MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 30622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018938	CT	3	6	218897	218902	0 %	50 %	0 %	50 %	410501217
4002	NC_018938	T	7	7	218991	218997	0 %	100 %	0 %	0 %	410501217
4003	NC_018938	CTCA	2	8	219098	219105	25 %	25 %	0 %	50 %	410501218
4004	NC_018938	TCA	2	6	219168	219173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501218
4005	NC_018938	TAA	2	6	219193	219198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501218
4006	NC_018938	CCA	2	6	219208	219213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501218
4007	NC_018938	A	6	6	219233	219238	100 %	0 %	0 %	0 %	410501218
4008	NC_018938	GCC	2	6	219254	219259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501218
4009	NC_018938	G	6	6	219274	219279	0 %	0 %	100 %	0 %	410501218
4010	NC_018938	TGA	2	6	219343	219348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501218
4011	NC_018938	ATTCTA	2	12	219364	219375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410501218
4012	NC_018938	CT	3	6	219423	219428	0 %	50 %	0 %	50 %	410501218
4013	NC_018938	TGG	2	6	219430	219435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501218
4014	NC_018938	GAT	2	6	219461	219466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501218
4015	NC_018938	ATT	2	6	219488	219493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501218
4016	NC_018938	TGCA	2	8	219506	219513	25 %	25 %	25 %	25 %	410501218
4017	NC_018938	TGA	2	6	219520	219525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501218
4018	NC_018938	AGCG	2	8	219596	219603	25 %	0 %	50 %	25 %	410501218
4019	NC_018938	GCA	2	6	219757	219762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501218
4020	NC_018938	CTT	2	6	219817	219822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501218
4021	NC_018938	A	6	6	219849	219854	100 %	0 %	0 %	0 %	410501218
4022	NC_018938	CCT	2	6	219903	219908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410501218
4023	NC_018938	TAA	2	6	219949	219954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501218
4024	NC_018938	AGG	2	6	219989	219994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410501218
4025	NC_018938	GCAAA	2	10	220014	220023	60 %	0 %	20 %	20 %	410501218
4026	NC_018938	TCT	2	6	220059	220064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501218
4027	NC_018938	G	7	7	220076	220082	0 %	0 %	100 %	0 %	410501218
4028	NC_018938	A	7	7	220098	220104	100 %	0 %	0 %	0 %	410501218
4029	NC_018938	TGG	2	6	220198	220203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501218
4030	NC_018938	TGA	2	6	220210	220215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501218
4031	NC_018938	ATATT	2	10	220482	220491	40 %	60 %	0 %	0 %	410501219
4032	NC_018938	T	6	6	220561	220566	0 %	100 %	0 %	0 %	410501219
4033	NC_018938	CG	3	6	220582	220587	0 %	0 %	50 %	50 %	410501219
4034	NC_018938	CTT	2	6	220657	220662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501219
4035	NC_018938	T	7	7	220724	220730	0 %	100 %	0 %	0 %	410501219
4036	NC_018938	TCT	2	6	220803	220808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501219
4037	NC_018938	AAGC	2	8	220814	220821	50 %	0 %	25 %	25 %	410501219
4038	NC_018938	TCGGC	2	10	220827	220836	0 %	20 %	40 %	40 %	410501219
4039	NC_018938	ATC	2	6	220880	220885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501219
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4041	NC_018938	CTT	2	6	220990	220995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501219
4042	NC_018938	T	7	7	221044	221050	0 %	100 %	0 %	0 %	410501219
4043	NC_018938	CATAGC	2	12	221104	221115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410501219
4044	NC_018938	TGA	2	6	221119	221124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501219
4045	NC_018938	ATA	2	6	221204	221209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501219
4046	NC_018938	ATGG	2	8	221219	221226	25 %	25 %	50 %	0 %	410501219
4047	NC_018938	TGG	2	6	221247	221252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501219
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4049	NC_018938	TGG	2	6	221370	221375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501219
4050	NC_018938	TGGG	2	8	221412	221419	0 %	25 %	75 %	0 %	410501219
4051	NC_018938	AGGG	2	8	221449	221456	25 %	0 %	75 %	0 %	410501219
4052	NC_018938	GTTTTG	2	12	221609	221620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501219
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4054	NC_018938	A	6	6	221649	221654	100 %	0 %	0 %	0 %	410501219
4055	NC_018938	TGA	2	6	221665	221670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501219
4056	NC_018938	T	6	6	221675	221680	0 %	100 %	0 %	0 %	410501219
4057	NC_018938	GTT	2	6	221693	221698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501219
4058	NC_018938	GA	3	6	221761	221766	50 %	0 %	50 %	0 %	410501219
4059	NC_018938	CCG	2	6	221851	221856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501219
4060	NC_018938	AC	3	6	221875	221880	50 %	0 %	0 %	50 %	410501219
4061	NC_018938	TAA	2	6	221905	221910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501219
4062	NC_018938	C	7	7	221920	221926	0 %	0 %	0 %	100 %	410501219
4063	NC_018938	CTT	2	6	221938	221943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501219
4064	NC_018938	C	6	6	222080	222085	0 %	0 %	0 %	100 %	410501219
4065	NC_018938	ACCA	2	8	222086	222093	50 %	0 %	0 %	50 %	410501219
4066	NC_018938	CTTT	2	8	222105	222112	0 %	75 %	0 %	25 %	410501219
4067	NC_018938	GAT	2	6	222259	222264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501220
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4069	NC_018938	CTA	2	6	222327	222332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501220
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4071	NC_018938	TGT	2	6	222408	222413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501220
4072	NC_018938	TGG	2	6	222442	222447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501220
4073	NC_018938	CTT	2	6	222539	222544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501220
4074	NC_018938	ATC	2	6	222556	222561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501220
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4079	NC_018938	CGG	2	6	222731	222736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501220
4080	NC_018938	TGA	2	6	222737	222742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501220
4081	NC_018938	TGG	2	6	222785	222790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501220
4082	NC_018938	AGA	2	6	222795	222800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501220
4083	NC_018938	AGA	2	6	222825	222830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501220
4084	NC_018938	TAT	2	6	222852	222857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501220
4085	NC_018938	ACT	2	6	222910	222915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501220
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4088	NC_018938	ATT	2	6	223240	223245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501220
4089	NC_018938	T	7	7	223271	223277	0 %	100 %	0 %	0 %	410501220
4090	NC_018938	AGAT	2	8	223307	223314	50 %	25 %	25 %	0 %	410501220
4091	NC_018938	GGC	2	6	223444	223449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501221
4092	NC_018938	GC	3	6	223463	223468	0 %	0 %	50 %	50 %	410501221
4093	NC_018938	TCA	2	6	223541	223546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501221
4094	NC_018938	CCACC	2	10	223730	223739	20 %	0 %	0 %	80 %	410501221
4095	NC_018938	GTT	2	6	223819	223824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501221
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4097	NC_018938	A	6	6	223879	223884	100 %	0 %	0 %	0 %	410501221
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4099	NC_018938	TTACA	2	10	223917	223926	40 %	40 %	0 %	20 %	410501222
4100	NC_018938	GTTT	2	8	223929	223936	0 %	75 %	25 %	0 %	410501222
4101	NC_018938	TGT	3	9	223976	223984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501222
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4103	NC_018938	ATT	2	6	224037	224042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501222
4104	NC_018938	GGC	2	6	224094	224099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501222
4105	NC_018938	TTA	2	6	224132	224137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501222
4106	NC_018938	T	6	6	224224	224229	0 %	100 %	0 %	0 %	410501222
4107	NC_018938	GTG	2	6	224287	224292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501222
4108	NC_018938	T	6	6	224314	224319	0 %	100 %	0 %	0 %	410501222
4109	NC_018938	T	6	6	224452	224457	0 %	100 %	0 %	0 %	410501222
4110	NC_018938	T	6	6	224467	224472	0 %	100 %	0 %	0 %	410501222
4111	NC_018938	T	6	6	224475	224480	0 %	100 %	0 %	0 %	410501222
4112	NC_018938	AAAG	2	8	224528	224535	75 %	0 %	25 %	0 %	410501222
4113	NC_018938	TGT	2	6	224633	224638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501222
4114	NC_018938	T	6	6	224640	224645	0 %	100 %	0 %	0 %	410501222
4115	NC_018938	GAAA	2	8	224655	224662	75 %	0 %	25 %	0 %	410501222
4116	NC_018938	CGG	2	6	224663	224668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501222
4117	NC_018938	GTT	2	6	224689	224694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501222
4118	NC_018938	A	7	7	224739	224745	100 %	0 %	0 %	0 %	410501223
4119	NC_018938	GAT	2	6	224913	224918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501223
4120	NC_018938	AGA	2	6	224919	224924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501223
4121	NC_018938	A	6	6	225004	225009	100 %	0 %	0 %	0 %	410501223
4122	NC_018938	AAAG	2	8	225025	225032	75 %	0 %	25 %	0 %	410501223
4123	NC_018938	TTA	2	6	225052	225057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501223
4124	NC_018938	GTT	2	6	225108	225113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501223
4125	NC_018938	G	7	7	225160	225166	0 %	0 %	100 %	0 %	410501223
4126	NC_018938	TGG	2	6	225374	225379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501223
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4376	NC_018938	GGCGT	2	10	237432	237441	0 %	20 %	60 %	20 %	410501235
4377	NC_018938	TTTTG	2	10	237464	237473	0 %	80 %	20 %	0 %	410501235
4378	NC_018938	GAT	2	6	237497	237502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501235
4379	NC_018938	CGGC	2	8	237511	237518	0 %	0 %	50 %	50 %	410501235
4380	NC_018938	TCA	2	6	237769	237774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501235
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4383	NC_018938	TTTCA	2	10	237906	237915	20 %	60 %	0 %	20 %	410501235
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4486	NC_018938	TGA	2	6	243402	243407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501240
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4499	NC_018938	T	6	6	243884	243889	0 %	100 %	0 %	0 %	410501241
4500	NC_018938	CTT	2	6	243903	243908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501241

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