MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 2523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021172	CAGCG	2	10	555	564	20 %	0 %	40 %	40 %	488575047
2	NC_021172	GCGCT	2	10	848	857	0 %	20 %	40 %	40 %	488575047
3	NC_021172	TCATT	2	10	3262	3271	20 %	60 %	0 %	20 %	488575049
4	NC_021172	GGGGA	2	10	3507	3516	20 %	0 %	80 %	0 %	488575049
5	NC_021172	GGCGC	2	10	4630	4639	0 %	0 %	60 %	40 %	488575050
6	NC_021172	CCGAT	2	10	5736	5745	20 %	20 %	20 %	40 %	488575051
7	NC_021172	GTGCT	2	10	5819	5828	0 %	40 %	40 %	20 %	488575051
8	NC_021172	GCCGC	2	10	7363	7372	0 %	0 %	40 %	60 %	488575051
9	NC_021172	ACGGC	2	10	8555	8564	20 %	0 %	40 %	40 %	488575052
10	NC_021172	GCAGC	2	10	10732	10741	20 %	0 %	40 %	40 %	488575053
11	NC_021172	GAACG	2	10	12478	12487	40 %	0 %	40 %	20 %	488575054
12	NC_021172	GATTT	2	10	16115	16124	20 %	60 %	20 %	0 %	488575058
13	NC_021172	CGGCG	2	10	16167	16176	0 %	0 %	60 %	40 %	488575058
14	NC_021172	TCGCG	2	10	17708	17717	0 %	20 %	40 %	40 %	488575059
15	NC_021172	AACTC	2	10	17870	17879	40 %	20 %	0 %	40 %	488575059
16	NC_021172	GGCGC	2	10	17923	17932	0 %	0 %	60 %	40 %	488575059
17	NC_021172	TTCGG	2	10	21442	21451	0 %	40 %	40 %	20 %	488575064
18	NC_021172	CACGC	2	10	22893	22902	20 %	0 %	20 %	60 %	488575065
19	NC_021172	GAGCG	2	10	23741	23750	20 %	0 %	60 %	20 %	488575066
20	NC_021172	CGGCG	2	10	24063	24072	0 %	0 %	60 %	40 %	488575066
21	NC_021172	TCGGG	2	10	30284	30293	0 %	20 %	60 %	20 %	488575073
22	NC_021172	ACTGC	2	10	31244	31253	20 %	20 %	20 %	40 %	488575075
23	NC_021172	CGAGA	2	10	31266	31275	40 %	0 %	40 %	20 %	488575075
24	NC_021172	GACAA	2	10	32753	32762	60 %	0 %	20 %	20 %	488575076
25	NC_021172	ACCCC	2	10	34474	34483	20 %	0 %	0 %	80 %	488575079
26	NC_021172	GGGGA	2	10	34501	34510	20 %	0 %	80 %	0 %	488575079
27	NC_021172	TCCCC	2	10	34658	34667	0 %	20 %	0 %	80 %	488575079
28	NC_021172	GGTCG	2	10	34956	34965	0 %	20 %	60 %	20 %	488575080
29	NC_021172	GGTGC	2	10	41798	41807	0 %	20 %	60 %	20 %	488575085
30	NC_021172	TCGTT	2	10	43486	43495	0 %	60 %	20 %	20 %	488575086
31	NC_021172	CGGCG	2	10	44106	44115	0 %	0 %	60 %	40 %	488575088
32	NC_021172	CCGGC	2	10	44533	44542	0 %	0 %	40 %	60 %	488575088
33	NC_021172	TGCCG	2	10	46199	46208	0 %	20 %	40 %	40 %	488575089
34	NC_021172	GCGCC	2	10	46624	46633	0 %	0 %	40 %	60 %	488575089
35	NC_021172	CGGGA	2	10	47595	47604	20 %	0 %	60 %	20 %	488575089
36	NC_021172	GCCGT	2	10	48114	48123	0 %	20 %	40 %	40 %	488575089
37	NC_021172	GACTT	2	10	48441	48450	20 %	40 %	20 %	20 %	488575089
38	NC_021172	TCGCT	2	10	50095	50104	0 %	40 %	20 %	40 %	488575089
39	NC_021172	CGTGC	2	10	52899	52908	0 %	20 %	40 %	40 %	488575091
40	NC_021172	GACCT	2	10	53007	53016	20 %	20 %	20 %	40 %	488575091
41	NC_021172	CGGCA	2	10	53407	53416	20 %	0 %	40 %	40 %	488575091
42	NC_021172	TGCCG	2	10	55232	55241	0 %	20 %	40 %	40 %	488575092
43	NC_021172	CGCGG	2	10	55660	55669	0 %	0 %	60 %	40 %	488575092
44	NC_021172	TCGGA	2	10	57311	57320	20 %	20 %	40 %	20 %	488575092
45	NC_021172	CGGCG	2	10	59277	59286	0 %	0 %	60 %	40 %	488575094
46	NC_021172	GGTCA	2	10	60088	60097	20 %	20 %	40 %	20 %	488575094
47	NC_021172	GCACG	2	10	60738	60747	20 %	0 %	40 %	40 %	488575094
48	NC_021172	GCGTC	2	10	61104	61113	0 %	20 %	40 %	40 %	488575094
49	NC_021172	CTTCG	2	10	62512	62521	0 %	40 %	20 %	40 %	488575095
50	NC_021172	GGCGG	2	10	62933	62942	0 %	0 %	80 %	20 %	488575096
51	NC_021172	TCGCG	2	10	63102	63111	0 %	20 %	40 %	40 %	488575097
52	NC_021172	TCGCC	2	10	63743	63752	0 %	20 %	20 %	60 %	488575097
53	NC_021172	GCCGT	2	10	65473	65482	0 %	20 %	40 %	40 %	488575099
54	NC_021172	GTCGC	2	10	66158	66167	0 %	20 %	40 %	40 %	488575101
55	NC_021172	GAGTA	2	10	67028	67037	40 %	20 %	40 %	0 %	488575101
56	NC_021172	GCCGC	2	10	69334	69343	0 %	0 %	40 %	60 %	488575102
57	NC_021172	AAGCT	2	10	69498	69507	40 %	20 %	20 %	20 %	488575103
58	NC_021172	CGGCG	2	10	69660	69669	0 %	0 %	60 %	40 %	488575103
59	NC_021172	CGATG	2	10	69962	69971	20 %	20 %	40 %	20 %	488575103
60	NC_021172	GCCGA	2	10	69999	70008	20 %	0 %	40 %	40 %	488575103
61	NC_021172	GCAGA	2	10	73307	73316	40 %	0 %	40 %	20 %	488575106
62	NC_021172	CGCGA	2	10	73743	73752	20 %	0 %	40 %	40 %	488575106
63	NC_021172	GGCAA	2	10	73849	73858	40 %	0 %	40 %	20 %	488575106
64	NC_021172	AGCCG	2	10	74216	74225	20 %	0 %	40 %	40 %	488575107
65	NC_021172	ATCCC	2	10	74901	74910	20 %	20 %	0 %	60 %	488575108
66	NC_021172	GTGCC	2	10	75322	75331	0 %	20 %	40 %	40 %	488575108
67	NC_021172	GCAGA	2	10	76513	76522	40 %	0 %	40 %	20 %	488575110
68	NC_021172	TGAGC	2	10	78680	78689	20 %	20 %	40 %	20 %	488575112
69	NC_021172	CGCGG	2	10	80702	80711	0 %	0 %	60 %	40 %	488575116
70	NC_021172	GTTCA	2	10	82710	82719	20 %	40 %	20 %	20 %	488575117
71	NC_021172	TGCCG	2	10	83241	83250	0 %	20 %	40 %	40 %	488575118
72	NC_021172	GGGAA	2	10	86654	86663	40 %	0 %	60 %	0 %	488575122
73	NC_021172	CCGCG	2	10	88851	88860	0 %	0 %	40 %	60 %	488575127
74	NC_021172	GAGAA	2	10	89546	89555	60 %	0 %	40 %	0 %	488575127
75	NC_021172	CGGTG	2	10	92086	92095	0 %	20 %	60 %	20 %	488575130
76	NC_021172	GCATC	2	10	92872	92881	20 %	20 %	20 %	40 %	488575130
77	NC_021172	CGCGT	2	10	93741	93750	0 %	20 %	40 %	40 %	488575131
78	NC_021172	CGGTG	2	10	93798	93807	0 %	20 %	60 %	20 %	488575131
79	NC_021172	GCTTT	2	10	93998	94007	0 %	60 %	20 %	20 %	488575132
80	NC_021172	ATCAG	2	10	94139	94148	40 %	20 %	20 %	20 %	488575132
81	NC_021172	TTCGG	2	10	95319	95328	0 %	40 %	40 %	20 %	488575133
82	NC_021172	TTCTC	2	10	95757	95766	0 %	60 %	0 %	40 %	488575133
83	NC_021172	TCGGA	2	10	96074	96083	20 %	20 %	40 %	20 %	488575134
84	NC_021172	TGATG	2	10	103023	103032	20 %	40 %	40 %	0 %	488575141
85	NC_021172	GGCGA	2	10	105170	105179	20 %	0 %	60 %	20 %	488575143
86	NC_021172	CAGAT	2	10	105622	105631	40 %	20 %	20 %	20 %	488575144
87	NC_021172	TGACC	2	10	106616	106625	20 %	20 %	20 %	40 %	488575144
88	NC_021172	GATCA	2	10	107922	107931	40 %	20 %	20 %	20 %	488575146
89	NC_021172	GTTCG	2	10	111131	111140	0 %	40 %	40 %	20 %	488575149
90	NC_021172	TACGA	2	10	111616	111625	40 %	20 %	20 %	20 %	488575149
91	NC_021172	GTCAT	2	10	112398	112407	20 %	40 %	20 %	20 %	488575150
92	NC_021172	ACCGA	2	10	113481	113490	40 %	0 %	20 %	40 %	488575152
93	NC_021172	CGTCA	2	10	114132	114141	20 %	20 %	20 %	40 %	488575154
94	NC_021172	TGCCG	2	10	120151	120160	0 %	20 %	40 %	40 %	488575159
95	NC_021172	TCCTG	2	10	120544	120553	0 %	40 %	20 %	40 %	488575160
96	NC_021172	TCGCC	2	10	120597	120606	0 %	20 %	20 %	60 %	488575160
97	NC_021172	TGGCG	2	10	129662	129671	0 %	20 %	60 %	20 %	488575167
98	NC_021172	CGTGT	2	10	129684	129693	0 %	40 %	40 %	20 %	488575167
99	NC_021172	GCGCG	2	10	130766	130775	0 %	0 %	60 %	40 %	488575168
100	NC_021172	CACGC	2	10	132151	132160	20 %	0 %	20 %	60 %	488575170
101	NC_021172	CGTGC	2	10	132880	132889	0 %	20 %	40 %	40 %	488575170
102	NC_021172	GCCTT	2	10	132993	133002	0 %	40 %	20 %	40 %	488575170
103	NC_021172	TGTGA	2	10	133764	133773	20 %	40 %	40 %	0 %	488575171
104	NC_021172	CCGGA	2	10	134128	134137	20 %	0 %	40 %	40 %	488575171
105	NC_021172	ATCCT	2	10	134149	134158	20 %	40 %	0 %	40 %	488575171
106	NC_021172	AGCGT	2	10	135087	135096	20 %	20 %	40 %	20 %	488575172
107	NC_021172	ACGGA	2	10	136422	136431	40 %	0 %	40 %	20 %	488575173
108	NC_021172	CCACA	2	10	136998	137007	40 %	0 %	0 %	60 %	488575174
109	NC_021172	AGGAT	2	10	144159	144168	40 %	20 %	40 %	0 %	488575186
110	NC_021172	GGCGC	2	10	144983	144992	0 %	0 %	60 %	40 %	488575187
111	NC_021172	TCGAC	2	10	145137	145146	20 %	20 %	20 %	40 %	488575187
112	NC_021172	GCCCG	2	10	152950	152959	0 %	0 %	40 %	60 %	488575197
113	NC_021172	CGGCG	2	10	153012	153021	0 %	0 %	60 %	40 %	488575197
114	NC_021172	GATCG	2	10	153690	153699	20 %	20 %	40 %	20 %	488575198
115	NC_021172	CCGAC	2	10	154728	154737	20 %	0 %	20 %	60 %	488575200
116	NC_021172	CCGGT	2	10	157048	157057	0 %	20 %	40 %	40 %	488575203
117	NC_021172	GCGCA	2	10	160141	160150	20 %	0 %	40 %	40 %	488575205
118	NC_021172	GACAC	2	10	161306	161315	40 %	0 %	20 %	40 %	488575207
119	NC_021172	GGAAA	2	10	161339	161348	60 %	0 %	40 %	0 %	488575207
120	NC_021172	AAACG	2	10	166481	166490	60 %	0 %	20 %	20 %	488575209
121	NC_021172	GTGAG	2	10	169016	169025	20 %	20 %	60 %	0 %	488575214
122	NC_021172	AAGGC	2	10	170809	170818	40 %	0 %	40 %	20 %	488575215
123	NC_021172	ATTGA	2	10	174053	174062	40 %	40 %	20 %	0 %	488575217
124	NC_021172	GCATC	2	10	174097	174106	20 %	20 %	20 %	40 %	488575217
125	NC_021172	AGTCT	2	10	177058	177067	20 %	40 %	20 %	20 %	488575220
126	NC_021172	CTATC	2	10	177474	177483	20 %	40 %	0 %	40 %	488575220
127	NC_021172	TTCTG	2	10	179685	179694	0 %	60 %	20 %	20 %	488575224
128	NC_021172	TCCTC	2	10	180664	180673	0 %	40 %	0 %	60 %	488575225
129	NC_021172	GCCAA	2	10	181161	181170	40 %	0 %	20 %	40 %	488575226
130	NC_021172	AAGTC	2	10	181533	181542	40 %	20 %	20 %	20 %	488575226
131	NC_021172	CGCGG	2	10	188266	188275	0 %	0 %	60 %	40 %	488575233
132	NC_021172	ATCGT	2	10	194335	194344	20 %	40 %	20 %	20 %	488575242
133	NC_021172	AGCGA	2	10	194764	194773	40 %	0 %	40 %	20 %	488575243
134	NC_021172	CATGG	2	10	196616	196625	20 %	20 %	40 %	20 %	488575245
135	NC_021172	CAGCC	2	10	196731	196740	20 %	0 %	20 %	60 %	488575245
136	NC_021172	CTGCA	2	10	198758	198767	20 %	20 %	20 %	40 %	488575248
137	NC_021172	CAAGC	2	10	199039	199048	40 %	0 %	20 %	40 %	488575248
138	NC_021172	CCAAG	2	10	202113	202122	40 %	0 %	20 %	40 %	488575253
139	NC_021172	GCGCC	2	10	202507	202516	0 %	0 %	40 %	60 %	488575253
140	NC_021172	CGCGA	2	10	203110	203119	20 %	0 %	40 %	40 %	488575253
141	NC_021172	AGGCA	2	10	203512	203521	40 %	0 %	40 %	20 %	488575254
142	NC_021172	GACGT	2	10	203633	203642	20 %	20 %	40 %	20 %	488575254
143	NC_021172	GGCGC	2	10	204533	204542	0 %	0 %	60 %	40 %	488575255
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145	NC_021172	CTCGT	2	10	204666	204675	0 %	40 %	20 %	40 %	488575255
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149	NC_021172	GCCGC	2	10	208374	208383	0 %	0 %	40 %	60 %	488575259
150	NC_021172	GTTCG	2	10	211404	211413	0 %	40 %	40 %	20 %	488575263
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152	NC_021172	GCGAG	2	10	215933	215942	20 %	0 %	60 %	20 %	488575268
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156	NC_021172	TCACG	2	10	223841	223850	20 %	20 %	20 %	40 %	488575277
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159	NC_021172	TGGCC	2	10	228076	228085	0 %	20 %	40 %	40 %	488575281
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164	NC_021172	GATCA	2	10	231601	231610	40 %	20 %	20 %	20 %	488575284
165	NC_021172	TCCGG	2	10	231641	231650	0 %	20 %	40 %	40 %	488575284
166	NC_021172	CTTAT	2	10	233854	233863	20 %	60 %	0 %	20 %	488575285
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170	NC_021172	GATCT	2	10	239755	239764	20 %	40 %	20 %	20 %	488575290
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174	NC_021172	GCCGA	2	10	246639	246648	20 %	0 %	40 %	40 %	488575296
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176	NC_021172	TCCGG	2	10	250468	250477	0 %	20 %	40 %	40 %	488575298
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182	NC_021172	GGCGA	2	10	260707	260716	20 %	0 %	60 %	20 %	488575304
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231	NC_021172	TCGTC	2	10	354348	354357	0 %	40 %	20 %	40 %	488575407
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246	NC_021172	CGGGG	2	10	379975	379984	0 %	0 %	80 %	20 %	488575433
247	NC_021172	AAAAG	2	10	380944	380953	80 %	0 %	20 %	0 %	488575434
248	NC_021172	CGCGG	2	10	388603	388612	0 %	0 %	60 %	40 %	488575442
249	NC_021172	CGCGC	2	10	389938	389947	0 %	0 %	40 %	60 %	488575443
250	NC_021172	GAGCT	2	10	391374	391383	20 %	20 %	40 %	20 %	488575444
251	NC_021172	GAGCG	2	10	394122	394131	20 %	0 %	60 %	20 %	488575446
252	NC_021172	GAGAT	2	10	394146	394155	40 %	20 %	40 %	0 %	488575446
253	NC_021172	TGCCG	2	10	394373	394382	0 %	20 %	40 %	40 %	488575446
254	NC_021172	AGAAA	2	10	395091	395100	80 %	0 %	20 %	0 %	488575447
255	NC_021172	GTTTC	2	10	396096	396105	0 %	60 %	20 %	20 %	488575450
256	NC_021172	ATCGT	2	10	397120	397129	20 %	40 %	20 %	20 %	488575451
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258	NC_021172	GGACC	2	10	402799	402808	20 %	0 %	40 %	40 %	488575458
259	NC_021172	CAGGA	2	10	403000	403009	40 %	0 %	40 %	20 %	488575458
260	NC_021172	CGGAA	2	10	406680	406689	40 %	0 %	40 %	20 %	488575460
261	NC_021172	CAGGC	2	10	408801	408810	20 %	0 %	40 %	40 %	488575462
262	NC_021172	GCGGA	2	10	409294	409303	20 %	0 %	60 %	20 %	488575462
263	NC_021172	GCGCG	2	10	409433	409442	0 %	0 %	60 %	40 %	488575462
264	NC_021172	GATTT	2	10	410745	410754	20 %	60 %	20 %	0 %	488575463
265	NC_021172	CAGGC	2	10	411200	411209	20 %	0 %	40 %	40 %	488575463
266	NC_021172	CCGAG	2	10	414153	414162	20 %	0 %	40 %	40 %	488575466
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