MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021521	TCA	2	6	32699	32704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058793
502	NC_021521	TTCG	2	8	32717	32724	0 %	50 %	25 %	25 %	514058793
503	NC_021521	TCA	2	6	32741	32746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058793
504	NC_021521	ATC	2	6	33196	33201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058793
505	NC_021521	GTT	2	6	33243	33248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058793
506	NC_021521	GTT	2	6	33282	33287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058793
507	NC_021521	ACT	2	6	33369	33374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058794
508	NC_021521	TCAAC	2	10	33417	33426	40 %	20 %	0 %	40 %	514058794
509	NC_021521	CAT	2	6	33496	33501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058794
510	NC_021521	CAC	2	6	33525	33530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058794
511	NC_021521	T	6	6	33532	33537	0 %	100 %	0 %	0 %	514058794
512	NC_021521	AGT	2	6	33611	33616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058794
513	NC_021521	AGTTC	2	10	33654	33663	20 %	40 %	20 %	20 %	514058794
514	NC_021521	GTT	2	6	33759	33764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058794
515	NC_021521	TAA	2	6	33841	33846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058794
516	NC_021521	CCA	2	6	33912	33917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058794
517	NC_021521	CTT	2	6	33930	33935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058794
518	NC_021521	A	6	6	34139	34144	100 %	0 %	0 %	0 %	514058794
519	NC_021521	T	6	6	34189	34194	0 %	100 %	0 %	0 %	514058794
520	NC_021521	AATA	2	8	34317	34324	75 %	25 %	0 %	0 %	514058795
521	NC_021521	AAT	2	6	34333	34338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058795
522	NC_021521	TGG	2	6	34409	34414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058795
523	NC_021521	GAA	2	6	34453	34458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058795
524	NC_021521	CAA	3	9	34483	34491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058795
525	NC_021521	GCG	2	6	34555	34560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058795
526	NC_021521	TCGC	2	8	34604	34611	0 %	25 %	25 %	50 %	514058795
527	NC_021521	TGTGA	2	10	34669	34678	20 %	40 %	40 %	0 %	514058795
528	NC_021521	CGG	2	6	34689	34694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058795
529	NC_021521	TTGCG	2	10	34722	34731	0 %	40 %	40 %	20 %	514058795
530	NC_021521	GAAA	2	8	34773	34780	75 %	0 %	25 %	0 %	514058795
531	NC_021521	GGC	2	6	34800	34805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058795
532	NC_021521	ATT	2	6	34962	34967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058795
533	NC_021521	GTT	2	6	35004	35009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058795
534	NC_021521	AGT	2	6	35214	35219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058796
535	NC_021521	T	6	6	35259	35264	0 %	100 %	0 %	0 %	514058796
536	NC_021521	TCA	2	6	35279	35284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058796
537	NC_021521	GAA	2	6	35396	35401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058796
538	NC_021521	TG	3	6	35406	35411	0 %	50 %	50 %	0 %	514058796
539	NC_021521	CGG	2	6	35466	35471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058796
540	NC_021521	AAT	2	6	35506	35511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058796
541	NC_021521	ATT	2	6	35617	35622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058796
542	NC_021521	TTC	2	6	35674	35679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058796
543	NC_021521	A	6	6	35750	35755	100 %	0 %	0 %	0 %	514058796
544	NC_021521	CAC	2	6	35835	35840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058796
545	NC_021521	TTGAG	2	10	35903	35912	20 %	40 %	40 %	0 %	514058796
546	NC_021521	T	6	6	35919	35924	0 %	100 %	0 %	0 %	514058796
547	NC_021521	CAT	2	6	36043	36048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058796
548	NC_021521	AATC	2	8	36310	36317	50 %	25 %	0 %	25 %	514058797
549	NC_021521	TAA	2	6	36383	36388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058797
550	NC_021521	GGT	2	6	36425	36430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058797
551	NC_021521	GTT	2	6	36449	36454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058797
552	NC_021521	TTCGC	2	10	36474	36483	0 %	40 %	20 %	40 %	514058797
553	NC_021521	CTG	2	6	36535	36540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058797
554	NC_021521	ACA	2	6	36555	36560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058797
555	NC_021521	AAC	2	6	36564	36569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058797
556	NC_021521	GTCG	2	8	36608	36615	0 %	25 %	50 %	25 %	514058797
557	NC_021521	ACG	2	6	36728	36733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058797
558	NC_021521	GGT	2	6	36734	36739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058797
559	NC_021521	CTA	2	6	36754	36759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058797
560	NC_021521	TTC	2	6	36776	36781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058797
561	NC_021521	TAA	2	6	36845	36850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058797
562	NC_021521	GAA	2	6	36875	36880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058797
563	NC_021521	CGC	2	6	36974	36979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514058797
564	NC_021521	ATTT	2	8	37003	37010	25 %	75 %	0 %	0 %	514058797
565	NC_021521	CTG	2	6	37063	37068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058797
566	NC_021521	TAAA	2	8	37100	37107	75 %	25 %	0 %	0 %	514058797
567	NC_021521	ACGGT	2	10	37162	37171	20 %	20 %	40 %	20 %	514058797
568	NC_021521	CAT	2	6	37196	37201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058797
569	NC_021521	T	7	7	37209	37215	0 %	100 %	0 %	0 %	514058797
570	NC_021521	TGCAT	2	10	37260	37269	20 %	40 %	20 %	20 %	514058797
571	NC_021521	CTG	2	6	37471	37476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058797
572	NC_021521	ATTG	3	12	37497	37508	25 %	50 %	25 %	0 %	514058797
573	NC_021521	TTG	2	6	37549	37554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058797
574	NC_021521	GTGG	2	8	37579	37586	0 %	25 %	75 %	0 %	514058797
575	NC_021521	TTG	2	6	37602	37607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058797
576	NC_021521	AAT	2	6	37611	37616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058797
577	NC_021521	CTT	2	6	37654	37659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058797
578	NC_021521	CCG	2	6	37704	37709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514058797
579	NC_021521	T	6	6	37717	37722	0 %	100 %	0 %	0 %	514058797
580	NC_021521	TG	3	6	37815	37820	0 %	50 %	50 %	0 %	514058798
581	NC_021521	CTG	2	6	37823	37828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058798
582	NC_021521	T	6	6	37848	37853	0 %	100 %	0 %	0 %	514058798
583	NC_021521	ACC	2	6	37881	37886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058798
584	NC_021521	CCTG	2	8	37966	37973	0 %	25 %	25 %	50 %	514058798
585	NC_021521	T	6	6	38004	38009	0 %	100 %	0 %	0 %	514058798
586	NC_021521	T	6	6	38024	38029	0 %	100 %	0 %	0 %	514058798
587	NC_021521	GCT	2	6	38092	38097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058798
588	NC_021521	CTT	2	6	38165	38170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058798
589	NC_021521	CAC	2	6	38171	38176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058798
590	NC_021521	ATTAC	2	10	38323	38332	40 %	40 %	0 %	20 %	514058798
591	NC_021521	TGC	2	6	38364	38369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058798
592	NC_021521	GAA	2	6	38427	38432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058798
593	NC_021521	AG	3	6	38433	38438	50 %	0 %	50 %	0 %	514058798
594	NC_021521	TTC	2	6	38442	38447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058798
595	NC_021521	TTGCAA	2	12	38633	38644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514058798
596	NC_021521	TTGA	2	8	38721	38728	25 %	50 %	25 %	0 %	514058798
597	NC_021521	TTG	2	6	38744	38749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058798
598	NC_021521	TGT	2	6	39093	39098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058799
599	NC_021521	CGCT	2	8	39125	39132	0 %	25 %	25 %	50 %	514058799
600	NC_021521	CCA	2	6	39141	39146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058799
601	NC_021521	TGT	2	6	39213	39218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058799
602	NC_021521	GTA	2	6	39250	39255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058799
603	NC_021521	GTT	2	6	39294	39299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058799
604	NC_021521	T	7	7	39298	39304	0 %	100 %	0 %	0 %	514058799
605	NC_021521	T	6	6	39321	39326	0 %	100 %	0 %	0 %	514058799
606	NC_021521	GAT	2	6	39394	39399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058799
607	NC_021521	AAG	2	6	39420	39425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058799
608	NC_021521	GAT	2	6	39439	39444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058799
609	NC_021521	TTG	2	6	39655	39660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058799
610	NC_021521	TCAA	2	8	39705	39712	50 %	25 %	0 %	25 %	514058799
611	NC_021521	TGT	2	6	39866	39871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058799
612	NC_021521	GTT	2	6	39889	39894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058799
613	NC_021521	ATT	2	6	40089	40094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058800
614	NC_021521	TAA	2	6	40112	40117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058800
615	NC_021521	GTG	2	6	40132	40137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058800
616	NC_021521	ACG	2	6	40201	40206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058800
617	NC_021521	ACG	2	6	40213	40218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058800
618	NC_021521	TTG	2	6	40237	40242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058800
619	NC_021521	TTC	2	6	40315	40320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058801
620	NC_021521	TTC	2	6	40326	40331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058801
621	NC_021521	GAAT	2	8	40412	40419	50 %	25 %	25 %	0 %	514058801
622	NC_021521	TCT	2	6	40423	40428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058801
623	NC_021521	TAC	2	6	40565	40570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058801
624	NC_021521	ATT	2	6	40997	41002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058802
625	NC_021521	GCG	2	6	41006	41011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514058802
626	NC_021521	CGT	2	6	41018	41023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058802
627	NC_021521	GAA	2	6	41072	41077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058802
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629	NC_021521	GTT	2	6	41138	41143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058802
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