MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori OK113 DNA

Total Repeats: 721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020508	CCGCAG	2	12	1043	1054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470164403
2	NC_020508	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	470164404
3	NC_020508	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470164406
4	NC_020508	GAAACC	2	12	7760	7771	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470164408
5	NC_020508	ACTAAA	2	12	14251	14262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470164414
6	NC_020508	AGAAAA	2	12	18698	18709	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470164417
7	NC_020508	GATAAA	2	12	22254	22265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470164420
8	NC_020508	TGTTAT	11	66	24541	24606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470164421
9	NC_020508	ATGCAA	2	12	27395	27406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470164424
10	NC_020508	ATTAGA	2	12	32424	32435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470164428
11	NC_020508	CATGGA	2	12	36816	36827	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470164434
12	NC_020508	TTTTAT	2	12	40427	40438	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470164436
13	NC_020508	TTGGTG	2	12	43505	43516	0 %	50 %	50 %	0 %	470164440
14	NC_020508	ACAAAA	2	12	44429	44440	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	470164441
15	NC_020508	ATTGAA	2	12	46312	46323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470164443
16	NC_020508	GGCACA	2	12	50995	51006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164446
17	NC_020508	TTAGAA	2	12	51130	51141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470164446
18	NC_020508	GAAAAT	2	12	53792	53803	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470164448
19	NC_020508	GTGCCT	2	12	56267	56278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470164451
20	NC_020508	GATTTT	2	12	56603	56614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470164451
21	NC_020508	ATGAAA	2	12	59198	59209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470164454
22	NC_020508	TTTTTA	2	12	60520	60531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470164455
23	NC_020508	TAAAAA	2	12	67957	67968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470164462
24	NC_020508	AATTTT	2	12	73004	73015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164465
25	NC_020508	GATGTG	2	12	74327	74338	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470164467
26	NC_020508	TTTTGT	2	12	76629	76640	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470164470
27	NC_020508	AAAGAG	2	12	76908	76919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164470
28	NC_020508	AGAAAA	2	12	78343	78354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470164472
29	NC_020508	GGACAA	2	12	79887	79898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470164475
30	NC_020508	AGCGGG	2	12	80511	80522	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	470164476
31	NC_020508	CCCACA	2	12	88287	88298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164484
32	NC_020508	TAAGGG	2	12	91002	91013	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470164487
33	NC_020508	CGCTAA	2	12	91365	91376	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470164487
34	NC_020508	CGCCCA	2	12	91539	91550	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470164487
35	NC_020508	AGCGGT	2	12	92522	92533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164489
36	NC_020508	GGCATG	2	12	94477	94488	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164493
37	NC_020508	AATATT	2	12	96078	96089	50 %	50 %	0 %	0 %	470164494
38	NC_020508	AACAGG	2	12	103894	103905	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470164500
39	NC_020508	GGCTTT	2	12	105196	105207	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470164502
40	NC_020508	AAAAAT	2	12	106435	106446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470164503
41	NC_020508	AAGCAT	2	12	107634	107645	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470164504
42	NC_020508	ATTAGA	2	12	107933	107944	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470164504
43	NC_020508	GATTTT	2	12	109693	109704	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470164508
44	NC_020508	CAAACT	2	12	109809	109820	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470164508
45	NC_020508	TCAAAA	2	12	111300	111311	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470164509
46	NC_020508	GCGGTG	2	12	112002	112013	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	470164510
47	NC_020508	TTAATT	2	12	112537	112548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164510
48	NC_020508	TTAAGG	2	12	113557	113568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164511
49	NC_020508	CAATAT	2	12	115217	115228	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470164511
50	NC_020508	GGAGCG	2	12	125909	125920	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	470164521
51	NC_020508	TTTTCT	2	12	127409	127420	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470164522
52	NC_020508	CGCTCG	2	12	132440	132451	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470164527
53	NC_020508	TAGGCA	2	12	134977	134988	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470164528
54	NC_020508	TTCTAT	2	12	137326	137337	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470164530
55	NC_020508	GTTCTA	2	12	137637	137648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470164530
56	NC_020508	GTTCTA	2	12	137700	137711	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470164530
57	NC_020508	CTAAGG	2	12	139020	139031	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470164531
58	NC_020508	TGAATT	2	12	139554	139565	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470164531
59	NC_020508	TTTCAA	2	12	139713	139724	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470164531
60	NC_020508	AGCAAA	2	12	143076	143087	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470164534
61	NC_020508	CAAAAA	2	12	143359	143370	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	470164534
62	NC_020508	TCATGA	2	12	145857	145868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470164538
63	NC_020508	GATAGC	2	12	146929	146940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470164539
64	NC_020508	AAAAAT	2	12	152572	152583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470164543
65	NC_020508	ATTCAA	2	12	153655	153666	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470164545
66	NC_020508	TAGCGA	2	12	154711	154722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470164546
67	NC_020508	TATCGC	2	12	157815	157826	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470164548
68	NC_020508	ATCGCT	2	12	159523	159534	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470164549
69	NC_020508	CCTAAA	2	12	161746	161757	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470164551
70	NC_020508	TTCTAT	2	12	162906	162917	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470164552
71	NC_020508	CTTGGG	2	12	166555	166566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470164558
72	NC_020508	GATTTT	2	12	171845	171856	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470164564
73	NC_020508	GATGGC	2	12	175164	175175	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164568
74	NC_020508	CTTTCT	2	12	175308	175319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164568
75	NC_020508	CCGCTC	2	12	177316	177327	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	470164570
76	NC_020508	GCTCTC	2	12	179744	179755	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470164572
77	NC_020508	TCAATA	2	12	183746	183757	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470164577
78	NC_020508	ATCGTT	2	12	184168	184179	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470164577
79	NC_020508	AATTTC	2	12	184514	184525	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470164578
80	NC_020508	TTCTTT	2	12	186297	186308	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470164581
81	NC_020508	ATTTTG	2	12	187698	187709	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470164583
82	NC_020508	CGCTTT	2	12	188176	188187	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470164583
83	NC_020508	GTTTAA	2	12	188960	188971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470164584
84	NC_020508	CCGCTC	2	12	191599	191610	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	470164587
85	NC_020508	GGTTTG	2	12	193206	193217	0 %	50 %	50 %	0 %	470164589
86	NC_020508	AGGCAT	2	12	195311	195322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470164590
87	NC_020508	GCATTT	2	12	197024	197035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470164592
88	NC_020508	TCAAAC	2	12	197591	197602	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470164593
89	NC_020508	ATAAAG	2	12	197758	197769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470164593
90	NC_020508	GGTATT	2	12	201535	201546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470164598
91	NC_020508	TCTAAA	2	12	201765	201776	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470164598
92	NC_020508	TGGGCA	2	12	202834	202845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164599
93	NC_020508	TTCTAA	2	12	203313	203324	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470164600
94	NC_020508	ATTTTC	2	12	205258	205269	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470164600
95	NC_020508	TGGGGC	2	12	212669	212680	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	470164610
96	NC_020508	CTGTAT	2	12	216081	216092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470164615
97	NC_020508	AATTTT	2	12	216765	216776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164615
98	NC_020508	ATTCTA	2	12	224986	224997	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470164623
99	NC_020508	CATAGC	2	12	226727	226738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470164624
100	NC_020508	GTTTTG	2	12	227232	227243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164624
101	NC_020508	TTATTT	2	12	228864	228875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470164625
102	NC_020508	AATGCC	2	12	238888	238899	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470164635
103	NC_020508	GGATTG	2	12	241179	241190	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470164636
104	NC_020508	TGGTTT	2	12	241322	241333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164636
105	NC_020508	AGGGCC	2	12	241528	241539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470164636
106	NC_020508	GGTGAT	2	12	243137	243148	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470164637
107	NC_020508	TCAATA	2	12	243554	243565	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470164638
108	NC_020508	CACGCC	2	12	244034	244045	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470164638
109	NC_020508	GCTAGG	2	12	246652	246663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164640
110	NC_020508	TCTTTA	2	12	253449	253460	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470164648
111	NC_020508	GTTTTT	2	12	259085	259096	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470164655
112	NC_020508	ATTGTC	2	12	262245	262256	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470164658
113	NC_020508	TCCCGC	2	12	264426	264437	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	470164660
114	NC_020508	TTTAGC	2	12	268459	268470	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470164663
115	NC_020508	TGAGCG	2	12	273088	273099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164668
116	NC_020508	GATTTT	2	12	279982	279993	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470164673
117	NC_020508	TGAGCG	2	12	283243	283254	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164676
118	NC_020508	AGCTTT	2	12	283391	283402	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470164676
119	NC_020508	GATTTT	2	12	287928	287939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470164683
120	NC_020508	ATTAGA	2	12	288050	288061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470164683
121	NC_020508	TCAAAA	2	12	290161	290172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470164685
122	NC_020508	AAATAC	2	12	290470	290481	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470164686
123	NC_020508	AAATCA	2	12	290831	290842	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470164687
124	NC_020508	GTTAGC	2	12	292583	292594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470164688
125	NC_020508	AGCGAG	2	12	301790	301801	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470164695
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127	NC_020508	ACTTTT	2	12	304182	304193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470164698
128	NC_020508	AGTAAT	2	12	305124	305135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470164698
129	NC_020508	TATGGA	2	12	306308	306319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164698
130	NC_020508	ATTTGA	2	12	307195	307206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470164698
131	NC_020508	TAACAT	2	12	309620	309631	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470164698
132	NC_020508	TTTAGA	2	12	312469	312480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470164699
133	NC_020508	GTAGCG	2	12	316805	316816	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164703
134	NC_020508	TTATCG	2	12	319051	319062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470164704
135	NC_020508	GGCATG	2	12	321191	321202	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164707
136	NC_020508	GTGAAT	2	12	322316	322327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164707
137	NC_020508	GAAAAA	2	12	323884	323895	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470164709
138	NC_020508	GCTATG	2	12	324735	324746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470164710
139	NC_020508	ATGCGC	2	12	326965	326976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470164712
140	NC_020508	TGCGTT	3	18	327083	327100	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470164713
141	NC_020508	GCACTA	2	12	327584	327595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470164713
142	NC_020508	AAATGA	2	12	332020	332031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470164719
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144	NC_020508	AGTTGT	2	12	333860	333871	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470164721
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147	NC_020508	TTTCTT	2	12	341405	341416	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470164729
148	NC_020508	TCATTT	2	12	342638	342649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470164729
149	NC_020508	GGCGTG	2	12	342817	342828	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	470164730
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230	NC_020508	AGAAAG	2	12	478423	478434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164865
231	NC_020508	TGCAAA	2	12	478893	478904	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470164865
232	NC_020508	ACTTTA	2	12	480531	480542	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470164866
233	NC_020508	GGAGCA	2	12	483700	483711	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470164870
234	NC_020508	TGGTAT	2	12	484432	484443	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470164870
235	NC_020508	CTACAA	2	12	485206	485217	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470164871
236	NC_020508	GCGTTG	2	12	486614	486625	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470164872
237	NC_020508	GATATT	2	12	488188	488199	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470164872
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239	NC_020508	TTTGTT	2	12	490853	490864	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470164875
240	NC_020508	AGGGTT	2	12	492068	492079	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470164877
241	NC_020508	TTGTTT	2	12	492217	492228	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470164877
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243	NC_020508	GCTCGC	2	12	496133	496144	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470164881
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247	NC_020508	TTGTGA	2	12	505874	505885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470164889
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254	NC_020508	TTAGAA	2	12	530110	530121	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470164911
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256	NC_020508	CAAGTT	2	12	532331	532342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470164913
257	NC_020508	CGCTTA	2	12	534237	534248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470164916
258	NC_020508	ACAATA	2	12	536815	536826	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470164920
259	NC_020508	ACAATA	2	12	537400	537411	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470164920
260	NC_020508	AGTGGG	2	12	538321	538332	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	470164921
261	NC_020508	TCCCTT	2	12	538637	538648	0 %	50 %	0 %	50 %	470164921
262	NC_020508	TGGGAG	2	12	539082	539093	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	470164921
263	NC_020508	AAGTCT	2	12	540534	540545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470164922
264	NC_020508	AAAGAA	2	12	541560	541571	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470164924
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323	NC_020508	TTGGCA	2	12	696007	696018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470165049
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326	NC_020508	AGAAAA	2	12	703440	703451	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470165057
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329	NC_020508	GCATTG	2	12	710205	710216	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470165063
330	NC_020508	CATAGC	2	12	711620	711631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470165065
331	NC_020508	GTTTTT	2	12	711681	711692	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470165065
332	NC_020508	AGCGTT	2	12	711783	711794	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470165065
333	NC_020508	TCAAAA	2	12	712982	712993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470165066
334	NC_020508	TATGAT	2	12	713901	713912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470165068
335	NC_020508	ATGGCA	2	12	717629	717640	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470165069
336	NC_020508	AAAAGA	2	12	717916	717927	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470165070
337	NC_020508	ACCATT	2	12	718082	718093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470165070
338	NC_020508	ACCAAA	2	12	720135	720146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470165072
339	NC_020508	TGCTCT	2	12	720153	720164	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470165072
340	NC_020508	GAAATT	2	12	723826	723837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470165074
341	NC_020508	TAAAGA	2	12	723900	723911	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470165075
342	NC_020508	TTTGGA	2	12	724735	724746	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470165076
343	NC_020508	GAATGC	2	12	725914	725925	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470165077
344	NC_020508	CATTGG	2	12	727592	727603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470165079
345	NC_020508	ATTACC	2	12	728556	728567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470165080
346	NC_020508	CTAAAG	2	12	730491	730502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470165083
347	NC_020508	AGACAA	2	12	733418	733429	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470165083
348	NC_020508	ACCATT	2	12	736127	736138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470165085
349	NC_020508	ATGAAA	2	12	738149	738160	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470165086
350	NC_020508	TGCGTG	2	12	740946	740957	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470165089
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352	NC_020508	TTTCTT	2	12	745702	745713	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470165094
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363	NC_020508	GATAAC	2	12	775160	775171	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470165116
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375	NC_020508	TATCGC	2	12	803127	803138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470165145
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450	NC_020508	TTTGGG	2	12	980252	980263	0 %	50 %	50 %	0 %	470165324
451	NC_020508	CTCACT	2	12	981556	981567	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470165325
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457	NC_020508	TCTTTA	2	12	994459	994470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470165330
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459	NC_020508	AGTGAG	2	12	996155	996166	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470165332
460	NC_020508	TTAGAA	2	12	997357	997368	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470165333
461	NC_020508	GCAAAA	2	12	999040	999051	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470165335
462	NC_020508	CATCAC	2	12	1000200	1000211	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	470165337
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464	NC_020508	AAAATG	2	12	1004733	1004744	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470165342
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