MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori UM066

Total Repeats: 1123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021218	AAAAC	2	10	8766	8775	80 %	0 %	0 %	20 %	499085038
2	NC_021218	TTTTA	2	10	10457	10466	20 %	80 %	0 %	0 %	499085039
3	NC_021218	AAAAC	2	10	11376	11385	80 %	0 %	0 %	20 %	499085039
4	NC_021218	TATGG	2	10	11489	11498	20 %	40 %	40 %	0 %	499085039
5	NC_021218	TAATC	2	10	11545	11554	40 %	40 %	0 %	20 %	499085039
6	NC_021218	GAATT	2	10	12200	12209	40 %	40 %	20 %	0 %	499085039
7	NC_021218	GAAAA	2	10	12948	12957	80 %	0 %	20 %	0 %	499085040
8	NC_021218	CAAAA	2	10	13075	13084	80 %	0 %	0 %	20 %	499085040
9	NC_021218	GGATG	2	10	13823	13832	20 %	20 %	60 %	0 %	499085040
10	NC_021218	TTTGG	2	10	13845	13854	0 %	60 %	40 %	0 %	499085041
11	NC_021218	CTTTG	2	10	14145	14154	0 %	60 %	20 %	20 %	499085041
12	NC_021218	TTTTC	2	10	14582	14591	0 %	80 %	0 %	20 %	499085041
13	NC_021218	TAAAA	2	10	15743	15752	80 %	20 %	0 %	0 %	499085042
14	NC_021218	AATAG	2	10	17439	17448	60 %	20 %	20 %	0 %	499085043
15	NC_021218	TTATG	2	10	17768	17777	20 %	60 %	20 %	0 %	499085044
16	NC_021218	CGCAC	2	10	17803	17812	20 %	0 %	20 %	60 %	499085044
17	NC_021218	AAATG	2	10	18327	18336	60 %	20 %	20 %	0 %	499085045
18	NC_021218	CAATA	2	10	18659	18668	60 %	20 %	0 %	20 %	499085045
19	NC_021218	CCCCA	2	10	21909	21918	20 %	0 %	0 %	80 %	499085047
20	NC_021218	GGATT	2	10	23263	23272	20 %	40 %	40 %	0 %	499085049
21	NC_021218	ATTGA	2	10	23938	23947	40 %	40 %	20 %	0 %	499085049
22	NC_021218	CCAAC	2	10	26113	26122	40 %	0 %	0 %	60 %	528816099
23	NC_021218	CTTTT	2	10	31455	31464	0 %	80 %	0 %	20 %	499085056
24	NC_021218	TATTC	2	10	32306	32315	20 %	60 %	0 %	20 %	499085057
25	NC_021218	TTTTA	2	10	32602	32611	20 %	80 %	0 %	0 %	499085057
26	NC_021218	ATTAC	2	10	34098	34107	40 %	40 %	0 %	20 %	499085058
27	NC_021218	CATTT	2	10	34889	34898	20 %	60 %	0 %	20 %	499085059
28	NC_021218	TCAAA	2	10	36452	36461	60 %	20 %	0 %	20 %	499085061
29	NC_021218	AAGAT	2	10	45840	45849	60 %	20 %	20 %	0 %	499085070
30	NC_021218	ATTGA	2	10	49239	49248	40 %	40 %	20 %	0 %	499085073
31	NC_021218	CACCC	2	10	50129	50138	20 %	0 %	0 %	80 %	499085074
32	NC_021218	AAAAT	2	10	50485	50494	80 %	20 %	0 %	0 %	499085074
33	NC_021218	AAAAG	2	10	51778	51787	80 %	0 %	20 %	0 %	499085075
34	NC_021218	CTCAA	2	10	53904	53913	40 %	20 %	0 %	40 %	499085079
35	NC_021218	TTTGC	2	10	53939	53948	0 %	60 %	20 %	20 %	499085079
36	NC_021218	CCAAA	2	10	54048	54057	60 %	0 %	0 %	40 %	499085079
37	NC_021218	TCCCC	2	10	55678	55687	0 %	20 %	0 %	80 %	499085081
38	NC_021218	GTTTT	2	10	55778	55787	0 %	80 %	20 %	0 %	499085081
39	NC_021218	TGATT	2	10	55897	55906	20 %	60 %	20 %	0 %	499085081
40	NC_021218	CAAAT	2	10	58398	58407	60 %	20 %	0 %	20 %	499085084
41	NC_021218	AATAA	2	10	59731	59740	80 %	20 %	0 %	0 %	499085087
42	NC_021218	GGCGT	2	10	61627	61636	0 %	20 %	60 %	20 %	499085091
43	NC_021218	AGTGA	2	10	64807	64816	40 %	20 %	40 %	0 %	528816012
44	NC_021218	CAAAA	2	10	66989	66998	80 %	0 %	0 %	20 %	499085094
45	NC_021218	CAAGC	2	10	67650	67659	40 %	0 %	20 %	40 %	499085095
46	NC_021218	ATCGC	2	10	67906	67915	20 %	20 %	20 %	40 %	499085095
47	NC_021218	GAATT	2	10	68065	68074	40 %	40 %	20 %	0 %	499085095
48	NC_021218	CAAAA	2	10	68699	68708	80 %	0 %	0 %	20 %	499085095
49	NC_021218	AAAGA	2	10	69862	69871	80 %	0 %	20 %	0 %	499085096
50	NC_021218	TTTAC	2	10	71760	71769	20 %	60 %	0 %	20 %	499085098
51	NC_021218	GAAAA	2	10	72312	72321	80 %	0 %	20 %	0 %	499085099
52	NC_021218	ATTTT	2	10	74663	74672	20 %	80 %	0 %	0 %	499085103
53	NC_021218	GATTT	2	10	76135	76144	20 %	60 %	20 %	0 %	528816013
54	NC_021218	CTTTT	2	10	78404	78413	0 %	80 %	0 %	20 %	499085106
55	NC_021218	AACAT	2	10	78816	78825	60 %	20 %	0 %	20 %	499085106
56	NC_021218	TCTTT	2	10	81358	81367	0 %	80 %	0 %	20 %	499085109
57	NC_021218	TTTTC	2	10	81863	81872	0 %	80 %	0 %	20 %	499085111
58	NC_021218	TTTTC	2	10	82181	82190	0 %	80 %	0 %	20 %	499085111
59	NC_021218	ACGCA	2	10	82342	82351	40 %	0 %	20 %	40 %	499085111
60	NC_021218	ACAAA	2	10	84375	84384	80 %	0 %	0 %	20 %	528816014
61	NC_021218	AAGCG	2	10	84731	84740	40 %	0 %	40 %	20 %	528816015
62	NC_021218	AAGTC	2	10	85640	85649	40 %	20 %	20 %	20 %	528816015
63	NC_021218	AAATC	2	10	86171	86180	60 %	20 %	0 %	20 %	528816015
64	NC_021218	CAGCG	2	10	86321	86330	20 %	0 %	40 %	40 %	528816015
65	NC_021218	AATCA	2	10	87419	87428	60 %	20 %	0 %	20 %	528816104
66	NC_021218	AAAAG	2	10	88663	88672	80 %	0 %	20 %	0 %	528816106
67	NC_021218	GGCTT	2	10	90623	90632	0 %	40 %	40 %	20 %	528816016
68	NC_021218	ATTGC	2	10	90661	90670	20 %	40 %	20 %	20 %	528816016
69	NC_021218	GAGCT	2	10	92511	92520	20 %	20 %	40 %	20 %	499085118
70	NC_021218	CGATC	2	10	92530	92539	20 %	20 %	20 %	40 %	499085118
71	NC_021218	TTTGG	2	10	94978	94987	0 %	60 %	40 %	0 %	499085120
72	NC_021218	AAGAT	2	10	95933	95942	60 %	20 %	20 %	0 %	499085120
73	NC_021218	CAATT	2	10	96406	96415	40 %	40 %	0 %	20 %	499085120
74	NC_021218	TTTAG	2	10	96556	96565	20 %	60 %	20 %	0 %	499085120
75	NC_021218	GGCAT	2	10	99202	99211	20 %	20 %	40 %	20 %	499085124
76	NC_021218	AGGGT	2	10	99334	99343	20 %	20 %	60 %	0 %	499085124
77	NC_021218	TCTAT	2	10	99610	99619	20 %	60 %	0 %	20 %	499085125
78	NC_021218	ATTTG	2	10	100763	100772	20 %	60 %	20 %	0 %	499085125
79	NC_021218	ACAAA	2	10	101158	101167	80 %	0 %	0 %	20 %	499085125
80	NC_021218	AGCGC	2	10	102938	102947	20 %	0 %	40 %	40 %	499085127
81	NC_021218	GCTTT	2	10	103200	103209	0 %	60 %	20 %	20 %	499085128
82	NC_021218	AAAAG	2	10	105976	105985	80 %	0 %	20 %	0 %	499085131
83	NC_021218	CAATT	2	10	111108	111117	40 %	40 %	0 %	20 %	499085135
84	NC_021218	ATCGT	2	10	112950	112959	20 %	40 %	20 %	20 %	499085136
85	NC_021218	TGCCG	2	10	115432	115441	0 %	20 %	40 %	40 %	499085138
86	NC_021218	TATGA	2	10	115514	115523	40 %	40 %	20 %	0 %	499085138
87	NC_021218	CAAGC	2	10	118096	118105	40 %	0 %	20 %	40 %	499085141
88	NC_021218	ATCAA	2	10	119413	119422	60 %	20 %	0 %	20 %	499085143
89	NC_021218	ATTTC	2	10	120255	120264	20 %	60 %	0 %	20 %	499085144
90	NC_021218	ACGCC	2	10	125754	125763	20 %	0 %	20 %	60 %	499085148
91	NC_021218	TTTGA	2	10	127066	127075	20 %	60 %	20 %	0 %	499085149
92	NC_021218	ATCAA	2	10	127568	127577	60 %	20 %	0 %	20 %	499085150
93	NC_021218	GGCAT	2	10	128493	128502	20 %	20 %	40 %	20 %	499085152
94	NC_021218	AGCCA	2	10	128915	128924	40 %	0 %	20 %	40 %	499085153
95	NC_021218	AAGAT	2	10	129456	129465	60 %	20 %	20 %	0 %	499085153
96	NC_021218	GCTTT	2	10	137898	137907	0 %	60 %	20 %	20 %	499085161
97	NC_021218	GGCGT	2	10	138664	138673	0 %	20 %	60 %	20 %	499085162
98	NC_021218	ACAAA	2	10	138969	138978	80 %	0 %	0 %	20 %	499085162
99	NC_021218	TTTGG	2	10	142274	142283	0 %	60 %	40 %	0 %	499085166
100	NC_021218	AGGCA	2	10	142692	142701	40 %	0 %	40 %	20 %	499085167
101	NC_021218	ATTGA	2	10	143618	143627	40 %	40 %	20 %	0 %	528816111
102	NC_021218	AACGC	2	10	144472	144481	40 %	0 %	20 %	40 %	499085169
103	NC_021218	ATGAC	2	10	150689	150698	40 %	20 %	20 %	20 %	528816116
104	NC_021218	TATGA	2	10	151593	151602	40 %	40 %	20 %	0 %	528816117
105	NC_021218	GGATA	2	10	152149	152158	40 %	20 %	40 %	0 %	528816117
106	NC_021218	ATTTG	2	10	156270	156279	20 %	60 %	20 %	0 %	499085182
107	NC_021218	AGGCG	2	10	157282	157291	20 %	0 %	60 %	20 %	499085182
108	NC_021218	ATTTG	2	10	160025	160034	20 %	60 %	20 %	0 %	499085183
109	NC_021218	AGGCA	2	10	163271	163280	40 %	0 %	40 %	20 %	499085187
110	NC_021218	AAAGA	2	10	164441	164450	80 %	0 %	20 %	0 %	528816018
111	NC_021218	TGAAT	2	10	167770	167779	40 %	40 %	20 %	0 %	499085192
112	NC_021218	TCTTT	2	10	167999	168008	0 %	80 %	0 %	20 %	499085192
113	NC_021218	GCCAA	2	10	168826	168835	40 %	0 %	20 %	40 %	499085193
114	NC_021218	CATTT	2	10	169658	169667	20 %	60 %	0 %	20 %	499085195
115	NC_021218	ACAAA	2	10	169765	169774	80 %	0 %	0 %	20 %	499085195
116	NC_021218	GTTTT	2	10	173232	173241	0 %	80 %	20 %	0 %	499085197
117	NC_021218	CTTGC	2	10	173883	173892	0 %	40 %	20 %	40 %	499085198
118	NC_021218	GATAA	2	10	174820	174829	60 %	20 %	20 %	0 %	528816120
119	NC_021218	CCTTT	2	10	181345	181354	0 %	60 %	0 %	40 %	499085205
120	NC_021218	ACAAA	2	10	182009	182018	80 %	0 %	0 %	20 %	499085206
121	NC_021218	TTTGA	2	10	182674	182683	20 %	60 %	20 %	0 %	499085206
122	NC_021218	CTAAA	2	10	184812	184821	60 %	20 %	0 %	20 %	499085208
123	NC_021218	AGCCA	2	10	185167	185176	40 %	0 %	20 %	40 %	499085208
124	NC_021218	CGCAT	2	10	186569	186578	20 %	20 %	20 %	40 %	499085209
125	NC_021218	TTCTT	2	10	186591	186600	0 %	80 %	0 %	20 %	499085209
126	NC_021218	TTTCA	2	10	186674	186683	20 %	60 %	0 %	20 %	499085209
127	NC_021218	TTAAA	2	10	186850	186859	60 %	40 %	0 %	0 %	499085209
128	NC_021218	AAGAC	2	10	187473	187482	60 %	0 %	20 %	20 %	499085210
129	NC_021218	TAAAA	2	10	189783	189792	80 %	20 %	0 %	0 %	499085213
130	NC_021218	TCAAT	2	10	190089	190098	40 %	40 %	0 %	20 %	499085214
131	NC_021218	TGCCC	2	10	190752	190761	0 %	20 %	20 %	60 %	499085214
132	NC_021218	ACGCC	2	10	192280	192289	20 %	0 %	20 %	60 %	499085216
133	NC_021218	CAAAT	2	10	195009	195018	60 %	20 %	0 %	20 %	499085220
134	NC_021218	AAATC	2	10	195857	195866	60 %	20 %	0 %	20 %	499085221
135	NC_021218	GTAAA	2	10	198557	198566	60 %	20 %	20 %	0 %	499085222
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