MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021521	GGA	2	6	65483	65488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514058822
1002	NC_021521	TGT	2	6	65558	65563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058822
1003	NC_021521	TTA	2	6	65577	65582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058822
1004	NC_021521	TCT	2	6	65612	65617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058822
1005	NC_021521	CTTT	2	8	65631	65638	0 %	75 %	0 %	25 %	514058822
1006	NC_021521	TCA	2	6	65645	65650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058822
1007	NC_021521	T	7	7	65674	65680	0 %	100 %	0 %	0 %	514058822
1008	NC_021521	GTT	2	6	65697	65702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058822
1009	NC_021521	TTC	2	6	65819	65824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058822
1010	NC_021521	TCT	2	6	65870	65875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058822
1011	NC_021521	T	7	7	65880	65886	0 %	100 %	0 %	0 %	514058822
1012	NC_021521	AAT	2	6	65897	65902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058822
1013	NC_021521	TCA	2	6	65912	65917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058822
1014	NC_021521	CTG	2	6	65934	65939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058822
1015	NC_021521	GAT	2	6	66024	66029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058822
1016	NC_021521	CAA	2	6	66051	66056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058822
1017	NC_021521	T	6	6	66063	66068	0 %	100 %	0 %	0 %	514058822
1018	NC_021521	AAAGCT	2	12	66095	66106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514058822
1019	NC_021521	TAAA	2	8	66126	66133	75 %	25 %	0 %	0 %	514058822
1020	NC_021521	ACC	2	6	66225	66230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058823
1021	NC_021521	TCA	2	6	66256	66261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058823
1022	NC_021521	T	6	6	66270	66275	0 %	100 %	0 %	0 %	514058823
1023	NC_021521	AAT	2	6	66386	66391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058823
1024	NC_021521	TAC	2	6	66408	66413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058823
1025	NC_021521	AAT	2	6	66460	66465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058823
1026	NC_021521	TAAT	2	8	66515	66522	50 %	50 %	0 %	0 %	514058823
1027	NC_021521	CAA	2	6	66554	66559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058823
1028	NC_021521	AGAT	2	8	66610	66617	50 %	25 %	25 %	0 %	514058823
1029	NC_021521	AG	3	6	66655	66660	50 %	0 %	50 %	0 %	514058823
1030	NC_021521	CCT	2	6	66667	66672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514058823
1031	NC_021521	TAT	2	6	66896	66901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058823
1032	NC_021521	CCAA	2	8	66906	66913	50 %	0 %	0 %	50 %	514058823
1033	NC_021521	T	7	7	66941	66947	0 %	100 %	0 %	0 %	514058823
1034	NC_021521	TAT	2	6	67139	67144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058823
1035	NC_021521	T	6	6	67144	67149	0 %	100 %	0 %	0 %	514058823
1036	NC_021521	AGA	2	6	67169	67174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058823
1037	NC_021521	CCA	2	6	67180	67185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058823
1038	NC_021521	TTTTA	2	10	67383	67392	20 %	80 %	0 %	0 %	514058823
1039	NC_021521	TA	3	6	67391	67396	50 %	50 %	0 %	0 %	514058823
1040	NC_021521	CCG	2	6	67412	67417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514058823
1041	NC_021521	TTCT	2	8	67466	67473	0 %	75 %	0 %	25 %	514058823
1042	NC_021521	AGC	2	6	67491	67496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058823
1043	NC_021521	TTG	2	6	67502	67507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058823
1044	NC_021521	CTT	2	6	67520	67525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058823
1045	NC_021521	CAT	2	6	67565	67570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058823
1046	NC_021521	CAA	2	6	67619	67624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058823
1047	NC_021521	ATC	2	6	67650	67655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058823
1048	NC_021521	ATT	2	6	67695	67700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058823
1049	NC_021521	CAA	2	6	67820	67825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058823
1050	NC_021521	CTT	2	6	67883	67888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058823
1051	NC_021521	T	6	6	67887	67892	0 %	100 %	0 %	0 %	514058823
1052	NC_021521	ATC	2	6	67893	67898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058823
1053	NC_021521	GTT	2	6	67910	67915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058823
1054	NC_021521	TGTT	2	8	67992	67999	0 %	75 %	25 %	0 %	514058823
1055	NC_021521	TAC	2	6	68006	68011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058823
1056	NC_021521	GTT	2	6	68054	68059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058823
1057	NC_021521	AAT	2	6	68269	68274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058823
1058	NC_021521	TGA	2	6	68285	68290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058823
1059	NC_021521	ATT	2	6	68355	68360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058823
1060	NC_021521	TAA	2	6	68384	68389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058823
1061	NC_021521	AAAT	2	8	68442	68449	75 %	25 %	0 %	0 %	514058823
1062	NC_021521	AAGCAA	2	12	68579	68590	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	514058823
1063	NC_021521	TAA	2	6	68604	68609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058823
1064	NC_021521	T	6	6	68625	68630	0 %	100 %	0 %	0 %	514058823
1065	NC_021521	AAT	2	6	68706	68711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058824
1066	NC_021521	AACA	2	8	68732	68739	75 %	0 %	0 %	25 %	514058824
1067	NC_021521	TTTC	2	8	68786	68793	0 %	75 %	0 %	25 %	514058824
1068	NC_021521	TCC	2	6	68825	68830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514058824
1069	NC_021521	TCA	2	6	68857	68862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058824
1070	NC_021521	GCCC	2	8	68956	68963	0 %	0 %	25 %	75 %	514058824
1071	NC_021521	AGAA	2	8	69062	69069	75 %	0 %	25 %	0 %	514058824
1072	NC_021521	T	6	6	69149	69154	0 %	100 %	0 %	0 %	514058824
1073	NC_021521	GTT	2	6	69184	69189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058824
1074	NC_021521	ATT	2	6	69191	69196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058824
1075	NC_021521	GTT	2	6	69219	69224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058824
1076	NC_021521	TAA	2	6	69343	69348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058824
1077	NC_021521	TTG	2	6	69596	69601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058824
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1079	NC_021521	TCTT	2	8	69858	69865	0 %	75 %	0 %	25 %	514058824
1080	NC_021521	ATA	2	6	69871	69876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058824
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1082	NC_021521	AACA	2	8	69953	69960	75 %	0 %	0 %	25 %	514058824
1083	NC_021521	TAAAA	2	10	69974	69983	80 %	20 %	0 %	0 %	514058824
1084	NC_021521	A	6	6	69980	69985	100 %	0 %	0 %	0 %	514058824
1085	NC_021521	GAAG	2	8	70018	70025	50 %	0 %	50 %	0 %	514058825
1086	NC_021521	TCC	2	6	70085	70090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514058825
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1088	NC_021521	CAC	2	6	70288	70293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058825
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1090	NC_021521	TAA	2	6	70564	70569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058825
1091	NC_021521	ACC	2	6	70588	70593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058825
1092	NC_021521	AAC	2	6	70597	70602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058825
1093	NC_021521	ATA	2	6	70609	70614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058825
1094	NC_021521	A	6	6	70635	70640	100 %	0 %	0 %	0 %	514058825
1095	NC_021521	ATA	2	6	70671	70676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058825
1096	NC_021521	CAC	2	6	70697	70702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058825
1097	NC_021521	CAA	2	6	70708	70713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058825
1098	NC_021521	ACA	2	6	70773	70778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058825
1099	NC_021521	ATC	2	6	70845	70850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058825
1100	NC_021521	AAC	2	6	70902	70907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058826
1101	NC_021521	GTT	2	6	70926	70931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058826
1102	NC_021521	TCA	2	6	70964	70969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058826
1103	NC_021521	ATA	2	6	71022	71027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058826
1104	NC_021521	A	6	6	71027	71032	100 %	0 %	0 %	0 %	514058826
1105	NC_021521	TAA	2	6	71065	71070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058826
1106	NC_021521	AAT	2	6	71112	71117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058826
1107	NC_021521	ATT	2	6	71146	71151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058826
1108	NC_021521	T	6	6	71150	71155	0 %	100 %	0 %	0 %	514058826
1109	NC_021521	GCA	2	6	71213	71218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058826
1110	NC_021521	GTT	2	6	71253	71258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058826
1111	NC_021521	T	6	6	71271	71276	0 %	100 %	0 %	0 %	514058826
1112	NC_021521	AAT	2	6	71311	71316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058826
1113	NC_021521	ATT	2	6	71329	71334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058826
1114	NC_021521	T	7	7	71344	71350	0 %	100 %	0 %	0 %	514058826
1115	NC_021521	TGAA	2	8	71485	71492	50 %	25 %	25 %	0 %	514058826
1116	NC_021521	CCAT	2	8	71561	71568	25 %	25 %	0 %	50 %	514058826
1117	NC_021521	AAT	2	6	71569	71574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058826
1118	NC_021521	T	6	6	71737	71742	0 %	100 %	0 %	0 %	514058827
1119	NC_021521	TAATA	2	10	71749	71758	60 %	40 %	0 %	0 %	514058827
1120	NC_021521	TGT	2	6	71837	71842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058827
1121	NC_021521	CGCT	2	8	71857	71864	0 %	25 %	25 %	50 %	514058827
1122	NC_021521	TTG	2	6	71889	71894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058827
1123	NC_021521	CAC	2	6	72054	72059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058827
1124	NC_021521	CTT	2	6	72195	72200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058827
1125	NC_021521	ATAA	2	8	72208	72215	75 %	25 %	0 %	0 %	514058827
1126	NC_021521	TGA	2	6	72266	72271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058827
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1128	NC_021521	AAT	2	6	72355	72360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058827
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