MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021521	CAA	2	6	225245	225250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058980
3502	NC_021521	A	6	6	225328	225333	100 %	0 %	0 %	0 %	514058980
3503	NC_021521	TCCG	2	8	225343	225350	0 %	25 %	25 %	50 %	514058980
3504	NC_021521	TGA	2	6	225379	225384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058980
3505	NC_021521	GGTA	2	8	226157	226164	25 %	25 %	50 %	0 %	514058981
3506	NC_021521	TGAAG	2	10	226268	226277	40 %	20 %	40 %	0 %	514058981
3507	NC_021521	GCG	2	6	226324	226329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058981
3508	NC_021521	AAG	2	6	226420	226425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058981
3509	NC_021521	G	6	6	226579	226584	0 %	0 %	100 %	0 %	514058981
3510	NC_021521	ATG	2	6	226589	226594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058981
3511	NC_021521	TCTTTT	2	12	226604	226615	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	514058982
3512	NC_021521	AATT	2	8	226620	226627	50 %	50 %	0 %	0 %	514058982
3513	NC_021521	TTG	2	6	226641	226646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058982
3514	NC_021521	AGT	2	6	226687	226692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058982
3515	NC_021521	TTA	2	6	226749	226754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058982
3516	NC_021521	CTTGGT	2	12	226822	226833	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	514058982
3517	NC_021521	CGGT	2	8	226860	226867	0 %	25 %	50 %	25 %	514058982
3518	NC_021521	GCTG	2	8	226889	226896	0 %	25 %	50 %	25 %	514058982
3519	NC_021521	AAC	2	6	226910	226915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058982
3520	NC_021521	AGT	2	6	226938	226943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058982
3521	NC_021521	AAATGC	2	12	227114	227125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514058983
3522	NC_021521	TGG	2	6	227128	227133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058983
3523	NC_021521	GAA	2	6	227249	227254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058983
3524	NC_021521	GA	3	6	227275	227280	50 %	0 %	50 %	0 %	514058983
3525	NC_021521	TCA	2	6	227386	227391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058983
3526	NC_021521	CCT	2	6	227579	227584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514058983
3527	NC_021521	ATT	2	6	227615	227620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058983
3528	NC_021521	TAT	2	6	227765	227770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058984
3529	NC_021521	AAC	2	6	227779	227784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058984
3530	NC_021521	AGA	2	6	227828	227833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058984
3531	NC_021521	TCAA	2	8	227836	227843	50 %	25 %	0 %	25 %	514058984
3532	NC_021521	GACC	2	8	227897	227904	25 %	0 %	25 %	50 %	514058984
3533	NC_021521	TGA	2	6	227981	227986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058984
3534	NC_021521	CGTGAC	2	12	228012	228023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	514058984
3535	NC_021521	AAACC	2	10	228053	228062	60 %	0 %	0 %	40 %	514058984
3536	NC_021521	ATT	2	6	228087	228092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058984
3537	NC_021521	ATG	2	6	228151	228156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058984
3538	NC_021521	AGC	2	6	228168	228173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058984
3539	NC_021521	AATGG	2	10	228212	228221	40 %	20 %	40 %	0 %	514058984
3540	NC_021521	CAA	2	6	228305	228310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058984
3541	NC_021521	TTG	2	6	228319	228324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058984
3542	NC_021521	TTCGT	2	10	228558	228567	0 %	60 %	20 %	20 %	514058984
3543	NC_021521	GGCA	2	8	228667	228674	25 %	0 %	50 %	25 %	514058984
3544	NC_021521	T	6	6	228729	228734	0 %	100 %	0 %	0 %	514058984
3545	NC_021521	TCG	2	6	228803	228808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058984
3546	NC_021521	A	6	6	228816	228821	100 %	0 %	0 %	0 %	514058984
3547	NC_021521	GAT	2	6	228840	228845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058984
3548	NC_021521	A	7	7	228887	228893	100 %	0 %	0 %	0 %	514058984
3549	NC_021521	TGAT	2	8	228940	228947	25 %	50 %	25 %	0 %	514058984
3550	NC_021521	AT	3	6	229138	229143	50 %	50 %	0 %	0 %	514058985
3551	NC_021521	TAA	2	6	229151	229156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058985
3552	NC_021521	GTC	2	6	229200	229205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058985
3553	NC_021521	TTTC	2	8	229208	229215	0 %	75 %	0 %	25 %	514058985
3554	NC_021521	TCA	3	9	229276	229284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058985
3555	NC_021521	CAA	2	6	229286	229291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058985
3556	NC_021521	CA	3	6	229302	229307	50 %	0 %	0 %	50 %	514058985
3557	NC_021521	AAT	2	6	229386	229391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058985
3558	NC_021521	TGC	2	6	229447	229452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058985
3559	NC_021521	TC	3	6	229453	229458	0 %	50 %	0 %	50 %	514058985
3560	NC_021521	GCA	2	6	229459	229464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058985
3561	NC_021521	TTTC	2	8	229478	229485	0 %	75 %	0 %	25 %	514058985
3562	NC_021521	ATT	2	6	229522	229527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058985
3563	NC_021521	A	6	6	229549	229554	100 %	0 %	0 %	0 %	514058985
3564	NC_021521	TTC	2	6	229560	229565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058985
3565	NC_021521	CAC	2	6	229580	229585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058985
3566	NC_021521	CAG	2	6	229801	229806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058986
3567	NC_021521	TC	3	6	229828	229833	0 %	50 %	0 %	50 %	514058986
3568	NC_021521	ATCA	2	8	229850	229857	50 %	25 %	0 %	25 %	514058986
3569	NC_021521	TTG	2	6	229891	229896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058986
3570	NC_021521	CATA	2	8	230129	230136	50 %	25 %	0 %	25 %	514058986
3571	NC_021521	CTCC	2	8	230233	230240	0 %	25 %	0 %	75 %	514058986
3572	NC_021521	AATC	2	8	230289	230296	50 %	25 %	0 %	25 %	514058986
3573	NC_021521	TAG	2	6	230351	230356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058986
3574	NC_021521	CTA	2	6	230426	230431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058986
3575	NC_021521	AAAC	2	8	230451	230458	75 %	0 %	0 %	25 %	514058986
3576	NC_021521	TTA	2	6	230515	230520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058986
3577	NC_021521	AG	3	6	230578	230583	50 %	0 %	50 %	0 %	514058986
3578	NC_021521	TAA	2	6	230833	230838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058987
3579	NC_021521	TTG	2	6	230999	231004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058987
3580	NC_021521	GCT	2	6	231069	231074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058987
3581	NC_021521	T	6	6	231104	231109	0 %	100 %	0 %	0 %	514058987
3582	NC_021521	CT	4	8	231136	231143	0 %	50 %	0 %	50 %	514058987
3583	NC_021521	AAG	2	6	231144	231149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058987
3584	NC_021521	CTT	2	6	231163	231168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058987
3585	NC_021521	TCT	2	6	231183	231188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058987
3586	NC_021521	CTAAAT	2	12	231211	231222	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514058987
3587	NC_021521	TCA	2	6	231285	231290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058987
3588	NC_021521	AGT	2	6	231303	231308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058987
3589	NC_021521	T	6	6	231323	231328	0 %	100 %	0 %	0 %	514058987
3590	NC_021521	GCT	2	6	231360	231365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058987
3591	NC_021521	AAG	2	6	231384	231389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058987
3592	NC_021521	CTT	2	6	231406	231411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058987
3593	NC_021521	CTT	2	6	231529	231534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058987
3594	NC_021521	TTG	2	6	231563	231568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058987
3595	NC_021521	TTAG	2	8	231621	231628	25 %	50 %	25 %	0 %	514058987
3596	NC_021521	CAA	2	6	231707	231712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058987
3597	NC_021521	ATA	2	6	231762	231767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058987
3598	NC_021521	AC	3	6	231769	231774	50 %	0 %	0 %	50 %	514058987
3599	NC_021521	TTC	2	6	231947	231952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058987
3600	NC_021521	T	6	6	232003	232008	0 %	100 %	0 %	0 %	514058987
3601	NC_021521	TCA	3	9	232137	232145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058987
3602	NC_021521	TCGCCT	2	12	232206	232217	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	514058987
3603	NC_021521	CTGC	2	8	232251	232258	0 %	25 %	25 %	50 %	514058987
3604	NC_021521	GAT	2	6	232408	232413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058987
3605	NC_021521	ATACCG	2	12	232434	232445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514058987
3606	NC_021521	TCA	2	6	232476	232481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058987
3607	NC_021521	CA	4	8	232493	232500	50 %	0 %	0 %	50 %	514058987
3608	NC_021521	CAG	2	6	232558	232563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058987
3609	NC_021521	TTA	2	6	232605	232610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058987
3610	NC_021521	AGTG	2	8	232617	232624	25 %	25 %	50 %	0 %	514058987
3611	NC_021521	AGT	2	6	232638	232643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058987
3612	NC_021521	TTC	2	6	232725	232730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058988
3613	NC_021521	TTGT	2	8	232778	232785	0 %	75 %	25 %	0 %	514058988
3614	NC_021521	GCAA	2	8	232803	232810	50 %	0 %	25 %	25 %	514058988
3615	NC_021521	GAA	2	6	232834	232839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058988
3616	NC_021521	A	6	6	232843	232848	100 %	0 %	0 %	0 %	514058988
3617	NC_021521	CTA	2	6	232856	232861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058988
3618	NC_021521	ATT	2	6	232892	232897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058988
3619	NC_021521	ATT	2	6	233021	233026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058989
3620	NC_021521	TCA	2	6	233063	233068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058989
3621	NC_021521	ATC	2	6	233088	233093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058989
3622	NC_021521	CACG	2	8	233135	233142	25 %	0 %	25 %	50 %	514058989
3623	NC_021521	GTG	2	6	233187	233192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058989
3624	NC_021521	CA	3	6	233301	233306	50 %	0 %	0 %	50 %	514058989
3625	NC_021521	TAATTG	2	12	233370	233381	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514058989
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3743	NC_021521	AAT	2	6	242147	242152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058998
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3874	NC_021521	AGAT	2	8	249315	249322	50 %	25 %	25 %	0 %	514059006
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3949	NC_021521	TTG	2	6	254164	254169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059011
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3987	NC_021521	AATA	2	8	256639	256646	75 %	25 %	0 %	0 %	514059014
3988	NC_021521	AAT	2	6	256668	256673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059014
3989	NC_021521	AAG	2	6	256728	256733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059015
3990	NC_021521	GAT	2	6	256736	256741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059015
3991	NC_021521	GAA	2	6	256742	256747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059015
3992	NC_021521	CAA	2	6	256864	256869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059015
3993	NC_021521	CAA	2	6	256912	256917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059015
3994	NC_021521	TAA	2	6	256981	256986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059015
3995	NC_021521	CAA	2	6	256993	256998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059015
3996	NC_021521	TAAGCA	2	12	257025	257036	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514059015
3997	NC_021521	GCGAT	2	10	257065	257074	20 %	20 %	40 %	20 %	514059015
3998	NC_021521	ATC	2	6	257124	257129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059015
3999	NC_021521	ACC	2	6	257181	257186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059015
4000	NC_021521	TGT	2	6	257201	257206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059015

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