MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017740	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386751996
2	NC_017740	TTTCT	2	10	6219	6228	0 %	80 %	0 %	20 %	386751999
3	NC_017740	TTGAA	2	10	9716	9725	40 %	40 %	20 %	0 %	386752002
4	NC_017740	TTTTG	2	10	9732	9741	0 %	80 %	20 %	0 %	386752002
5	NC_017740	TGGTG	2	10	10570	10579	0 %	40 %	60 %	0 %	386752004
6	NC_017740	AGTTT	2	10	13080	13089	20 %	60 %	20 %	0 %	386752007
7	NC_017740	CAAAA	2	10	16447	16456	80 %	0 %	0 %	20 %	386752009
8	NC_017740	CATCA	2	10	17823	17832	40 %	20 %	0 %	40 %	386752010
9	NC_017740	TGAAA	2	10	18791	18800	60 %	20 %	20 %	0 %	386752011
10	NC_017740	CCATG	2	10	20988	20997	20 %	20 %	20 %	40 %	386752014
11	NC_017740	CTCTT	2	10	21018	21027	0 %	60 %	0 %	40 %	386752014
12	NC_017740	CAAGC	2	10	25629	25638	40 %	0 %	20 %	40 %	386752016
13	NC_017740	TTTTA	2	10	26559	26568	20 %	80 %	0 %	0 %	386752017
14	NC_017740	GATAA	2	10	28639	28648	60 %	20 %	20 %	0 %	386752021
15	NC_017740	GTGGG	2	10	30098	30107	0 %	20 %	80 %	0 %	386752022
16	NC_017740	TGGGG	2	10	31349	31358	0 %	20 %	80 %	0 %	386752024
17	NC_017740	AAGCC	2	10	37115	37124	40 %	0 %	20 %	40 %	386752031
18	NC_017740	AGAAA	2	10	38415	38424	80 %	0 %	20 %	0 %	386752032
19	NC_017740	AAAGT	2	10	38612	38621	60 %	20 %	20 %	0 %	386752032
20	NC_017740	TAAAA	2	10	41134	41143	80 %	20 %	0 %	0 %	386752034
21	NC_017740	TCCCA	2	10	42146	42155	20 %	20 %	0 %	60 %	386752035
22	NC_017740	GCTCC	2	10	42467	42476	0 %	20 %	20 %	60 %	386752035
23	NC_017740	TCGCA	2	10	43004	43013	20 %	20 %	20 %	40 %	386752035
24	NC_017740	AGGCT	2	10	44884	44893	20 %	20 %	40 %	20 %	386752037
25	NC_017740	TGCCT	2	10	45259	45268	0 %	40 %	20 %	40 %	386752037
26	NC_017740	TAAAA	2	10	48734	48743	80 %	20 %	0 %	0 %	386752039
27	NC_017740	ATTTC	2	10	48809	48818	20 %	60 %	0 %	20 %	386752039
28	NC_017740	TGAAA	2	10	50952	50961	60 %	20 %	20 %	0 %	386752043
29	NC_017740	TCAAA	2	10	51206	51215	60 %	20 %	0 %	20 %	386752043
30	NC_017740	TCGCC	2	10	53949	53958	0 %	20 %	20 %	60 %	386752044
31	NC_017740	TCAAA	2	10	54961	54970	60 %	20 %	0 %	20 %	386752044
32	NC_017740	GCGTT	2	10	61439	61448	0 %	40 %	40 %	20 %	386752050
33	NC_017740	TCAAT	2	10	62293	62302	40 %	40 %	0 %	20 %	386752051
34	NC_017740	TGCCT	2	10	63209	63218	0 %	40 %	20 %	40 %	386752052
35	NC_017740	TCCAA	2	10	63621	63630	40 %	20 %	0 %	40 %	386752053
36	NC_017740	ACGCC	2	10	67231	67240	20 %	0 %	20 %	60 %	386752056
37	NC_017740	AAAGC	2	10	67997	68006	60 %	0 %	20 %	20 %	386752057
38	NC_017740	ATCTT	2	10	76038	76047	20 %	60 %	0 %	20 %	386752064
39	NC_017740	TGGCT	2	10	76580	76589	0 %	40 %	40 %	20 %	386752065
40	NC_017740	ATGCC	2	10	77004	77013	20 %	20 %	20 %	40 %	386752066
41	NC_017740	TTGAT	2	10	78043	78052	20 %	60 %	20 %	0 %	386752068
42	NC_017740	GGCGT	2	10	79856	79865	0 %	20 %	60 %	20 %	386752070
43	NC_017740	CTTTC	2	10	83360	83369	0 %	60 %	0 %	40 %	386752072
44	NC_017740	TTTGA	2	10	86150	86159	20 %	60 %	20 %	0 %	386752075
45	NC_017740	TCTTT	2	10	86361	86370	0 %	80 %	0 %	20 %	386752075
46	NC_017740	CGGCA	2	10	90128	90137	20 %	0 %	40 %	40 %	386752078
47	NC_017740	ACGAT	2	10	92612	92621	40 %	20 %	20 %	20 %	386752080
48	NC_017740	TTTTC	2	10	92807	92816	0 %	80 %	0 %	20 %	386752080
49	NC_017740	AATTG	2	10	94463	94472	40 %	40 %	20 %	0 %	386752081
50	NC_017740	TCGTT	2	10	96263	96272	0 %	60 %	20 %	20 %	386752082
51	NC_017740	TCTTT	2	10	99573	99582	0 %	80 %	0 %	20 %	386752085
52	NC_017740	AAAGC	2	10	102339	102348	60 %	0 %	20 %	20 %	386752087
53	NC_017740	GAATG	2	10	103560	103569	40 %	20 %	40 %	0 %	386752089
54	NC_017740	TGTCT	2	10	104377	104386	0 %	60 %	20 %	20 %	386752090
55	NC_017740	ACCCT	2	10	106199	106208	20 %	20 %	0 %	60 %	386752091
56	NC_017740	ATGCC	2	10	106331	106340	20 %	20 %	20 %	40 %	386752091
57	NC_017740	TGATT	2	10	108337	108346	20 %	60 %	20 %	0 %	386752093
58	NC_017740	GAATT	2	10	108957	108966	40 %	40 %	20 %	0 %	386752095
59	NC_017740	GGATC	2	10	112832	112841	20 %	20 %	40 %	20 %	386752097
60	NC_017740	AGCTC	2	10	112852	112861	20 %	20 %	20 %	40 %	386752097
61	NC_017740	AAGCC	2	10	114740	114749	40 %	0 %	20 %	40 %	386752098
62	NC_017740	GTTTG	2	10	116099	116108	0 %	60 %	40 %	0 %	386752099
63	NC_017740	GTTTG	2	10	117342	117351	0 %	60 %	40 %	0 %	386752100
64	NC_017740	TGATC	2	10	117969	117978	20 %	40 %	20 %	20 %	386752100
65	NC_017740	CGCTG	2	10	118909	118918	0 %	20 %	40 %	40 %	386752101
66	NC_017740	TTTGA	2	10	119056	119065	20 %	60 %	20 %	0 %	386752101
67	NC_017740	GACTT	2	10	119590	119599	20 %	40 %	20 %	20 %	386752101
68	NC_017740	ATCTC	2	10	120341	120350	20 %	40 %	0 %	40 %	386752101
69	NC_017740	CGCTT	2	10	120499	120508	0 %	40 %	20 %	40 %	386752101
70	NC_017740	TTTGT	2	10	120859	120868	0 %	80 %	20 %	0 %	386752102
71	NC_017740	TGCGT	2	10	122892	122901	0 %	40 %	40 %	20 %	386752104
72	NC_017740	GAAAA	2	10	123053	123062	80 %	0 %	20 %	0 %	386752104
73	NC_017740	GAAAA	2	10	123371	123380	80 %	0 %	20 %	0 %	386752104
74	NC_017740	ATTTT	2	10	126343	126352	20 %	80 %	0 %	0 %	386752110
75	NC_017740	ATGTT	2	10	126425	126434	20 %	60 %	20 %	0 %	386752110
76	NC_017740	AAAAG	2	10	126837	126846	80 %	0 %	20 %	0 %	386752110
77	NC_017740	AAATC	2	10	129099	129108	60 %	20 %	0 %	20 %	386752111
78	NC_017740	AAAAT	2	10	130571	130580	80 %	20 %	0 %	0 %	386752112
79	NC_017740	GAGTT	2	10	130633	130642	20 %	40 %	40 %	0 %	386752112
80	NC_017740	TTTTC	2	10	132921	132930	0 %	80 %	0 %	20 %	386752116
81	NC_017740	GTAAA	2	10	133473	133482	60 %	20 %	20 %	0 %	386752117
82	NC_017740	TTCTT	2	10	134877	134886	0 %	80 %	0 %	20 %	386752118
83	NC_017740	TCTTT	2	10	135371	135380	0 %	80 %	0 %	20 %	386752119
84	NC_017740	TTTTG	2	10	136534	136543	0 %	80 %	20 %	0 %	386752120
85	NC_017740	AATTC	2	10	137168	137177	40 %	40 %	0 %	20 %	386752120
86	NC_017740	GCGAT	2	10	137327	137336	20 %	20 %	40 %	20 %	386752120
87	NC_017740	GCTTG	2	10	137583	137592	0 %	40 %	40 %	20 %	386752120
88	NC_017740	TTTTG	2	10	138235	138244	0 %	80 %	20 %	0 %	386752121
89	NC_017740	CCAAA	2	10	140075	140084	60 %	0 %	0 %	40 %	386752122
90	NC_017740	ACGCC	2	10	143599	143608	20 %	0 %	20 %	60 %	386752124
91	NC_017740	TTATT	2	10	145495	145504	20 %	80 %	0 %	0 %	386752128
92	NC_017740	GAAAT	2	10	145652	145661	60 %	20 %	20 %	0 %	386752128
93	NC_017740	GCGTT	2	10	145853	145862	0 %	40 %	40 %	20 %	386752130
94	NC_017740	ATTTG	2	10	146828	146837	20 %	60 %	20 %	0 %	386752131
95	NC_017740	AAAAC	2	10	149448	149457	80 %	0 %	0 %	20 %	386752134
96	NC_017740	AAGCC	2	10	152684	152693	40 %	0 %	20 %	40 %	386752139
97	NC_017740	GGGTG	2	10	155093	155102	0 %	20 %	80 %	0 %	386752141
98	NC_017740	ATTCA	2	10	156467	156476	40 %	40 %	0 %	20 %	386752143
99	NC_017740	AAAAC	2	10	158804	158813	80 %	0 %	0 %	20 %	386752145
100	NC_017740	ATCTT	2	10	159869	159878	20 %	60 %	0 %	20 %	386752146
101	NC_017740	TATCA	2	10	168234	168243	40 %	40 %	0 %	20 %	386752155
102	NC_017740	AGCAG	2	10	168891	168900	40 %	0 %	40 %	20 %	386752156
103	NC_017740	ATTTG	2	10	169242	169251	20 %	60 %	20 %	0 %	386752156
104	NC_017740	AATTG	2	10	169398	169407	40 %	40 %	20 %	0 %	386752157
105	NC_017740	TTTCT	2	10	170062	170071	0 %	80 %	0 %	20 %	386752158
106	NC_017740	AAATG	2	10	170399	170408	60 %	20 %	20 %	0 %	386752158
107	NC_017740	TGTAA	2	10	171189	171198	40 %	40 %	20 %	0 %	386752159
108	NC_017740	ATAAA	2	10	172685	172694	80 %	20 %	0 %	0 %	386752160
109	NC_017740	GAATA	2	10	172982	172991	60 %	20 %	20 %	0 %	386752160
110	NC_017740	AAAAG	2	10	173854	173863	80 %	0 %	20 %	0 %	386752162
111	NC_017740	ACCCC	2	10	173919	173928	20 %	0 %	0 %	80 %	386752162
112	NC_017740	TGAAT	2	10	174235	174244	40 %	40 %	20 %	0 %	386752163
113	NC_017740	ATTCA	2	10	181323	181332	40 %	40 %	0 %	20 %	386752168
114	NC_017740	GCGAA	2	10	183897	183906	40 %	0 %	40 %	20 %	386752170
115	NC_017740	TCATT	2	10	186934	186943	20 %	60 %	0 %	20 %	386752172
116	NC_017740	CATAA	2	10	187494	187503	60 %	20 %	0 %	20 %	386752173
117	NC_017740	CTATT	2	10	187823	187832	20 %	60 %	0 %	20 %	386752174
118	NC_017740	TTTTC	2	10	188883	188892	0 %	80 %	0 %	20 %	386752175
119	NC_017740	ATTAG	2	10	190861	190870	40 %	40 %	20 %	0 %	386752177
120	NC_017740	TATTT	2	10	192634	192643	20 %	80 %	0 %	0 %	386752180
121	NC_017740	TGGGG	2	10	200006	200015	0 %	20 %	80 %	0 %	386752186
122	NC_017740	TATTG	2	10	201884	201893	20 %	60 %	20 %	0 %	386752187
123	NC_017740	TAAAA	2	10	204984	204993	80 %	20 %	0 %	0 %	386752192
124	NC_017740	CAATA	2	10	205993	206002	60 %	20 %	0 %	20 %	386752192
125	NC_017740	CTTTA	2	10	207388	207397	20 %	60 %	0 %	20 %	386752193
126	NC_017740	ATTAC	2	10	208434	208443	40 %	40 %	0 %	20 %	386752193
127	NC_017740	ATTAT	2	10	211010	211019	40 %	60 %	0 %	0 %	386752196
128	NC_017740	ATCAA	2	10	211238	211247	60 %	20 %	0 %	20 %	386752196
129	NC_017740	CAAAA	2	10	211475	211484	80 %	0 %	0 %	20 %	386752196
130	NC_017740	ATCTA	2	10	213449	213458	40 %	40 %	0 %	20 %	386752201
131	NC_017740	CTTAG	2	10	214073	214082	20 %	40 %	20 %	20 %	386752202
132	NC_017740	ATCTT	2	10	214754	214763	20 %	60 %	0 %	20 %	386752203
133	NC_017740	TTGAT	2	10	215083	215092	20 %	60 %	20 %	0 %	386752204
134	NC_017740	TGAAA	2	10	215624	215633	60 %	20 %	20 %	0 %	386752205
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