MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 6387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017943	TTG	2	6	196678	196683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848763
4002	NC_017943	CT	3	6	196728	196733	0 %	50 %	0 %	50 %	389848763
4003	NC_017943	CAAG	2	8	196757	196764	50 %	0 %	25 %	25 %	389848763
4004	NC_017943	GCT	2	6	196815	196820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848763
4005	NC_017943	CAC	2	6	196857	196862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848763
4006	NC_017943	CTC	2	6	196875	196880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848763
4007	NC_017943	TCG	2	6	196912	196917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848763
4008	NC_017943	GTG	2	6	196932	196937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848763
4009	NC_017943	CT	3	6	196944	196949	0 %	50 %	0 %	50 %	389848763
4010	NC_017943	AAT	2	6	196980	196985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389848763
4011	NC_017943	CGT	2	6	197105	197110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848763
4012	NC_017943	GTA	2	6	197218	197223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848763
4013	NC_017943	TCG	2	6	197257	197262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848763
4014	NC_017943	CGAG	2	8	197324	197331	25 %	0 %	50 %	25 %	389848763
4015	NC_017943	ATC	2	6	197388	197393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848763
4016	NC_017943	GA	3	6	197395	197400	50 %	0 %	50 %	0 %	389848763
4017	NC_017943	GAG	2	6	197433	197438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848763
4018	NC_017943	GTG	2	6	197473	197478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848763
4019	NC_017943	GAAG	2	8	197550	197557	50 %	0 %	50 %	0 %	389848763
4020	NC_017943	CGA	2	6	197588	197593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848763
4021	NC_017943	ACGGTG	2	12	197631	197642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389848763
4022	NC_017943	TCA	2	6	197716	197721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848763
4023	NC_017943	CAG	2	6	197778	197783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848763
4024	NC_017943	CGA	2	6	197792	197797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848763
4025	NC_017943	TGG	2	6	197905	197910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848763
4026	NC_017943	AAAT	2	8	197996	198003	75 %	25 %	0 %	0 %	389848763
4027	NC_017943	ACC	2	6	198024	198029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848763
4028	NC_017943	TC	3	6	198047	198052	0 %	50 %	0 %	50 %	389848763
4029	NC_017943	CA	3	6	198086	198091	50 %	0 %	0 %	50 %	389848763
4030	NC_017943	TCA	2	6	198160	198165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848763
4031	NC_017943	TCG	2	6	198256	198261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848763
4032	NC_017943	TC	3	6	198351	198356	0 %	50 %	0 %	50 %	389848763
4033	NC_017943	GAA	2	6	198357	198362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848763
4034	NC_017943	TTC	2	6	198414	198419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848763
4035	NC_017943	GAA	2	6	198420	198425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848763
4036	NC_017943	TAC	2	6	198434	198439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848763
4037	NC_017943	AGG	2	6	198445	198450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848763
4038	NC_017943	ACC	3	9	198487	198495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848763
4039	NC_017943	G	6	6	198499	198504	0 %	0 %	100 %	0 %	389848763
4040	NC_017943	TCG	2	6	198584	198589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848764
4041	NC_017943	GCG	2	6	198659	198664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848764
4042	NC_017943	ATG	2	6	198719	198724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848764
4043	NC_017943	TGA	2	6	199047	199052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848765
4044	NC_017943	TC	3	6	199080	199085	0 %	50 %	0 %	50 %	389848765
4045	NC_017943	CGG	2	6	199161	199166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848765
4046	NC_017943	TG	3	6	199391	199396	0 %	50 %	50 %	0 %	389848765
4047	NC_017943	GC	3	6	199443	199448	0 %	0 %	50 %	50 %	389848765
4048	NC_017943	GAC	2	6	199541	199546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848765
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4050	NC_017943	GCT	2	6	199598	199603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848765
4051	NC_017943	CAA	2	6	199606	199611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848765
4052	NC_017943	CGT	2	6	199621	199626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848765
4053	NC_017943	ACG	2	6	199737	199742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848765
4054	NC_017943	TCG	2	6	199827	199832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848765
4055	NC_017943	ACG	2	6	199887	199892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848765
4056	NC_017943	CGA	3	9	199921	199929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848765
4057	NC_017943	ATC	2	6	200000	200005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848765
4058	NC_017943	G	6	6	200009	200014	0 %	0 %	100 %	0 %	389848765
4059	NC_017943	GC	3	6	200105	200110	0 %	0 %	50 %	50 %	389848765
4060	NC_017943	GCT	2	6	200170	200175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848765
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4062	NC_017943	TGG	2	6	200218	200223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848765
4063	NC_017943	GAC	2	6	200245	200250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848765
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4065	NC_017943	TCG	2	6	200318	200323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848765
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4068	NC_017943	GTC	2	6	200398	200403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848765
4069	NC_017943	GGCA	2	8	200404	200411	25 %	0 %	50 %	25 %	389848765
4070	NC_017943	GAA	2	6	200429	200434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848765
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4081	NC_017943	CGA	2	6	200784	200789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848765
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4086	NC_017943	GACC	2	8	201178	201185	25 %	0 %	25 %	50 %	389848766
4087	NC_017943	CGGAC	2	10	201246	201255	20 %	0 %	40 %	40 %	389848766
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4092	NC_017943	ACG	2	6	201422	201427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848766
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4094	NC_017943	AC	3	6	201668	201673	50 %	0 %	0 %	50 %	389848767
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4102	NC_017943	GGT	2	6	202138	202143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848767
4103	NC_017943	TCG	2	6	202155	202160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848767
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4105	NC_017943	CGG	2	6	202224	202229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848767
4106	NC_017943	GC	3	6	202239	202244	0 %	0 %	50 %	50 %	389848767
4107	NC_017943	TCG	2	6	202245	202250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848767
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4109	NC_017943	TCA	2	6	202287	202292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848767
4110	NC_017943	GC	3	6	202312	202317	0 %	0 %	50 %	50 %	389848767
4111	NC_017943	TCG	2	6	202377	202382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848767
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4117	NC_017943	CTGGG	2	10	202604	202613	0 %	20 %	60 %	20 %	389848767
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4481	NC_017943	CG	3	6	221220	221225	0 %	0 %	50 %	50 %	389848782
4482	NC_017943	CCG	2	6	221310	221315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848782
4483	NC_017943	CACAT	2	10	221390	221399	40 %	20 %	0 %	40 %	389848782
4484	NC_017943	GCC	2	6	221485	221490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848783
4485	NC_017943	GAG	2	6	221491	221496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848783
4486	NC_017943	TCA	2	6	221501	221506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848783
4487	NC_017943	TCGG	2	8	221510	221517	0 %	25 %	50 %	25 %	389848783
4488	NC_017943	CGT	2	6	221586	221591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848783
4489	NC_017943	CGT	2	6	221691	221696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848783
4490	NC_017943	CCT	2	6	221697	221702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848783
4491	NC_017943	CGG	2	6	221715	221720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848783
4492	NC_017943	ACG	2	6	221732	221737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848783
4493	NC_017943	TCG	2	6	221774	221779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848783
4494	NC_017943	CGG	2	6	221814	221819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848783
4495	NC_017943	GAC	2	6	221838	221843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848783
4496	NC_017943	AAG	2	6	221864	221869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848783
4497	NC_017943	AC	3	6	221945	221950	50 %	0 %	0 %	50 %	389848783
4498	NC_017943	GCG	2	6	222061	222066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848783
4499	NC_017943	GAG	2	6	222106	222111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848783
4500	NC_017943	GAACG	2	10	222126	222135	40 %	0 %	40 %	20 %	389848783

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