MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021521	A	7	7	290233	290239	100 %	0 %	0 %	0 %	514059049
4502	NC_021521	TTG	2	6	290282	290287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059049
4503	NC_021521	AGA	2	6	290382	290387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059049
4504	NC_021521	GGC	2	6	290505	290510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059049
4505	NC_021521	A	6	6	290522	290527	100 %	0 %	0 %	0 %	514059049
4506	NC_021521	A	7	7	290544	290550	100 %	0 %	0 %	0 %	514059049
4507	NC_021521	TTG	2	6	290561	290566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059049
4508	NC_021521	GCAA	3	12	290569	290580	50 %	0 %	25 %	25 %	514059049
4509	NC_021521	TAG	2	6	290657	290662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059049
4510	NC_021521	AAT	2	6	290776	290781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059049
4511	NC_021521	GTT	2	6	290791	290796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059049
4512	NC_021521	ATT	2	6	290863	290868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059049
4513	NC_021521	CTG	2	6	290982	290987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059050
4514	NC_021521	TCA	2	6	290996	291001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059050
4515	NC_021521	A	6	6	291054	291059	100 %	0 %	0 %	0 %	514059050
4516	NC_021521	TTG	2	6	291106	291111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059050
4517	NC_021521	GCA	2	6	291216	291221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059050
4518	NC_021521	ATT	2	6	291441	291446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059050
4519	NC_021521	CAA	2	6	291513	291518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059050
4520	NC_021521	GAA	2	6	291531	291536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059050
4521	NC_021521	CAA	2	6	291586	291591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059050
4522	NC_021521	A	6	6	291590	291595	100 %	0 %	0 %	0 %	514059050
4523	NC_021521	AAG	2	6	291628	291633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059050
4524	NC_021521	GGT	2	6	291665	291670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059050
4525	NC_021521	CA	3	6	291811	291816	50 %	0 %	0 %	50 %	514059050
4526	NC_021521	TGC	2	6	292384	292389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059051
4527	NC_021521	GGT	2	6	292401	292406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059051
4528	NC_021521	GAT	2	6	292417	292422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059051
4529	NC_021521	CTG	2	6	292467	292472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059051
4530	NC_021521	GCC	2	6	292609	292614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059051
4531	NC_021521	TGA	2	6	292714	292719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059051
4532	NC_021521	ATTTT	2	10	292802	292811	20 %	80 %	0 %	0 %	514059051
4533	NC_021521	CAC	2	6	292848	292853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059051
4534	NC_021521	AT	3	6	292937	292942	50 %	50 %	0 %	0 %	514059051
4535	NC_021521	TTG	2	6	293071	293076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059051
4536	NC_021521	CTT	2	6	293109	293114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059051
4537	NC_021521	TAA	2	6	293167	293172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059051
4538	NC_021521	GA	3	6	293206	293211	50 %	0 %	50 %	0 %	514059051
4539	NC_021521	GCTC	2	8	293255	293262	0 %	25 %	25 %	50 %	514059051
4540	NC_021521	TTCAC	2	10	293360	293369	20 %	40 %	0 %	40 %	514059051
4541	NC_021521	AT	3	6	293381	293386	50 %	50 %	0 %	0 %	514059051
4542	NC_021521	T	6	6	293415	293420	0 %	100 %	0 %	0 %	514059051
4543	NC_021521	CCAC	2	8	293492	293499	25 %	0 %	0 %	75 %	514059051
4544	NC_021521	ACC	2	6	293527	293532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059051
4545	NC_021521	TCGT	2	8	293555	293562	0 %	50 %	25 %	25 %	514059051
4546	NC_021521	TCG	2	6	293583	293588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059051
4547	NC_021521	CAC	2	6	293601	293606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059051
4548	NC_021521	GTT	2	6	293653	293658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059051
4549	NC_021521	ATA	2	6	293804	293809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059051
4550	NC_021521	ACG	2	6	293847	293852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059051
4551	NC_021521	AGA	2	6	293875	293880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059051
4552	NC_021521	AAC	2	6	293881	293886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059051
4553	NC_021521	ATT	2	6	294025	294030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059052
4554	NC_021521	ATGA	2	8	294059	294066	50 %	25 %	25 %	0 %	514059052
4555	NC_021521	CTT	2	6	294218	294223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059052
4556	NC_021521	TTC	3	9	294231	294239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059052
4557	NC_021521	TAA	2	6	294252	294257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059052
4558	NC_021521	CA	3	6	294381	294386	50 %	0 %	0 %	50 %	514059052
4559	NC_021521	GGC	2	6	294404	294409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059052
4560	NC_021521	TCT	2	6	294436	294441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059052
4561	NC_021521	GAT	2	6	294542	294547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059052
4562	NC_021521	GACC	2	8	294572	294579	25 %	0 %	25 %	50 %	514059052
4563	NC_021521	TGG	2	6	294723	294728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059053
4564	NC_021521	TCA	2	6	294775	294780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059053
4565	NC_021521	CGT	2	6	294794	294799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059053
4566	NC_021521	ATC	2	6	294837	294842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059053
4567	NC_021521	ACG	2	6	294870	294875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059053
4568	NC_021521	TCT	2	6	294952	294957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059053
4569	NC_021521	T	6	6	294962	294967	0 %	100 %	0 %	0 %	514059053
4570	NC_021521	GCC	2	6	295005	295010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059053
4571	NC_021521	TAA	2	6	295238	295243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059054
4572	NC_021521	TGA	2	6	295259	295264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059054
4573	NC_021521	GTT	2	6	295272	295277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059054
4574	NC_021521	TAA	2	6	295283	295288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059054
4575	NC_021521	ATTT	2	8	295346	295353	25 %	75 %	0 %	0 %	514059054
4576	NC_021521	TAT	2	6	295405	295410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059054
4577	NC_021521	TAA	2	6	295418	295423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059054
4578	NC_021521	GAAAAA	2	12	295461	295472	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	514059054
4579	NC_021521	AGA	2	6	295507	295512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059054
4580	NC_021521	TTAG	2	8	295730	295737	25 %	50 %	25 %	0 %	514059055
4581	NC_021521	GAT	2	6	295796	295801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059055
4582	NC_021521	AAG	2	6	295808	295813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059055
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4584	NC_021521	GGT	2	6	295967	295972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059056
4585	NC_021521	ATT	2	6	295976	295981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059056
4586	NC_021521	CAAAG	2	10	295986	295995	60 %	0 %	20 %	20 %	514059056
4587	NC_021521	GTA	2	6	296001	296006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059056
4588	NC_021521	CGC	2	6	296115	296120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059056
4589	NC_021521	TAC	2	6	296205	296210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059056
4590	NC_021521	TGG	2	6	296239	296244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059056
4591	NC_021521	TCA	2	6	296286	296291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059056
4592	NC_021521	GTGG	2	8	296343	296350	0 %	25 %	75 %	0 %	514059056
4593	NC_021521	AAC	2	6	296351	296356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059056
4594	NC_021521	AT	3	6	296378	296383	50 %	50 %	0 %	0 %	514059056
4595	NC_021521	GGA	2	6	296399	296404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059056
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4598	NC_021521	CTGT	2	8	296562	296569	0 %	50 %	25 %	25 %	514059056
4599	NC_021521	ACG	2	6	296593	296598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059056
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4601	NC_021521	GTT	2	6	296625	296630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059056
4602	NC_021521	GAT	2	6	296673	296678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059056
4603	NC_021521	TCG	2	6	296789	296794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059056
4604	NC_021521	ATG	2	6	296880	296885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059056
4605	NC_021521	A	7	7	296905	296911	100 %	0 %	0 %	0 %	514059056
4606	NC_021521	GAGC	2	8	296941	296948	25 %	0 %	50 %	25 %	514059057
4607	NC_021521	TC	3	6	296960	296965	0 %	50 %	0 %	50 %	514059057
4608	NC_021521	GGC	2	6	296967	296972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059057
4609	NC_021521	TATC	2	8	297040	297047	25 %	50 %	0 %	25 %	514059057
4610	NC_021521	AATT	2	8	297048	297055	50 %	50 %	0 %	0 %	514059057
4611	NC_021521	T	7	7	297100	297106	0 %	100 %	0 %	0 %	514059057
4612	NC_021521	GTC	2	6	297183	297188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059057
4613	NC_021521	CA	3	6	297208	297213	50 %	0 %	0 %	50 %	514059057
4614	NC_021521	TTG	2	6	297221	297226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059057
4615	NC_021521	TTGC	2	8	297234	297241	0 %	50 %	25 %	25 %	514059057
4616	NC_021521	TTC	2	6	297248	297253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059057
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4621	NC_021521	CAA	2	6	297540	297545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059057
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4623	NC_021521	CACT	2	8	297642	297649	25 %	25 %	0 %	50 %	514059057
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4734	NC_021521	CAT	2	6	303782	303787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059062
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4747	NC_021521	AAAG	2	8	304957	304964	75 %	0 %	25 %	0 %	514059064
4748	NC_021521	ATTC	2	8	305043	305050	25 %	50 %	0 %	25 %	514059064
4749	NC_021521	AATT	2	8	305055	305062	50 %	50 %	0 %	0 %	514059064
4750	NC_021521	GTA	2	6	305071	305076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059064
4751	NC_021521	TTCG	2	8	305098	305105	0 %	50 %	25 %	25 %	514059064
4752	NC_021521	GAAAA	2	10	305224	305233	80 %	0 %	20 %	0 %	514059064
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4754	NC_021521	ACG	2	6	305296	305301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059064
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4758	NC_021521	CAC	2	6	305657	305662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059065
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4762	NC_021521	ACC	2	6	305777	305782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059065
4763	NC_021521	TTG	2	6	305903	305908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059065
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4773	NC_021521	AGC	2	6	306558	306563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059066
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4776	NC_021521	T	6	6	306759	306764	0 %	100 %	0 %	0 %	514059067
4777	NC_021521	AAT	2	6	306873	306878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059067
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4809	NC_021521	ACT	2	6	308992	308997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059070
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4853	NC_021521	CT	3	6	310734	310739	0 %	50 %	0 %	50 %	514059072
4854	NC_021521	CTG	2	6	310753	310758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059072
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4857	NC_021521	TATT	2	8	310835	310842	25 %	75 %	0 %	0 %	514059072
4858	NC_021521	ATA	2	6	310858	310863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059072
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4861	NC_021521	A	6	6	310971	310976	100 %	0 %	0 %	0 %	514059072
4862	NC_021521	AGA	2	6	311003	311008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059072
4863	NC_021521	TG	3	6	311064	311069	0 %	50 %	50 %	0 %	514059072
4864	NC_021521	CTT	2	6	311109	311114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059073
4865	NC_021521	ATG	3	9	311126	311134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059073
4866	NC_021521	TGATG	2	10	311185	311194	20 %	40 %	40 %	0 %	514059073
4867	NC_021521	CGT	2	6	311396	311401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059073
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4869	NC_021521	CAG	2	6	311520	311525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059073
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4871	NC_021521	A	7	7	311749	311755	100 %	0 %	0 %	0 %	514059073
4872	NC_021521	GAA	2	6	311759	311764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059073
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4885	NC_021521	A	6	6	312610	312615	100 %	0 %	0 %	0 %	514059074
4886	NC_021521	TTG	2	6	312620	312625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059074
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4992	NC_021521	AAC	2	6	318715	318720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059079
4993	NC_021521	A	6	6	318812	318817	100 %	0 %	0 %	0 %	514059079
4994	NC_021521	AAC	2	6	318834	318839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059079
4995	NC_021521	ATG	2	6	318920	318925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059079
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4998	NC_021521	CAAAA	2	10	319096	319105	80 %	0 %	0 %	20 %	514059080
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