MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 30622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_018938	GAA	2	6	164560	164565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501159
3003	NC_018938	G	6	6	164590	164595	0 %	0 %	100 %	0 %	410501159
3004	NC_018938	CAA	2	6	164614	164619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501159
3005	NC_018938	GAA	2	6	164678	164683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501159
3006	NC_018938	AGC	2	6	164708	164713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501159
3007	NC_018938	TGG	2	6	164718	164723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501159
3008	NC_018938	TGG	2	6	164781	164786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501159
3009	NC_018938	TTA	2	6	164788	164793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501159
3010	NC_018938	TGG	2	6	164802	164807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501159
3011	NC_018938	GAT	2	6	164912	164917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501159
3012	NC_018938	TTGT	2	8	164918	164925	0 %	75 %	25 %	0 %	410501159
3013	NC_018938	AACG	2	8	164926	164933	50 %	0 %	25 %	25 %	410501159
3014	NC_018938	A	7	7	164958	164964	100 %	0 %	0 %	0 %	410501159
3015	NC_018938	TGA	2	6	165063	165068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501159
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3017	NC_018938	G	6	6	165215	165220	0 %	0 %	100 %	0 %	410501159
3018	NC_018938	GTT	2	6	165238	165243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501159
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3020	NC_018938	T	6	6	165302	165307	0 %	100 %	0 %	0 %	410501160
3021	NC_018938	TTGGGT	2	12	165349	165360	0 %	50 %	50 %	0 %	410501160
3022	NC_018938	ATT	2	6	165361	165366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501160
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3026	NC_018938	AGATT	2	10	165518	165527	40 %	40 %	20 %	0 %	410501160
3027	NC_018938	A	6	6	165547	165552	100 %	0 %	0 %	0 %	410501161
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3029	NC_018938	TGG	3	9	165564	165572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501161
3030	NC_018938	ATTG	2	8	165785	165792	25 %	50 %	25 %	0 %	410501161
3031	NC_018938	AC	3	6	165817	165822	50 %	0 %	0 %	50 %	410501161
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3034	NC_018938	GCAA	2	8	165881	165888	50 %	0 %	25 %	25 %	410501161
3035	NC_018938	GAT	2	6	165892	165897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501161
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3041	NC_018938	GCA	2	6	166145	166150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501161
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3043	NC_018938	TGAT	2	8	166330	166337	25 %	50 %	25 %	0 %	410501162
3044	NC_018938	C	6	6	166357	166362	0 %	0 %	0 %	100 %	410501162
3045	NC_018938	AAAG	2	8	166473	166480	75 %	0 %	25 %	0 %	410501162
3046	NC_018938	CTCA	2	8	166506	166513	25 %	25 %	0 %	50 %	410501162
3047	NC_018938	A	7	7	166552	166558	100 %	0 %	0 %	0 %	410501162
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3055	NC_018938	A	6	6	166814	166819	100 %	0 %	0 %	0 %	410501163
3056	NC_018938	T	7	7	166820	166826	0 %	100 %	0 %	0 %	410501163
3057	NC_018938	AAGCC	2	10	166857	166866	40 %	0 %	20 %	40 %	410501163
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3059	NC_018938	TAT	2	6	166959	166964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501163
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3061	NC_018938	TAG	2	6	167035	167040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501163
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3063	NC_018938	ACC	2	6	167392	167397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501163
3064	NC_018938	GAT	2	6	167414	167419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501163
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3070	NC_018938	T	6	6	167716	167721	0 %	100 %	0 %	0 %	410501164
3071	NC_018938	GCA	2	6	167872	167877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501164
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3073	NC_018938	GGGT	2	8	167928	167935	0 %	25 %	75 %	0 %	410501164
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3082	NC_018938	GGCAT	2	10	168672	168681	20 %	20 %	40 %	20 %	410501164
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3089	NC_018938	TATG	2	8	169078	169085	25 %	50 %	25 %	0 %	410501165
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3094	NC_018938	TATG	2	8	169186	169193	25 %	50 %	25 %	0 %	410501165
3095	NC_018938	A	7	7	169212	169218	100 %	0 %	0 %	0 %	410501165
3096	NC_018938	CTAT	2	8	169230	169237	25 %	50 %	0 %	25 %	410501165
3097	NC_018938	GGGTG	2	10	169264	169273	0 %	20 %	80 %	0 %	410501165
3098	NC_018938	TTTC	2	8	169343	169350	0 %	75 %	0 %	25 %	410501165
3099	NC_018938	A	6	6	169439	169444	100 %	0 %	0 %	0 %	410501165
3100	NC_018938	TG	3	6	169493	169498	0 %	50 %	50 %	0 %	410501165
3101	NC_018938	CAAA	2	8	169534	169541	75 %	0 %	0 %	25 %	410501165
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3105	NC_018938	AAG	2	6	169736	169741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501165
3106	NC_018938	TGA	2	6	169744	169749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501165
3107	NC_018938	GAT	2	6	169781	169786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501165
3108	NC_018938	CAT	3	9	170726	170734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501166
3109	NC_018938	ATTCA	2	10	170784	170793	40 %	40 %	0 %	20 %	410501166
3110	NC_018938	C	6	6	170888	170893	0 %	0 %	0 %	100 %	410501166
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3113	NC_018938	TTC	2	6	170925	170930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501166
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3123	NC_018938	TCT	2	6	171688	171693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501167
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3125	NC_018938	ATG	2	6	171829	171834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501167
3126	NC_018938	CCAT	2	8	171889	171896	25 %	25 %	0 %	50 %	410501167
3127	NC_018938	T	6	6	172074	172079	0 %	100 %	0 %	0 %	410501167
3128	NC_018938	GGC	2	6	172089	172094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501167
3129	NC_018938	TTC	2	6	172197	172202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501167
3130	NC_018938	ATC	2	6	172311	172316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501167
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3133	NC_018938	TC	3	6	172394	172399	0 %	50 %	0 %	50 %	410501167
3134	NC_018938	G	14	14	172473	172486	0 %	0 %	100 %	0 %	410501168
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3142	NC_018938	TCA	2	6	172884	172889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501168
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3144	NC_018938	GCT	2	6	172972	172977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501168
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3378	NC_018938	GATT	2	8	185009	185016	25 %	50 %	25 %	0 %	410501182
3379	NC_018938	CTT	2	6	185024	185029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501182
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3395	NC_018938	CTT	2	6	185837	185842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501183
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3402	NC_018938	TCA	2	6	185989	185994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501183
3403	NC_018938	T	6	6	186012	186017	0 %	100 %	0 %	0 %	410501183
3404	NC_018938	GTT	2	6	186044	186049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501183
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3487	NC_018938	TGA	2	6	190739	190744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501187
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