MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 30648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018937	TGAG	2	8	233	240	25 %	25 %	50 %	0 %	410023237
2	NC_018937	CATT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	410023237
3	NC_018937	GAT	3	9	328	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023237
4	NC_018937	T	6	6	465	470	0 %	100 %	0 %	0 %	410023237
5	NC_018937	AAAGCG	2	12	494	505	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410023237
6	NC_018937	GTTG	2	8	507	514	0 %	50 %	50 %	0 %	410023237
7	NC_018937	T	7	7	524	530	0 %	100 %	0 %	0 %	410023237
8	NC_018937	T	7	7	552	558	0 %	100 %	0 %	0 %	410023237
9	NC_018937	TTC	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023237
10	NC_018937	ACA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023237
11	NC_018937	C	6	6	606	611	0 %	0 %	0 %	100 %	410023237
12	NC_018937	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023238
13	NC_018937	C	6	6	848	853	0 %	0 %	0 %	100 %	410023238
14	NC_018937	CT	3	6	897	902	0 %	50 %	0 %	50 %	410023238
15	NC_018937	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023238
16	NC_018937	TAAAA	2	10	914	923	80 %	20 %	0 %	0 %	410023238
17	NC_018937	CTT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023238
18	NC_018937	TCTG	2	8	1016	1023	0 %	50 %	25 %	25 %	410023238
19	NC_018937	TGA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023238
20	NC_018937	AAAT	2	8	1118	1125	75 %	25 %	0 %	0 %	410023239
21	NC_018937	AAC	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023239
22	NC_018937	CCG	3	9	1249	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023239
23	NC_018937	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023239
24	NC_018937	GCT	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410023239
25	NC_018937	CA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	0 %	50 %	410023239
26	NC_018937	T	6	6	1449	1454	0 %	100 %	0 %	0 %	410023239
27	NC_018937	TC	3	6	1491	1496	0 %	50 %	0 %	50 %	410023239
28	NC_018937	T	6	6	1553	1558	0 %	100 %	0 %	0 %	410023239
29	NC_018937	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023239
30	NC_018937	GCTT	2	8	1661	1668	0 %	50 %	25 %	25 %	410023239
31	NC_018937	CT	3	6	1767	1772	0 %	50 %	0 %	50 %	410023239
32	NC_018937	TAAAA	2	10	1807	1816	80 %	20 %	0 %	0 %	410023239
33	NC_018937	GTT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023239
34	NC_018937	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023239
35	NC_018937	A	7	7	1983	1989	100 %	0 %	0 %	0 %	410023240
36	NC_018937	ATTATA	2	12	2001	2012	50 %	50 %	0 %	0 %	410023240
37	NC_018937	CCTG	2	8	2016	2023	0 %	25 %	25 %	50 %	410023240
38	NC_018937	ATG	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023240
39	NC_018937	CCAA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	0 %	50 %	410023240
40	NC_018937	ATTC	2	8	2057	2064	25 %	50 %	0 %	25 %	410023240
41	NC_018937	TGAA	2	8	2080	2087	50 %	25 %	25 %	0 %	410023240
42	NC_018937	GTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023240
43	NC_018937	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	410023240
44	NC_018937	T	6	6	2182	2187	0 %	100 %	0 %	0 %	410023240
45	NC_018937	CTT	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023240
46	NC_018937	TGG	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023240
47	NC_018937	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023240
48	NC_018937	G	6	6	2395	2400	0 %	0 %	100 %	0 %	410023240
49	NC_018937	CA	3	6	2481	2486	50 %	0 %	0 %	50 %	410023240
50	NC_018937	ATTC	2	8	2555	2562	25 %	50 %	0 %	25 %	410023240
51	NC_018937	A	8	8	2747	2754	100 %	0 %	0 %	0 %	410023241
52	NC_018937	TCTT	2	8	2763	2770	0 %	75 %	0 %	25 %	410023241
53	NC_018937	T	7	7	2843	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	410023241
54	NC_018937	TGA	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023241
55	NC_018937	T	7	7	2885	2891	0 %	100 %	0 %	0 %	410023241
56	NC_018937	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023241
57	NC_018937	GC	3	6	2996	3001	0 %	0 %	50 %	50 %	410023241
58	NC_018937	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	410023241
59	NC_018937	AG	3	6	3153	3158	50 %	0 %	50 %	0 %	410023241
60	NC_018937	GTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023241
61	NC_018937	CAAA	2	8	3306	3313	75 %	0 %	0 %	25 %	410023241
62	NC_018937	GTG	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023241
63	NC_018937	GCC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023241
64	NC_018937	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023242
65	NC_018937	AG	3	6	3433	3438	50 %	0 %	50 %	0 %	410023242
66	NC_018937	GAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023242
67	NC_018937	GAAA	2	8	3528	3535	75 %	0 %	25 %	0 %	410023242
68	NC_018937	GTT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023242
69	NC_018937	CA	3	6	3981	3986	50 %	0 %	0 %	50 %	410023242
70	NC_018937	A	6	6	4022	4027	100 %	0 %	0 %	0 %	410023242
71	NC_018937	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023242
72	NC_018937	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	410023242
73	NC_018937	ATT	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023242
74	NC_018937	TGT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023242
75	NC_018937	TGG	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023242
76	NC_018937	TAT	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023243
77	NC_018937	T	7	7	4964	4970	0 %	100 %	0 %	0 %	410023243
78	NC_018937	A	6	6	4979	4984	100 %	0 %	0 %	0 %	410023243
79	NC_018937	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023243
80	NC_018937	TCGC	2	8	5377	5384	0 %	25 %	25 %	50 %	410023244
81	NC_018937	ATTC	2	8	5406	5413	25 %	50 %	0 %	25 %	410023244
82	NC_018937	CATT	2	8	5450	5457	25 %	50 %	0 %	25 %	410023244
83	NC_018937	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023244
84	NC_018937	C	6	6	5535	5540	0 %	0 %	0 %	100 %	410023244
85	NC_018937	TGG	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023244
86	NC_018937	A	7	7	5682	5688	100 %	0 %	0 %	0 %	410023244
87	NC_018937	ATA	2	6	5691	5696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023244
88	NC_018937	TCT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023244
89	NC_018937	T	6	6	5714	5719	0 %	100 %	0 %	0 %	410023244
90	NC_018937	A	6	6	5724	5729	100 %	0 %	0 %	0 %	410023244
91	NC_018937	GTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
92	NC_018937	TAA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023244
93	NC_018937	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023244
94	NC_018937	GTG	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023244
95	NC_018937	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
96	NC_018937	GC	3	6	6030	6035	0 %	0 %	50 %	50 %	410023244
97	NC_018937	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023244
98	NC_018937	TTGAT	2	10	6052	6061	20 %	60 %	20 %	0 %	410023244
99	NC_018937	C	6	6	6134	6139	0 %	0 %	0 %	100 %	410023244
100	NC_018937	AGT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023244
101	NC_018937	T	6	6	6240	6245	0 %	100 %	0 %	0 %	410023244
102	NC_018937	GCTTGC	2	12	6274	6285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410023244
103	NC_018937	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023244
104	NC_018937	GTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
105	NC_018937	AC	3	6	6459	6464	50 %	0 %	0 %	50 %	410023244
106	NC_018937	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023244
107	NC_018937	TAG	8	24	6593	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023244
108	NC_018937	TTA	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023244
109	NC_018937	TGT	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
110	NC_018937	TTG	2	6	6717	6722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
111	NC_018937	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
112	NC_018937	CCG	2	6	6920	6925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023244
113	NC_018937	T	6	6	6968	6973	0 %	100 %	0 %	0 %	410023244
114	NC_018937	ATCG	2	8	7008	7015	25 %	25 %	25 %	25 %	410023244
115	NC_018937	GCT	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410023244
116	NC_018937	CGTT	2	8	7043	7050	0 %	50 %	25 %	25 %	410023244
117	NC_018937	TTGA	2	8	7056	7063	25 %	50 %	25 %	0 %	410023244
118	NC_018937	GTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
119	NC_018937	T	6	6	7116	7121	0 %	100 %	0 %	0 %	410023244
120	NC_018937	CAT	2	6	7606	7611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
121	NC_018937	TCT	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
122	NC_018937	GAAACC	2	12	7721	7732	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410023245
123	NC_018937	AAT	2	6	7771	7776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023245
124	NC_018937	CTT	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
125	NC_018937	TTCA	2	8	7849	7856	25 %	50 %	0 %	25 %	410023245
126	NC_018937	CAT	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
127	NC_018937	GC	3	6	7916	7921	0 %	0 %	50 %	50 %	410023245
128	NC_018937	ATG	2	6	7922	7927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023245
129	NC_018937	TCA	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
130	NC_018937	CG	3	6	7981	7986	0 %	0 %	50 %	50 %	410023245
131	NC_018937	CCG	2	6	8000	8005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023245
132	NC_018937	CTT	2	6	8019	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
133	NC_018937	CAT	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
134	NC_018937	T	6	6	8068	8073	0 %	100 %	0 %	0 %	410023245
135	NC_018937	AG	3	6	8128	8133	50 %	0 %	50 %	0 %	410023245
136	NC_018937	CAT	2	6	8223	8228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
137	NC_018937	GTG	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023245
138	NC_018937	TTC	2	6	8335	8340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
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