MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 30622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018938	TCT	2	6	29682	29687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501032
502	NC_018938	C	6	6	29708	29713	0 %	0 %	0 %	100 %	410501032
503	NC_018938	TCT	3	9	29802	29810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501032
504	NC_018938	G	6	6	29824	29829	0 %	0 %	100 %	0 %	410501032
505	NC_018938	TC	3	6	30179	30184	0 %	50 %	0 %	50 %	410501033
506	NC_018938	TATCAA	2	12	30208	30219	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410501033
507	NC_018938	GAGT	2	8	30242	30249	25 %	25 %	50 %	0 %	410501033
508	NC_018938	TCAA	2	8	30264	30271	50 %	25 %	0 %	25 %	410501033
509	NC_018938	TGCT	2	8	30296	30303	0 %	50 %	25 %	25 %	410501033
510	NC_018938	AGCA	2	8	30413	30420	50 %	0 %	25 %	25 %	410501033
511	NC_018938	CAAT	2	8	30427	30434	50 %	25 %	0 %	25 %	410501033
512	NC_018938	T	6	6	30446	30451	0 %	100 %	0 %	0 %	410501033
513	NC_018938	TTA	2	6	30477	30482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501033
514	NC_018938	GTTTC	2	10	30491	30500	0 %	60 %	20 %	20 %	410501033
515	NC_018938	T	7	7	30569	30575	0 %	100 %	0 %	0 %	410501033
516	NC_018938	TTA	2	6	30750	30755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501033
517	NC_018938	AG	3	6	30779	30784	50 %	0 %	50 %	0 %	410501033
518	NC_018938	TCTTAT	2	12	30922	30933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410501033
519	NC_018938	CAAT	2	8	30937	30944	50 %	25 %	0 %	25 %	410501033
520	NC_018938	TCAAA	2	10	31006	31015	60 %	20 %	0 %	20 %	410501033
521	NC_018938	CTA	2	6	31020	31025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501033
522	NC_018938	A	6	6	31043	31048	100 %	0 %	0 %	0 %	410501033
523	NC_018938	TTTTC	2	10	31176	31185	0 %	80 %	0 %	20 %	410501033
524	NC_018938	TC	3	6	31199	31204	0 %	50 %	0 %	50 %	410501033
525	NC_018938	CTT	2	6	31243	31248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501033
526	NC_018938	T	6	6	31247	31252	0 %	100 %	0 %	0 %	410501033
527	NC_018938	A	6	6	31253	31258	100 %	0 %	0 %	0 %	410501033
528	NC_018938	GAAA	2	8	31372	31379	75 %	0 %	25 %	0 %	410501033
529	NC_018938	TAT	2	6	31442	31447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501033
530	NC_018938	TCATA	2	10	31648	31657	40 %	40 %	0 %	20 %	410501033
531	NC_018938	AAG	2	6	31795	31800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501033
532	NC_018938	TCA	2	6	31815	31820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501033
533	NC_018938	A	6	6	31830	31835	100 %	0 %	0 %	0 %	410501033
534	NC_018938	TTG	2	6	32060	32065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501034
535	NC_018938	TTTA	2	8	32084	32091	25 %	75 %	0 %	0 %	410501034
536	NC_018938	GAT	2	6	32104	32109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501034
537	NC_018938	CAGA	2	8	32120	32127	50 %	0 %	25 %	25 %	410501034
538	NC_018938	AGA	3	9	32134	32142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501034
539	NC_018938	A	6	6	32183	32188	100 %	0 %	0 %	0 %	410501034
540	NC_018938	GCG	2	6	32220	32225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501034
541	NC_018938	TGAT	2	8	32229	32236	25 %	50 %	25 %	0 %	410501034
542	NC_018938	ATTG	2	8	32272	32279	25 %	50 %	25 %	0 %	410501034
543	NC_018938	GCGA	2	8	32282	32289	25 %	0 %	50 %	25 %	410501034
544	NC_018938	TGT	2	6	32298	32303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501034
545	NC_018938	TGT	2	6	32356	32361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501034
546	NC_018938	ACCC	2	8	32422	32429	25 %	0 %	0 %	75 %	410501035
547	NC_018938	CCA	2	6	32430	32435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501035
548	NC_018938	TGA	2	6	32455	32460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501035
549	NC_018938	T	7	7	32503	32509	0 %	100 %	0 %	0 %	410501035
550	NC_018938	AGA	2	6	32521	32526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501035
551	NC_018938	CATC	2	8	32548	32555	25 %	25 %	0 %	50 %	410501035
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557	NC_018938	TCAA	2	8	32690	32697	50 %	25 %	0 %	25 %	410501036
558	NC_018938	CAC	2	6	32760	32765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501036
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560	NC_018938	ATT	2	6	32812	32817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501036
561	NC_018938	TTG	2	6	32872	32877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501036
562	NC_018938	GTT	2	6	32963	32968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501036
563	NC_018938	GCGTGG	2	12	32975	32986	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410501036
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565	NC_018938	TAATGA	2	12	33120	33131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410501036
566	NC_018938	A	7	7	33156	33162	100 %	0 %	0 %	0 %	410501036
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584	NC_018938	A	7	7	33898	33904	100 %	0 %	0 %	0 %	410501036
585	NC_018938	TGA	2	6	33912	33917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501036
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595	NC_018938	A	6	6	34303	34308	100 %	0 %	0 %	0 %	410501036
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604	NC_018938	A	7	7	34747	34753	100 %	0 %	0 %	0 %	410501036
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608	NC_018938	A	7	7	34841	34847	100 %	0 %	0 %	0 %	410501036
609	NC_018938	GC	4	8	34872	34879	0 %	0 %	50 %	50 %	410501036
610	NC_018938	GAAA	2	8	34887	34894	75 %	0 %	25 %	0 %	410501036
611	NC_018938	TA	3	6	34958	34963	50 %	50 %	0 %	0 %	410501037
612	NC_018938	AG	3	6	35009	35014	50 %	0 %	50 %	0 %	410501037
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614	NC_018938	A	7	7	35081	35087	100 %	0 %	0 %	0 %	410501037
615	NC_018938	GCA	2	6	35111	35116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501037
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617	NC_018938	CA	3	6	35190	35195	50 %	0 %	0 %	50 %	410501037
618	NC_018938	A	7	7	35220	35226	100 %	0 %	0 %	0 %	410501037
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626	NC_018938	TGA	2	6	35453	35458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501038
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629	NC_018938	TTA	2	6	35560	35565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501039
630	NC_018938	T	8	8	35583	35590	0 %	100 %	0 %	0 %	410501039
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