MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 3983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017740	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	386751994
2	NC_017740	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386751994
3	NC_017740	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386751995
4	NC_017740	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386751996
5	NC_017740	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	386751996
6	NC_017740	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	386751997
7	NC_017740	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	386751998
8	NC_017740	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	386751998
9	NC_017740	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	386751998
10	NC_017740	TTCA	2	8	5683	5690	25 %	50 %	0 %	25 %	386751999
11	NC_017740	TCTT	2	8	5977	5984	0 %	75 %	0 %	25 %	386751999
12	NC_017740	AAGC	2	8	6792	6799	50 %	0 %	25 %	25 %	386751999
13	NC_017740	GATA	2	8	7768	7775	50 %	25 %	25 %	0 %	386752001
14	NC_017740	TCAA	2	8	7875	7882	50 %	25 %	0 %	25 %	386752001
15	NC_017740	ACAA	2	8	8457	8464	75 %	0 %	0 %	25 %	386752001
16	NC_017740	GCTC	2	8	9318	9325	0 %	25 %	25 %	50 %	386752001
17	NC_017740	ATTG	2	8	9670	9677	25 %	50 %	25 %	0 %	386752002
18	NC_017740	GCAA	2	8	9861	9868	50 %	0 %	25 %	25 %	386752002
19	NC_017740	TGCT	2	8	10066	10073	0 %	50 %	25 %	25 %	386752002
20	NC_017740	GGCC	2	8	10329	10336	0 %	0 %	50 %	50 %	386752002
21	NC_017740	TGCA	2	8	10547	10554	25 %	25 %	25 %	25 %	386752003
22	NC_017740	TCTT	2	8	11347	11354	0 %	75 %	0 %	25 %	386752004
23	NC_017740	AGCG	2	8	11818	11825	25 %	0 %	50 %	25 %	386752006
24	NC_017740	GATT	2	8	11926	11933	25 %	50 %	25 %	0 %	386752006
25	NC_017740	CAAA	2	8	12095	12102	75 %	0 %	0 %	25 %	386752007
26	NC_017740	GCAC	2	8	12463	12470	25 %	0 %	25 %	50 %	386752007
27	NC_017740	ATGC	2	8	12510	12517	25 %	25 %	25 %	25 %	386752007
28	NC_017740	TTGG	2	8	12792	12799	0 %	50 %	50 %	0 %	386752007
29	NC_017740	GAGC	2	8	12815	12822	25 %	0 %	50 %	25 %	386752007
30	NC_017740	TTTA	2	8	13097	13104	25 %	75 %	0 %	0 %	386752007
31	NC_017740	TGAT	2	8	14299	14306	25 %	50 %	25 %	0 %	386752007
32	NC_017740	GCTT	2	8	15294	15301	0 %	50 %	25 %	25 %	386752008
33	NC_017740	CGAT	2	8	15528	15535	25 %	25 %	25 %	25 %	386752008
34	NC_017740	ATCT	2	8	15851	15858	25 %	50 %	0 %	25 %	386752008
35	NC_017740	GTTT	2	8	16069	16076	0 %	75 %	25 %	0 %	386752008
36	NC_017740	TTGA	2	8	16411	16418	25 %	50 %	25 %	0 %	386752009
37	NC_017740	TGCT	2	8	16787	16794	0 %	50 %	25 %	25 %	386752009
38	NC_017740	AGCG	2	8	16959	16966	25 %	0 %	50 %	25 %	386752009
39	NC_017740	GGAA	2	8	17392	17399	50 %	0 %	50 %	0 %	386752010
40	NC_017740	ACAA	2	8	17524	17531	75 %	0 %	0 %	25 %	386752010
41	NC_017740	TAAA	2	8	18465	18472	75 %	25 %	0 %	0 %	386752011
42	NC_017740	GCGA	2	8	18474	18481	25 %	0 %	50 %	25 %	386752011
43	NC_017740	AGGC	2	8	18906	18913	25 %	0 %	50 %	25 %	386752011
44	NC_017740	TGAT	2	8	19064	19071	25 %	50 %	25 %	0 %	386752012
45	NC_017740	CTTT	2	8	19331	19338	0 %	75 %	0 %	25 %	386752012
46	NC_017740	AAGT	2	8	19643	19650	50 %	25 %	25 %	0 %	386752012
47	NC_017740	GCTT	2	8	19776	19783	0 %	50 %	25 %	25 %	386752012
48	NC_017740	TTTA	2	8	20230	20237	25 %	75 %	0 %	0 %	386752012
49	NC_017740	CTTT	2	8	20408	20415	0 %	75 %	0 %	25 %	386752012
50	NC_017740	TTAG	2	8	20757	20764	25 %	50 %	25 %	0 %	386752013
51	NC_017740	CTTT	2	8	20772	20779	0 %	75 %	0 %	25 %	386752013
52	NC_017740	GTTT	2	8	21345	21352	0 %	75 %	25 %	0 %	386752014
53	NC_017740	TCCC	2	8	22491	22498	0 %	25 %	0 %	75 %	386752014
54	NC_017740	CATC	2	8	23716	23723	25 %	25 %	0 %	50 %	386752015
55	NC_017740	ATAA	2	8	24182	24189	75 %	25 %	0 %	0 %	386752015
56	NC_017740	GCTC	2	8	25707	25714	0 %	25 %	25 %	50 %	386752016
57	NC_017740	ATGG	2	8	26155	26162	25 %	25 %	50 %	0 %	386752016
58	NC_017740	ATGA	2	8	26418	26425	50 %	25 %	25 %	0 %	386752017
59	NC_017740	TTTA	2	8	26792	26799	25 %	75 %	0 %	0 %	386752017
60	NC_017740	CGTT	2	8	26860	26867	0 %	50 %	25 %	25 %	386752018
61	NC_017740	TGGT	2	8	27310	27317	0 %	50 %	50 %	0 %	386752018
62	NC_017740	AGTC	2	8	27591	27598	25 %	25 %	25 %	25 %	386752019
63	NC_017740	TTTA	2	8	28075	28082	25 %	75 %	0 %	0 %	386752020
64	NC_017740	CAGA	2	8	28111	28118	50 %	0 %	25 %	25 %	386752020
65	NC_017740	GCGA	2	8	28273	28280	25 %	0 %	50 %	25 %	386752020
66	NC_017740	ACCC	2	8	28390	28397	25 %	0 %	0 %	75 %	386752021
67	NC_017740	CATC	2	8	28516	28523	25 %	25 %	0 %	50 %	386752021
68	NC_017740	TCAA	2	8	28658	28665	50 %	25 %	0 %	25 %	386752022
69	NC_017740	CATG	2	8	29778	29785	25 %	25 %	25 %	25 %	386752022
70	NC_017740	TTGC	2	8	30282	30289	0 %	50 %	25 %	25 %	386752022
71	NC_017740	GCTT	2	8	30793	30800	0 %	50 %	25 %	25 %	386752022
72	NC_017740	GAAA	2	8	30825	30832	75 %	0 %	25 %	0 %	386752022
73	NC_017740	GAAA	2	8	30852	30859	75 %	0 %	25 %	0 %	386752022
74	NC_017740	GATC	2	8	30930	30937	25 %	25 %	25 %	25 %	386752023
75	NC_017740	ATGA	2	8	31133	31140	50 %	25 %	25 %	0 %	386752023
76	NC_017740	CTTT	2	8	32892	32899	0 %	75 %	0 %	25 %	386752026
77	NC_017740	AATA	2	8	33569	33576	75 %	25 %	0 %	0 %	386752026
78	NC_017740	TAAA	2	8	33591	33598	75 %	25 %	0 %	0 %	386752026
79	NC_017740	GAAA	2	8	33721	33728	75 %	0 %	25 %	0 %	386752027
80	NC_017740	GTGA	2	8	33818	33825	25 %	25 %	50 %	0 %	386752028
81	NC_017740	ATGA	2	8	34298	34305	50 %	25 %	25 %	0 %	386752028
82	NC_017740	AAAC	2	8	34306	34313	75 %	0 %	0 %	25 %	386752028
83	NC_017740	TTTG	2	8	34351	34358	0 %	75 %	25 %	0 %	386752028
84	NC_017740	TGAT	2	8	34841	34848	25 %	50 %	25 %	0 %	386752029
85	NC_017740	AACC	2	8	35513	35520	50 %	0 %	0 %	50 %	386752030
86	NC_017740	AAAC	2	8	35727	35734	75 %	0 %	0 %	25 %	386752030
87	NC_017740	CAAA	2	8	35803	35810	75 %	0 %	0 %	25 %	386752030
88	NC_017740	ATTG	2	8	36217	36224	25 %	50 %	25 %	0 %	386752030
89	NC_017740	ATCA	2	8	36392	36399	50 %	25 %	0 %	25 %	386752030
90	NC_017740	TCAA	2	8	36405	36412	50 %	25 %	0 %	25 %	386752030
91	NC_017740	GATT	2	8	36997	37004	25 %	50 %	25 %	0 %	386752031
92	NC_017740	TGTT	2	8	37179	37186	0 %	75 %	25 %	0 %	386752031
93	NC_017740	CTTT	2	8	37772	37779	0 %	75 %	0 %	25 %	386752031
94	NC_017740	GAGC	2	8	37798	37805	25 %	0 %	50 %	25 %	386752031
95	NC_017740	ATAA	2	8	38026	38033	75 %	25 %	0 %	0 %	386752031
96	NC_017740	GAAA	2	8	38046	38053	75 %	0 %	25 %	0 %	386752032
97	NC_017740	GATC	2	8	38175	38182	25 %	25 %	25 %	25 %	386752032
98	NC_017740	ATGA	2	8	39182	39189	50 %	25 %	25 %	0 %	386752032
99	NC_017740	CAAA	2	8	40021	40028	75 %	0 %	0 %	25 %	386752033
100	NC_017740	TGAT	2	8	40592	40599	25 %	50 %	25 %	0 %	386752034
101	NC_017740	AAAC	2	8	40605	40612	75 %	0 %	0 %	25 %	386752034
102	NC_017740	CGCT	2	8	40746	40753	0 %	25 %	25 %	50 %	386752034
103	NC_017740	GTTT	2	8	41368	41375	0 %	75 %	25 %	0 %	386752034
104	NC_017740	CAAA	2	8	41864	41871	75 %	0 %	0 %	25 %	386752035
105	NC_017740	GGGT	2	8	42320	42327	0 %	25 %	75 %	0 %	386752035
106	NC_017740	TCGC	2	8	42679	42686	0 %	25 %	25 %	50 %	386752035
107	NC_017740	AGGG	2	8	42690	42697	25 %	0 %	75 %	0 %	386752035
108	NC_017740	GCAA	2	8	43343	43350	50 %	0 %	25 %	25 %	386752035
109	NC_017740	CAAC	2	8	43475	43482	50 %	0 %	0 %	50 %	386752035
110	NC_017740	TAAA	2	8	43612	43619	75 %	25 %	0 %	0 %	386752035
111	NC_017740	AGCG	2	8	44035	44042	25 %	0 %	50 %	25 %	386752036
112	NC_017740	TTCA	2	8	44655	44662	25 %	50 %	0 %	25 %	386752036
113	NC_017740	CTTT	2	8	45001	45008	0 %	75 %	0 %	25 %	386752037
114	NC_017740	TGGT	2	8	45761	45768	0 %	50 %	50 %	0 %	386752038
115	NC_017740	AAAT	2	8	46447	46454	75 %	25 %	0 %	0 %	386752038
116	NC_017740	TCAA	2	8	48488	48495	50 %	25 %	0 %	25 %	386752039
117	NC_017740	TGTA	2	8	48883	48890	25 %	50 %	25 %	0 %	386752039
118	NC_017740	ATAG	2	8	48892	48899	50 %	25 %	25 %	0 %	386752039
119	NC_017740	GTTT	2	8	49618	49625	0 %	75 %	25 %	0 %	386752040
120	NC_017740	GATT	2	8	49692	49699	25 %	50 %	25 %	0 %	386752040
121	NC_017740	AAAT	2	8	49768	49775	75 %	25 %	0 %	0 %	386752040
122	NC_017740	GATT	2	8	49899	49906	25 %	50 %	25 %	0 %	386752040
123	NC_017740	AAAT	2	8	49975	49982	75 %	25 %	0 %	0 %	386752040
124	NC_017740	AAAT	2	8	50303	50310	75 %	25 %	0 %	0 %	386752041
125	NC_017740	AAAC	2	8	50700	50707	75 %	0 %	0 %	25 %	386752043
126	NC_017740	AGCC	2	8	50900	50907	25 %	0 %	25 %	50 %	386752043
127	NC_017740	CAAG	2	8	51379	51386	50 %	0 %	25 %	25 %	386752043
128	NC_017740	AAGA	2	8	51421	51428	75 %	0 %	25 %	0 %	386752043
129	NC_017740	TCGC	2	8	51946	51953	0 %	25 %	25 %	50 %	386752043
130	NC_017740	ATTT	2	8	52143	52150	25 %	75 %	0 %	0 %	386752044
131	NC_017740	TCGT	2	8	52478	52485	0 %	50 %	25 %	25 %	386752044
132	NC_017740	TCTG	2	8	53438	53445	0 %	50 %	25 %	25 %	386752044
133	NC_017740	CCAT	2	8	54162	54169	25 %	25 %	0 %	50 %	386752044
134	NC_017740	TTTG	2	8	54307	54314	0 %	75 %	25 %	0 %	386752044
135	NC_017740	AAAG	2	8	54428	54435	75 %	0 %	25 %	0 %	386752044
136	NC_017740	CTTT	2	8	54882	54889	0 %	75 %	0 %	25 %	386752044
137	NC_017740	AAAG	2	8	55385	55392	75 %	0 %	25 %	0 %	386752044
138	NC_017740	GCTC	2	8	55627	55634	0 %	25 %	25 %	50 %	386752044
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