MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 plasmid p1HPAKL86

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019564	AAGA	2	8	283	290	75 %	0 %	25 %	0 %	425791555
2	NC_019564	TCCA	2	8	2732	2739	25 %	25 %	0 %	50 %	425791558
3	NC_019564	AAGA	2	8	2784	2791	75 %	0 %	25 %	0 %	425791558
4	NC_019564	CATG	2	8	3515	3522	25 %	25 %	25 %	25 %	425791559
5	NC_019564	ATCA	2	8	3745	3752	50 %	25 %	0 %	25 %	425791559
6	NC_019564	ATGC	2	8	4292	4299	25 %	25 %	25 %	25 %	425791560
7	NC_019564	ATTT	2	8	5548	5555	25 %	75 %	0 %	0 %	425791561
8	NC_019564	AGAA	2	8	5635	5642	75 %	0 %	25 %	0 %	425791561
9	NC_019564	ATCA	2	8	5658	5665	50 %	25 %	0 %	25 %	425791561
10	NC_019564	GATT	2	8	6359	6366	25 %	50 %	25 %	0 %	425791561
11	NC_019564	CAAA	2	8	6494	6501	75 %	0 %	0 %	25 %	425791562
12	NC_019564	GTTA	2	8	6656	6663	25 %	50 %	25 %	0 %	425791562
13	NC_019564	TTTG	2	8	7019	7026	0 %	75 %	25 %	0 %	425791562
14	NC_019564	CAAA	2	8	7068	7075	75 %	0 %	0 %	25 %	425791562
15	NC_019564	AATC	2	8	7583	7590	50 %	25 %	0 %	25 %	425791563
16	NC_019564	AAAT	2	8	7722	7729	75 %	25 %	0 %	0 %	425791563
17	NC_019564	TTGA	2	8	7833	7840	25 %	50 %	25 %	0 %	425791563
18	NC_019564	AAGT	2	8	8432	8439	50 %	25 %	25 %	0 %	425791563
19	NC_019564	GTTT	2	8	8502	8509	0 %	75 %	25 %	0 %	425791563
20	NC_019564	CTTT	2	8	8573	8580	0 %	75 %	0 %	25 %	425791563
21	NC_019564	TTTC	2	8	10146	10153	0 %	75 %	0 %	25 %	425791565
22	NC_019564	TGGT	2	8	10632	10639	0 %	50 %	50 %	0 %	425791565
23	NC_019564	GCTT	2	8	10921	10928	0 %	50 %	25 %	25 %	425791565
24	NC_019564	TGAG	2	8	11610	11617	25 %	25 %	50 %	0 %	425791565
25	NC_019564	TAAC	2	8	11752	11759	50 %	25 %	0 %	25 %	425791565
26	NC_019564	ATTG	2	8	11783	11790	25 %	50 %	25 %	0 %	425791566
27	NC_019564	TTGT	3	12	12069	12080	0 %	75 %	25 %	0 %	425791566

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.