MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 plasmid p1HPAKL86

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019564	TAA	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791555
2	NC_019564	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791555
3	NC_019564	TTA	2	6	340	345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791555
4	NC_019564	GTT	2	6	694	699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791556
5	NC_019564	CAT	2	6	1185	1190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791557
6	NC_019564	GTT	2	6	1195	1200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791557
7	NC_019564	TTA	2	6	1202	1207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791557
8	NC_019564	ATT	2	6	1898	1903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791558
9	NC_019564	AGA	2	6	1904	1909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791558
10	NC_019564	CAC	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425791558
11	NC_019564	ACC	2	6	2094	2099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425791558
12	NC_019564	TAA	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791558
13	NC_019564	CAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791558
14	NC_019564	AAC	2	6	2931	2936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791558
15	NC_019564	CAA	2	6	3104	3109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791558
16	NC_019564	AGA	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791558
17	NC_019564	CAA	2	6	3323	3328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791558
18	NC_019564	AGA	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791558
19	NC_019564	ACT	3	9	3469	3477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791558
20	NC_019564	TGA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791559
21	NC_019564	ATT	2	6	3856	3861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791559
22	NC_019564	CAA	2	6	3905	3910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791559
23	NC_019564	CAA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791559
24	NC_019564	CAT	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791559
25	NC_019564	ATA	2	6	4356	4361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791560
26	NC_019564	AAT	2	6	4448	4453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791560
27	NC_019564	AGA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791560
28	NC_019564	ATT	2	6	5041	5046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791561
29	NC_019564	GAA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791561
30	NC_019564	AGT	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791561
31	NC_019564	GGA	2	6	5099	5104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	425791561
32	NC_019564	GAT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791561
33	NC_019564	CAA	2	6	5358	5363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791561
34	NC_019564	ATT	2	6	5409	5414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791561
35	NC_019564	AGT	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791561
36	NC_019564	TGT	2	6	5492	5497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791561
37	NC_019564	TAT	2	6	5523	5528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791561
38	NC_019564	AGA	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791561
39	NC_019564	TGG	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425791561
40	NC_019564	ATG	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791561
41	NC_019564	ACA	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791561
42	NC_019564	CAA	2	6	6249	6254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791561
43	NC_019564	GTG	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425791561
44	NC_019564	CAC	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425791562
45	NC_019564	AAG	2	6	6604	6609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791562
46	NC_019564	TGT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791562
47	NC_019564	CAT	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791562
48	NC_019564	CAT	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791562
49	NC_019564	TGA	2	6	6726	6731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791562
50	NC_019564	AAT	2	6	6910	6915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791562
51	NC_019564	TCT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791562
52	NC_019564	TAA	2	6	7132	7137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791562
53	NC_019564	GGC	2	6	7244	7249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425791562
54	NC_019564	ATC	2	6	7254	7259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791562
55	NC_019564	TGT	2	6	7650	7655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791563
56	NC_019564	GAT	2	6	7700	7705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791563
57	NC_019564	TAT	2	6	7944	7949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791563
58	NC_019564	TTA	2	6	8025	8030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791563
59	NC_019564	GGT	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425791563
60	NC_019564	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791563
61	NC_019564	ATA	2	6	8113	8118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791563
62	NC_019564	CTT	2	6	8229	8234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791563
63	NC_019564	ATT	2	6	8293	8298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791563
64	NC_019564	GTT	2	6	8328	8333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791563
65	NC_019564	TTG	2	6	8410	8415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791563
66	NC_019564	AAT	2	6	8467	8472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791563
67	NC_019564	CTT	2	6	8565	8570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791563
68	NC_019564	ACC	2	6	8695	8700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425791563
69	NC_019564	TAG	2	6	8713	8718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791563
70	NC_019564	AGT	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791563
71	NC_019564	ATT	2	6	8890	8895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791563
72	NC_019564	CTT	3	9	8916	8924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791563
73	NC_019564	TAA	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791563
74	NC_019564	ATA	3	9	9010	9018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791563
75	NC_019564	TAA	2	6	9096	9101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791563
76	NC_019564	ATC	2	6	9106	9111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791563
77	NC_019564	ATA	2	6	9215	9220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791563
78	NC_019564	TCA	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791563
79	NC_019564	ATG	2	6	9299	9304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791563
80	NC_019564	AGA	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791564
81	NC_019564	TAA	2	6	9544	9549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791564
82	NC_019564	TTA	3	9	9567	9575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791564
83	NC_019564	TGA	2	6	9577	9582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791564
84	NC_019564	TGT	2	6	9824	9829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791565
85	NC_019564	TTG	2	6	9883	9888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791565
86	NC_019564	AAG	2	6	9894	9899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791565
87	NC_019564	TAA	2	6	10204	10209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791565
88	NC_019564	TAG	2	6	10222	10227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791565
89	NC_019564	CTG	2	6	10323	10328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425791565
90	NC_019564	TAA	2	6	10348	10353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791565
91	NC_019564	GTA	2	6	10401	10406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791565
92	NC_019564	CTT	2	6	10437	10442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791565
93	NC_019564	TTG	2	6	10808	10813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791565
94	NC_019564	TAG	2	6	10887	10892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791565
95	NC_019564	GTT	2	6	10894	10899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791565
96	NC_019564	GTA	2	6	11060	11065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791565
97	NC_019564	GTT	2	6	11278	11283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791565
98	NC_019564	TGT	2	6	11287	11292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791565
99	NC_019564	TGT	2	6	11482	11487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791565
100	NC_019564	TCA	2	6	11556	11561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791565
101	NC_019564	GTT	2	6	11774	11779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791566
102	NC_019564	TTA	2	6	11836	11841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791566
103	NC_019564	ATT	2	6	11871	11876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791566
104	NC_019564	TAA	2	6	12062	12067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791566

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.