MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 74415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021172	CGGCG	2	10	24063	24072	0 %	0 %	60 %	40 %	488575066
502	NC_021172	GAC	2	6	24095	24100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575066
503	NC_021172	GA	3	6	24102	24107	50 %	0 %	50 %	0 %	488575066
504	NC_021172	TGC	2	6	24214	24219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575066
505	NC_021172	GGC	2	6	24326	24331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575066
506	NC_021172	CGA	2	6	24350	24355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575066
507	NC_021172	TCG	2	6	24367	24372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575066
508	NC_021172	TC	3	6	24408	24413	0 %	50 %	0 %	50 %	488575066
509	NC_021172	CCG	2	6	24539	24544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575067
510	NC_021172	CGCT	2	8	24567	24574	0 %	25 %	25 %	50 %	488575067
511	NC_021172	GAGC	2	8	24629	24636	25 %	0 %	50 %	25 %	488575067
512	NC_021172	GAAC	2	8	24687	24694	50 %	0 %	25 %	25 %	488575067
513	NC_021172	TGA	2	6	24795	24800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575067
514	NC_021172	AG	3	6	24824	24829	50 %	0 %	50 %	0 %	488575067
515	NC_021172	ACG	2	6	24896	24901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575067
516	NC_021172	GATC	2	8	24985	24992	25 %	25 %	25 %	25 %	488575067
517	NC_021172	CGT	2	6	25009	25014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575067
518	NC_021172	TCG	2	6	25380	25385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575068
519	NC_021172	GAC	2	6	25421	25426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575068
520	NC_021172	CCT	2	6	25441	25446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575068
521	NC_021172	CGA	2	6	25519	25524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575068
522	NC_021172	CGA	2	6	25597	25602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575068
523	NC_021172	GGCA	2	8	25614	25621	25 %	0 %	50 %	25 %	488575068
524	NC_021172	CAGGCG	2	12	25637	25648	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488575068
525	NC_021172	GAT	2	6	25655	25660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575068
526	NC_021172	CG	3	6	25682	25687	0 %	0 %	50 %	50 %	488575068
527	NC_021172	ATG	2	6	25719	25724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575068
528	NC_021172	GC	3	6	25844	25849	0 %	0 %	50 %	50 %	488575068
529	NC_021172	GCC	2	6	25896	25901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575068
530	NC_021172	CGA	2	6	25948	25953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575068
531	NC_021172	CGA	3	9	25975	25983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575068
532	NC_021172	GCC	2	6	26118	26123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575068
533	NC_021172	CCG	2	6	26128	26133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575068
534	NC_021172	CCG	2	6	26152	26157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575068
535	NC_021172	ATA	2	6	26168	26173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575068
536	NC_021172	CGTC	2	8	26175	26182	0 %	25 %	25 %	50 %	488575068
537	NC_021172	GGC	2	6	26183	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575068
538	NC_021172	ACG	2	6	26235	26240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575068
539	NC_021172	CGC	2	6	26263	26268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575068
540	NC_021172	TCA	2	6	26274	26279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575068
541	NC_021172	CGA	2	6	26300	26305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575068
542	NC_021172	TCGCCG	2	12	26310	26321	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	488575068
543	NC_021172	GAT	2	6	26378	26383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575068
544	NC_021172	TCG	2	6	26404	26409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575068
545	NC_021172	CGA	2	6	26419	26424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575068
546	NC_021172	TGC	2	6	26497	26502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575069
547	NC_021172	CGTC	2	8	26566	26573	0 %	25 %	25 %	50 %	488575069
548	NC_021172	ATG	2	6	26592	26597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575069
549	NC_021172	CTT	2	6	26692	26697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575069
550	NC_021172	CGT	2	6	26761	26766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575069
551	NC_021172	TGGC	2	8	26883	26890	0 %	25 %	50 %	25 %	488575069
552	NC_021172	TCGATG	2	12	26902	26913	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488575069
553	NC_021172	GCC	2	6	26951	26956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575070
554	NC_021172	TCG	2	6	26975	26980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575070
555	NC_021172	CGG	2	6	26991	26996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575070
556	NC_021172	TTC	2	6	27043	27048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575070
557	NC_021172	CGT	3	9	27076	27084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575070
558	NC_021172	ATG	3	9	27131	27139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575070
559	NC_021172	T	6	6	27173	27178	0 %	100 %	0 %	0 %	488575070
560	NC_021172	ATC	2	6	27200	27205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575070
561	NC_021172	GCC	3	9	27208	27216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575070
562	NC_021172	CTGC	2	8	27240	27247	0 %	25 %	25 %	50 %	488575070
563	NC_021172	TGC	2	6	27334	27339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575070
564	NC_021172	AGC	2	6	27374	27379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575070
565	NC_021172	GCC	2	6	27472	27477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575070
566	NC_021172	GAC	3	9	27520	27528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575070
567	NC_021172	CGA	2	6	27582	27587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575070
568	NC_021172	CGA	2	6	27636	27641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575070
569	NC_021172	GGTTCG	2	12	27648	27659	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488575070
570	NC_021172	GAA	3	9	27670	27678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575070
571	NC_021172	TTGG	2	8	27690	27697	0 %	50 %	50 %	0 %	488575070
572	NC_021172	AG	3	6	27841	27846	50 %	0 %	50 %	0 %	488575070
573	NC_021172	GCC	2	6	27863	27868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575070
574	NC_021172	CGT	2	6	27937	27942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575070
575	NC_021172	TCC	2	6	27977	27982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575070
576	NC_021172	TAT	2	6	28014	28019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575070
577	NC_021172	GCC	2	6	28107	28112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575070
578	NC_021172	CAA	2	6	28170	28175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575070
579	NC_021172	A	6	6	28174	28179	100 %	0 %	0 %	0 %	488575070
580	NC_021172	AG	3	6	28421	28426	50 %	0 %	50 %	0 %	488575071
581	NC_021172	GCG	2	6	28434	28439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575071
582	NC_021172	GCG	2	6	28445	28450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575071
583	NC_021172	CGG	2	6	28619	28624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575071
584	NC_021172	CGA	2	6	28643	28648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575071
585	NC_021172	CTGC	2	8	28737	28744	0 %	25 %	25 %	50 %	488575071
586	NC_021172	CG	3	6	28801	28806	0 %	0 %	50 %	50 %	488575071
587	NC_021172	TCG	2	6	28897	28902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575071
588	NC_021172	AAGG	2	8	28904	28911	50 %	0 %	50 %	0 %	488575071
589	NC_021172	CGG	2	6	28948	28953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575071
590	NC_021172	GGTT	2	8	28996	29003	0 %	50 %	50 %	0 %	488575071
591	NC_021172	GTCG	2	8	29042	29049	0 %	25 %	50 %	25 %	488575071
592	NC_021172	GGCG	2	8	29054	29061	0 %	0 %	75 %	25 %	488575071
593	NC_021172	TCG	2	6	29074	29079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575071
594	NC_021172	CG	4	8	29085	29092	0 %	0 %	50 %	50 %	488575071
595	NC_021172	CGT	2	6	29105	29110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575071
596	NC_021172	ATT	2	6	29146	29151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575071
597	NC_021172	GCC	2	6	29240	29245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575071
598	NC_021172	ACGC	2	8	29247	29254	25 %	0 %	25 %	50 %	488575071
599	NC_021172	CGG	2	6	29341	29346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575071
600	NC_021172	GCG	3	9	29347	29355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575071
601	NC_021172	CG	3	6	29359	29364	0 %	0 %	50 %	50 %	488575071
602	NC_021172	ATC	2	6	29418	29423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575071
603	NC_021172	AG	3	6	29534	29539	50 %	0 %	50 %	0 %	488575071
604	NC_021172	GCC	2	6	29715	29720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575072
605	NC_021172	T	6	6	29790	29795	0 %	100 %	0 %	0 %	488575072
606	NC_021172	CG	3	6	29814	29819	0 %	0 %	50 %	50 %	488575072
607	NC_021172	TCC	2	6	29857	29862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575072
608	NC_021172	GC	3	6	29939	29944	0 %	0 %	50 %	50 %	488575072
609	NC_021172	CCAG	2	8	29951	29958	25 %	0 %	25 %	50 %	488575072
610	NC_021172	TGCG	2	8	29972	29979	0 %	25 %	50 %	25 %	488575072
611	NC_021172	CAA	3	9	30017	30025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575072
612	NC_021172	GCG	2	6	30158	30163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575073
613	NC_021172	CGA	2	6	30179	30184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575073
614	NC_021172	TCGGG	2	10	30284	30293	0 %	20 %	60 %	20 %	488575073
615	NC_021172	GCG	2	6	30318	30323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575073
616	NC_021172	GGC	3	9	30627	30635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575074
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618	NC_021172	GCT	2	6	30678	30683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575074
619	NC_021172	GAA	2	6	30717	30722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575074
620	NC_021172	GC	4	8	30725	30732	0 %	0 %	50 %	50 %	488575074
621	NC_021172	CGG	2	6	30741	30746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575074
622	NC_021172	TGC	2	6	30755	30760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575074
623	NC_021172	GC	3	6	30778	30783	0 %	0 %	50 %	50 %	488575074
624	NC_021172	GAA	2	6	30831	30836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575074
625	NC_021172	CG	3	6	30847	30852	0 %	0 %	50 %	50 %	488575074
626	NC_021172	TCG	2	6	31120	31125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575075
627	NC_021172	CGA	2	6	31160	31165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575075
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752	NC_021172	TGA	2	6	36435	36440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575081
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754	NC_021172	GGC	2	6	36526	36531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575081
755	NC_021172	TGCG	2	8	36576	36583	0 %	25 %	50 %	25 %	488575081
756	NC_021172	CGACCG	2	12	36603	36614	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	488575081
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