MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 23727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021521	TTG	2	6	665	670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058763
2	NC_021521	GAC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058763
3	NC_021521	TGT	2	6	907	912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058763
4	NC_021521	TTG	2	6	928	933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058763
5	NC_021521	AAT	2	6	2286	2291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058764
6	NC_021521	ATT	2	6	2378	2383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058764
7	NC_021521	AAG	2	6	2440	2445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058764
8	NC_021521	ATG	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058764
9	NC_021521	TGT	2	6	2645	2650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058764
10	NC_021521	ATT	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058764
11	NC_021521	TGT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058764
12	NC_021521	TCA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058764
13	NC_021521	ATG	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058764
14	NC_021521	CTA	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058764
15	NC_021521	TTG	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058764
16	NC_021521	ATT	2	6	3171	3176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058764
17	NC_021521	TTG	2	6	3205	3210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058764
18	NC_021521	CAG	2	6	3217	3222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058764
19	NC_021521	GGT	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058765
20	NC_021521	AGT	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058765
21	NC_021521	TTC	2	6	4229	4234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058765
22	NC_021521	CAT	2	6	4277	4282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058765
23	NC_021521	TGA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058765
24	NC_021521	TGA	2	6	4303	4308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058765
25	NC_021521	GTC	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058765
26	NC_021521	TTC	2	6	4355	4360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058765
27	NC_021521	CAT	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058765
28	NC_021521	TTC	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058765
29	NC_021521	TCA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058765
30	NC_021521	CAA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058765
31	NC_021521	GTT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058765
32	NC_021521	CAC	2	6	5089	5094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058765
33	NC_021521	AAG	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058765
34	NC_021521	ATA	2	6	5226	5231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058765
35	NC_021521	CGG	2	6	5801	5806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058766
36	NC_021521	TTA	2	6	5838	5843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058766
37	NC_021521	GAA	2	6	5911	5916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058766
38	NC_021521	TGA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058766
39	NC_021521	TTA	2	6	6340	6345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058766
40	NC_021521	TGA	2	6	6455	6460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058766
41	NC_021521	GCA	2	6	6533	6538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058766
42	NC_021521	GAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058766
43	NC_021521	AAC	2	6	6704	6709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058766
44	NC_021521	TTG	2	6	6844	6849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058767
45	NC_021521	TTA	2	6	6978	6983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058767
46	NC_021521	CCG	2	6	7026	7031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514058767
47	NC_021521	ATT	2	6	7127	7132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058767
48	NC_021521	TGA	2	6	7163	7168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058767
49	NC_021521	AAG	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058767
50	NC_021521	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058767
51	NC_021521	GAT	2	6	7652	7657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058768
52	NC_021521	AAC	2	6	7669	7674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058768
53	NC_021521	ACT	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058769
54	NC_021521	TGT	2	6	7998	8003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058769
55	NC_021521	ACA	2	6	8136	8141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058769
56	NC_021521	CAC	2	6	8241	8246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058769
57	NC_021521	TGG	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058769
58	NC_021521	GAT	2	6	8329	8334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058769
59	NC_021521	GAC	2	6	8751	8756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058770
60	NC_021521	ATT	2	6	8875	8880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
61	NC_021521	TGT	2	6	8956	8961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058770
62	NC_021521	CAG	2	6	9024	9029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058770
63	NC_021521	AAG	2	6	9058	9063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058770
64	NC_021521	ATT	2	6	9175	9180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
65	NC_021521	AGA	2	6	9260	9265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058770
66	NC_021521	ATT	2	6	9372	9377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
67	NC_021521	TAA	2	6	9440	9445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058770
68	NC_021521	TGG	2	6	9454	9459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058770
69	NC_021521	TTA	2	6	9495	9500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
70	NC_021521	GGC	2	6	9570	9575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058770
71	NC_021521	TAA	2	6	9632	9637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058770
72	NC_021521	AGA	2	6	9659	9664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058770
73	NC_021521	TGA	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058770
74	NC_021521	CAC	2	6	9713	9718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058770
75	NC_021521	GTT	2	6	9749	9754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058770
76	NC_021521	ATT	2	6	9757	9762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
77	NC_021521	TGA	2	6	9833	9838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058770
78	NC_021521	TGT	2	6	9868	9873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058770
79	NC_021521	CAA	2	6	9882	9887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058770
80	NC_021521	AAC	2	6	9901	9906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058770
81	NC_021521	TAA	2	6	9980	9985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058770
82	NC_021521	AGA	2	6	9992	9997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058770
83	NC_021521	AAT	2	6	10125	10130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058770
84	NC_021521	ATT	2	6	10548	10553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058770
85	NC_021521	AGA	2	6	10811	10816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058770
86	NC_021521	CCA	2	6	10954	10959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058770
87	NC_021521	TGA	2	6	10997	11002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058770
88	NC_021521	GCG	2	6	11169	11174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058770
89	NC_021521	GCA	2	6	11207	11212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058770
90	NC_021521	AAC	2	6	11383	11388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058770
91	NC_021521	TGG	2	6	11447	11452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058770
92	NC_021521	TGC	2	6	11663	11668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058770
93	NC_021521	AAC	2	6	11936	11941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058770
94	NC_021521	GAT	2	6	12011	12016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058770
95	NC_021521	GTG	2	6	12026	12031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058770
96	NC_021521	AAG	2	6	12343	12348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058771
97	NC_021521	AAG	2	6	12445	12450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058771
98	NC_021521	ATT	2	6	12454	12459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058771
99	NC_021521	TAA	2	6	12554	12559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058771
100	NC_021521	AAG	2	6	12610	12615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058771
101	NC_021521	ATG	2	6	12640	12645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058771
102	NC_021521	TCA	3	9	12734	12742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058771
103	NC_021521	CAA	2	6	12869	12874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058771
104	NC_021521	CAA	2	6	12915	12920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058771
105	NC_021521	ATG	2	6	13008	13013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058771
106	NC_021521	GAT	2	6	13025	13030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058771
107	NC_021521	ATT	2	6	13064	13069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058771
108	NC_021521	AAT	2	6	13071	13076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058771
109	NC_021521	GAA	2	6	13158	13163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058771
110	NC_021521	TTG	2	6	13239	13244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058771
111	NC_021521	TTG	2	6	13526	13531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058772
112	NC_021521	ATT	2	6	13688	13693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058772
113	NC_021521	CGT	2	6	13750	13755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058772
114	NC_021521	TAA	2	6	13798	13803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058772
115	NC_021521	TAC	2	6	13848	13853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058772
116	NC_021521	TGA	2	6	13930	13935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
117	NC_021521	GAA	2	6	14093	14098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058772
118	NC_021521	ATT	2	6	14197	14202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058772
119	NC_021521	AAC	2	6	14271	14276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058772
120	NC_021521	TTA	2	6	14294	14299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058772
121	NC_021521	GAT	2	6	14357	14362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
122	NC_021521	ATG	3	9	14370	14378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
123	NC_021521	GAT	2	6	14393	14398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
124	NC_021521	GAT	2	6	14411	14416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
125	NC_021521	ATT	2	6	14549	14554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058772
126	NC_021521	GTG	2	6	14624	14629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058772
127	NC_021521	ATC	2	6	14646	14651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058772
128	NC_021521	TGA	2	6	14689	14694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
129	NC_021521	AAT	2	6	14696	14701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058772
130	NC_021521	AGC	3	9	14794	14802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058772
131	NC_021521	AAC	2	6	14874	14879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058772
132	NC_021521	TGG	2	6	14919	14924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058772
133	NC_021521	TGA	2	6	15022	15027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
134	NC_021521	GAA	2	6	15104	15109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058772
135	NC_021521	TGA	2	6	15124	15129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
136	NC_021521	TGA	2	6	15202	15207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
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138	NC_021521	TGA	2	6	15322	15327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058772
139	NC_021521	CAA	2	6	15350	15355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058772
140	NC_021521	CAA	2	6	15395	15400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058772
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142	NC_021521	AGA	2	6	15838	15843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058772
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146	NC_021521	AAC	2	6	16071	16076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058772
147	NC_021521	CTG	2	6	16277	16282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058773
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150	NC_021521	TCT	2	6	16447	16452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058773
151	NC_021521	AGT	2	6	16572	16577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058773
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154	NC_021521	ACT	2	6	16893	16898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058774
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157	NC_021521	TGG	2	6	17168	17173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058774
158	NC_021521	TGA	2	6	17190	17195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058774
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162	NC_021521	AAT	2	6	17973	17978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058775
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253	NC_021521	ATA	2	6	26104	26109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058783
254	NC_021521	GCG	2	6	26247	26252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058783
255	NC_021521	ATT	2	6	26358	26363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058783
256	NC_021521	AAT	2	6	26422	26427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058783
257	NC_021521	AAT	2	6	26433	26438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058783
258	NC_021521	AAT	2	6	26645	26650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058783
259	NC_021521	TCG	2	6	26678	26683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058783
260	NC_021521	CTT	2	6	26805	26810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058784
261	NC_021521	TCA	2	6	26868	26873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058784
262	NC_021521	TCT	2	6	26883	26888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058784
263	NC_021521	CTT	2	6	27003	27008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058784
264	NC_021521	AAT	2	6	27133	27138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058785
265	NC_021521	ATC	2	6	27567	27572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058785
266	NC_021521	CAT	2	6	27584	27589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058785
267	NC_021521	TGT	2	6	27855	27860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058785
268	NC_021521	TCA	2	6	27924	27929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058785
269	NC_021521	AAT	2	6	27950	27955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058785
270	NC_021521	CTG	2	6	28013	28018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058785
271	NC_021521	TTG	2	6	28061	28066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058785
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273	NC_021521	TCA	2	6	28569	28574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058786
274	NC_021521	TTC	2	6	28623	28628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058787
275	NC_021521	TTC	2	6	28641	28646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058787
276	NC_021521	ACT	2	6	28858	28863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058787
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280	NC_021521	CGA	2	6	29132	29137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058787
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282	NC_021521	TCA	2	6	29332	29337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058787
283	NC_021521	CAA	2	6	29345	29350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058787
284	NC_021521	CCA	2	6	29378	29383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058787
285	NC_021521	AAT	2	6	29505	29510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058787
286	NC_021521	CAC	2	6	29580	29585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058788
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288	NC_021521	AAG	2	6	29836	29841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058788
289	NC_021521	CGC	2	6	29847	29852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514058788
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342	NC_021521	CGG	2	6	35466	35471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058796
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344	NC_021521	ATT	2	6	35617	35622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058796
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