MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	CAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790161
2	NC_019561	TAA	2	6	954	959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
3	NC_019561	ATA	2	6	1013	1018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
4	NC_019561	AAT	2	6	1237	1242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
5	NC_019561	TTG	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790161
6	NC_019561	TGT	2	6	1260	1265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790161
7	NC_019561	TCT	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790161
8	NC_019561	AAT	2	6	1348	1353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
9	NC_019561	ATG	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790162
10	NC_019561	AAT	2	6	1575	1580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790162
11	NC_019561	TTG	2	6	1639	1644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790162
12	NC_019561	TGG	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790162
13	NC_019561	ATG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790162
14	NC_019561	TTG	2	6	1716	1721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790162
15	NC_019561	AAC	2	6	2022	2027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790162
16	NC_019561	GCT	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790162
17	NC_019561	AAT	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790162
18	NC_019561	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790162
19	NC_019561	TCC	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	425790163
20	NC_019561	TGA	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790163
21	NC_019561	ATC	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790163
22	NC_019561	GTT	2	6	2721	2726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790163
23	NC_019561	GAT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790163
24	NC_019561	AAC	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790163
25	NC_019561	GCA	2	6	2857	2862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790163
26	NC_019561	TCA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790163
27	NC_019561	TGT	3	9	2952	2960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790163
28	NC_019561	CTG	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790163
29	NC_019561	ATT	2	6	3188	3193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790163
30	NC_019561	CAT	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790163
31	NC_019561	TTC	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790163
32	NC_019561	ATA	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790163
33	NC_019561	CTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
34	NC_019561	AAC	2	6	3585	3590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790164
35	NC_019561	TTG	2	6	3741	3746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790164
36	NC_019561	CTT	2	6	3847	3852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
37	NC_019561	ACC	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790164
38	NC_019561	TTC	2	6	4047	4052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
39	NC_019561	AAT	2	6	4099	4104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790164
40	NC_019561	TCT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
41	NC_019561	AGC	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790164
42	NC_019561	TCT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
43	NC_019561	TTG	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790164
44	NC_019561	CTT	3	9	4514	4522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
45	NC_019561	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790164
46	NC_019561	CAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790165
47	NC_019561	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790165
48	NC_019561	TCT	2	6	4986	4991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790165
49	NC_019561	CTT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790165
50	NC_019561	AAG	2	6	5122	5127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790165
51	NC_019561	AAT	2	6	5146	5151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790165
52	NC_019561	TGT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
53	NC_019561	GTT	2	6	5375	5380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
54	NC_019561	AAT	2	6	5412	5417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790165
55	NC_019561	AAC	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790165
56	NC_019561	GTT	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
57	NC_019561	CAC	2	6	5443	5448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790165
58	NC_019561	TTG	2	6	5574	5579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
59	NC_019561	GAA	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790165
60	NC_019561	TTC	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790165
61	NC_019561	TGT	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790166
62	NC_019561	TTG	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790166
63	NC_019561	TTG	2	6	6706	6711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790166
64	NC_019561	AAT	2	6	6755	6760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790166
65	NC_019561	ATT	2	6	6773	6778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790166
66	NC_019561	AAT	2	6	6844	6849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790166
67	NC_019561	ATC	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790166
68	NC_019561	TTC	2	6	7156	7161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
69	NC_019561	AGT	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790167
70	NC_019561	TCT	2	6	7405	7410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
71	NC_019561	CTT	2	6	7657	7662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
72	NC_019561	GTT	2	6	7674	7679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
73	NC_019561	GTT	2	6	7763	7768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
74	NC_019561	AAG	2	6	8054	8059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790167
75	NC_019561	TTG	2	6	8080	8085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
76	NC_019561	AAC	2	6	8259	8264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790167
77	NC_019561	GTT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
78	NC_019561	TTC	2	6	8682	8687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
79	NC_019561	TAA	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790167
80	NC_019561	GAA	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790168
81	NC_019561	CAA	2	6	10294	10299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790168
82	NC_019561	TAC	2	6	10451	10456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790168
83	NC_019561	AAT	2	6	10471	10476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790168
84	NC_019561	ATT	2	6	10595	10600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
85	NC_019561	AAT	2	6	10957	10962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790168
86	NC_019561	ATT	2	6	10978	10983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
87	NC_019561	TCT	2	6	11000	11005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790168
88	NC_019561	ATT	2	6	11044	11049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
89	NC_019561	AAC	2	6	11078	11083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790168
90	NC_019561	TAT	2	6	11107	11112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
91	NC_019561	ATG	2	6	11172	11177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790168
92	NC_019561	ATA	2	6	11229	11234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790168
93	NC_019561	ATC	2	6	11239	11244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790168
94	NC_019561	TAA	2	6	11245	11250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790168
95	NC_019561	TAT	2	6	11254	11259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
96	NC_019561	ATT	2	6	11338	11343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
97	NC_019561	ACT	2	6	11361	11366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790168
98	NC_019561	CAA	2	6	11501	11506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790168
99	NC_019561	ATT	2	6	11584	11589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
100	NC_019561	TCA	2	6	11713	11718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790168
101	NC_019561	AGA	2	6	11734	11739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790168
102	NC_019561	TTC	2	6	11891	11896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790169
103	NC_019561	TAC	2	6	11996	12001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790169
104	NC_019561	ATT	2	6	12064	12069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790169
105	NC_019561	CAT	2	6	12090	12095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790169
106	NC_019561	TAA	2	6	12108	12113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790169
107	NC_019561	ATT	2	6	12273	12278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790169
108	NC_019561	TAT	2	6	12455	12460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790169
109	NC_019561	AAT	2	6	12517	12522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790169
110	NC_019561	CAC	2	6	12579	12584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790169
111	NC_019561	TAT	2	6	12618	12623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790169
112	NC_019561	ATT	2	6	12752	12757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790169
113	NC_019561	AGA	2	6	12807	12812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790169
114	NC_019561	TAA	2	6	12903	12908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790169
115	NC_019561	ATT	2	6	12960	12965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790169
116	NC_019561	ATT	2	6	12997	13002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790169
117	NC_019561	ACC	2	6	13046	13051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790169
118	NC_019561	ATA	2	6	13106	13111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790169
119	NC_019561	AAC	2	6	13126	13131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790169
120	NC_019561	TGA	2	6	13179	13184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790169
121	NC_019561	ATT	2	6	13221	13226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790169
122	NC_019561	TGT	2	6	13314	13319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790169
123	NC_019561	AGT	2	6	13333	13338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790169
124	NC_019561	TGA	2	6	13446	13451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790169
125	NC_019561	ATT	2	6	13453	13458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790169
126	NC_019561	TGT	2	6	13642	13647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790170
127	NC_019561	AAG	2	6	13712	13717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790170
128	NC_019561	AGT	2	6	13824	13829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790170
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130	NC_019561	TAG	2	6	14040	14045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790170
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.