MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 9598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017944	ACG	3	9	267567	267575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849115
5003	NC_017944	ACC	2	6	267627	267632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849115
5004	NC_017944	GAA	2	6	267646	267651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849115
5005	NC_017944	ACG	2	6	267657	267662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849115
5006	NC_017944	CA	3	6	268559	268564	50 %	0 %	0 %	50 %	389849116
5007	NC_017944	CAG	2	6	268587	268592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849116
5008	NC_017944	GGC	2	6	268641	268646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849116
5009	NC_017944	GAC	2	6	268655	268660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849116
5010	NC_017944	ACG	2	6	268702	268707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849117
5011	NC_017944	TCG	2	6	268714	268719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849117
5012	NC_017944	CGG	2	6	268777	268782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849117
5013	NC_017944	TGAC	2	8	268804	268811	25 %	25 %	25 %	25 %	389849117
5014	NC_017944	GAC	3	9	268809	268817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849117
5015	NC_017944	TGC	2	6	268864	268869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849117
5016	NC_017944	CGA	2	6	268886	268891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849117
5017	NC_017944	CCG	3	9	268937	268945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849117
5018	NC_017944	TCG	2	6	268948	268953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849117
5019	NC_017944	GCT	2	6	268958	268963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849117
5020	NC_017944	GCA	2	6	269025	269030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849117
5021	NC_017944	CGT	2	6	269048	269053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849117
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5023	NC_017944	TCG	2	6	269126	269131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849117
5024	NC_017944	AAC	2	6	269181	269186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849117
5025	NC_017944	CGA	2	6	269193	269198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849117
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5027	NC_017944	CGA	2	6	269267	269272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849117
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5029	NC_017944	CGA	2	6	269384	269389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849117
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5031	NC_017944	GGCGA	2	10	269455	269464	20 %	0 %	60 %	20 %	389849118
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5035	NC_017944	CGA	2	6	269667	269672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849118
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5041	NC_017944	AGTCG	2	10	269949	269958	20 %	20 %	40 %	20 %	389849119
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5044	NC_017944	CGA	2	6	270042	270047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849119
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5054	NC_017944	GTC	2	6	271865	271870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849123
5055	NC_017944	CGA	2	6	271924	271929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849123
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5060	NC_017944	AGTAC	2	10	272191	272200	40 %	20 %	20 %	20 %	389849123
5061	NC_017944	CCT	2	6	272233	272238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389849123
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5064	NC_017944	GTC	3	9	272303	272311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849123
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5070	NC_017944	GTC	2	6	272537	272542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849123
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5089	NC_017944	ACGT	2	8	274165	274172	25 %	25 %	25 %	25 %	389849124
5090	NC_017944	CGG	3	9	274187	274195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849124
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5099	NC_017944	GCC	2	6	274476	274481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849124
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5104	NC_017944	CGA	2	6	274913	274918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849125
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5114	NC_017944	GTC	4	12	275293	275304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849126
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5117	NC_017944	CGTT	2	8	275898	275905	0 %	50 %	25 %	25 %	389849127
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5119	NC_017944	AACGT	2	10	275993	276002	40 %	20 %	20 %	20 %	389849127
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5123	NC_017944	CGT	2	6	276470	276475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849127
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5231	NC_017944	CGT	4	12	282651	282662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849135
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5234	NC_017944	GCC	2	6	282835	282840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849135
5235	NC_017944	GTA	2	6	282847	282852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849135
5236	NC_017944	GA	3	6	282916	282921	50 %	0 %	50 %	0 %	389849135
5237	NC_017944	GCC	2	6	283022	283027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849135
5238	NC_017944	GAC	2	6	283039	283044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849135
5239	NC_017944	GAG	3	9	283051	283059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849135
5240	NC_017944	CGC	2	6	283063	283068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849135
5241	NC_017944	GTC	2	6	283145	283150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849136
5242	NC_017944	GCT	2	6	283186	283191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849136
5243	NC_017944	CCG	2	6	283201	283206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849136
5244	NC_017944	CGC	2	6	283246	283251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849136
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5250	NC_017944	GAC	2	6	283571	283576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849136
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5252	NC_017944	GAC	2	6	283756	283761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849138
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5255	NC_017944	TCG	2	6	283842	283847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849138
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5259	NC_017944	GTC	2	6	283987	283992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849138
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5279	NC_017944	GAC	2	6	284722	284727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849138
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5282	NC_017944	TCCTGT	2	12	284897	284908	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	389849138
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5310	NC_017944	CTG	2	6	285891	285896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849139
5311	NC_017944	CTG	2	6	285918	285923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849139
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5322	NC_017944	CGT	2	6	286265	286270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849140
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5346	NC_017944	GAGC	2	8	287331	287338	25 %	0 %	50 %	25 %	389849140
5347	NC_017944	GGT	2	6	287339	287344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849140
5348	NC_017944	TGA	2	6	287399	287404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849140
5349	NC_017944	GCGTC	2	10	287513	287522	0 %	20 %	40 %	40 %	389849140
5350	NC_017944	CGT	2	6	287533	287538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849140
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5353	NC_017944	TGA	2	6	287618	287623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849140
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5355	NC_017944	GAG	2	6	287883	287888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849140
5356	NC_017944	CGT	2	6	287998	288003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849140
5357	NC_017944	CGT	3	9	288029	288037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849140
5358	NC_017944	TTC	2	6	288064	288069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849140
5359	NC_017944	GTA	2	6	288123	288128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849140
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5462	NC_017944	CGGA	2	8	292547	292554	25 %	0 %	50 %	25 %	389849143
5463	NC_017944	TACGTC	2	12	292561	292572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389849143
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5474	NC_017944	CGG	2	6	293290	293295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849144
5475	NC_017944	CGA	2	6	293311	293316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849144
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5477	NC_017944	CGAA	2	8	293443	293450	50 %	0 %	25 %	25 %	389849145
5478	NC_017944	CT	3	6	293461	293466	0 %	50 %	0 %	50 %	389849145
5479	NC_017944	CTTCC	2	10	293488	293497	0 %	40 %	0 %	60 %	389849145
5480	NC_017944	CAC	2	6	293502	293507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849145
5481	NC_017944	TCG	2	6	293683	293688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849145
5482	NC_017944	GAC	2	6	293706	293711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849145
5483	NC_017944	AACC	2	8	293730	293737	50 %	0 %	0 %	50 %	389849145
5484	NC_017944	CGT	2	6	293780	293785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849145
5485	NC_017944	CGA	2	6	293786	293791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849145
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5487	NC_017944	ACA	2	6	293829	293834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849145
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5489	NC_017944	CTC	2	6	293889	293894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389849145
5490	NC_017944	CGAC	2	8	294056	294063	25 %	0 %	25 %	50 %	389849146
5491	NC_017944	CCCG	2	8	294099	294106	0 %	0 %	25 %	75 %	389849146
5492	NC_017944	TTC	2	6	294168	294173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849146
5493	NC_017944	CGT	2	6	294218	294223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849146
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5497	NC_017944	TGC	2	6	294357	294362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849146
5498	NC_017944	CGA	2	6	294434	294439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849146
5499	NC_017944	GGC	2	6	294456	294461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849146
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