MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	CAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790161
2	NC_019561	CT	3	6	890	895	0 %	50 %	0 %	50 %	425790161
3	NC_019561	TAA	2	6	954	959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
4	NC_019561	ATA	2	6	1013	1018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
5	NC_019561	TTTA	2	8	1096	1103	25 %	75 %	0 %	0 %	425790161
6	NC_019561	T	7	7	1109	1115	0 %	100 %	0 %	0 %	425790161
7	NC_019561	CAAA	2	8	1116	1123	75 %	0 %	0 %	25 %	425790161
8	NC_019561	A	7	7	1143	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	425790161
9	NC_019561	AAT	2	6	1237	1242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
10	NC_019561	TTG	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790161
11	NC_019561	TGT	2	6	1260	1265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790161
12	NC_019561	TCT	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790161
13	NC_019561	AAT	2	6	1348	1353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
14	NC_019561	T	6	6	1415	1420	0 %	100 %	0 %	0 %	425790161
15	NC_019561	ATG	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790162
16	NC_019561	T	6	6	1474	1479	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
17	NC_019561	GT	3	6	1493	1498	0 %	50 %	50 %	0 %	425790162
18	NC_019561	TTTG	2	8	1541	1548	0 %	75 %	25 %	0 %	425790162
19	NC_019561	AAT	2	6	1575	1580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790162
20	NC_019561	TTGT	2	8	1586	1593	0 %	75 %	25 %	0 %	425790162
21	NC_019561	CCTG	2	8	1604	1611	0 %	25 %	25 %	50 %	425790162
22	NC_019561	TTG	2	6	1639	1644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790162
23	NC_019561	TGG	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790162
24	NC_019561	ATG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790162
25	NC_019561	AAACG	2	10	1696	1705	60 %	0 %	20 %	20 %	425790162
26	NC_019561	TTG	2	6	1716	1721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790162
27	NC_019561	AT	3	6	1817	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	425790162
28	NC_019561	A	6	6	1849	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	425790162
29	NC_019561	T	7	7	1944	1950	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
30	NC_019561	GTTT	2	8	1957	1964	0 %	75 %	25 %	0 %	425790162
31	NC_019561	AAC	2	6	2022	2027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790162
32	NC_019561	T	6	6	2095	2100	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
33	NC_019561	GCT	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790162
34	NC_019561	AATA	2	8	2142	2149	75 %	25 %	0 %	0 %	425790162
35	NC_019561	TATT	2	8	2170	2177	25 %	75 %	0 %	0 %	425790162
36	NC_019561	AAAT	2	8	2190	2197	75 %	25 %	0 %	0 %	425790162
37	NC_019561	T	6	6	2269	2274	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
38	NC_019561	T	6	6	2293	2298	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
39	NC_019561	AAT	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790162
40	NC_019561	TA	3	6	2375	2380	50 %	50 %	0 %	0 %	425790162
41	NC_019561	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790162
42	NC_019561	TCC	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	425790163
43	NC_019561	TGA	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790163
44	NC_019561	ATC	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790163
45	NC_019561	TCAG	2	8	2702	2709	25 %	25 %	25 %	25 %	425790163
46	NC_019561	GTT	2	6	2721	2726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790163
47	NC_019561	GAT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790163
48	NC_019561	AAC	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790163
49	NC_019561	A	6	6	2840	2845	100 %	0 %	0 %	0 %	425790163
50	NC_019561	GCA	2	6	2857	2862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790163
51	NC_019561	TCA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790163
52	NC_019561	T	6	6	2889	2894	0 %	100 %	0 %	0 %	425790163
53	NC_019561	GTGCA	2	10	2905	2914	20 %	20 %	40 %	20 %	425790163
54	NC_019561	TGT	3	9	2952	2960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790163
55	NC_019561	CTG	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790163
56	NC_019561	ATT	2	6	3188	3193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790163
57	NC_019561	CAT	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790163
58	NC_019561	T	6	6	3224	3229	0 %	100 %	0 %	0 %	425790163
59	NC_019561	TTC	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790163
60	NC_019561	ATA	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790163
61	NC_019561	CTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
62	NC_019561	A	6	6	3493	3498	100 %	0 %	0 %	0 %	425790164
63	NC_019561	A	7	7	3501	3507	100 %	0 %	0 %	0 %	425790164
64	NC_019561	AAC	2	6	3585	3590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790164
65	NC_019561	T	6	6	3652	3657	0 %	100 %	0 %	0 %	425790164
66	NC_019561	TTG	2	6	3741	3746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790164
67	NC_019561	TTGAG	2	10	3776	3785	20 %	40 %	40 %	0 %	425790164
68	NC_019561	CTT	2	6	3847	3852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
69	NC_019561	TG	3	6	3876	3881	0 %	50 %	50 %	0 %	425790164
70	NC_019561	T	6	6	3901	3906	0 %	100 %	0 %	0 %	425790164
71	NC_019561	ACC	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790164
72	NC_019561	TTC	2	6	4047	4052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
73	NC_019561	AAT	2	6	4099	4104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790164
74	NC_019561	AATT	2	8	4149	4156	50 %	50 %	0 %	0 %	425790164
75	NC_019561	TCT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
76	NC_019561	TG	3	6	4290	4295	0 %	50 %	50 %	0 %	425790164
77	NC_019561	AGC	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790164
78	NC_019561	T	6	6	4341	4346	0 %	100 %	0 %	0 %	425790164
79	NC_019561	TCT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
80	NC_019561	ATAAG	2	10	4385	4394	60 %	20 %	20 %	0 %	425790164
81	NC_019561	TG	3	6	4454	4459	0 %	50 %	50 %	0 %	425790164
82	NC_019561	TTG	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790164
83	NC_019561	CTT	3	9	4514	4522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
84	NC_019561	TA	3	6	4659	4664	50 %	50 %	0 %	0 %	425790164
85	NC_019561	AATC	2	8	4668	4675	50 %	25 %	0 %	25 %	425790164
86	NC_019561	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790164
87	NC_019561	T	6	6	4758	4763	0 %	100 %	0 %	0 %	425790165
88	NC_019561	CAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790165
89	NC_019561	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790165
90	NC_019561	TCT	2	6	4986	4991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790165
91	NC_019561	CTT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790165
92	NC_019561	A	6	6	5095	5100	100 %	0 %	0 %	0 %	425790165
93	NC_019561	ACTG	2	8	5110	5117	25 %	25 %	25 %	25 %	425790165
94	NC_019561	AAG	2	6	5122	5127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790165
95	NC_019561	AAT	2	6	5146	5151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790165
96	NC_019561	TGT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
97	NC_019561	TG	3	6	5214	5219	0 %	50 %	50 %	0 %	425790165
98	NC_019561	CTAA	2	8	5313	5320	50 %	25 %	0 %	25 %	425790165
99	NC_019561	ATCA	2	8	5354	5361	50 %	25 %	0 %	25 %	425790165
100	NC_019561	GTT	2	6	5375	5380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
101	NC_019561	AAT	2	6	5412	5417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790165
102	NC_019561	AAC	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790165
103	NC_019561	GTT	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
104	NC_019561	CAC	2	6	5443	5448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790165
105	NC_019561	T	7	7	5449	5455	0 %	100 %	0 %	0 %	425790165
106	NC_019561	TTG	2	6	5574	5579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
107	NC_019561	GAA	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790165
108	NC_019561	TTC	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790165
109	NC_019561	AGAAA	2	10	6383	6392	80 %	0 %	20 %	0 %	425790166
110	NC_019561	TGT	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790166
111	NC_019561	TTG	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790166
112	NC_019561	TTG	2	6	6706	6711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790166
113	NC_019561	T	6	6	6740	6745	0 %	100 %	0 %	0 %	425790166
114	NC_019561	AAT	2	6	6755	6760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790166
115	NC_019561	ATT	2	6	6773	6778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790166
116	NC_019561	T	6	6	6777	6782	0 %	100 %	0 %	0 %	425790166
117	NC_019561	AAT	2	6	6844	6849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790166
118	NC_019561	TGAT	2	8	6864	6871	25 %	50 %	25 %	0 %	425790166
119	NC_019561	ATC	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790166
120	NC_019561	T	7	7	6906	6912	0 %	100 %	0 %	0 %	425790166
121	NC_019561	CTTC	2	8	6969	6976	0 %	50 %	0 %	50 %	425790166
122	NC_019561	ATTTG	2	10	7000	7009	20 %	60 %	20 %	0 %	425790166
123	NC_019561	T	7	7	7044	7050	0 %	100 %	0 %	0 %	425790166
124	NC_019561	GCAT	2	8	7093	7100	25 %	25 %	25 %	25 %	425790166
125	NC_019561	T	6	6	7127	7132	0 %	100 %	0 %	0 %	425790167
126	NC_019561	TTC	2	6	7156	7161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
127	NC_019561	AGT	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790167
128	NC_019561	TCT	2	6	7405	7410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
129	NC_019561	T	6	6	7422	7427	0 %	100 %	0 %	0 %	425790167
130	NC_019561	AC	3	6	7478	7483	50 %	0 %	0 %	50 %	425790167
131	NC_019561	T	6	6	7500	7505	0 %	100 %	0 %	0 %	425790167
132	NC_019561	CTT	2	6	7657	7662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
133	NC_019561	GTT	2	6	7674	7679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
134	NC_019561	TTTTTG	2	12	7728	7739	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425790167
135	NC_019561	GTT	2	6	7763	7768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
136	NC_019561	AAG	2	6	8054	8059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790167
137	NC_019561	TTG	2	6	8080	8085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
138	NC_019561	GTTT	2	8	8144	8151	0 %	75 %	25 %	0 %	425790167
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.