MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	386755088
2	NC_017742	CGCTTG	2	12	6439	6450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755091
3	NC_017742	TGCCAT	2	12	7125	7136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755091
4	NC_017742	GAAACC	2	12	7934	7945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386755092
5	NC_017742	AACGAT	2	12	10653	10664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386755094
6	NC_017742	ACCAAA	2	12	14436	14447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755098
7	NC_017742	AGAAAA	2	12	18871	18882	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386755101
8	NC_017742	GATAAA	2	12	22460	22471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386755104
9	NC_017742	CAATTC	2	12	27193	27204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755107
10	NC_017742	TAGCCC	2	12	28149	28160	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386755108
11	NC_017742	TATCAA	2	12	30382	30393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386755111
12	NC_017742	ACTTTT	2	12	30683	30694	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755111
13	NC_017742	GCGTGG	2	12	33072	33083	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755114
14	NC_017742	TAATGA	2	12	33208	33219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386755114
15	NC_017742	TTGAAT	2	12	34268	34279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386755114
16	NC_017742	TAAGGA	2	12	34567	34578	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386755114
17	NC_017742	GCTAGG	2	12	36075	36086	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755117
18	NC_017742	CAAAAT	2	12	41523	41534	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386755123
19	NC_017742	GGATAA	2	12	43482	43493	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386755125
20	NC_017742	CACTAC	2	12	44908	44919	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386755126
21	NC_017742	CGCAAA	2	12	45889	45900	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386755127
22	NC_017742	GGCTAG	2	12	50131	50142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755131
23	NC_017742	CTTTTT	2	12	52242	52253	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386755133
24	NC_017742	TTTATC	2	12	53659	53670	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755133
25	NC_017742	CCACGC	2	12	57724	57735	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386755135
26	NC_017742	CTAAAG	2	12	59011	59022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386755135
27	NC_017742	AGAAAG	2	12	60690	60701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755137
28	NC_017742	AGACAA	2	12	60717	60728	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386755137
29	NC_017742	AATTTT	2	12	61246	61257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755137
30	NC_017742	GATGTG	2	12	62684	62695	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386755138
31	NC_017742	AGCCAA	2	12	62762	62773	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386755138
32	NC_017742	CCAACA	2	12	64629	64640	50 %	0 %	0 %	50 %	386755138
33	NC_017742	ACAGAA	2	12	67119	67130	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386755140
34	NC_017742	ACGCCC	2	12	76770	76781	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386755151
35	NC_017742	TAAGGG	2	12	79499	79510	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386755154
36	NC_017742	CGCTAA	2	12	79862	79873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386755154
37	NC_017742	CAACGA	2	12	81726	81737	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386755156
38	NC_017742	GCGCAT	2	12	82939	82950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386755157
39	NC_017742	GGCATG	2	12	83251	83262	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755157
40	NC_017742	CTAACA	2	12	84047	84058	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386755157
41	NC_017742	ATACCG	2	12	84212	84223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386755157
42	NC_017742	GCAACG	2	12	84293	84304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755157
43	NC_017742	CTTTAG	2	12	93077	93088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755166
44	NC_017742	TTGTTT	2	12	93118	93129	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386755166
45	NC_017742	ATTAGA	2	12	97115	97126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386755169
46	NC_017742	GATTTT	2	12	98877	98888	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386755171
47	NC_017742	AAACTC	2	12	98994	99005	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386755171
48	NC_017742	TCAAAA	2	12	100309	100320	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386755172
49	NC_017742	TATCGT	2	12	100888	100899	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755173
50	NC_017742	GCGGTG	2	12	101007	101018	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755173
51	NC_017742	TAATAT	2	12	104213	104224	50 %	50 %	0 %	0 %	386755174
52	NC_017742	TTTTCT	2	12	116500	116511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386755184
53	NC_017742	ATTGCC	2	12	120580	120591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755188
54	NC_017742	GTTAAG	2	12	121411	121422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755189
55	NC_017742	TAGGCA	2	12	124024	124035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386755190
56	NC_017742	TGAATT	2	12	128536	128547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386755193
57	NC_017742	TTTCAA	2	12	128695	128706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386755193
58	NC_017742	CTTTAG	2	12	130098	130109	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755195
59	NC_017742	TCGCTA	2	12	130299	130310	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755195
60	NC_017742	AGCAAA	2	12	132041	132052	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386755196
61	NC_017742	TCATGA	2	12	134971	134982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386755200
62	NC_017742	AAAAAT	2	12	141482	141493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386755205
63	NC_017742	TTGGCT	2	12	142769	142780	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386755207
64	NC_017742	ACGATT	2	12	146137	146148	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386755210
65	NC_017742	TTAGCG	2	12	146506	146517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386755210
66	NC_017742	TATCGC	2	12	146718	146729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755210
67	NC_017742	TTTTAG	2	12	147833	147844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386755211
68	NC_017742	ATCGCT	2	12	148426	148437	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755211
69	NC_017742	TTCTAT	2	12	151809	151820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755214
70	NC_017742	TTGTTT	2	12	154797	154808	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386755219
71	NC_017742	TTGGGT	2	12	160767	160778	0 %	50 %	50 %	0 %	386755226
72	NC_017742	GATTTT	2	12	161280	161291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386755227
73	NC_017742	GATGGC	2	12	164526	164537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755231
74	NC_017742	GGCGTG	2	12	164745	164756	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755231
75	NC_017742	CTTTCT	2	12	164778	164789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755231
76	NC_017742	CCGCTC	2	12	166669	166680	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386755233
77	NC_017742	TAGTGG	2	12	170862	170873	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386755238
78	NC_017742	TTCTAA	2	12	171415	171426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386755238
79	NC_017742	GGGGGA	2	12	172426	172437	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	386755239
80	NC_017742	ATCGTT	2	12	173526	173537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755240
81	NC_017742	AATTTC	2	12	173877	173888	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386755241
82	NC_017742	TTCTTT	2	12	175811	175822	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386755242
83	NC_017742	ATTTTG	2	12	177210	177221	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386755244
84	NC_017742	GTTTAA	2	12	178472	178483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386755245
85	NC_017742	TGGTTA	2	12	181146	181157	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386755247
86	NC_017742	ATTTTT	2	12	181194	181205	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386755247
87	NC_017742	CCGCTC	2	12	181727	181738	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386755248
88	NC_017742	TGGTAG	2	12	183377	183388	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386755250
89	NC_017742	GAAAAA	2	12	185365	185376	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386755251
90	NC_017742	AGGCAT	2	12	185454	185465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386755251
91	NC_017742	GCATTT	2	12	187166	187177	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755253
92	NC_017742	ATAAAG	2	12	187894	187905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386755254
93	NC_017742	TTAAAG	2	12	190765	190776	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386755255
94	NC_017742	GGTATT	2	12	191667	191678	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386755256
95	NC_017742	TCTAAA	2	12	191897	191908	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386755256
96	NC_017742	GGCATG	2	12	192968	192979	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755257
97	NC_017742	TTCTAA	2	12	193445	193456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386755258
98	NC_017742	ATTTTC	2	12	195390	195401	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755258
99	NC_017742	TGGGGC	2	12	202902	202913	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755268
100	NC_017742	AAATCC	2	12	204742	204753	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386755270
101	NC_017742	CTGTAT	2	12	206673	206684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755271
102	NC_017742	ATTCTA	2	12	215580	215591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386755278
103	NC_017742	CATAGC	2	12	217336	217347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386755279
104	NC_017742	GTTTTG	2	12	217841	217852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755279
105	NC_017742	TAATTA	2	12	222332	222343	50 %	50 %	0 %	0 %	386755283
106	NC_017742	TAAAGA	2	12	223005	223016	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386755284
107	NC_017742	AATGCC	2	12	230289	230300	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386755293
108	NC_017742	CACGCC	2	12	235453	235464	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386755296
109	NC_017742	GCTTTG	2	12	236697	236708	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386755297
110	NC_017742	GGCTAG	2	12	238073	238084	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755298
111	NC_017742	TCTTTA	2	12	244415	244426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755305
112	NC_017742	GTTTTT	2	12	250069	250080	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386755312
113	NC_017742	TCCCGC	2	12	255405	255416	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386755317
114	NC_017742	CCGCTC	2	12	256220	256231	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386755317
115	NC_017742	TGAGCG	2	12	264060	264071	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755325
116	NC_017742	CTTTAG	2	12	264366	264377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755325
117	NC_017742	GGGGCT	2	12	269583	269594	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755330
118	NC_017742	GAAAAG	2	12	270252	270263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755330
119	NC_017742	AAAGAA	2	12	270264	270275	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386755330
120	NC_017742	GATTTT	2	12	270875	270886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386755330
121	NC_017742	AGCTTT	2	12	274284	274295	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755333
122	NC_017742	TAAAGA	2	12	280433	280444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386755341
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125	NC_017742	AAATCA	2	12	281898	281909	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386755344
126	NC_017742	GGGGCT	2	12	292230	292241	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755352
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129	NC_017742	ATTTGA	2	12	298340	298351	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386755355
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139	NC_017742	TTTGCG	2	12	318189	318200	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386755368
140	NC_017742	GCACTA	2	12	318686	318697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386755368
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147	NC_017742	TTTCTT	2	12	334232	334243	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386755387
148	NC_017742	TTTCTT	2	12	334355	334366	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386755387
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221	NC_017742	TTTGTT	2	12	481201	481212	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386755521
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227	NC_017742	GCATTT	2	12	495808	495819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755533
228	NC_017742	TTGTGA	2	12	496205	496216	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386755534
229	NC_017742	CATTTT	2	12	496246	496257	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755534
230	NC_017742	TATCGC	2	12	506379	506390	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755542
231	NC_017742	GAAATT	2	12	506812	506823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386755542
232	NC_017742	TAAAGA	2	12	507776	507787	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386755543
233	NC_017742	AGAAAA	2	12	511605	511616	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386755547
234	NC_017742	AGAAAA	2	12	512833	512844	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386755548
235	NC_017742	GAAAAA	2	12	512923	512934	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386755548
236	NC_017742	TATCCA	2	12	513460	513471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755549
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238	NC_017742	ATAGTA	2	12	516355	516366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386755551
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253	NC_017742	CAATGT	2	12	565660	565671	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386755596
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341	NC_017742	AAGTGT	2	12	795488	795499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755790
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458	NC_017742	TCATTC	2	12	1126044	1126055	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386756073
459	NC_017742	TAAAGC	2	12	1133045	1133056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386756081
460	NC_017742	ATATTG	2	12	1136104	1136115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386756084
461	NC_017742	AATTTA	2	12	1137386	1137397	50 %	50 %	0 %	0 %	386756085
462	NC_017742	CGCCAT	2	12	1146043	1146054	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386756094
463	NC_017742	CCATCG	2	12	1146192	1146203	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386756094
464	NC_017742	TTTATG	2	12	1147425	1147436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386756096
465	NC_017742	TAGCGA	2	12	1148332	1148343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756096
466	NC_017742	AAGTGC	2	12	1148584	1148595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756096
467	NC_017742	TTTGAA	2	12	1150620	1150631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386756098
468	NC_017742	GAGCGG	2	12	1151868	1151879	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386756099
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470	NC_017742	AAAGCG	2	12	1155941	1155952	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386756102
471	NC_017742	TTAGAA	2	12	1162285	1162296	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386756109
472	NC_017742	AGCGTT	2	12	1166560	1166571	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386756112
473	NC_017742	GCTTCA	2	12	1167525	1167536	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386756113
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475	NC_017742	TTAGCG	2	12	1174431	1174442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386756118
476	NC_017742	CGATTG	2	12	1178239	1178250	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386756122
477	NC_017742	CTTGAG	2	12	1179743	1179754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386756124
478	NC_017742	TCAAAA	2	12	1180232	1180243	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386756125
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480	NC_017742	CACGCT	2	12	1186530	1186541	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386756133
481	NC_017742	TTATCT	2	12	1187882	1187893	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386756133
482	NC_017742	GCATTA	2	12	1196641	1196652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386756142
483	NC_017742	AAATTA	2	12	1200791	1200802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386756143
484	NC_017742	AGTTTT	2	12	1205669	1205680	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386756150
485	NC_017742	TTAAAG	2	12	1207965	1207976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386756150
486	NC_017742	CAAAGC	2	12	1213859	1213870	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386756155
487	NC_017742	TAATGG	2	12	1214329	1214340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386756155
488	NC_017742	AAAAAG	2	12	1220333	1220344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386756163
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492	NC_017742	TGTTGA	2	12	1228314	1228325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386756167
493	NC_017742	ACAGAA	2	12	1232969	1232980	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386756173
494	NC_017742	AGCATA	2	12	1237184	1237195	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386756176
495	NC_017742	AGCGTA	2	12	1238750	1238761	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386756177
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499	NC_017742	CAAACA	2	12	1245861	1245872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386756184
500	NC_017742	CTTCTA	2	12	1248350	1248361	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386756186

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