MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 14657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429023
2	NC_020509	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429023
3	NC_020509	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429023
4	NC_020509	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429023
5	NC_020509	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429023
6	NC_020509	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429024
7	NC_020509	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429024
8	NC_020509	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429024
9	NC_020509	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429024
10	NC_020509	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429025
11	NC_020509	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429025
12	NC_020509	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429025
13	NC_020509	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429025
14	NC_020509	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478429025
15	NC_020509	GCT	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429025
16	NC_020509	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429025
17	NC_020509	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429025
18	NC_020509	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429026
19	NC_020509	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429026
20	NC_020509	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429026
21	NC_020509	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429026
22	NC_020509	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429026
23	NC_020509	CAT	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429026
24	NC_020509	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429026
25	NC_020509	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429026
26	NC_020509	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429027
27	NC_020509	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429027
28	NC_020509	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429027
29	NC_020509	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429028
30	NC_020509	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429028
31	NC_020509	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429028
32	NC_020509	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478429028
33	NC_020509	ATT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
34	NC_020509	TGG	2	6	5575	5580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429029
35	NC_020509	GTT	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
36	NC_020509	TAA	2	6	5846	5851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429029
37	NC_020509	TTA	2	6	5904	5909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
38	NC_020509	GTG	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429029
39	NC_020509	GTT	2	6	5993	5998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
40	NC_020509	TCT	2	6	6117	6122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429029
41	NC_020509	AGT	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429029
42	NC_020509	AGA	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429029
43	NC_020509	TCA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429029
44	NC_020509	CTG	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429029
45	NC_020509	TGT	2	6	6637	6642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
46	NC_020509	ACC	2	6	6647	6652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429029
47	NC_020509	TTA	2	6	6669	6674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
48	NC_020509	CCG	2	6	6690	6695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429029
49	NC_020509	GTT	2	6	6752	6757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
50	NC_020509	TTG	2	6	6794	6799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
51	NC_020509	CAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
52	NC_020509	GCC	2	6	7654	7659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
53	NC_020509	TCT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
54	NC_020509	AAT	2	6	7813	7818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429030
55	NC_020509	CTT	2	6	7821	7826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
56	NC_020509	CAT	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
57	NC_020509	ATG	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429030
58	NC_020509	TCA	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
59	NC_020509	CCG	2	6	8042	8047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
60	NC_020509	CTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
61	NC_020509	TCA	2	6	8096	8101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
62	NC_020509	CAT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
63	NC_020509	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
64	NC_020509	CCG	2	6	8396	8401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
65	NC_020509	CAC	2	6	8497	8502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429030
66	NC_020509	GAT	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429030
67	NC_020509	TAG	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429030
68	NC_020509	GAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429030
69	NC_020509	CTT	2	6	8751	8756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
70	NC_020509	TCT	2	6	8861	8866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
71	NC_020509	TAA	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429030
72	NC_020509	CTT	2	6	8982	8987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
73	NC_020509	GCA	2	6	9035	9040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478429030
74	NC_020509	CTT	2	6	9060	9065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
75	NC_020509	ACA	2	6	9382	9387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429031
76	NC_020509	TCT	2	6	9416	9421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429031
77	NC_020509	CTT	2	6	9498	9503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429031
78	NC_020509	GAT	3	9	9586	9594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429031
79	NC_020509	TCT	2	6	9614	9619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429031
80	NC_020509	CTA	2	6	9630	9635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429031
81	NC_020509	TTG	2	6	10045	10050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429032
82	NC_020509	GAA	2	6	10061	10066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429032
83	NC_020509	TTA	2	6	10240	10245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429032
84	NC_020509	AGA	2	6	10255	10260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429032
85	NC_020509	ACC	2	6	10263	10268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429032
86	NC_020509	AAG	2	6	10296	10301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429032
87	NC_020509	ATT	2	6	10329	10334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429032
88	NC_020509	CAT	2	6	10510	10515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429032
89	NC_020509	GTG	2	6	10544	10549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429032
90	NC_020509	ATG	2	6	10824	10829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429032
91	NC_020509	AGG	2	6	10889	10894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478429032
92	NC_020509	AAC	2	6	10916	10921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429032
93	NC_020509	AGA	2	6	11302	11307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429032
94	NC_020509	TTG	2	6	11315	11320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429032
95	NC_020509	GAC	2	6	11402	11407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478429032
96	NC_020509	TTA	3	9	11423	11431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429032
97	NC_020509	TTG	2	6	11480	11485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429032
98	NC_020509	TGT	2	6	11666	11671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429033
99	NC_020509	TGT	2	6	11834	11839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429033
100	NC_020509	AAG	2	6	11993	11998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429033
101	NC_020509	TAA	2	6	12303	12308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429033
102	NC_020509	CAA	2	6	12390	12395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429033
103	NC_020509	TGG	3	9	12404	12412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429033
104	NC_020509	GAA	3	9	12421	12429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429033
105	NC_020509	ATT	2	6	12474	12479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429033
106	NC_020509	AGA	2	6	12525	12530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429033
107	NC_020509	TTA	2	6	12836	12841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429034
108	NC_020509	GAA	2	6	12853	12858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429034
109	NC_020509	GTT	2	6	12920	12925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429034
110	NC_020509	ATT	2	6	12943	12948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429034
111	NC_020509	AAT	2	6	13225	13230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429034
112	NC_020509	CAA	2	6	13324	13329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429034
113	NC_020509	CTA	2	6	13382	13387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429034
114	NC_020509	GGT	2	6	13461	13466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429034
115	NC_020509	ATT	2	6	13468	13473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429034
116	NC_020509	AGA	3	9	13521	13529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429034
117	NC_020509	GTG	2	6	13945	13950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429035
118	NC_020509	GAA	2	6	14036	14041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429036
119	NC_020509	ATT	3	9	14223	14231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429036
120	NC_020509	GAA	2	6	14362	14367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429037
121	NC_020509	AAC	2	6	14368	14373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429037
122	NC_020509	ATG	2	6	14387	14392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429037
123	NC_020509	TGG	2	6	14423	14428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429037
124	NC_020509	TCC	2	6	14432	14437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478429037
125	NC_020509	CAA	2	6	14572	14577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429037
126	NC_020509	AAG	2	6	14633	14638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429037
127	NC_020509	TAG	2	6	14900	14905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429037
128	NC_020509	ATT	2	6	14957	14962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429037
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130	NC_020509	AGG	2	6	15354	15359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478429037
131	NC_020509	ACC	2	6	15395	15400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429037
132	NC_020509	ATT	2	6	15518	15523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429037
133	NC_020509	AAG	2	6	15551	15556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429037
134	NC_020509	CAA	2	6	15564	15569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429037
135	NC_020509	ATG	2	6	15655	15660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429037
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138	NC_020509	AAG	2	6	15866	15871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429037
139	NC_020509	CAT	2	6	16089	16094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429037
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252	NC_020509	GGA	2	6	28906	28911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478429047
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