MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 9598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017944	GTTC	3	12	165367	165378	0 %	50 %	25 %	25 %	389849022
3003	NC_017944	ACCC	2	8	165398	165405	25 %	0 %	0 %	75 %	389849022
3004	NC_017944	TTC	2	6	165436	165441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849022
3005	NC_017944	CTG	2	6	165466	165471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849022
3006	NC_017944	GTCG	2	8	165480	165487	0 %	25 %	50 %	25 %	389849022
3007	NC_017944	GACG	2	8	165503	165510	25 %	0 %	50 %	25 %	389849022
3008	NC_017944	GGA	2	6	165517	165522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849022
3009	NC_017944	CAC	2	6	165577	165582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849022
3010	NC_017944	ACG	2	6	165624	165629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849022
3011	NC_017944	CGA	2	6	165655	165660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849022
3012	NC_017944	GAA	2	6	165664	165669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849022
3013	NC_017944	CGT	3	9	165730	165738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849022
3014	NC_017944	GTCTC	2	10	165762	165771	0 %	40 %	20 %	40 %	389849022
3015	NC_017944	CCGT	2	8	165794	165801	0 %	25 %	25 %	50 %	389849022
3016	NC_017944	CGA	2	6	165810	165815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849022
3017	NC_017944	ACT	2	6	165817	165822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849022
3018	NC_017944	CCGTCG	2	12	165854	165865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	389849022
3019	NC_017944	GGC	2	6	165887	165892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849022
3020	NC_017944	CGT	3	9	165927	165935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849022
3021	NC_017944	GTCA	2	8	165982	165989	25 %	25 %	25 %	25 %	389849022
3022	NC_017944	TTA	2	6	166035	166040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849022
3023	NC_017944	CGA	2	6	166090	166095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849022
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3025	NC_017944	CCG	2	6	166200	166205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849022
3026	NC_017944	GAC	2	6	166222	166227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849022
3027	NC_017944	TGT	2	6	166233	166238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849022
3028	NC_017944	CGAA	2	8	166248	166255	50 %	0 %	25 %	25 %	389849022
3029	NC_017944	GA	3	6	166256	166261	50 %	0 %	50 %	0 %	389849022
3030	NC_017944	CGGTT	2	10	166281	166290	0 %	40 %	40 %	20 %	389849022
3031	NC_017944	GGC	2	6	166318	166323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849022
3032	NC_017944	CAC	2	6	166390	166395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849022
3033	NC_017944	CGA	2	6	166476	166481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849022
3034	NC_017944	GGT	2	6	166495	166500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849022
3035	NC_017944	AGA	2	6	166562	166567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849022
3036	NC_017944	CAT	2	6	166585	166590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849022
3037	NC_017944	GTC	2	6	166917	166922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849023
3038	NC_017944	GTC	2	6	166935	166940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849023
3039	NC_017944	CCG	2	6	167041	167046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849023
3040	NC_017944	AAG	2	6	167049	167054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849023
3041	NC_017944	ACGG	2	8	167093	167100	25 %	0 %	50 %	25 %	389849023
3042	NC_017944	GTG	2	6	167104	167109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849023
3043	NC_017944	TCG	3	9	167116	167124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849023
3044	NC_017944	TGA	2	6	167153	167158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849023
3045	NC_017944	TTC	2	6	167176	167181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849023
3046	NC_017944	CGCTGG	2	12	167269	167280	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	389849023
3047	NC_017944	CGT	2	6	167301	167306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849023
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3049	NC_017944	TTG	2	6	167466	167471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849023
3050	NC_017944	ACC	2	6	167791	167796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849024
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3052	NC_017944	CGA	2	6	167879	167884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849024
3053	NC_017944	CTCA	2	8	167928	167935	25 %	25 %	0 %	50 %	389849024
3054	NC_017944	CGA	2	6	167969	167974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849024
3055	NC_017944	TGACGG	2	12	167983	167994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389849024
3056	NC_017944	CGA	2	6	168027	168032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849024
3057	NC_017944	TCG	2	6	168131	168136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849024
3058	NC_017944	ATC	2	6	168265	168270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849024
3059	NC_017944	ATG	2	6	168277	168282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849024
3060	NC_017944	GTC	2	6	168288	168293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849024
3061	NC_017944	CGG	2	6	168309	168314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849024
3062	NC_017944	GGA	2	6	168368	168373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849024
3063	NC_017944	GTC	2	6	168468	168473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849024
3064	NC_017944	CGA	2	6	168488	168493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849024
3065	NC_017944	CCG	2	6	168572	168577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849024
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3067	NC_017944	CGA	2	6	168665	168670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849024
3068	NC_017944	TCG	2	6	168688	168693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849024
3069	NC_017944	GCGG	2	8	168797	168804	0 %	0 %	75 %	25 %	389849025
3070	NC_017944	CGT	3	9	168933	168941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849025
3071	NC_017944	GGTT	2	8	168947	168954	0 %	50 %	50 %	0 %	389849025
3072	NC_017944	ATA	2	6	168970	168975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389849025
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3079	NC_017944	GACC	2	8	169178	169185	25 %	0 %	25 %	50 %	389849025
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3095	NC_017944	CGAC	2	8	169830	169837	25 %	0 %	25 %	50 %	389849025
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3099	NC_017944	ACTG	2	8	170316	170323	25 %	25 %	25 %	25 %	389849026
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3101	NC_017944	GATGG	2	10	170356	170365	20 %	20 %	60 %	0 %	389849026
3102	NC_017944	CGA	2	6	170373	170378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849026
3103	NC_017944	TCGAC	2	10	170420	170429	20 %	20 %	20 %	40 %	389849026
3104	NC_017944	GA	3	6	170450	170455	50 %	0 %	50 %	0 %	389849026
3105	NC_017944	CGA	2	6	170508	170513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849026
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3120	NC_017944	GAG	2	6	172264	172269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849028
3121	NC_017944	TGA	2	6	172322	172327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849028
3122	NC_017944	GA	3	6	172326	172331	50 %	0 %	50 %	0 %	389849028
3123	NC_017944	GTA	2	6	172381	172386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849028
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3129	NC_017944	GTC	2	6	172609	172614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849028
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3241	NC_017944	GCG	2	6	178646	178651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849034
3242	NC_017944	CG	3	6	178683	178688	0 %	0 %	50 %	50 %	389849034
3243	NC_017944	CGA	2	6	178793	178798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849034
3244	NC_017944	ATC	2	6	178900	178905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849034
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3269	NC_017944	GAC	2	6	180705	180710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849035
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3273	NC_017944	CGA	2	6	180794	180799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849035
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3480	NC_017944	CGA	2	6	193238	193243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849045
3481	NC_017944	GAA	2	6	193275	193280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849045
3482	NC_017944	CG	3	6	193292	193297	0 %	0 %	50 %	50 %	389849045
3483	NC_017944	CGC	2	6	193311	193316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849045
3484	NC_017944	GAG	2	6	193342	193347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849045
3485	NC_017944	CCGA	2	8	193348	193355	25 %	0 %	25 %	50 %	389849045
3486	NC_017944	CGC	2	6	193356	193361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849045
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3494	NC_017944	ATCG	2	8	194415	194422	25 %	25 %	25 %	25 %	389849046
3495	NC_017944	CTC	2	6	194430	194435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389849046
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