MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 9598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017944	CGT	2	6	86294	86299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848947
1502	NC_017944	CGG	2	6	86303	86308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848947
1503	NC_017944	CTC	2	6	86376	86381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848947
1504	NC_017944	CGA	2	6	86393	86398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848947
1505	NC_017944	TCG	2	6	86449	86454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848947
1506	NC_017944	CGA	2	6	86456	86461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848947
1507	NC_017944	TAC	3	9	86538	86546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848947
1508	NC_017944	ACC	2	6	86607	86612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848947
1509	NC_017944	ACG	2	6	86689	86694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848947
1510	NC_017944	ACT	2	6	86699	86704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848947
1511	NC_017944	CGA	2	6	86792	86797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848947
1512	NC_017944	CT	3	6	86837	86842	0 %	50 %	0 %	50 %	389848947
1513	NC_017944	TCG	2	6	86893	86898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848947
1514	NC_017944	CAC	2	6	86973	86978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848947
1515	NC_017944	TCG	2	6	87019	87024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848947
1516	NC_017944	AACG	2	8	87030	87037	50 %	0 %	25 %	25 %	389848947
1517	NC_017944	ACAG	2	8	87061	87068	50 %	0 %	25 %	25 %	389848947
1518	NC_017944	TGT	2	6	87121	87126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848948
1519	NC_017944	CGA	2	6	87177	87182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848948
1520	NC_017944	C	8	8	87185	87192	0 %	0 %	0 %	100 %	389848948
1521	NC_017944	AGA	2	6	87534	87539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848949
1522	NC_017944	GGA	2	6	87543	87548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848949
1523	NC_017944	CTA	2	6	87549	87554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848949
1524	NC_017944	CAC	2	6	87568	87573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848949
1525	NC_017944	TCG	2	6	87602	87607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848949
1526	NC_017944	TCG	2	6	87617	87622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848949
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1532	NC_017944	TCA	2	6	88203	88208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848951
1533	NC_017944	TTA	2	6	88235	88240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389848951
1534	NC_017944	TCG	2	6	88259	88264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848951
1535	NC_017944	TTC	2	6	88271	88276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848951
1536	NC_017944	CGA	2	6	88289	88294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848951
1537	NC_017944	AAT	2	6	88466	88471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389848951
1538	NC_017944	GTC	2	6	88848	88853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848952
1539	NC_017944	GCTC	2	8	88858	88865	0 %	25 %	25 %	50 %	389848952
1540	NC_017944	GGT	2	6	88993	88998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848952
1541	NC_017944	G	7	7	89004	89010	0 %	0 %	100 %	0 %	389848952
1542	NC_017944	TCT	2	6	89021	89026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848952
1543	NC_017944	T	6	6	89046	89051	0 %	100 %	0 %	0 %	389848952
1544	NC_017944	TGG	2	6	89063	89068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848952
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1546	NC_017944	GTCG	2	8	89136	89143	0 %	25 %	50 %	25 %	389848952
1547	NC_017944	GA	3	6	89156	89161	50 %	0 %	50 %	0 %	389848952
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1550	NC_017944	TC	3	6	89235	89240	0 %	50 %	0 %	50 %	389848952
1551	NC_017944	TCT	2	6	89278	89283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848952
1552	NC_017944	CTT	2	6	89327	89332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848952
1553	NC_017944	TCT	2	6	89339	89344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848952
1554	NC_017944	CCCT	2	8	89345	89352	0 %	25 %	0 %	75 %	389848952
1555	NC_017944	TCT	2	6	89369	89374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848952
1556	NC_017944	GTC	2	6	89401	89406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848952
1557	NC_017944	CTT	2	6	89417	89422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848952
1558	NC_017944	GTG	2	6	89507	89512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848953
1559	NC_017944	TGT	2	6	89538	89543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848953
1560	NC_017944	ACG	2	6	89612	89617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848953
1561	NC_017944	ACGTG	2	10	89622	89631	20 %	20 %	40 %	20 %	389848953
1562	NC_017944	CGA	2	6	89663	89668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848953
1563	NC_017944	CTG	2	6	89669	89674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848953
1564	NC_017944	CGA	2	6	89820	89825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848954
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1566	NC_017944	TCCA	2	8	89894	89901	25 %	25 %	0 %	50 %	389848954
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1569	NC_017944	CTG	2	6	90123	90128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848954
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1572	NC_017944	CGA	3	9	90227	90235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848954
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1589	NC_017944	GCC	2	6	90981	90986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848954
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1591	NC_017944	GCGG	2	8	91072	91079	0 %	0 %	75 %	25 %	389848954
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1594	NC_017944	TCG	3	9	91354	91362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848954
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1596	NC_017944	TAG	2	6	91843	91848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848955
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1599	NC_017944	GCTC	2	8	91978	91985	0 %	25 %	25 %	50 %	389848955
1600	NC_017944	ACGTC	2	10	91994	92003	20 %	20 %	20 %	40 %	389848955
1601	NC_017944	CGT	2	6	92027	92032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848955
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1605	NC_017944	AG	3	6	92151	92156	50 %	0 %	50 %	0 %	389848955
1606	NC_017944	CGA	2	6	92171	92176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848955
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1608	NC_017944	TCGG	2	8	92265	92272	0 %	25 %	50 %	25 %	389848955
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1611	NC_017944	CACGGG	2	12	92528	92539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389848955
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1613	NC_017944	GACC	2	8	92694	92701	25 %	0 %	25 %	50 %	389848955
1614	NC_017944	ATC	2	6	92728	92733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848955
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1622	NC_017944	GAA	2	6	92945	92950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848956
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1989	NC_017944	GGA	2	6	114679	114684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848981
1990	NC_017944	GTT	2	6	114686	114691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848981
1991	NC_017944	GAA	2	6	114695	114700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848981
1992	NC_017944	AGA	2	6	114814	114819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848981
1993	NC_017944	CGG	2	6	114866	114871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848981
1994	NC_017944	TCG	2	6	114916	114921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848981
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1997	NC_017944	TCG	2	6	115098	115103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848981
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2000	NC_017944	CGT	2	6	115219	115224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848981

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