MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 1136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018939	TAAAA	2	10	914	923	80 %	20 %	0 %	0 %	410681524
2	NC_018939	TAAAA	2	10	1807	1816	80 %	20 %	0 %	0 %	410681525
3	NC_018939	TTGAT	2	10	6052	6061	20 %	60 %	20 %	0 %	410681530
4	NC_018939	TTTCT	2	10	8385	8394	0 %	80 %	0 %	20 %	410681531
5	NC_018939	TGCCA	2	10	11857	11866	20 %	20 %	20 %	40 %	410681534
6	NC_018939	TTGAA	2	10	11897	11906	40 %	40 %	20 %	0 %	410681534
7	NC_018939	TTTTG	2	10	11913	11922	0 %	80 %	20 %	0 %	410681534
8	NC_018939	TGGTG	2	10	12748	12757	0 %	40 %	60 %	0 %	410681535
9	NC_018939	CAAAA	2	10	18638	18647	80 %	0 %	0 %	20 %	410681540
10	NC_018939	TGAAA	2	10	20982	20991	60 %	20 %	20 %	0 %	410681542
11	NC_018939	TAAAG	2	10	21687	21696	60 %	20 %	20 %	0 %	410681543
12	NC_018939	CCATG	2	10	23437	23446	20 %	20 %	20 %	40 %	410681545
13	NC_018939	CAAGC	2	10	28246	28255	40 %	0 %	20 %	40 %	410681547
14	NC_018939	TGGGT	2	10	28683	28692	0 %	40 %	60 %	0 %	410681547
15	NC_018939	TTTTA	2	10	29177	29186	20 %	80 %	0 %	0 %	410681548
16	NC_018939	GTTTC	2	10	30491	30500	0 %	60 %	20 %	20 %	410681550
17	NC_018939	TCAAA	2	10	31006	31015	60 %	20 %	0 %	20 %	410681550
18	NC_018939	TTTTC	2	10	31176	31185	0 %	80 %	0 %	20 %	410681550
19	NC_018939	TCATA	2	10	31648	31657	40 %	40 %	0 %	20 %	410681550
20	NC_018939	GTGGG	2	10	34133	34142	0 %	20 %	80 %	0 %	410681553
21	NC_018939	AGCCT	2	10	39551	39560	20 %	20 %	20 %	40 %	410681560
22	NC_018939	AAGCC	2	10	41149	41158	40 %	0 %	20 %	40 %	410681561
23	NC_018939	CAAAC	2	10	41790	41799	60 %	0 %	0 %	40 %	410681561
24	NC_018939	AGAAA	2	10	42476	42485	80 %	0 %	20 %	0 %	410681562
25	NC_018939	TACTC	2	10	43329	43338	20 %	40 %	0 %	40 %	410681563
26	NC_018939	TAAAA	2	10	45758	45767	80 %	20 %	0 %	0 %	410681565
27	NC_018939	TCCCA	2	10	46770	46779	20 %	20 %	0 %	60 %	410681566
28	NC_018939	TGCCT	2	10	49883	49892	0 %	40 %	20 %	40 %	410681568
29	NC_018939	GATTG	2	10	52111	52120	20 %	40 %	40 %	0 %	410681571
30	NC_018939	TGCTT	2	10	52166	52175	0 %	60 %	20 %	20 %	410681571
31	NC_018939	CTTGA	2	10	52582	52591	20 %	40 %	20 %	20 %	410681572
32	NC_018939	CAACA	2	10	52621	52630	60 %	0 %	0 %	40 %	410681572
33	NC_018939	AAATA	2	10	53404	53413	80 %	20 %	0 %	0 %	410681572
34	NC_018939	CCAAA	2	10	53737	53746	60 %	0 %	0 %	40 %	410681573
35	NC_018939	TAAAA	2	10	55788	55797	80 %	20 %	0 %	0 %	410681573
36	NC_018939	ATCAA	2	10	55819	55828	60 %	20 %	0 %	20 %	410681573
37	NC_018939	TGAAA	2	10	56548	56557	60 %	20 %	20 %	0 %	410681574
38	NC_018939	TCAAA	2	10	56802	56811	60 %	20 %	0 %	20 %	410681574
39	NC_018939	CAGCA	2	10	57749	57758	40 %	0 %	20 %	40 %	410681575
40	NC_018939	TAAAA	2	10	59841	59850	80 %	20 %	0 %	0 %	410681575
41	NC_018939	TCAAA	2	10	60557	60566	60 %	20 %	0 %	20 %	410681575
42	NC_018939	TATCC	2	10	65037	65046	20 %	40 %	0 %	40 %	410681579
43	NC_018939	GGTGG	2	10	70511	70520	0 %	20 %	80 %	0 %	410681585
44	NC_018939	ACACC	2	10	71183	71192	40 %	0 %	0 %	60 %	410681585
45	NC_018939	TCAAT	2	10	73688	73697	40 %	40 %	0 %	20 %	410681588
46	NC_018939	TTTCT	2	10	74225	74234	0 %	80 %	0 %	20 %	410681589
47	NC_018939	CTTGG	2	10	74488	74497	0 %	40 %	40 %	20 %	410681589
48	NC_018939	CTTCT	2	10	74542	74551	0 %	60 %	0 %	40 %	410681589
49	NC_018939	TGCCT	2	10	74619	74628	0 %	40 %	20 %	40 %	410681589
50	NC_018939	TCCAA	2	10	75031	75040	40 %	20 %	0 %	40 %	410681590
51	NC_018939	TTTTG	2	10	78313	78322	0 %	80 %	20 %	0 %	410681594
52	NC_018939	ACGCC	2	10	78619	78628	20 %	0 %	20 %	60 %	410681594
53	NC_018939	AAAGC	2	10	79385	79394	60 %	0 %	20 %	20 %	410681595
54	NC_018939	GTATG	2	10	84898	84907	20 %	40 %	40 %	0 %	410681600
55	NC_018939	CCTCA	2	10	86914	86923	20 %	20 %	0 %	60 %	410681602
56	NC_018939	ATCTT	2	10	88013	88022	20 %	60 %	0 %	20 %	410681602
57	NC_018939	TGGCT	2	10	88554	88563	0 %	40 %	40 %	20 %	410681602
58	NC_018939	ATGCC	2	10	88978	88987	20 %	20 %	20 %	40 %	410681603
59	NC_018939	TTGAT	2	10	90024	90033	20 %	60 %	20 %	0 %	410681605
60	NC_018939	GGCGT	2	10	91838	91847	0 %	20 %	60 %	20 %	410681607
61	NC_018939	CTTTC	2	10	95403	95412	0 %	60 %	0 %	40 %	410681609
62	NC_018939	TTTGA	2	10	98197	98206	20 %	60 %	20 %	0 %	410681612
63	NC_018939	TCTTT	2	10	98408	98417	0 %	80 %	0 %	20 %	410681612
64	NC_018939	GGCTT	2	10	99528	99537	0 %	40 %	40 %	20 %	410681614
65	NC_018939	GAATT	2	10	106322	106331	40 %	40 %	20 %	0 %	410681620
66	NC_018939	TCGTT	2	10	108220	108229	0 %	60 %	20 %	20 %	410681621
67	NC_018939	TCTTT	2	10	111524	111533	0 %	80 %	0 %	20 %	410681624
68	NC_018939	TAGGC	2	10	113127	113136	20 %	20 %	40 %	20 %	410681626
69	NC_018939	AAAGC	2	10	114314	114323	60 %	0 %	20 %	20 %	410681627
70	NC_018939	GAATG	2	10	115545	115554	40 %	20 %	40 %	0 %	410681629
71	NC_018939	CAAAT	2	10	116868	116877	60 %	20 %	0 %	20 %	410681630
72	NC_018939	ACCCT	2	10	118296	118305	20 %	20 %	0 %	60 %	410681631
73	NC_018939	ATGCC	2	10	118428	118437	20 %	20 %	20 %	40 %	410681631
74	NC_018939	TGATT	2	10	120590	120599	20 %	60 %	20 %	0 %	410681633
75	NC_018939	AAGCC	2	10	126993	127002	40 %	0 %	20 %	40 %	410681638
76	NC_018939	TTGAT	2	10	128822	128831	20 %	60 %	20 %	0 %	410681639
77	NC_018939	TTGAT	2	10	131948	131957	20 %	60 %	20 %	0 %	410681641
78	NC_018939	CTGAT	2	10	132123	132132	20 %	40 %	20 %	20 %	410681641
79	NC_018939	TTTGA	2	10	133188	133197	20 %	60 %	20 %	0 %	410681642
80	NC_018939	GACTT	2	10	133722	133731	20 %	40 %	20 %	20 %	410681642
81	NC_018939	ATCTC	2	10	134473	134482	20 %	40 %	0 %	40 %	410681642
82	NC_018939	TTTGT	2	10	134987	134996	0 %	80 %	20 %	0 %	410681643
83	NC_018939	GAAAA	2	10	137180	137189	80 %	0 %	20 %	0 %	410681645
84	NC_018939	GAAAA	2	10	137498	137507	80 %	0 %	20 %	0 %	410681645
85	NC_018939	ATTTT	2	10	140455	140464	20 %	80 %	0 %	0 %	410681650
86	NC_018939	ATGTT	2	10	140537	140546	20 %	60 %	20 %	0 %	410681650
87	NC_018939	AAAAG	2	10	140949	140958	80 %	0 %	20 %	0 %	410681650
88	NC_018939	AAATC	2	10	143248	143257	60 %	20 %	0 %	20 %	410681652
89	NC_018939	AAAAT	2	10	144720	144729	80 %	20 %	0 %	0 %	410681653
90	NC_018939	TTTTC	2	10	147075	147084	0 %	80 %	0 %	20 %	410681656
91	NC_018939	GTAAA	2	10	147627	147636	60 %	20 %	20 %	0 %	410681657
92	NC_018939	TTCTT	2	10	149031	149040	0 %	80 %	0 %	20 %	410681658
93	NC_018939	TCTTT	2	10	149525	149534	0 %	80 %	0 %	20 %	410681659
94	NC_018939	TTTTG	2	10	150698	150707	0 %	80 %	20 %	0 %	410681660
95	NC_018939	GCGAT	2	10	151491	151500	20 %	20 %	40 %	20 %	410681660
96	NC_018939	GCTTG	2	10	151747	151756	0 %	40 %	40 %	20 %	410681660
97	NC_018939	GTCCA	2	10	152359	152368	20 %	20 %	20 %	40 %	410681661
98	NC_018939	TTTTG	2	10	152407	152416	0 %	80 %	20 %	0 %	410681661
99	NC_018939	CCAAA	2	10	154247	154256	60 %	0 %	0 %	40 %	410681662
100	NC_018939	TAAGG	2	10	155307	155316	40 %	20 %	40 %	0 %	410681663
101	NC_018939	ACGCC	2	10	157771	157780	20 %	0 %	20 %	60 %	410681665
102	NC_018939	TTATT	2	10	159666	159675	20 %	80 %	0 %	0 %	410681669
103	NC_018939	GCGTT	2	10	160024	160033	0 %	40 %	40 %	20 %	410681671
104	NC_018939	ATTTG	2	10	161000	161009	20 %	60 %	20 %	0 %	410681672
105	NC_018939	AGATT	2	10	165518	165527	40 %	40 %	20 %	0 %	410681677
106	NC_018939	AAGCC	2	10	166857	166866	40 %	0 %	20 %	40 %	410681680
107	NC_018939	TGGCG	2	10	167531	167540	0 %	20 %	60 %	20 %	410681680
108	NC_018939	GGCAT	2	10	168672	168681	20 %	20 %	40 %	20 %	410681681
109	NC_018939	ATTTT	2	10	168908	168917	20 %	80 %	0 %	0 %	410681682
110	NC_018939	GGGTG	2	10	169264	169273	0 %	20 %	80 %	0 %	410681682
111	NC_018939	ATTCA	2	10	170784	170793	40 %	40 %	0 %	20 %	410681683
112	NC_018939	ATCTT	2	10	174186	174195	20 %	60 %	0 %	20 %	410681686
113	NC_018939	ATATT	2	10	181587	181596	40 %	60 %	0 %	0 %	410681695
114	NC_018939	TGGGG	2	10	182824	182833	0 %	20 %	80 %	0 %	410681697
115	NC_018939	ATTTG	2	10	183601	183610	20 %	60 %	20 %	0 %	410681697
116	NC_018939	AATTG	2	10	183757	183766	40 %	40 %	20 %	0 %	410681698
117	NC_018939	AAATG	2	10	185132	185141	60 %	20 %	20 %	0 %	410681699
118	NC_018939	TGTAA	2	10	185922	185931	40 %	40 %	20 %	0 %	410681700
119	NC_018939	ATAAA	2	10	187418	187427	80 %	20 %	0 %	0 %	410681701
120	NC_018939	AAAAG	2	10	188568	188577	80 %	0 %	20 %	0 %	410681702
121	NC_018939	ACCCC	2	10	188633	188642	20 %	0 %	0 %	80 %	410681702
122	NC_018939	TGAAT	2	10	188949	188958	40 %	40 %	20 %	0 %	410681703
123	NC_018939	AGAGG	2	10	194285	194294	40 %	0 %	60 %	0 %	410681707
124	NC_018939	TTCAA	2	10	196061	196070	40 %	40 %	0 %	20 %	410681711
125	NC_018939	AATCC	2	10	196737	196746	40 %	20 %	0 %	40 %	410681711
126	NC_018939	TATTG	2	10	201342	201351	20 %	60 %	20 %	0 %	410681715
127	NC_018939	TCATT	2	10	201673	201682	20 %	60 %	0 %	20 %	410681715
128	NC_018939	GCTAC	2	10	202491	202500	20 %	20 %	20 %	40 %	410681716
129	NC_018939	CTATT	2	10	202562	202571	20 %	60 %	0 %	20 %	410681717
130	NC_018939	TTTTC	2	10	203622	203631	0 %	80 %	0 %	20 %	410681718
131	NC_018939	TATTT	2	10	207378	207387	20 %	80 %	0 %	0 %	410681723
132	NC_018939	TTTCA	2	10	208039	208048	20 %	60 %	0 %	20 %	410681724
133	NC_018939	TGAAT	2	10	210942	210951	40 %	40 %	20 %	0 %	410681727
134	NC_018939	CTTCA	2	10	211296	211305	20 %	40 %	0 %	40 %	410681727
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260	NC_018939	ACGAT	2	10	389856	389865	40 %	20 %	20 %	20 %	410681901
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262	NC_018939	AATAA	2	10	394424	394433	80 %	20 %	0 %	0 %	410681906
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