MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017944	T	6	6	8336	8341	0 %	100 %	0 %	0 %	389848887
2	NC_017944	G	6	6	12903	12908	0 %	0 %	100 %	0 %	389848892
3	NC_017944	G	6	6	18581	18586	0 %	0 %	100 %	0 %	389848897
4	NC_017944	G	6	6	31800	31805	0 %	0 %	100 %	0 %	389848908
5	NC_017944	C	6	6	41581	41586	0 %	0 %	0 %	100 %	389848915
6	NC_017944	A	7	7	48254	48260	100 %	0 %	0 %	0 %	389848919
7	NC_017944	G	6	6	49952	49957	0 %	0 %	100 %	0 %	389848920
8	NC_017944	A	7	7	60019	60025	100 %	0 %	0 %	0 %	389848930
9	NC_017944	C	6	6	60501	60506	0 %	0 %	0 %	100 %	389848930
10	NC_017944	C	6	6	64396	64401	0 %	0 %	0 %	100 %	389848934
11	NC_017944	C	8	8	87185	87192	0 %	0 %	0 %	100 %	389848948
12	NC_017944	G	7	7	89004	89010	0 %	0 %	100 %	0 %	389848952
13	NC_017944	T	6	6	89046	89051	0 %	100 %	0 %	0 %	389848952
14	NC_017944	C	6	6	90470	90475	0 %	0 %	0 %	100 %	389848954
15	NC_017944	C	6	6	96333	96338	0 %	0 %	0 %	100 %	389848959
16	NC_017944	T	6	6	101549	101554	0 %	100 %	0 %	0 %	389848963
17	NC_017944	G	6	6	112248	112253	0 %	0 %	100 %	0 %	389848977
18	NC_017944	A	7	7	116963	116969	100 %	0 %	0 %	0 %	389848983
19	NC_017944	C	6	6	119273	119278	0 %	0 %	0 %	100 %	389848984
20	NC_017944	T	6	6	120348	120353	0 %	100 %	0 %	0 %	389848985
21	NC_017944	C	6	6	120975	120980	0 %	0 %	0 %	100 %	389848986
22	NC_017944	T	7	7	122819	122825	0 %	100 %	0 %	0 %	389848990
23	NC_017944	C	6	6	124214	124219	0 %	0 %	0 %	100 %	389848992
24	NC_017944	G	6	6	124510	124515	0 %	0 %	100 %	0 %	389848992
25	NC_017944	C	6	6	125130	125135	0 %	0 %	0 %	100 %	389848993
26	NC_017944	A	7	7	125976	125982	100 %	0 %	0 %	0 %	389848994
27	NC_017944	A	6	6	128442	128447	100 %	0 %	0 %	0 %	389848996
28	NC_017944	A	8	8	130686	130693	100 %	0 %	0 %	0 %	389848998
29	NC_017944	G	6	6	132264	132269	0 %	0 %	100 %	0 %	389848999
30	NC_017944	G	6	6	140181	140186	0 %	0 %	100 %	0 %	389849004
31	NC_017944	C	6	6	141679	141684	0 %	0 %	0 %	100 %	389849004
32	NC_017944	T	7	7	151224	151230	0 %	100 %	0 %	0 %	389849011
33	NC_017944	G	6	6	153284	153289	0 %	0 %	100 %	0 %	389849012
34	NC_017944	C	6	6	160175	160180	0 %	0 %	0 %	100 %	389849018
35	NC_017944	C	6	6	163383	163388	0 %	0 %	0 %	100 %	389849019
36	NC_017944	T	6	6	170733	170738	0 %	100 %	0 %	0 %	389849026
37	NC_017944	A	6	6	172688	172693	100 %	0 %	0 %	0 %	389849028
38	NC_017944	T	6	6	205573	205578	0 %	100 %	0 %	0 %	389849056
39	NC_017944	T	6	6	205584	205589	0 %	100 %	0 %	0 %	389849056
40	NC_017944	C	6	6	210773	210778	0 %	0 %	0 %	100 %	389849061
41	NC_017944	T	6	6	214058	214063	0 %	100 %	0 %	0 %	389849065
42	NC_017944	C	6	6	220492	220497	0 %	0 %	0 %	100 %	389849072
43	NC_017944	C	6	6	221287	221292	0 %	0 %	0 %	100 %	389849072
44	NC_017944	A	6	6	238032	238037	100 %	0 %	0 %	0 %	389849089
45	NC_017944	G	6	6	258457	258462	0 %	0 %	100 %	0 %	389849104
46	NC_017944	A	6	6	260036	260041	100 %	0 %	0 %	0 %	389849106
47	NC_017944	T	6	6	274446	274451	0 %	100 %	0 %	0 %	389849124
48	NC_017944	C	6	6	285169	285174	0 %	0 %	0 %	100 %	389849138
49	NC_017944	C	6	6	289589	289594	0 %	0 %	0 %	100 %	389849141
50	NC_017944	C	6	6	295899	295904	0 %	0 %	0 %	100 %	389849147
51	NC_017944	G	6	6	316375	316380	0 %	0 %	100 %	0 %	389849167
52	NC_017944	A	6	6	337908	337913	100 %	0 %	0 %	0 %	389849188
53	NC_017944	T	6	6	340218	340223	0 %	100 %	0 %	0 %	389849191
54	NC_017944	T	6	6	348792	348797	0 %	100 %	0 %	0 %	389849199
55	NC_017944	C	6	6	355674	355679	0 %	0 %	0 %	100 %	389849205
56	NC_017944	C	6	6	356135	356140	0 %	0 %	0 %	100 %	389849205
57	NC_017944	G	6	6	369204	369209	0 %	0 %	100 %	0 %	389849217
58	NC_017944	C	6	6	384846	384851	0 %	0 %	0 %	100 %	389849235
59	NC_017944	A	6	6	393424	393429	100 %	0 %	0 %	0 %	389849246
60	NC_017944	G	6	6	396464	396469	0 %	0 %	100 %	0 %	389849251
61	NC_017944	T	6	6	399882	399887	0 %	100 %	0 %	0 %	389849254
62	NC_017944	A	6	6	409517	409522	100 %	0 %	0 %	0 %	389849269
63	NC_017944	G	7	7	441986	441992	0 %	0 %	100 %	0 %	389849308
64	NC_017944	G	6	6	452725	452730	0 %	0 %	100 %	0 %	389849314
65	NC_017944	G	6	6	457539	457544	0 %	0 %	100 %	0 %	389849319
66	NC_017944	C	7	7	458224	458230	0 %	0 %	0 %	100 %	389849319
67	NC_017944	T	6	6	464233	464238	0 %	100 %	0 %	0 %	389849323
68	NC_017944	G	6	6	471965	471970	0 %	0 %	100 %	0 %	389849329
69	NC_017944	G	6	6	472920	472925	0 %	0 %	100 %	0 %	389849330
70	NC_017944	G	6	6	473234	473239	0 %	0 %	100 %	0 %	389849331
71	NC_017944	G	6	6	474936	474941	0 %	0 %	100 %	0 %	389849332
72	NC_017944	G	6	6	492233	492238	0 %	0 %	100 %	0 %	389849346
73	NC_017944	C	6	6	494185	494190	0 %	0 %	0 %	100 %	389849348
74	NC_017944	A	6	6	496122	496127	100 %	0 %	0 %	0 %	389849349
75	NC_017944	G	6	6	500285	500290	0 %	0 %	100 %	0 %	389849354
76	NC_017944	G	6	6	500687	500692	0 %	0 %	100 %	0 %	389849355

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.