MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 30622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_018938	TCA	2	6	109716	109721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501106
2003	NC_018938	GGT	2	6	109762	109767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501106
2004	NC_018938	CAAA	2	8	109887	109894	75 %	0 %	0 %	25 %	410501106
2005	NC_018938	TCA	2	6	110003	110008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501106
2006	NC_018938	TCG	2	6	110064	110069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501106
2007	NC_018938	AAT	2	6	110087	110092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501106
2008	NC_018938	GTG	2	6	110096	110101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501106
2009	NC_018938	TCA	2	6	110105	110110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501106
2010	NC_018938	CTT	2	6	110127	110132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501106
2011	NC_018938	TCA	2	6	110201	110206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501106
2012	NC_018938	T	6	6	110224	110229	0 %	100 %	0 %	0 %	410501106
2013	NC_018938	TAA	2	6	110264	110269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501106
2014	NC_018938	T	6	6	110284	110289	0 %	100 %	0 %	0 %	410501106
2015	NC_018938	GCC	2	6	110291	110296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501106
2016	NC_018938	ATA	2	6	110314	110319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501106
2017	NC_018938	ACC	2	6	110390	110395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501106
2018	NC_018938	CCA	4	12	110406	110417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501106
2019	NC_018938	TCG	2	6	110435	110440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501106
2020	NC_018938	AAT	2	6	110454	110459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501106
2021	NC_018938	AAT	2	6	110524	110529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501106
2022	NC_018938	AGCG	2	8	110542	110549	25 %	0 %	50 %	25 %	410501106
2023	NC_018938	T	6	6	110550	110555	0 %	100 %	0 %	0 %	410501106
2024	NC_018938	C	6	6	110644	110649	0 %	0 %	0 %	100 %	410501106
2025	NC_018938	GAA	2	6	110711	110716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501106
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2028	NC_018938	CT	3	6	110943	110948	0 %	50 %	0 %	50 %	410501107
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2030	NC_018938	TC	3	6	111021	111026	0 %	50 %	0 %	50 %	410501107
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2034	NC_018938	TGA	2	6	111127	111132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501107
2035	NC_018938	TTG	2	6	111240	111245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501107
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2045	NC_018938	T	6	6	111782	111787	0 %	100 %	0 %	0 %	410501107
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2054	NC_018938	CTT	2	6	112108	112113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501107
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2072	NC_018938	TTGG	2	8	113151	113158	0 %	50 %	50 %	0 %	410501108
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2083	NC_018938	T	7	7	113714	113720	0 %	100 %	0 %	0 %	410501109
2084	NC_018938	CAGC	2	8	113767	113774	25 %	0 %	25 %	50 %	410501109
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2122	NC_018938	A	6	6	115874	115879	100 %	0 %	0 %	0 %	410501111
2123	NC_018938	TTA	2	6	115979	115984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501111
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2251	NC_018938	AAT	2	6	122451	122456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501117
2252	NC_018938	TGT	2	6	122467	122472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501117
2253	NC_018938	TGCA	2	8	122486	122493	25 %	25 %	25 %	25 %	410501117
2254	NC_018938	AAT	2	6	122555	122560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501117
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2257	NC_018938	ATA	2	6	122648	122653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501117
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2370	NC_018938	GAAC	2	8	129478	129485	50 %	0 %	25 %	25 %	410501122
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2372	NC_018938	GTT	2	6	129766	129771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501122
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2374	NC_018938	T	6	6	129881	129886	0 %	100 %	0 %	0 %	410501122
2375	NC_018938	TTGT	2	8	129954	129961	0 %	75 %	25 %	0 %	410501122
2376	NC_018938	TCT	2	6	129982	129987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501122
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2500	NC_018938	AGC	2	6	136573	136578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501126

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