MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 6651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017941	GTCA	2	8	451	458	25 %	25 %	25 %	25 %	389845494
2	NC_017941	CGAA	2	8	585	592	50 %	0 %	25 %	25 %	389845494
3	NC_017941	CCAA	2	8	1022	1029	50 %	0 %	0 %	50 %	389845494
4	NC_017941	GACG	2	8	1083	1090	25 %	0 %	50 %	25 %	389845494
5	NC_017941	CTGT	2	8	1804	1811	0 %	50 %	25 %	25 %	389845495
6	NC_017941	AGCG	2	8	2136	2143	25 %	0 %	50 %	25 %	389845495
7	NC_017941	GGGC	2	8	2626	2633	0 %	0 %	75 %	25 %	389845495
8	NC_017941	CGGA	2	8	3061	3068	25 %	0 %	50 %	25 %	389845496
9	NC_017941	CGGG	2	8	4499	4506	0 %	0 %	75 %	25 %	389845497
10	NC_017941	CCGA	2	8	5496	5503	25 %	0 %	25 %	50 %	389845497
11	NC_017941	TGCG	2	8	5684	5691	0 %	25 %	50 %	25 %	389845498
12	NC_017941	CTCG	2	8	6645	6652	0 %	25 %	25 %	50 %	389845499
13	NC_017941	GCGA	2	8	7399	7406	25 %	0 %	50 %	25 %	389845500
14	NC_017941	ACCG	2	8	7993	8000	25 %	0 %	25 %	50 %	389845500
15	NC_017941	CCGG	2	8	8222	8229	0 %	0 %	50 %	50 %	389845500
16	NC_017941	TCCG	2	8	8975	8982	0 %	25 %	25 %	50 %	389845501
17	NC_017941	CGCC	2	8	9153	9160	0 %	0 %	25 %	75 %	389845501
18	NC_017941	CGAC	2	8	9177	9184	25 %	0 %	25 %	50 %	389845501
19	NC_017941	ACCG	2	8	9893	9900	25 %	0 %	25 %	50 %	389845501
20	NC_017941	CGTC	2	8	9910	9917	0 %	25 %	25 %	50 %	389845501
21	NC_017941	CGAC	2	8	10904	10911	25 %	0 %	25 %	50 %	389845503
22	NC_017941	TACA	2	8	11446	11453	50 %	25 %	0 %	25 %	389845503
23	NC_017941	TCGC	2	8	13183	13190	0 %	25 %	25 %	50 %	389845505
24	NC_017941	CGTC	2	8	13226	13233	0 %	25 %	25 %	50 %	389845505
25	NC_017941	GTCG	2	8	13865	13872	0 %	25 %	50 %	25 %	389845505
26	NC_017941	TGCC	2	8	14169	14176	0 %	25 %	25 %	50 %	389845505
27	NC_017941	CCAG	2	8	14297	14304	25 %	0 %	25 %	50 %	389845505
28	NC_017941	CGAG	2	8	14489	14496	25 %	0 %	50 %	25 %	389845505
29	NC_017941	GGCC	2	8	14819	14826	0 %	0 %	50 %	50 %	389845505
30	NC_017941	CGAG	2	8	16016	16023	25 %	0 %	50 %	25 %	389845507
31	NC_017941	TGGG	2	8	16057	16064	0 %	25 %	75 %	0 %	389845507
32	NC_017941	GCGA	2	8	16139	16146	25 %	0 %	50 %	25 %	389845507
33	NC_017941	GGTT	2	8	16175	16182	0 %	50 %	50 %	0 %	389845507
34	NC_017941	TCGC	2	8	18142	18149	0 %	25 %	25 %	50 %	389845510
35	NC_017941	GCGA	2	8	19138	19145	25 %	0 %	50 %	25 %	389845511
36	NC_017941	GACA	2	8	19501	19508	50 %	0 %	25 %	25 %	389845511
37	NC_017941	ACCG	2	8	20051	20058	25 %	0 %	25 %	50 %	389845512
38	NC_017941	ACCG	2	8	20771	20778	25 %	0 %	25 %	50 %	389845512
39	NC_017941	CGAG	2	8	20833	20840	25 %	0 %	50 %	25 %	389845512
40	NC_017941	CGAA	2	8	21080	21087	50 %	0 %	25 %	25 %	389845512
41	NC_017941	TCGT	2	8	21216	21223	0 %	50 %	25 %	25 %	389845512
42	NC_017941	TTGC	2	8	21409	21416	0 %	50 %	25 %	25 %	389845513
43	NC_017941	GGTC	2	8	21746	21753	0 %	25 %	50 %	25 %	389845513
44	NC_017941	GATA	2	8	22035	22042	50 %	25 %	25 %	0 %	389845513
45	NC_017941	TCGG	2	8	22126	22133	0 %	25 %	50 %	25 %	389845513
46	NC_017941	AACG	2	8	22347	22354	50 %	0 %	25 %	25 %	389845513
47	NC_017941	TCGC	2	8	24230	24237	0 %	25 %	25 %	50 %	389845515
48	NC_017941	GAAG	2	8	24395	24402	50 %	0 %	50 %	0 %	389845515
49	NC_017941	CTGA	2	8	24998	25005	25 %	25 %	25 %	25 %	389845516
50	NC_017941	TCGC	2	8	25378	25385	0 %	25 %	25 %	50 %	389845516
51	NC_017941	GTCG	2	8	25390	25397	0 %	25 %	50 %	25 %	389845516
52	NC_017941	ACGA	2	8	25748	25755	50 %	0 %	25 %	25 %	389845516
53	NC_017941	CGAA	2	8	25899	25906	50 %	0 %	25 %	25 %	389845516
54	NC_017941	TGAC	2	8	25958	25965	25 %	25 %	25 %	25 %	389845516
55	NC_017941	GTAT	2	8	26007	26014	25 %	50 %	25 %	0 %	389845516
56	NC_017941	GATG	2	8	26392	26399	25 %	25 %	50 %	0 %	389845517
57	NC_017941	CCGC	2	8	26520	26527	0 %	0 %	25 %	75 %	389845517
58	NC_017941	GACC	2	8	26731	26738	25 %	0 %	25 %	50 %	389845517
59	NC_017941	TCCG	2	8	27514	27521	0 %	25 %	25 %	50 %	389845518
60	NC_017941	CTCG	2	8	27551	27558	0 %	25 %	25 %	50 %	389845518
61	NC_017941	CCGC	2	8	28825	28832	0 %	0 %	25 %	75 %	389845519
62	NC_017941	GCCG	2	8	30403	30410	0 %	0 %	50 %	50 %	389845520
63	NC_017941	TCGC	2	8	31196	31203	0 %	25 %	25 %	50 %	389845520
64	NC_017941	CCGA	2	8	31513	31520	25 %	0 %	25 %	50 %	389845521
65	NC_017941	GACC	2	8	32588	32595	25 %	0 %	25 %	50 %	389845522
66	NC_017941	CCGA	2	8	32800	32807	25 %	0 %	25 %	50 %	389845522
67	NC_017941	GCTC	2	8	33034	33041	0 %	25 %	25 %	50 %	389845522
68	NC_017941	CGAC	2	8	33733	33740	25 %	0 %	25 %	50 %	389845522
69	NC_017941	CGAG	2	8	34564	34571	25 %	0 %	50 %	25 %	389845522
70	NC_017941	CTCG	2	8	35150	35157	0 %	25 %	25 %	50 %	389845523
71	NC_017941	CGAA	2	8	35555	35562	50 %	0 %	25 %	25 %	389845523
72	NC_017941	CTCG	2	8	36000	36007	0 %	25 %	25 %	50 %	389845524
73	NC_017941	TCCA	2	8	36187	36194	25 %	25 %	0 %	50 %	389845524
74	NC_017941	CCGC	2	8	36204	36211	0 %	0 %	25 %	75 %	389845524
75	NC_017941	TCGC	3	12	36737	36748	0 %	25 %	25 %	50 %	389845525
76	NC_017941	GACC	2	8	37523	37530	25 %	0 %	25 %	50 %	389845525
77	NC_017941	CGCC	2	8	38015	38022	0 %	0 %	25 %	75 %	389845527
78	NC_017941	CGCT	2	8	38335	38342	0 %	25 %	25 %	50 %	389845528
79	NC_017941	GTTC	2	8	38583	38590	0 %	50 %	25 %	25 %	389845529
80	NC_017941	CCGC	2	8	38968	38975	0 %	0 %	25 %	75 %	389845529
81	NC_017941	GTCC	2	8	39418	39425	0 %	25 %	25 %	50 %	389845529
82	NC_017941	TCGG	2	8	39526	39533	0 %	25 %	50 %	25 %	389845529
83	NC_017941	CTGC	2	8	39829	39836	0 %	25 %	25 %	50 %	389845529
84	NC_017941	GCCA	2	8	40922	40929	25 %	0 %	25 %	50 %	389845531
85	NC_017941	TCCA	2	8	41608	41615	25 %	25 %	0 %	50 %	389845531
86	NC_017941	GTGA	2	8	41989	41996	25 %	25 %	50 %	0 %	389845531
87	NC_017941	ACGA	2	8	42856	42863	50 %	0 %	25 %	25 %	389845531
88	NC_017941	TGGG	2	8	43167	43174	0 %	25 %	75 %	0 %	389845532
89	NC_017941	CTCG	2	8	43258	43265	0 %	25 %	25 %	50 %	389845532
90	NC_017941	GCAG	3	12	43617	43628	25 %	0 %	50 %	25 %	389845533
91	NC_017941	ACGA	2	8	43902	43909	50 %	0 %	25 %	25 %	389845533
92	NC_017941	AAGC	2	8	44613	44620	50 %	0 %	25 %	25 %	389845534
93	NC_017941	CTCG	2	8	44982	44989	0 %	25 %	25 %	50 %	389845534
94	NC_017941	CAGT	2	8	45464	45471	25 %	25 %	25 %	25 %	389845534
95	NC_017941	CGTC	2	8	45482	45489	0 %	25 %	25 %	50 %	389845534
96	NC_017941	CGTC	2	8	45509	45516	0 %	25 %	25 %	50 %	389845534
97	NC_017941	TCTG	2	8	45538	45545	0 %	50 %	25 %	25 %	389845534
98	NC_017941	AGGC	2	8	46001	46008	25 %	0 %	50 %	25 %	389845535
99	NC_017941	CGTG	2	8	46776	46783	0 %	25 %	50 %	25 %	389845536
100	NC_017941	CGCC	2	8	47289	47296	0 %	0 %	25 %	75 %	389845536
101	NC_017941	CGAG	2	8	50187	50194	25 %	0 %	50 %	25 %	389845540
102	NC_017941	CCGA	2	8	50285	50292	25 %	0 %	25 %	50 %	389845540
103	NC_017941	GGCG	2	8	51057	51064	0 %	0 %	75 %	25 %	389845540
104	NC_017941	CGCT	2	8	51079	51086	0 %	25 %	25 %	50 %	389845540
105	NC_017941	GCGG	2	8	51283	51290	0 %	0 %	75 %	25 %	389845540
106	NC_017941	CGGG	2	8	51539	51546	0 %	0 %	75 %	25 %	389845540
107	NC_017941	GCCT	2	8	52103	52110	0 %	25 %	25 %	50 %	389845541
108	NC_017941	CCGT	2	8	54039	54046	0 %	25 %	25 %	50 %	389845542
109	NC_017941	GCCC	2	8	54242	54249	0 %	0 %	25 %	75 %	389845543
110	NC_017941	CGAG	2	8	54419	54426	25 %	0 %	50 %	25 %	389845543
111	NC_017941	GTCG	2	8	55199	55206	0 %	25 %	50 %	25 %	389845543
112	NC_017941	TTGC	2	8	55594	55601	0 %	50 %	25 %	25 %	389845544
113	NC_017941	GACT	2	8	56258	56265	25 %	25 %	25 %	25 %	389845545
114	NC_017941	GAGT	2	8	56431	56438	25 %	25 %	50 %	0 %	389845545
115	NC_017941	CCGA	2	8	56862	56869	25 %	0 %	25 %	50 %	389845546
116	NC_017941	CGAC	2	8	57992	57999	25 %	0 %	25 %	50 %	389845546
117	NC_017941	ACGT	2	8	58844	58851	25 %	25 %	25 %	25 %	389845547
118	NC_017941	CGGT	2	8	59043	59050	0 %	25 %	50 %	25 %	389845547
119	NC_017941	CGCA	2	8	59565	59572	25 %	0 %	25 %	50 %	389845548
120	NC_017941	GAGT	2	8	59576	59583	25 %	25 %	50 %	0 %	389845548
121	NC_017941	CCTG	2	8	59811	59818	0 %	25 %	25 %	50 %	389845548
122	NC_017941	AGCG	2	8	59858	59865	25 %	0 %	50 %	25 %	389845548
123	NC_017941	CGTC	2	8	60523	60530	0 %	25 %	25 %	50 %	389845550
124	NC_017941	TGTC	2	8	60717	60724	0 %	50 %	25 %	25 %	389845550
125	NC_017941	GCCC	2	8	61278	61285	0 %	0 %	25 %	75 %	389845550
126	NC_017941	CCGA	2	8	61576	61583	25 %	0 %	25 %	50 %	389845550
127	NC_017941	TTCG	2	8	61992	61999	0 %	50 %	25 %	25 %	389845551
128	NC_017941	CGTG	2	8	62192	62199	0 %	25 %	50 %	25 %	389845551
129	NC_017941	ACCG	2	8	62718	62725	25 %	0 %	25 %	50 %	389845551
130	NC_017941	ATGG	2	8	63580	63587	25 %	25 %	50 %	0 %	389845552
131	NC_017941	GGAC	2	8	64480	64487	25 %	0 %	50 %	25 %	389845553
132	NC_017941	CTCG	2	8	64508	64515	0 %	25 %	25 %	50 %	389845553
133	NC_017941	CGAG	2	8	64783	64790	25 %	0 %	50 %	25 %	389845553
134	NC_017941	CGAA	2	8	64924	64931	50 %	0 %	25 %	25 %	389845553
135	NC_017941	CGGA	2	8	64955	64962	25 %	0 %	50 %	25 %	389845553
136	NC_017941	TTAC	2	8	65498	65505	25 %	50 %	0 %	25 %	389845554
137	NC_017941	ACCG	2	8	66611	66618	25 %	0 %	25 %	50 %	389845554
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