MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 71283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_019779	AGA	2	6	244221	244226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774877
4003	NC_019779	GGT	2	6	244255	244260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774877
4004	NC_019779	AAT	2	6	244264	244269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774877
4005	NC_019779	GA	3	6	244304	244309	50 %	0 %	50 %	0 %	428774877
4006	NC_019779	AAG	2	6	244312	244317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774877
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4008	NC_019779	ATCAA	2	10	244397	244406	60 %	20 %	0 %	20 %	428774877
4009	NC_019779	A	6	6	244405	244410	100 %	0 %	0 %	0 %	428774877
4010	NC_019779	AAAACG	2	12	244419	244430	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428774877
4011	NC_019779	ACT	2	6	244450	244455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774877
4012	NC_019779	ATAA	2	8	244460	244467	75 %	25 %	0 %	0 %	428774877
4013	NC_019779	AAT	2	6	244516	244521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774877
4014	NC_019779	TGA	2	6	244533	244538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774877
4015	NC_019779	ATC	2	6	244544	244549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774877
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4017	NC_019779	ACCG	2	8	244702	244709	25 %	0 %	25 %	50 %	428774877
4018	NC_019779	T	6	6	244712	244717	0 %	100 %	0 %	0 %	428774877
4019	NC_019779	GTA	2	6	244725	244730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774877
4020	NC_019779	ACC	2	6	244860	244865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774877
4021	NC_019779	ATA	2	6	245041	245046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774877
4022	NC_019779	AGG	2	6	245049	245054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774877
4023	NC_019779	GTA	2	6	245143	245148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774877
4024	NC_019779	TCT	2	6	245195	245200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774877
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4027	NC_019779	C	6	6	245307	245312	0 %	0 %	0 %	100 %	428774877
4028	NC_019779	TC	3	6	245318	245323	0 %	50 %	0 %	50 %	428774877
4029	NC_019779	T	6	6	245331	245336	0 %	100 %	0 %	0 %	428774877
4030	NC_019779	ATA	2	6	245350	245355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774877
4031	NC_019779	GGCT	2	8	245364	245371	0 %	25 %	50 %	25 %	428774877
4032	NC_019779	CGA	2	6	245402	245407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774877
4033	NC_019779	GAA	2	6	245460	245465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774877
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4040	NC_019779	GTTT	2	8	246012	246019	0 %	75 %	25 %	0 %	428774878
4041	NC_019779	T	6	6	246017	246022	0 %	100 %	0 %	0 %	428774878
4042	NC_019779	AAC	2	6	246041	246046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774878
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4054	NC_019779	CAT	2	6	246614	246619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774879
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4058	NC_019779	CTG	2	6	246893	246898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774879
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4093	NC_019779	GCT	2	6	248656	248661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774881
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4104	NC_019779	A	6	6	249195	249200	100 %	0 %	0 %	0 %	428774881
4105	NC_019779	T	6	6	249228	249233	0 %	100 %	0 %	0 %	428774881
4106	NC_019779	ACTGCA	2	12	249391	249402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428774881
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4108	NC_019779	AGTC	2	8	249934	249941	25 %	25 %	25 %	25 %	428774882
4109	NC_019779	TTA	2	6	249947	249952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774882
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4111	NC_019779	GCA	2	6	249974	249979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774882
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4118	NC_019779	A	7	7	250234	250240	100 %	0 %	0 %	0 %	428774882
4119	NC_019779	TAT	2	6	250242	250247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774882
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4121	NC_019779	CAG	2	6	250290	250295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774882
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4491	NC_019779	CTA	2	6	270063	270068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774902
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