MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 4105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018938	TGAG	2	8	233	240	25 %	25 %	50 %	0 %	410501006
2	NC_018938	CATT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	410501006
3	NC_018938	GTTG	2	8	507	514	0 %	50 %	50 %	0 %	410501006
4	NC_018938	TCTG	2	8	1016	1023	0 %	50 %	25 %	25 %	410501007
5	NC_018938	AAAT	2	8	1118	1125	75 %	25 %	0 %	0 %	410501008
6	NC_018938	GCTT	2	8	1661	1668	0 %	50 %	25 %	25 %	410501008
7	NC_018938	CCTG	2	8	2016	2023	0 %	25 %	25 %	50 %	410501009
8	NC_018938	CCAA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	0 %	50 %	410501009
9	NC_018938	ATTC	2	8	2057	2064	25 %	50 %	0 %	25 %	410501009
10	NC_018938	TGAA	2	8	2080	2087	50 %	25 %	25 %	0 %	410501009
11	NC_018938	ATTC	2	8	2555	2562	25 %	50 %	0 %	25 %	410501009
12	NC_018938	TCTT	2	8	2763	2770	0 %	75 %	0 %	25 %	410501010
13	NC_018938	CAAA	2	8	3306	3313	75 %	0 %	0 %	25 %	410501010
14	NC_018938	GAAA	2	8	3528	3535	75 %	0 %	25 %	0 %	410501011
15	NC_018938	TCGC	2	8	5377	5384	0 %	25 %	25 %	50 %	410501013
16	NC_018938	ATTC	2	8	5406	5413	25 %	50 %	0 %	25 %	410501013
17	NC_018938	CATT	2	8	5450	5457	25 %	50 %	0 %	25 %	410501013
18	NC_018938	ATCG	2	8	7008	7015	25 %	25 %	25 %	25 %	410501013
19	NC_018938	CGTT	2	8	7043	7050	0 %	50 %	25 %	25 %	410501013
20	NC_018938	TTGA	2	8	7056	7063	25 %	50 %	25 %	0 %	410501013
21	NC_018938	TTCA	2	8	7849	7856	25 %	50 %	0 %	25 %	410501014
22	NC_018938	TCAA	2	8	10056	10063	50 %	25 %	0 %	25 %	410501016
23	NC_018938	TTTG	2	8	10876	10883	0 %	75 %	25 %	0 %	410501016
24	NC_018938	GTTT	2	8	10972	10979	0 %	75 %	25 %	0 %	410501016
25	NC_018938	GCTC	2	8	11499	11506	0 %	25 %	25 %	50 %	410501016
26	NC_018938	CGCT	2	8	12366	12373	0 %	25 %	25 %	50 %	410501017
27	NC_018938	GCCG	2	8	12511	12518	0 %	0 %	50 %	50 %	410501017
28	NC_018938	TGCA	2	8	12725	12732	25 %	25 %	25 %	25 %	410501018
29	NC_018938	AGCA	2	8	12780	12787	50 %	0 %	25 %	25 %	410501018
30	NC_018938	GTTT	2	8	13138	13145	0 %	75 %	25 %	0 %	410501018
31	NC_018938	TCTT	2	8	13525	13532	0 %	75 %	0 %	25 %	410501018
32	NC_018938	AGCG	2	8	13997	14004	25 %	0 %	50 %	25 %	410501020
33	NC_018938	GATT	2	8	14105	14112	25 %	50 %	25 %	0 %	410501020
34	NC_018938	CAAA	2	8	14274	14281	75 %	0 %	0 %	25 %	410501021
35	NC_018938	CACT	2	8	14643	14650	25 %	25 %	0 %	50 %	410501021
36	NC_018938	ATGC	2	8	14689	14696	25 %	25 %	25 %	25 %	410501021
37	NC_018938	TTTA	2	8	15276	15283	25 %	75 %	0 %	0 %	410501021
38	NC_018938	CAGG	2	8	16434	16441	25 %	0 %	50 %	25 %	410501021
39	NC_018938	TGAT	2	8	16478	16485	25 %	50 %	25 %	0 %	410501021
40	NC_018938	CGAA	2	8	17299	17306	50 %	0 %	25 %	25 %	410501022
41	NC_018938	CTTA	2	8	17474	17481	25 %	50 %	0 %	25 %	410501022
42	NC_018938	GTTT	2	8	18248	18255	0 %	75 %	25 %	0 %	410501022
43	NC_018938	TTGA	2	8	18602	18609	25 %	50 %	25 %	0 %	410501023
44	NC_018938	TGCT	2	8	18978	18985	0 %	50 %	25 %	25 %	410501023
45	NC_018938	CTTG	2	8	19452	19459	0 %	50 %	25 %	25 %	410501024
46	NC_018938	TAAA	2	8	20656	20663	75 %	25 %	0 %	0 %	410501025
47	NC_018938	GCGA	2	8	20665	20672	25 %	0 %	50 %	25 %	410501025
48	NC_018938	CTTT	2	8	21522	21529	0 %	75 %	0 %	25 %	410501026
49	NC_018938	AAGT	2	8	21834	21841	50 %	25 %	25 %	0 %	410501026
50	NC_018938	GCTT	2	8	21961	21968	0 %	50 %	25 %	25 %	410501026
51	NC_018938	CTTT	2	8	22593	22600	0 %	75 %	0 %	25 %	410501026
52	NC_018938	GTTT	2	8	23794	23801	0 %	75 %	25 %	0 %	410501028
53	NC_018938	CTGG	2	8	24811	24818	0 %	25 %	50 %	25 %	410501028
54	NC_018938	GCAA	2	8	24995	25002	50 %	0 %	25 %	25 %	410501028
55	NC_018938	GACA	2	8	27350	27357	50 %	0 %	25 %	25 %	410501029
56	NC_018938	GCTC	2	8	28324	28331	0 %	25 %	25 %	50 %	410501030
57	NC_018938	ATGG	2	8	28772	28779	25 %	25 %	50 %	0 %	410501030
58	NC_018938	GAAT	2	8	29034	29041	50 %	25 %	25 %	0 %	410501031
59	NC_018938	AATC	2	8	29227	29234	50 %	25 %	0 %	25 %	410501031
60	NC_018938	TTTA	2	8	29410	29417	25 %	75 %	0 %	0 %	410501031
61	NC_018938	GAGT	2	8	30242	30249	25 %	25 %	50 %	0 %	410501033
62	NC_018938	TCAA	2	8	30264	30271	50 %	25 %	0 %	25 %	410501033
63	NC_018938	TGCT	2	8	30296	30303	0 %	50 %	25 %	25 %	410501033
64	NC_018938	AGCA	2	8	30413	30420	50 %	0 %	25 %	25 %	410501033
65	NC_018938	CAAT	2	8	30427	30434	50 %	25 %	0 %	25 %	410501033
66	NC_018938	CAAT	2	8	30937	30944	50 %	25 %	0 %	25 %	410501033
67	NC_018938	GAAA	2	8	31372	31379	75 %	0 %	25 %	0 %	410501033
68	NC_018938	TTTA	2	8	32084	32091	25 %	75 %	0 %	0 %	410501034
69	NC_018938	CAGA	2	8	32120	32127	50 %	0 %	25 %	25 %	410501034
70	NC_018938	TGAT	2	8	32229	32236	25 %	50 %	25 %	0 %	410501034
71	NC_018938	ATTG	2	8	32272	32279	25 %	50 %	25 %	0 %	410501034
72	NC_018938	GCGA	2	8	32282	32289	25 %	0 %	50 %	25 %	410501034
73	NC_018938	ACCC	2	8	32422	32429	25 %	0 %	0 %	75 %	410501035
74	NC_018938	CATC	2	8	32548	32555	25 %	25 %	0 %	50 %	410501035
75	NC_018938	TCAA	2	8	32690	32697	50 %	25 %	0 %	25 %	410501036
76	NC_018938	CATG	2	8	33813	33820	25 %	25 %	25 %	25 %	410501036
77	NC_018938	GAAA	2	8	33921	33928	75 %	0 %	25 %	0 %	410501036
78	NC_018938	CGCT	2	8	33929	33936	0 %	25 %	25 %	50 %	410501036
79	NC_018938	TCAT	2	8	34754	34761	25 %	50 %	0 %	25 %	410501036
80	NC_018938	GCTT	2	8	34828	34835	0 %	50 %	25 %	25 %	410501036
81	NC_018938	GAAA	2	8	34887	34894	75 %	0 %	25 %	0 %	410501036
82	NC_018938	ATGA	2	8	35168	35175	50 %	25 %	25 %	0 %	410501037
83	NC_018938	TTGT	2	8	36763	36770	0 %	75 %	25 %	0 %	410501040
84	NC_018938	CTTT	2	8	36910	36917	0 %	75 %	0 %	25 %	410501040
85	NC_018938	AATA	2	8	37587	37594	75 %	25 %	0 %	0 %	410501040
86	NC_018938	TAAA	2	8	37609	37616	75 %	25 %	0 %	0 %	410501040
87	NC_018938	GAAA	2	8	37740	37747	75 %	0 %	25 %	0 %	410501041
88	NC_018938	TTTG	2	8	38370	38377	0 %	75 %	25 %	0 %	410501041
89	NC_018938	TGAT	2	8	38469	38476	25 %	50 %	25 %	0 %	410501041
90	NC_018938	CGAA	2	8	38554	38561	50 %	0 %	25 %	25 %	410501042
91	NC_018938	TGAT	2	8	38854	38861	25 %	50 %	25 %	0 %	410501042
92	NC_018938	ATTG	2	8	40251	40258	25 %	50 %	25 %	0 %	410501043
93	NC_018938	ATTG	2	8	40317	40324	25 %	50 %	25 %	0 %	410501043
94	NC_018938	ATCA	2	8	40426	40433	50 %	25 %	0 %	25 %	410501043
95	NC_018938	TGTT	2	8	41213	41220	0 %	75 %	25 %	0 %	410501044
96	NC_018938	AAAG	2	8	41533	41540	75 %	0 %	25 %	0 %	410501044
97	NC_018938	AAAC	2	8	41681	41688	75 %	0 %	0 %	25 %	410501044
98	NC_018938	CTTT	2	8	41806	41813	0 %	75 %	0 %	25 %	410501044
99	NC_018938	GAAA	2	8	42107	42114	75 %	0 %	25 %	0 %	410501045
100	NC_018938	GATC	2	8	42236	42243	25 %	25 %	25 %	25 %	410501045
101	NC_018938	ATGA	2	8	43243	43250	50 %	25 %	25 %	0 %	410501045
102	NC_018938	TGTT	2	8	43360	43367	0 %	75 %	25 %	0 %	410501046
103	NC_018938	ATGA	2	8	43459	43466	50 %	25 %	25 %	0 %	410501046
104	NC_018938	AACG	2	8	43635	43642	50 %	0 %	25 %	25 %	410501046
105	NC_018938	CAAA	2	8	44082	44089	75 %	0 %	0 %	25 %	410501046
106	NC_018938	TCTA	2	8	44782	44789	25 %	50 %	0 %	25 %	410501047
107	NC_018938	TTGA	2	8	45215	45222	25 %	50 %	25 %	0 %	410501048
108	NC_018938	AAAC	2	8	45229	45236	75 %	0 %	0 %	25 %	410501048
109	NC_018938	CGCT	2	8	45370	45377	0 %	25 %	25 %	50 %	410501048
110	NC_018938	TCAA	2	8	45981	45988	50 %	25 %	0 %	25 %	410501048
111	NC_018938	GTTT	2	8	45992	45999	0 %	75 %	25 %	0 %	410501048
112	NC_018938	CAAA	2	8	46488	46495	75 %	0 %	0 %	25 %	410501049
113	NC_018938	CGCT	2	8	46836	46843	0 %	25 %	25 %	50 %	410501049
114	NC_018938	TCGC	2	8	47303	47310	0 %	25 %	25 %	50 %	410501049
115	NC_018938	AGGG	2	8	47314	47321	25 %	0 %	75 %	0 %	410501049
116	NC_018938	TTCC	2	8	47624	47631	0 %	50 %	0 %	50 %	410501049
117	NC_018938	GATA	2	8	47808	47815	50 %	25 %	25 %	0 %	410501049
118	NC_018938	CAAC	2	8	48099	48106	50 %	0 %	0 %	50 %	410501049
119	NC_018938	TAAA	2	8	48236	48243	75 %	25 %	0 %	0 %	410501049
120	NC_018938	CGAG	2	8	48661	48668	25 %	0 %	50 %	25 %	410501050
121	NC_018938	TTCA	2	8	49279	49286	25 %	50 %	0 %	25 %	410501050
122	NC_018938	CTTT	2	8	49625	49632	0 %	75 %	0 %	25 %	410501051
123	NC_018938	TGGT	2	8	50385	50392	0 %	50 %	50 %	0 %	410501052
124	NC_018938	CTTT	2	8	50679	50686	0 %	75 %	0 %	25 %	410501052
125	NC_018938	AAAT	2	8	51071	51078	75 %	25 %	0 %	0 %	410501052
126	NC_018938	ATCA	2	8	52718	52725	50 %	25 %	0 %	25 %	410501055
127	NC_018938	TAAA	2	8	52752	52759	75 %	25 %	0 %	0 %	410501055
128	NC_018938	GAGT	2	8	52771	52778	25 %	25 %	50 %	0 %	410501055
129	NC_018938	ATTG	2	8	53168	53175	25 %	50 %	25 %	0 %	410501055
130	NC_018938	GTTT	2	8	53324	53331	0 %	75 %	25 %	0 %	410501055
131	NC_018938	CATG	2	8	53464	53471	25 %	25 %	25 %	25 %	410501055
132	NC_018938	ATTG	2	8	53703	53710	25 %	50 %	25 %	0 %	410501055
133	NC_018938	TGTC	2	8	54125	54132	0 %	50 %	25 %	25 %	410501056
134	NC_018938	GATA	2	8	54195	54202	50 %	25 %	25 %	0 %	410501056
135	NC_018938	TTGT	2	8	54217	54224	0 %	75 %	25 %	0 %	410501056
136	NC_018938	AACG	2	8	54269	54276	50 %	0 %	25 %	25 %	410501056
137	NC_018938	TGAG	2	8	54497	54504	25 %	25 %	50 %	0 %	410501056
138	NC_018938	TAAA	2	8	54697	54704	75 %	25 %	0 %	0 %	410501056
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