MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478429024
2	NC_020509	CCGCAG	2	12	1043	1054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478429025
3	NC_020509	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	478429026
4	NC_020509	GCTTGC	2	12	6279	6290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429029
5	NC_020509	GAAACC	2	12	7763	7774	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478429030
6	NC_020509	AGAAAA	2	12	18695	18706	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478429039
7	NC_020509	TTTCTT	2	12	22909	22920	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478429043
8	NC_020509	TTGTTA	2	12	24448	24459	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478429044
9	NC_020509	ATGCAA	2	12	27201	27212	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478429047
10	NC_020509	CCAAAA	2	12	31306	31317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429050
11	NC_020509	CATGGA	2	12	36592	36603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478429057
12	NC_020509	TTTTAT	2	12	40203	40214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478429059
13	NC_020509	TTCTTT	2	12	40872	40883	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478429060
14	NC_020509	TTTTTA	2	12	41392	41403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478429060
15	NC_020509	TTGGTG	2	12	43287	43298	0 %	50 %	50 %	0 %	478429063
16	NC_020509	ACAAAA	2	12	44211	44222	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	478429064
17	NC_020509	ATTGAA	2	12	46094	46105	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478429066
18	NC_020509	ATTAAA	2	12	50592	50603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429069
19	NC_020509	AAAAGA	2	12	51311	51322	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478429071
20	NC_020509	TGAGCA	2	12	52605	52616	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478429073
21	NC_020509	GAAAAT	2	12	53273	53284	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478429073
22	NC_020509	GTGCCT	2	12	55739	55750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429076
23	NC_020509	GATTTT	2	12	56075	56086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478429076
24	NC_020509	GTTTTT	2	12	60010	60021	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	478429080
25	NC_020509	TCTTTG	2	12	62409	62420	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478429083
26	NC_020509	TGAAAT	2	12	62914	62925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478429083
27	NC_020509	TAAAAA	2	12	67670	67681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	478429087
28	NC_020509	AAAAGA	2	12	72506	72517	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478429090
29	NC_020509	AGAAAA	2	12	72572	72583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478429090
30	NC_020509	GAAAAC	2	12	73254	73265	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478429092
31	NC_020509	ATAAAG	2	12	73902	73913	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478429094
32	NC_020509	GATGTG	2	12	74144	74155	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	478429094
33	NC_020509	AGCCAA	2	12	74222	74233	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478429094
34	NC_020509	AAAAGA	2	12	75258	75269	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478429095
35	NC_020509	CCAACA	2	12	76112	76123	50 %	0 %	0 %	50 %	478429095
36	NC_020509	ATGCGT	2	12	76283	76294	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478429096
37	NC_020509	TTTTGT	2	12	76445	76456	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	478429096
38	NC_020509	AAAAGA	2	12	76723	76734	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478429096
39	NC_020509	AGAAAA	2	12	78453	78464	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	478429099
40	NC_020509	AGCGGG	2	12	80621	80632	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	478429103
41	NC_020509	ACGCCC	2	12	88433	88444	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	478429112
42	NC_020509	TAAGGG	2	12	91151	91162	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478429115
43	NC_020509	CGCTAA	2	12	91514	91525	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478429115
44	NC_020509	CGCCCA	2	12	91688	91699	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	478429115
45	NC_020509	GCAACG	2	12	93529	93540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478429116
46	NC_020509	ATATTG	2	12	94317	94328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478429117
47	NC_020509	TCTTGA	2	12	97278	97289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478429120
48	NC_020509	AACAGG	2	12	102120	102131	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	478429123
49	NC_020509	ATTAGA	2	12	106138	106149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478429127
50	NC_020509	GATTTT	2	12	107897	107908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478429130
51	NC_020509	AAACTC	2	12	108014	108025	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478429130
52	NC_020509	TCAAAA	2	12	109505	109516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478429131
53	NC_020509	GCGGTG	2	12	110204	110215	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	478429132
54	NC_020509	TTAAGG	2	12	111751	111762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429133
55	NC_020509	AATATT	2	12	113412	113423	50 %	50 %	0 %	0 %	478429133
56	NC_020509	CATATT	2	12	119158	119169	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478429138
57	NC_020509	TGCTCA	2	12	120741	120752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478429140
58	NC_020509	TGCATG	2	12	121827	121838	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478429140
59	NC_020509	GGAGCG	2	12	123513	123524	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	478429142
60	NC_020509	TTTTCT	2	12	125013	125024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478429143
61	NC_020509	GCAAGC	2	12	125420	125431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478429143
62	NC_020509	CGCTCG	2	12	130030	130041	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	478429148
63	NC_020509	TAGGCA	2	12	132567	132578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478429149
64	NC_020509	TTCTAT	2	12	134908	134919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478429151
65	NC_020509	GTTCTA	2	12	135303	135314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478429151
66	NC_020509	CTATCT	2	12	136060	136071	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478429152
67	NC_020509	CTAAGG	2	12	136628	136639	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478429152
68	NC_020509	TGAATT	2	12	137162	137173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478429152
69	NC_020509	TTTCAA	2	12	137321	137332	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478429152
70	NC_020509	AGCAAA	2	12	140668	140679	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478429155
71	NC_020509	TGGTTT	2	12	142193	142204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429158
72	NC_020509	TCATGA	2	12	143452	143463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478429159
73	NC_020509	AAAAAT	2	12	149988	149999	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	478429164
74	NC_020509	ATCCTT	2	12	150681	150692	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478429165
75	NC_020509	ATTCAA	2	12	151073	151084	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478429166
76	NC_020509	TAGCGA	2	12	152129	152140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478429167
77	NC_020509	TATCGC	2	12	155233	155244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478429169
78	NC_020509	GGCTTA	2	12	155890	155901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478429170
79	NC_020509	ATTGAG	2	12	157596	157607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429171
80	NC_020509	CCTAAA	2	12	159172	159183	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478429172
81	NC_020509	TTCTAT	2	12	160332	160343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478429173
82	NC_020509	CTTGGG	2	12	163981	163992	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	478429179
83	NC_020509	GATTTT	2	12	169273	169284	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478429185
84	NC_020509	GATGGC	2	12	172498	172509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478429189
85	NC_020509	GGCGTG	2	12	172717	172728	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	478429189
86	NC_020509	CTTTCT	2	12	172750	172761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429189
87	NC_020509	CCGCTC	2	12	174761	174772	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	478429191
88	NC_020509	GCTCTC	2	12	177189	177200	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	478429193
89	NC_020509	TTCTAA	2	12	179523	179534	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478429196
90	NC_020509	TCAATA	2	12	181205	181216	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478429198
91	NC_020509	CGTTTT	2	12	181314	181325	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478429198
92	NC_020509	ATCGTT	2	12	181627	181638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478429198
93	NC_020509	AATTTC	2	12	181973	181984	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478429199
94	NC_020509	TAAAAT	2	12	182758	182769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429201
95	NC_020509	TTCTTT	2	12	183168	183179	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478429201
96	NC_020509	ATTTTG	2	12	184569	184580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478429203
97	NC_020509	CGCTTT	2	12	185047	185058	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478429203
98	NC_020509	ACTTAT	2	12	185144	185155	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478429203
99	NC_020509	GTTTAA	2	12	185831	185842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478429204
100	NC_020509	CCGCTC	2	12	188483	188494	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	478429207
101	NC_020509	GGTTTG	2	12	190090	190101	0 %	50 %	50 %	0 %	478429209
102	NC_020509	AGGCAT	2	12	192180	192191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478429210
103	NC_020509	GCATTT	2	12	193893	193904	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478429212
104	NC_020509	TCAAAC	2	12	194460	194471	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478429213
105	NC_020509	ATAAAG	2	12	194624	194635	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478429213
106	NC_020509	GGTATT	2	12	198369	198380	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478429217
107	NC_020509	TCTAAA	2	12	198599	198610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478429217
108	NC_020509	TGGGCA	2	12	199668	199679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478429218
109	NC_020509	TTCTAA	2	12	200147	200158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478429219
110	NC_020509	ATTTTC	2	12	202092	202103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478429219
111	NC_020509	TGGGGC	2	12	209503	209514	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	478429229
112	NC_020509	CTGTAT	2	12	212947	212958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478429232
113	NC_020509	AATTTT	2	12	213673	213684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429232
114	NC_020509	ATTCTA	2	12	221881	221892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478429239
115	NC_020509	CATAGC	2	12	223622	223633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478429240
116	NC_020509	GTTTTG	2	12	224127	224138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429240
117	NC_020509	TTATTT	2	12	225759	225770	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478429241
118	NC_020509	GTCATG	2	12	226658	226669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478429242
119	NC_020509	TAATTA	2	12	228630	228641	50 %	50 %	0 %	0 %	478429244
120	NC_020509	AGGCTA	2	12	232137	232148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478429249
121	NC_020509	AATGCC	2	12	236875	236886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478429253
122	NC_020509	AGGGCC	2	12	239468	239479	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	478429254
123	NC_020509	GTGTTA	2	12	241025	241036	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478429255
124	NC_020509	GGTGAT	2	12	241084	241095	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	478429255
125	NC_020509	CACGCC	2	12	242005	242016	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	478429256
126	NC_020509	TATTTT	2	12	242565	242576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478429256
127	NC_020509	GCTTTG	2	12	243259	243270	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	478429257
128	NC_020509	GCTAGG	2	12	244640	244651	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478429258
129	NC_020509	TCTTTA	2	12	251210	251221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478429265
130	NC_020509	GTTTTT	2	12	256846	256857	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	478429272
131	NC_020509	ATTGTC	2	12	260006	260017	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478429275
132	NC_020509	TCCCGC	2	12	263000	263011	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	478429277
133	NC_020509	AGTGGG	2	12	266190	266201	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478429280
134	NC_020509	TGAGCG	2	12	270846	270857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478429285
135	NC_020509	GATTTT	2	12	277734	277745	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478429290
136	NC_020509	TGAGCG	2	12	280995	281006	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478429293
137	NC_020509	AGCTTT	2	12	281143	281154	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478429293
138	NC_020509	GATTTT	2	12	285680	285691	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478429300
139	NC_020509	ATTAGA	2	12	285802	285813	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478429300
140	NC_020509	TCAAAA	2	12	287912	287923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478429302
141	NC_020509	AAATAC	2	12	288220	288231	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478429303
142	NC_020509	AAATCA	2	12	288581	288592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478429304
143	NC_020509	GTTAGC	2	12	290333	290344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478429305
144	NC_020509	GAGTGG	2	12	291776	291787	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478429307
145	NC_020509	AGCGAG	2	12	299570	299581	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	478429312
146	NC_020509	TTTTAA	2	12	301862	301873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429316
147	NC_020509	ACTTTT	2	12	301968	301979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478429316
148	NC_020509	AGTAAT	2	12	302910	302921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478429316
149	NC_020509	TATGGA	2	12	304100	304111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429316
150	NC_020509	ATTTGA	2	12	304987	304998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478429316
151	NC_020509	TAACAT	2	12	307412	307423	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478429316
152	NC_020509	TTTAGA	2	12	310263	310274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478429318
153	NC_020509	ATTTCA	2	12	313275	313286	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478429321
154	NC_020509	GTAGCG	2	12	314606	314617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478429322
155	NC_020509	TTATCG	2	12	316853	316864	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478429323
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159	NC_020509	GCTATG	2	12	322579	322590	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478429329
160	NC_020509	ATTGGA	2	12	324546	324557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429331
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171	NC_020509	CGCAAT	2	12	341187	341198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478429350
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189	NC_020509	GCTAAA	2	12	373826	373837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478429385
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202	NC_020509	ATCATA	2	12	400600	400611	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478429410
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230	NC_020509	TTCTTT	2	12	454679	454690	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478429464
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232	NC_020509	TTCTTT	2	12	460005	460016	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478429467
233	NC_020509	GGTTTT	2	12	460371	460382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429467
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346	NC_020509	GCAAAA	2	12	670515	670526	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478429678
347	NC_020509	GAATGC	2	12	671521	671532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478429679
348	NC_020509	TTAGAA	2	12	671834	671845	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478429680
349	NC_020509	GATTTT	2	12	672754	672765	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478429681
350	NC_020509	CATTGG	2	12	673200	673211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478429681
351	NC_020509	ATTACC	2	12	674164	674175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429682
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353	NC_020509	ACCATT	2	12	679381	679392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429686
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457	NC_020509	ATTTAT	2	12	893282	893293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429864
458	NC_020509	CAAACT	2	12	899947	899958	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478429868
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460	NC_020509	ATCGCC	2	12	900296	900307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478429868
461	NC_020509	CATCAA	2	12	901276	901287	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478429869
462	NC_020509	AATTTA	2	12	910114	910125	50 %	50 %	0 %	0 %	478429878
463	NC_020509	GCGTTA	2	12	919321	919332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478429885
464	NC_020509	CAATAT	2	12	922869	922880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478429887
465	NC_020509	AAAGTG	2	12	925067	925078	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478429888
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