MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 14940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753520
2	NC_017741	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753520
3	NC_017741	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753520
4	NC_017741	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753520
5	NC_017741	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753520
6	NC_017741	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753521
7	NC_017741	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753521
8	NC_017741	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753521
9	NC_017741	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753521
10	NC_017741	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753521
11	NC_017741	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753522
12	NC_017741	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753522
13	NC_017741	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753522
14	NC_017741	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753522
15	NC_017741	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753522
16	NC_017741	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753522
17	NC_017741	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386753522
18	NC_017741	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753522
19	NC_017741	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753522
20	NC_017741	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753522
21	NC_017741	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753523
22	NC_017741	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753523
23	NC_017741	TCA	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753523
24	NC_017741	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753523
25	NC_017741	CTG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753523
26	NC_017741	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753523
27	NC_017741	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753523
28	NC_017741	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753523
29	NC_017741	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753523
30	NC_017741	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753523
31	NC_017741	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386753523
32	NC_017741	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753524
33	NC_017741	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753524
34	NC_017741	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753524
35	NC_017741	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753524
36	NC_017741	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753524
37	NC_017741	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753525
38	NC_017741	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753525
39	NC_017741	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753525
40	NC_017741	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386753525
41	NC_017741	CAT	2	6	7345	7350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
42	NC_017741	TCT	2	6	7412	7417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
43	NC_017741	AAT	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753526
44	NC_017741	CTT	2	6	7518	7523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
45	NC_017741	CAT	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
46	NC_017741	ATG	2	6	7661	7666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753526
47	NC_017741	TCA	2	6	7685	7690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
48	NC_017741	CCG	2	6	7739	7744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753526
49	NC_017741	CTT	2	6	7758	7763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
50	NC_017741	TCA	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
51	NC_017741	CAT	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
52	NC_017741	TTC	2	6	8074	8079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
53	NC_017741	TAA	2	6	8082	8087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753526
54	NC_017741	CCG	2	6	8093	8098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753526
55	NC_017741	CAC	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753526
56	NC_017741	GAT	2	6	8236	8241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753526
57	NC_017741	TAG	2	6	8275	8280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753526
58	NC_017741	CTT	2	6	8448	8453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
59	NC_017741	TCT	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
60	NC_017741	TAA	2	6	8601	8606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753526
61	NC_017741	GCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753526
62	NC_017741	CTT	2	6	8757	8762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
63	NC_017741	ACA	2	6	9077	9082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753527
64	NC_017741	TCT	2	6	9111	9116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753527
65	NC_017741	CTT	2	6	9193	9198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753527
66	NC_017741	GAT	3	9	9281	9289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753527
67	NC_017741	TCT	2	6	9309	9314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753527
68	NC_017741	CTA	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753527
69	NC_017741	TTG	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753528
70	NC_017741	GAA	2	6	9756	9761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
71	NC_017741	TTA	2	6	9935	9940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753528
72	NC_017741	AGA	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
73	NC_017741	ACC	2	6	9958	9963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753528
74	NC_017741	AAG	2	6	9991	9996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
75	NC_017741	ATT	2	6	10024	10029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753528
76	NC_017741	CAT	2	6	10205	10210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753528
77	NC_017741	GTG	2	6	10239	10244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753528
78	NC_017741	ATG	2	6	10519	10524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753528
79	NC_017741	AGG	2	6	10584	10589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386753528
80	NC_017741	AAC	2	6	10611	10616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753528
81	NC_017741	AGA	2	6	10997	11002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
82	NC_017741	TTG	2	6	11010	11015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753528
83	NC_017741	GAC	2	6	11097	11102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753528
84	NC_017741	TTA	3	9	11118	11126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753528
85	NC_017741	TTG	2	6	11175	11180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753528
86	NC_017741	TGT	2	6	11361	11366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753529
87	NC_017741	TGT	2	6	11529	11534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753529
88	NC_017741	AAG	2	6	11688	11693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753529
89	NC_017741	GTT	2	6	11803	11808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753529
90	NC_017741	TGG	3	9	12099	12107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753529
91	NC_017741	GAA	3	9	12116	12124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753529
92	NC_017741	TGG	2	6	12198	12203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753529
93	NC_017741	AGA	2	6	12220	12225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753529
94	NC_017741	TTA	2	6	12532	12537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753530
95	NC_017741	GAA	2	6	12549	12554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753530
96	NC_017741	GTT	2	6	12616	12621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753530
97	NC_017741	ATT	2	6	12639	12644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753530
98	NC_017741	GAA	2	6	12845	12850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753530
99	NC_017741	AAT	2	6	12921	12926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753530
100	NC_017741	CAA	2	6	13020	13025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753530
101	NC_017741	TTG	2	6	13165	13170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753530
102	NC_017741	AGA	2	6	13217	13222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753530
103	NC_017741	GTG	2	6	13644	13649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753531
104	NC_017741	GAA	2	6	13735	13740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753532
105	NC_017741	ATT	3	9	13922	13930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753532
106	NC_017741	GAA	2	6	14061	14066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753533
107	NC_017741	AAC	2	6	14067	14072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753533
108	NC_017741	ATG	2	6	14086	14091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753533
109	NC_017741	TCC	2	6	14131	14136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386753533
110	NC_017741	CAA	2	6	14271	14276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753533
111	NC_017741	AAG	2	6	14332	14337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753533
112	NC_017741	TAG	2	6	14599	14604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753533
113	NC_017741	ATT	2	6	14656	14661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753533
114	NC_017741	GCT	2	6	14879	14884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753533
115	NC_017741	ACC	2	6	15094	15099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753533
116	NC_017741	ATT	2	6	15217	15222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753533
117	NC_017741	AAG	2	6	15250	15255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753533
118	NC_017741	CAA	2	6	15263	15268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753533
119	NC_017741	ATG	2	6	15354	15359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753533
120	NC_017741	CTT	2	6	15524	15529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753533
121	NC_017741	AAG	2	6	15565	15570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753533
122	NC_017741	AGA	2	6	15575	15580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753533
123	NC_017741	TAT	2	6	15828	15833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753533
124	NC_017741	AGA	2	6	15851	15856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753533
125	NC_017741	GTG	3	9	15978	15986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753533
126	NC_017741	TAT	2	6	16688	16693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753534
127	NC_017741	GAA	2	6	16694	16699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753534
128	NC_017741	CTT	2	6	16812	16817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753534
129	NC_017741	AAC	2	6	16839	16844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753534
130	NC_017741	ATT	2	6	16959	16964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753534
131	NC_017741	TAT	2	6	17060	17065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753534
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