MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 71283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019779	TAAT	2	8	53370	53377	50 %	50 %	0 %	0 %	428774727
1002	NC_019779	AACGT	2	10	53393	53402	40 %	20 %	20 %	20 %	428774727
1003	NC_019779	GCT	2	6	53456	53461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774727
1004	NC_019779	ATA	2	6	53494	53499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774727
1005	NC_019779	T	6	6	53532	53537	0 %	100 %	0 %	0 %	428774727
1006	NC_019779	CTG	2	6	53551	53556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774727
1007	NC_019779	A	7	7	53563	53569	100 %	0 %	0 %	0 %	428774727
1008	NC_019779	ATT	2	6	53599	53604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774727
1009	NC_019779	AAT	2	6	53682	53687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774727
1010	NC_019779	AATC	2	8	53697	53704	50 %	25 %	0 %	25 %	428774727
1011	NC_019779	ATCA	2	8	53728	53735	50 %	25 %	0 %	25 %	428774727
1012	NC_019779	TGT	2	6	53801	53806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774727
1013	NC_019779	GTT	2	6	53841	53846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774727
1014	NC_019779	GTT	2	6	53853	53858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774727
1015	NC_019779	GCTT	2	8	53894	53901	0 %	50 %	25 %	25 %	428774727
1016	NC_019779	TTG	2	6	53923	53928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774727
1017	NC_019779	GTT	2	6	54000	54005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774727
1018	NC_019779	TAAA	2	8	54017	54024	75 %	25 %	0 %	0 %	428774727
1019	NC_019779	TTC	2	6	54043	54048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774727
1020	NC_019779	TGC	2	6	54168	54173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774727
1021	NC_019779	CTT	2	6	54264	54269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774727
1022	NC_019779	GCTTGC	2	12	54347	54358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774727
1023	NC_019779	TCC	2	6	54368	54373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774727
1024	NC_019779	CTT	2	6	54387	54392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774727
1025	NC_019779	GCT	2	6	54401	54406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774727
1026	NC_019779	GTT	2	6	54429	54434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774727
1027	NC_019779	T	6	6	54454	54459	0 %	100 %	0 %	0 %	428774727
1028	NC_019779	AATT	2	8	54468	54475	50 %	50 %	0 %	0 %	428774727
1029	NC_019779	ATTG	2	8	55064	55071	25 %	50 %	25 %	0 %	428774728
1030	NC_019779	TAT	2	6	55146	55151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774728
1031	NC_019779	GCA	2	6	55181	55186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774729
1032	NC_019779	AGA	2	6	55268	55273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774729
1033	NC_019779	TGG	2	6	55354	55359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774729
1034	NC_019779	TCA	2	6	55517	55522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774729
1035	NC_019779	CT	3	6	55648	55653	0 %	50 %	0 %	50 %	428774730
1036	NC_019779	ATC	2	6	55804	55809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774730
1037	NC_019779	GAA	2	6	55895	55900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774730
1038	NC_019779	ATC	2	6	55941	55946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774730
1039	NC_019779	TTGG	2	8	56135	56142	0 %	50 %	50 %	0 %	428774730
1040	NC_019779	GAG	2	6	56189	56194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774730
1041	NC_019779	AG	3	6	56309	56314	50 %	0 %	50 %	0 %	428774730
1042	NC_019779	GAAA	2	8	56324	56331	75 %	0 %	25 %	0 %	428774730
1043	NC_019779	TTAAAA	2	12	56456	56467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774730
1044	NC_019779	TGA	2	6	56537	56542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774731
1045	NC_019779	TCA	2	6	56574	56579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774731
1046	NC_019779	TCT	2	6	56661	56666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774731
1047	NC_019779	ATT	2	6	56752	56757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774731
1048	NC_019779	GAT	2	6	56782	56787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774731
1049	NC_019779	CG	3	6	56814	56819	0 %	0 %	50 %	50 %	428774731
1050	NC_019779	A	6	6	56856	56861	100 %	0 %	0 %	0 %	428774731
1051	NC_019779	CCA	2	6	56945	56950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774731
1052	NC_019779	AGA	2	6	57093	57098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774731
1053	NC_019779	TCC	2	6	57103	57108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774731
1054	NC_019779	TTA	2	6	57124	57129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774731
1055	NC_019779	CAC	2	6	57162	57167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774731
1056	NC_019779	TA	3	6	57170	57175	50 %	50 %	0 %	0 %	428774731
1057	NC_019779	GTT	2	6	57234	57239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774731
1058	NC_019779	A	6	6	57284	57289	100 %	0 %	0 %	0 %	428774731
1059	NC_019779	C	6	6	57452	57457	0 %	0 %	0 %	100 %	428774731
1060	NC_019779	CGT	2	6	57466	57471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774731
1061	NC_019779	TGC	2	6	57506	57511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774731
1062	NC_019779	GTTT	2	8	57620	57627	0 %	75 %	25 %	0 %	428774731
1063	NC_019779	TG	3	6	57629	57634	0 %	50 %	50 %	0 %	428774731
1064	NC_019779	TGG	2	6	57667	57672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774731
1065	NC_019779	CGA	3	9	57700	57708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774731
1066	NC_019779	TTA	2	6	57751	57756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774731
1067	NC_019779	CAG	2	6	57804	57809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774731
1068	NC_019779	TTA	2	6	57937	57942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774731
1069	NC_019779	GAG	2	6	57976	57981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774731
1070	NC_019779	AGG	2	6	57993	57998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774731
1071	NC_019779	TGC	2	6	58031	58036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774731
1072	NC_019779	TTG	2	6	58130	58135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774731
1073	NC_019779	CCAATC	2	12	58205	58216	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428774731
1074	NC_019779	TTA	2	6	58222	58227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774731
1075	NC_019779	AGC	3	9	58293	58301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774731
1076	NC_019779	GAATT	2	10	58306	58315	40 %	40 %	20 %	0 %	428774731
1077	NC_019779	ATG	2	6	58418	58423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774731
1078	NC_019779	ATT	2	6	58453	58458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774731
1079	NC_019779	CGT	2	6	58492	58497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774731
1080	NC_019779	GCTGC	2	10	58684	58693	0 %	20 %	40 %	40 %	428774731
1081	NC_019779	ACTGA	2	10	58798	58807	40 %	20 %	20 %	20 %	428774731
1082	NC_019779	A	6	6	58807	58812	100 %	0 %	0 %	0 %	428774731
1083	NC_019779	CAA	2	6	58840	58845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774731
1084	NC_019779	GCT	2	6	58876	58881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774731
1085	NC_019779	TTC	3	9	58896	58904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774731
1086	NC_019779	ATC	2	6	58917	58922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774731
1087	NC_019779	CAT	2	6	59219	59224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774732
1088	NC_019779	T	6	6	59312	59317	0 %	100 %	0 %	0 %	428774732
1089	NC_019779	GTT	3	9	59445	59453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774733
1090	NC_019779	AGA	2	6	59457	59462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774733
1091	NC_019779	ATT	2	6	59469	59474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774733
1092	NC_019779	TTG	2	6	59604	59609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774733
1093	NC_019779	AAT	2	6	59634	59639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774733
1094	NC_019779	GCGG	2	8	59646	59653	0 %	0 %	75 %	25 %	428774733
1095	NC_019779	TGC	2	6	59674	59679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774733
1096	NC_019779	CCA	2	6	59855	59860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774733
1097	NC_019779	GCT	2	6	59894	59899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774733
1098	NC_019779	GGAGA	2	10	59900	59909	40 %	0 %	60 %	0 %	428774733
1099	NC_019779	GTT	2	6	59921	59926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774733
1100	NC_019779	TTG	2	6	59931	59936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774733
1101	NC_019779	CTT	2	6	59954	59959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774733
1102	NC_019779	AG	3	6	60018	60023	50 %	0 %	50 %	0 %	428774733
1103	NC_019779	AAT	2	6	60069	60074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774733
1104	NC_019779	CAAC	2	8	60345	60352	50 %	0 %	0 %	50 %	428774733
1105	NC_019779	AGG	2	6	60478	60483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774733
1106	NC_019779	GTT	2	6	60551	60556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774733
1107	NC_019779	CAC	2	6	60597	60602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774733
1108	NC_019779	TAA	2	6	60624	60629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774733
1109	NC_019779	GAG	2	6	60642	60647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774733
1110	NC_019779	CAG	2	6	60653	60658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774733
1111	NC_019779	TGCAG	2	10	60739	60748	20 %	20 %	40 %	20 %	428774733
1112	NC_019779	CAA	2	6	60749	60754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774733
1113	NC_019779	ACA	2	6	60781	60786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774733
1114	NC_019779	TTG	2	6	60825	60830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774733
1115	NC_019779	CAA	2	6	60911	60916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774733
1116	NC_019779	ACG	2	6	60925	60930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774733
1117	NC_019779	AGGATT	2	12	60931	60942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774733
1118	NC_019779	GA	3	6	60977	60982	50 %	0 %	50 %	0 %	428774733
1119	NC_019779	TTA	2	6	61028	61033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774733
1120	NC_019779	AG	3	6	61047	61052	50 %	0 %	50 %	0 %	428774733
1121	NC_019779	TGG	2	6	61426	61431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774734
1122	NC_019779	CG	3	6	61449	61454	0 %	0 %	50 %	50 %	428774734
1123	NC_019779	GTTG	2	8	61465	61472	0 %	50 %	50 %	0 %	428774734
1124	NC_019779	GCAGTC	2	12	61522	61533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428774734
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1499	NC_019779	GAT	2	6	88253	88258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774752
1500	NC_019779	CCG	2	6	88326	88331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428774752

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