MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 30648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018937	ATG	2	6	217968	217973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023447
4002	NC_018937	AACG	2	8	218021	218028	50 %	0 %	25 %	25 %	410023447
4003	NC_018937	CTT	2	6	218297	218302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023448
4004	NC_018937	T	6	6	218322	218327	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4005	NC_018937	GCTT	2	8	218341	218348	0 %	50 %	25 %	25 %	410023448
4006	NC_018937	AACG	2	8	218438	218445	50 %	0 %	25 %	25 %	410023448
4007	NC_018937	CCT	2	6	218450	218455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410023448
4008	NC_018937	TA	5	10	218474	218483	50 %	50 %	0 %	0 %	410023448
4009	NC_018937	AGT	2	6	218639	218644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023448
4010	NC_018937	T	6	6	218655	218660	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4011	NC_018937	CAT	2	6	218723	218728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023448
4012	NC_018937	T	6	6	218763	218768	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4013	NC_018937	CTT	2	6	218792	218797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023448
4014	NC_018937	A	7	7	218812	218818	100 %	0 %	0 %	0 %	410023448
4015	NC_018937	T	6	6	218833	218838	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4016	NC_018937	CTT	2	6	218886	218891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023448
4017	NC_018937	CT	3	6	218896	218901	0 %	50 %	0 %	50 %	410023448
4018	NC_018937	T	7	7	218990	218996	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4019	NC_018937	CTCA	2	8	219097	219104	25 %	25 %	0 %	50 %	410023449
4020	NC_018937	TCA	2	6	219167	219172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023449
4021	NC_018937	TAA	2	6	219192	219197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023449
4022	NC_018937	CCA	2	6	219207	219212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023449
4023	NC_018937	A	6	6	219232	219237	100 %	0 %	0 %	0 %	410023449
4024	NC_018937	GCC	2	6	219253	219258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023449
4025	NC_018937	G	6	6	219273	219278	0 %	0 %	100 %	0 %	410023449
4026	NC_018937	TGA	2	6	219342	219347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023449
4027	NC_018937	ATTCTA	2	12	219363	219374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410023449
4028	NC_018937	CT	3	6	219422	219427	0 %	50 %	0 %	50 %	410023449
4029	NC_018937	TGG	2	6	219429	219434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023449
4030	NC_018937	GAT	2	6	219460	219465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023449
4031	NC_018937	ATT	2	6	219487	219492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023449
4032	NC_018937	TGCA	2	8	219505	219512	25 %	25 %	25 %	25 %	410023449
4033	NC_018937	TGA	2	6	219519	219524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023449
4034	NC_018937	AGCG	2	8	219595	219602	25 %	0 %	50 %	25 %	410023449
4035	NC_018937	GCA	2	6	219756	219761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023449
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4037	NC_018937	A	6	6	219848	219853	100 %	0 %	0 %	0 %	410023449
4038	NC_018937	CCT	2	6	219902	219907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410023449
4039	NC_018937	TAA	2	6	219948	219953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023449
4040	NC_018937	AGG	2	6	219988	219993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410023449
4041	NC_018937	GCAAA	2	10	220013	220022	60 %	0 %	20 %	20 %	410023449
4042	NC_018937	TCT	2	6	220058	220063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023449
4043	NC_018937	G	7	7	220075	220081	0 %	0 %	100 %	0 %	410023449
4044	NC_018937	A	7	7	220097	220103	100 %	0 %	0 %	0 %	410023449
4045	NC_018937	TGG	2	6	220197	220202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023449
4046	NC_018937	TGA	2	6	220209	220214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023449
4047	NC_018937	ATATT	2	10	220481	220490	40 %	60 %	0 %	0 %	410023450
4048	NC_018937	T	6	6	220560	220565	0 %	100 %	0 %	0 %	410023450
4049	NC_018937	CG	3	6	220581	220586	0 %	0 %	50 %	50 %	410023450
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4051	NC_018937	T	7	7	220723	220729	0 %	100 %	0 %	0 %	410023450
4052	NC_018937	TCT	2	6	220802	220807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023450
4053	NC_018937	AAGC	2	8	220813	220820	50 %	0 %	25 %	25 %	410023450
4054	NC_018937	TCGGC	2	10	220826	220835	0 %	20 %	40 %	40 %	410023450
4055	NC_018937	ATC	2	6	220879	220884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023450
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4057	NC_018937	CTT	2	6	220989	220994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023450
4058	NC_018937	T	7	7	221043	221049	0 %	100 %	0 %	0 %	410023450
4059	NC_018937	CATAGC	2	12	221103	221114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410023450
4060	NC_018937	TGA	2	6	221118	221123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023450
4061	NC_018937	ATA	2	6	221203	221208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023450
4062	NC_018937	ATGG	2	8	221218	221225	25 %	25 %	50 %	0 %	410023450
4063	NC_018937	TGG	2	6	221246	221251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023450
4064	NC_018937	G	6	6	221337	221342	0 %	0 %	100 %	0 %	410023450
4065	NC_018937	TGG	2	6	221369	221374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023450
4066	NC_018937	TGGG	2	8	221411	221418	0 %	25 %	75 %	0 %	410023450
4067	NC_018937	AGGG	2	8	221448	221455	25 %	0 %	75 %	0 %	410023450
4068	NC_018937	GTTTTG	2	12	221608	221619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023450
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4071	NC_018937	TGA	2	6	221664	221669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023450
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4073	NC_018937	GTT	2	6	221692	221697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023450
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4075	NC_018937	CCG	2	6	221850	221855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023450
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4081	NC_018937	ACCA	2	8	222085	222092	50 %	0 %	0 %	50 %	410023450
4082	NC_018937	CTTT	2	8	222104	222111	0 %	75 %	0 %	25 %	410023450
4083	NC_018937	GAT	2	6	222258	222263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023451
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4096	NC_018937	TGA	2	6	222736	222741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023451
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4104	NC_018937	ATT	2	6	223239	223244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023451
4105	NC_018937	T	7	7	223270	223276	0 %	100 %	0 %	0 %	410023451
4106	NC_018937	AGAT	2	8	223306	223313	50 %	25 %	25 %	0 %	410023451
4107	NC_018937	GGC	2	6	223443	223448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023452
4108	NC_018937	GC	3	6	223462	223467	0 %	0 %	50 %	50 %	410023452
4109	NC_018937	TCA	2	6	223540	223545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023452
4110	NC_018937	CCACC	2	10	223729	223738	20 %	0 %	0 %	80 %	410023452
4111	NC_018937	GTT	2	6	223818	223823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023452
4112	NC_018937	T	6	6	223844	223849	0 %	100 %	0 %	0 %	410023452
4113	NC_018937	A	6	6	223878	223883	100 %	0 %	0 %	0 %	410023452
4114	NC_018937	AGA	2	6	223889	223894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023453
4115	NC_018937	TTACA	2	10	223916	223925	40 %	40 %	0 %	20 %	410023453
4116	NC_018937	GTTT	2	8	223928	223935	0 %	75 %	25 %	0 %	410023453
4117	NC_018937	TGT	3	9	223975	223983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023453
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4119	NC_018937	ATT	2	6	224036	224041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023453
4120	NC_018937	GGC	2	6	224093	224098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023453
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4123	NC_018937	GTG	2	6	224286	224291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023453
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4499	NC_018937	GCT	2	6	243264	243269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410023471
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