MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 4111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018937	TGAG	2	8	233	240	25 %	25 %	50 %	0 %	410023237
2	NC_018937	CATT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	410023237
3	NC_018937	GTTG	2	8	507	514	0 %	50 %	50 %	0 %	410023237
4	NC_018937	TCTG	2	8	1016	1023	0 %	50 %	25 %	25 %	410023238
5	NC_018937	AAAT	2	8	1118	1125	75 %	25 %	0 %	0 %	410023239
6	NC_018937	GCTT	2	8	1661	1668	0 %	50 %	25 %	25 %	410023239
7	NC_018937	CCTG	2	8	2016	2023	0 %	25 %	25 %	50 %	410023240
8	NC_018937	CCAA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	0 %	50 %	410023240
9	NC_018937	ATTC	2	8	2057	2064	25 %	50 %	0 %	25 %	410023240
10	NC_018937	TGAA	2	8	2080	2087	50 %	25 %	25 %	0 %	410023240
11	NC_018937	ATTC	2	8	2555	2562	25 %	50 %	0 %	25 %	410023240
12	NC_018937	TCTT	2	8	2763	2770	0 %	75 %	0 %	25 %	410023241
13	NC_018937	CAAA	2	8	3306	3313	75 %	0 %	0 %	25 %	410023241
14	NC_018937	GAAA	2	8	3528	3535	75 %	0 %	25 %	0 %	410023242
15	NC_018937	TCGC	2	8	5377	5384	0 %	25 %	25 %	50 %	410023244
16	NC_018937	ATTC	2	8	5406	5413	25 %	50 %	0 %	25 %	410023244
17	NC_018937	CATT	2	8	5450	5457	25 %	50 %	0 %	25 %	410023244
18	NC_018937	ATCG	2	8	7008	7015	25 %	25 %	25 %	25 %	410023244
19	NC_018937	CGTT	2	8	7043	7050	0 %	50 %	25 %	25 %	410023244
20	NC_018937	TTGA	2	8	7056	7063	25 %	50 %	25 %	0 %	410023244
21	NC_018937	TTCA	2	8	7849	7856	25 %	50 %	0 %	25 %	410023245
22	NC_018937	TCAA	2	8	10056	10063	50 %	25 %	0 %	25 %	410023247
23	NC_018937	TTTG	2	8	10876	10883	0 %	75 %	25 %	0 %	410023247
24	NC_018937	GTTT	2	8	10972	10979	0 %	75 %	25 %	0 %	410023247
25	NC_018937	GCTC	2	8	11499	11506	0 %	25 %	25 %	50 %	410023247
26	NC_018937	CGCT	2	8	12366	12373	0 %	25 %	25 %	50 %	410023248
27	NC_018937	GCCG	2	8	12511	12518	0 %	0 %	50 %	50 %	410023248
28	NC_018937	TGCA	2	8	12725	12732	25 %	25 %	25 %	25 %	410023249
29	NC_018937	AGCA	2	8	12780	12787	50 %	0 %	25 %	25 %	410023249
30	NC_018937	GTTT	2	8	13138	13145	0 %	75 %	25 %	0 %	410023249
31	NC_018937	TCTT	2	8	13525	13532	0 %	75 %	0 %	25 %	410023249
32	NC_018937	AGCG	2	8	13997	14004	25 %	0 %	50 %	25 %	410023251
33	NC_018937	GATT	2	8	14105	14112	25 %	50 %	25 %	0 %	410023251
34	NC_018937	CAAA	2	8	14274	14281	75 %	0 %	0 %	25 %	410023252
35	NC_018937	CACT	2	8	14643	14650	25 %	25 %	0 %	50 %	410023252
36	NC_018937	ATGC	2	8	14689	14696	25 %	25 %	25 %	25 %	410023252
37	NC_018937	TTTA	2	8	15276	15283	25 %	75 %	0 %	0 %	410023252
38	NC_018937	CAGG	2	8	16434	16441	25 %	0 %	50 %	25 %	410023252
39	NC_018937	TGAT	2	8	16478	16485	25 %	50 %	25 %	0 %	410023252
40	NC_018937	CGAA	2	8	17299	17306	50 %	0 %	25 %	25 %	410023253
41	NC_018937	CTTA	2	8	17474	17481	25 %	50 %	0 %	25 %	410023253
42	NC_018937	GTTT	2	8	18248	18255	0 %	75 %	25 %	0 %	410023253
43	NC_018937	TTGA	2	8	18602	18609	25 %	50 %	25 %	0 %	410023254
44	NC_018937	TGCT	2	8	18978	18985	0 %	50 %	25 %	25 %	410023254
45	NC_018937	CTTG	2	8	19452	19459	0 %	50 %	25 %	25 %	410023255
46	NC_018937	TAAA	2	8	20656	20663	75 %	25 %	0 %	0 %	410023256
47	NC_018937	GCGA	2	8	20665	20672	25 %	0 %	50 %	25 %	410023256
48	NC_018937	CTTT	2	8	21522	21529	0 %	75 %	0 %	25 %	410023257
49	NC_018937	AAGT	2	8	21834	21841	50 %	25 %	25 %	0 %	410023257
50	NC_018937	GCTT	2	8	21961	21968	0 %	50 %	25 %	25 %	410023257
51	NC_018937	CTTT	2	8	22593	22600	0 %	75 %	0 %	25 %	410023257
52	NC_018937	GTTT	2	8	23794	23801	0 %	75 %	25 %	0 %	410023259
53	NC_018937	CTGG	2	8	24811	24818	0 %	25 %	50 %	25 %	410023259
54	NC_018937	GCAA	2	8	24995	25002	50 %	0 %	25 %	25 %	410023259
55	NC_018937	GACA	2	8	27350	27357	50 %	0 %	25 %	25 %	410023260
56	NC_018937	GCTC	2	8	28324	28331	0 %	25 %	25 %	50 %	410023261
57	NC_018937	ATGG	2	8	28772	28779	25 %	25 %	50 %	0 %	410023261
58	NC_018937	GAAT	2	8	29034	29041	50 %	25 %	25 %	0 %	410023262
59	NC_018937	AATC	2	8	29227	29234	50 %	25 %	0 %	25 %	410023262
60	NC_018937	TTTA	2	8	29410	29417	25 %	75 %	0 %	0 %	410023262
61	NC_018937	GAGT	2	8	30242	30249	25 %	25 %	50 %	0 %	410023264
62	NC_018937	TCAA	2	8	30264	30271	50 %	25 %	0 %	25 %	410023264
63	NC_018937	TGCT	2	8	30296	30303	0 %	50 %	25 %	25 %	410023264
64	NC_018937	AGCA	2	8	30413	30420	50 %	0 %	25 %	25 %	410023264
65	NC_018937	CAAT	2	8	30427	30434	50 %	25 %	0 %	25 %	410023264
66	NC_018937	CAAT	2	8	30937	30944	50 %	25 %	0 %	25 %	410023264
67	NC_018937	GAAA	2	8	31372	31379	75 %	0 %	25 %	0 %	410023264
68	NC_018937	TTTA	2	8	32084	32091	25 %	75 %	0 %	0 %	410023265
69	NC_018937	CAGA	2	8	32120	32127	50 %	0 %	25 %	25 %	410023265
70	NC_018937	TGAT	2	8	32229	32236	25 %	50 %	25 %	0 %	410023265
71	NC_018937	ATTG	2	8	32272	32279	25 %	50 %	25 %	0 %	410023265
72	NC_018937	GCGA	2	8	32282	32289	25 %	0 %	50 %	25 %	410023265
73	NC_018937	ACCC	2	8	32422	32429	25 %	0 %	0 %	75 %	410023266
74	NC_018937	CATC	2	8	32548	32555	25 %	25 %	0 %	50 %	410023266
75	NC_018937	TCAA	2	8	32690	32697	50 %	25 %	0 %	25 %	410023267
76	NC_018937	CATG	2	8	33813	33820	25 %	25 %	25 %	25 %	410023267
77	NC_018937	GAAA	2	8	33921	33928	75 %	0 %	25 %	0 %	410023267
78	NC_018937	CGCT	2	8	33929	33936	0 %	25 %	25 %	50 %	410023267
79	NC_018937	TCAT	2	8	34754	34761	25 %	50 %	0 %	25 %	410023267
80	NC_018937	GCTT	2	8	34828	34835	0 %	50 %	25 %	25 %	410023267
81	NC_018937	GAAA	2	8	34887	34894	75 %	0 %	25 %	0 %	410023267
82	NC_018937	ATGA	2	8	35168	35175	50 %	25 %	25 %	0 %	410023268
83	NC_018937	TTGT	2	8	36763	36770	0 %	75 %	25 %	0 %	410023271
84	NC_018937	CTTT	2	8	36910	36917	0 %	75 %	0 %	25 %	410023271
85	NC_018937	AATA	2	8	37587	37594	75 %	25 %	0 %	0 %	410023271
86	NC_018937	TAAA	2	8	37609	37616	75 %	25 %	0 %	0 %	410023271
87	NC_018937	GAAA	2	8	37740	37747	75 %	0 %	25 %	0 %	410023272
88	NC_018937	TTTG	2	8	38370	38377	0 %	75 %	25 %	0 %	410023272
89	NC_018937	TGAT	2	8	38469	38476	25 %	50 %	25 %	0 %	410023272
90	NC_018937	CGAA	2	8	38554	38561	50 %	0 %	25 %	25 %	410023273
91	NC_018937	TGAT	2	8	38854	38861	25 %	50 %	25 %	0 %	410023273
92	NC_018937	ATTG	2	8	40251	40258	25 %	50 %	25 %	0 %	410023274
93	NC_018937	ATTG	2	8	40317	40324	25 %	50 %	25 %	0 %	410023274
94	NC_018937	ATCA	2	8	40426	40433	50 %	25 %	0 %	25 %	410023274
95	NC_018937	TGTT	2	8	41213	41220	0 %	75 %	25 %	0 %	410023275
96	NC_018937	AAAG	2	8	41533	41540	75 %	0 %	25 %	0 %	410023275
97	NC_018937	AAAC	2	8	41681	41688	75 %	0 %	0 %	25 %	410023275
98	NC_018937	CTTT	2	8	41806	41813	0 %	75 %	0 %	25 %	410023275
99	NC_018937	GAAA	2	8	42107	42114	75 %	0 %	25 %	0 %	410023276
100	NC_018937	GATC	2	8	42236	42243	25 %	25 %	25 %	25 %	410023276
101	NC_018937	ATGA	2	8	43243	43250	50 %	25 %	25 %	0 %	410023276
102	NC_018937	TGTT	2	8	43360	43367	0 %	75 %	25 %	0 %	410023277
103	NC_018937	ATGA	2	8	43459	43466	50 %	25 %	25 %	0 %	410023277
104	NC_018937	AACG	2	8	43635	43642	50 %	0 %	25 %	25 %	410023277
105	NC_018937	CAAA	2	8	44082	44089	75 %	0 %	0 %	25 %	410023277
106	NC_018937	TCTA	2	8	44782	44789	25 %	50 %	0 %	25 %	410023278
107	NC_018937	TTGA	2	8	45215	45222	25 %	50 %	25 %	0 %	410023279
108	NC_018937	AAAC	2	8	45229	45236	75 %	0 %	0 %	25 %	410023279
109	NC_018937	CGCT	2	8	45370	45377	0 %	25 %	25 %	50 %	410023279
110	NC_018937	TCAA	2	8	45981	45988	50 %	25 %	0 %	25 %	410023279
111	NC_018937	GTTT	2	8	45992	45999	0 %	75 %	25 %	0 %	410023279
112	NC_018937	CAAA	2	8	46488	46495	75 %	0 %	0 %	25 %	410023280
113	NC_018937	CGCT	2	8	46836	46843	0 %	25 %	25 %	50 %	410023280
114	NC_018937	TCGC	2	8	47303	47310	0 %	25 %	25 %	50 %	410023280
115	NC_018937	AGGG	2	8	47314	47321	25 %	0 %	75 %	0 %	410023280
116	NC_018937	TTCC	2	8	47624	47631	0 %	50 %	0 %	50 %	410023280
117	NC_018937	GATA	2	8	47808	47815	50 %	25 %	25 %	0 %	410023280
118	NC_018937	CAAC	2	8	48099	48106	50 %	0 %	0 %	50 %	410023280
119	NC_018937	TAAA	2	8	48236	48243	75 %	25 %	0 %	0 %	410023280
120	NC_018937	CGAG	2	8	48661	48668	25 %	0 %	50 %	25 %	410023281
121	NC_018937	TTCA	2	8	49279	49286	25 %	50 %	0 %	25 %	410023281
122	NC_018937	CTTT	2	8	49625	49632	0 %	75 %	0 %	25 %	410023282
123	NC_018937	TGGT	2	8	50385	50392	0 %	50 %	50 %	0 %	410023283
124	NC_018937	CTTT	2	8	50679	50686	0 %	75 %	0 %	25 %	410023283
125	NC_018937	AAAT	2	8	51071	51078	75 %	25 %	0 %	0 %	410023283
126	NC_018937	AAAG	2	8	51375	51382	75 %	0 %	25 %	0 %	410023285
127	NC_018937	TAAA	2	8	51734	51741	75 %	25 %	0 %	0 %	410023285
128	NC_018937	ATCA	2	8	52717	52724	50 %	25 %	0 %	25 %	410023286
129	NC_018937	TAAA	2	8	52751	52758	75 %	25 %	0 %	0 %	410023286
130	NC_018937	GAGT	2	8	52770	52777	25 %	25 %	50 %	0 %	410023286
131	NC_018937	ATTG	2	8	53167	53174	25 %	50 %	25 %	0 %	410023286
132	NC_018937	GTTT	2	8	53323	53330	0 %	75 %	25 %	0 %	410023286
133	NC_018937	CATG	2	8	53463	53470	25 %	25 %	25 %	25 %	410023286
134	NC_018937	ATTG	2	8	53702	53709	25 %	50 %	25 %	0 %	410023286
135	NC_018937	TGTC	2	8	54124	54131	0 %	50 %	25 %	25 %	410023287
136	NC_018937	GATA	2	8	54194	54201	50 %	25 %	25 %	0 %	410023287
137	NC_018937	TTGT	2	8	54216	54223	0 %	75 %	25 %	0 %	410023287
138	NC_018937	AACG	2	8	54268	54275	50 %	0 %	25 %	25 %	410023287
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