	514059043
162	NC_021521	AAGGT	2	10	285982	285991	40 %	20 %	40 %	0 %	514059044
163	NC_021521	CTTAC	2	10	286424	286433	20 %	40 %	0 %	40 %	514059045
164	NC_021521	TGGCT	2	10	288973	288982	0 %	40 %	40 %	20 %	514059048
165	NC_021521	GGCTT	2	10	289490	289499	0 %	40 %	40 %	20 %	514059048
166	NC_021521	ATTTT	2	10	292802	292811	20 %	80 %	0 %	0 %	514059051
167	NC_021521	TTCAC	2	10	293360	293369	20 %	40 %	0 %	40 %	514059051
168	NC_021521	CAAAG	2	10	295986	295995	60 %	0 %	20 %	20 %	514059056
169	NC_021521	GCTTT	2	10	297927	297936	0 %	60 %	20 %	20 %	514059057
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172	NC_021521	TTTGA	2	10	300899	300908	20 %	60 %	20 %	0 %	514059060
173	NC_021521	ATCTG	2	10	302377	302386	20 %	40 %	20 %	20 %	514059061
174	NC_021521	TCGTA	2	10	302422	302431	20 %	40 %	20 %	20 %	514059061
175	NC_021521	GTAAT	2	10	303567	303576	40 %	40 %	20 %	0 %	514059062
176	NC_021521	GAAAA	2	10	305224	305233	80 %	0 %	20 %	0 %	514059064
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178	NC_021521	GCTTG	2	10	307856	307865	0 %	40 %	40 %	20 %	514059068
179	NC_021521	TTCTT	2	10	309857	309866	0 %	80 %	0 %	20 %	514059071
180	NC_021521	GAAGC	2	10	309952	309961	40 %	0 %	40 %	20 %	514059071
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182	NC_021521	TGATG	2	10	311185	311194	20 %	40 %	40 %	0 %	514059073
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185	NC_021521	TGAAA	2	10	315072	315081	60 %	20 %	20 %	0 %	514059076
186	NC_021521	GCTCA	2	10	316070	316079	20 %	20 %	20 %	40 %	514059077
187	NC_021521	CATTA	2	10	316112	316121	40 %	40 %	0 %	20 %	514059077
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190	NC_021521	TCGGT	2	10	319490	319499	0 %	40 %	40 %	20 %	514059080
191	NC_021521	ACGGC	2	10	326854	326863	20 %	0 %	40 %	40 %	514059087
192	NC_021521	GAAAA	2	10	327325	327334	80 %	0 %	20 %	0 %	514059088
193	NC_021521	ATTTT	2	10	327704	327713	20 %	80 %	0 %	0 %	514059088
194	NC_021521	TGATT	2	10	329458	329467	20 %	60 %	20 %	0 %	514059090
195	NC_021521	GGATA	2	10	331003	331012	40 %	20 %	40 %	0 %	514059094
196	NC_021521	GGATT	2	10	338203	338212	20 %	40 %	40 %	0 %	514059103
197	NC_021521	TCTTA	2	10	339038	339047	20 %	60 %	0 %	20 %	514059104
198	NC_021521	CTTTT	2	10	346898	346907	0 %	80 %	0 %	20 %	514059108
199	NC_021521	CTGTT	2	10	348714	348723	0 %	60 %	20 %	20 %	514059109
200	NC_021521	TGCCT	2	10	352455	352464	0 %	40 %	20 %	40 %	514059112
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202	NC_021521	GGCAC	2	10	361601	361610	20 %	0 %	40 %	40 %	514059122
203	NC_021521	ATTTT	2	10	363285	363294	20 %	80 %	0 %	0 %	514059123
204	NC_021521	TTCGT	2	10	366870	366879	0 %	60 %	20 %	20 %	514059127
205	NC_021521	TATTT	2	10	366972	366981	20 %	80 %	0 %	0 %	514059127
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209	NC_021521	TTCGT	2	10	374588	374597	0 %	60 %	20 %	20 %	514059136
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213	NC_021521	ATTGT	2	10	381655	381664	20 %	60 %	20 %	0 %	514059143
214	NC_021521	ATTGC	2	10	388615	388624	20 %	40 %	20 %	20 %	514059146
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228	NC_021521	TTGCA	2	10	405218	405227	20 %	40 %	20 %	20 %	514059163
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230	NC_021521	GAATG	2	10	409526	409535	40 %	20 %	40 %	0 %	514059166
231	NC_021521	GCTGG	2	10	411288	411297	0 %	20 %	60 %	20 %	514059168
232	NC_021521	TGCCT	2	10	411652	411661	0 %	40 %	20 %	40 %	514059168
233	NC_021521	GTGAT	2	10	415129	415138	20 %	40 %	40 %	0 %	514059172
234	NC_021521	GAAGA	2	10	416589	416598	60 %	0 %	40 %	0 %	514059174
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236	NC_021521	AAAAC	2	10	431040	431049	80 %	0 %	0 %	20 %	514059177
237	NC_021521	TTTTA	2	10	431596	431605	20 %	80 %	0 %	0 %	514059178
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241	NC_021521	GAAAA	2	10	451804	451813	80 %	0 %	20 %	0 %	514059191
242	NC_021521	GATGT	2	10	453925	453934	20 %	40 %	40 %	0 %	514059192
243	NC_021521	GTGAT	2	10	454424	454433	20 %	40 %	40 %	0 %	514059192
244	NC_021521	AGCCC	2	10	455959	455968	20 %	0 %	20 %	60 %	514059193
245	NC_021521	TTCCA	2	10	456311	456320	20 %	40 %	0 %	40 %	514059194
246	NC_021521	ATTGC	2	10	457077	457086	20 %	40 %	20 %	20 %	514059194
247	NC_021521	TTCTT	2	10	461472	461481	0 %	80 %	0 %	20 %	514059198
248	NC_021521	TAAGG	2	10	462851	462860	40 %	20 %	40 %	0 %	514059200
249	NC_021521	TTCAT	2	10	464111	464120	20 %	60 %	0 %	20 %	514059201
250	NC_021521	AAATA	2	10	464861	464870	80 %	20 %	0 %	0 %	514059202
251	NC_021521	AACGC	2	10	467725	467734	40 %	0 %	20 %	40 %	514059205
252	NC_021521	GCTTT	2	10	473700	473709	0 %	60 %	20 %	20 %	514059210
253	NC_021521	GTTGA	2	10	473801	473810	20 %	40 %	40 %	0 %	514059210
254	NC_021521	AAGGC	2	10	474175	474184	40 %	0 %	40 %	20 %	514059211
255	NC_021521	ATTGC	2	10	475939	475948	20 %	40 %	20 %	20 %	514059213
256	NC_021521	ATTTA	2	10	476420	476429	40 %	60 %	0 %	0 %	514059213
257	NC_021521	GGACG	2	10	477968	477977	20 %	0 %	60 %	20 %	514059214
258	NC_021521	CGCAC	2	10	479949	479958	20 %	0 %	20 %	60 %	514059216
259	NC_021521	TTATT	2	10	481451	481460	20 %	80 %	0 %	0 %	514059218
260	NC_021521	AATCT	2	10	485038	485047	40 %	40 %	0 %	20 %	514059222
261	NC_021521	TTTGC	2	10	487421	487430	0 %	60 %	20 %	20 %	514059225
262	NC_021521	TTGCC	2	10	488058	488067	0 %	40 %	20 %	40 %	514059226
263	NC_021521	GAATG	2	10	488723	488732	40 %	20 %	40 %	0 %	514059226
264	NC_021521	GAGCC	2	10	489565	489574	20 %	0 %	40 %	40 %	514059227
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