MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 14416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017740	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751994
2	NC_017740	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386751994
3	NC_017740	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751994
4	NC_017740	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386751994
5	NC_017740	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386751994
6	NC_017740	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751995
7	NC_017740	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751995
8	NC_017740	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386751995
9	NC_017740	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751995
10	NC_017740	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751995
11	NC_017740	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751996
12	NC_017740	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751996
13	NC_017740	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386751996
14	NC_017740	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751996
15	NC_017740	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386751996
16	NC_017740	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386751996
17	NC_017740	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751996
18	NC_017740	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751996
19	NC_017740	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386751997
20	NC_017740	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386751997
21	NC_017740	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386751997
22	NC_017740	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386751997
23	NC_017740	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751997
24	NC_017740	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386751998
25	NC_017740	TTG	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386751998
26	NC_017740	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751998
27	NC_017740	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386751998
28	NC_017740	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386751998
29	NC_017740	CAT	2	6	5440	5445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
30	NC_017740	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751999
31	NC_017740	TCT	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
32	NC_017740	AAT	2	6	5605	5610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751999
33	NC_017740	CTT	2	6	5613	5618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
34	NC_017740	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
35	NC_017740	ATG	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751999
36	NC_017740	TCA	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
37	NC_017740	CCG	2	6	5834	5839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751999
38	NC_017740	CTT	2	6	5853	5858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
39	NC_017740	TCA	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
40	NC_017740	CAT	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
41	NC_017740	GTG	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386751999
42	NC_017740	TTC	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
43	NC_017740	TAA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751999
44	NC_017740	CCG	2	6	6188	6193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751999
45	NC_017740	CAC	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386751999
46	NC_017740	GAT	2	6	6331	6336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751999
47	NC_017740	TAG	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751999
48	NC_017740	CTT	2	6	6543	6548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
49	NC_017740	TCT	2	6	6653	6658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
50	NC_017740	TAA	2	6	6696	6701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751999
51	NC_017740	GCA	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386751999
52	NC_017740	CTT	2	6	6852	6857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
53	NC_017740	ACA	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386752000
54	NC_017740	TCT	2	6	7205	7210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386752000
55	NC_017740	CTT	2	6	7287	7292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386752000
56	NC_017740	GAT	3	9	7375	7383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386752000
57	NC_017740	TCT	2	6	7403	7408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386752000
58	NC_017740	CTA	2	6	7419	7424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386752000
59	NC_017740	TTG	2	6	7834	7839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752001
60	NC_017740	GAA	2	6	7850	7855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752001
61	NC_017740	TTA	2	6	8029	8034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752001
62	NC_017740	AGA	2	6	8044	8049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752001
63	NC_017740	ACC	2	6	8052	8057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386752001
64	NC_017740	AAG	2	6	8085	8090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752001
65	NC_017740	ATT	2	6	8118	8123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752001
66	NC_017740	CAT	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386752001
67	NC_017740	GTG	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386752001
68	NC_017740	ATG	2	6	8613	8618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386752001
69	NC_017740	AAC	2	6	8705	8710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386752001
70	NC_017740	AGA	2	6	9091	9096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752001
71	NC_017740	TTG	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752001
72	NC_017740	GAC	2	6	9191	9196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386752001
73	NC_017740	TTA	3	9	9212	9220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752001
74	NC_017740	TTG	2	6	9269	9274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752001
75	NC_017740	TGT	2	6	9455	9460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752002
76	NC_017740	TGT	2	6	9623	9628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752002
77	NC_017740	AAG	2	6	9782	9787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752002
78	NC_017740	GTT	2	6	9897	9902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752002
79	NC_017740	TGG	3	9	10193	10201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386752002
80	NC_017740	GAA	3	9	10210	10218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752002
81	NC_017740	TGG	2	6	10292	10297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386752002
82	NC_017740	AGA	2	6	10314	10319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752002
83	NC_017740	AGG	2	6	10539	10544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386752003
84	NC_017740	TTA	2	6	10626	10631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752004
85	NC_017740	GAA	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752004
86	NC_017740	GTT	2	6	10710	10715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752004
87	NC_017740	ATT	2	6	10733	10738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752004
88	NC_017740	GAA	2	6	10939	10944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752004
89	NC_017740	AAT	2	6	11015	11020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386752004
90	NC_017740	CAA	2	6	11114	11119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386752004
91	NC_017740	CTA	2	6	11172	11177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386752004
92	NC_017740	TTG	2	6	11259	11264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752004
93	NC_017740	AGA	2	6	11311	11316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752004
94	NC_017740	GTG	2	6	11736	11741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386752005
95	NC_017740	GAA	2	6	11827	11832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752006
96	NC_017740	ATT	3	9	12014	12022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752006
97	NC_017740	GAA	2	6	12153	12158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752007
98	NC_017740	AAC	2	6	12159	12164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386752007
99	NC_017740	ATG	2	6	12178	12183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386752007
100	NC_017740	TCC	2	6	12223	12228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386752007
101	NC_017740	CAA	2	6	12363	12368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386752007
102	NC_017740	AAG	2	6	12424	12429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752007
103	NC_017740	TAG	2	6	12691	12696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386752007
104	NC_017740	ATT	2	6	12748	12753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752007
105	NC_017740	CTA	2	6	12972	12977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386752007
106	NC_017740	ACC	2	6	13186	13191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386752007
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108	NC_017740	AAG	2	6	13342	13347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752007
109	NC_017740	ATG	2	6	13446	13451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386752007
110	NC_017740	CTT	2	6	13616	13621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386752007
111	NC_017740	AAG	2	6	13657	13662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752007
112	NC_017740	AGA	2	6	13667	13672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752007
113	NC_017740	TAT	2	6	13920	13925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752007
114	NC_017740	AGA	2	6	13943	13948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752007
115	NC_017740	GTG	3	9	14070	14078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386752007
116	NC_017740	TAT	2	6	14780	14785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752008
117	NC_017740	GAA	2	6	14786	14791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752008
118	NC_017740	CTT	2	6	14904	14909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386752008
119	NC_017740	AAC	2	6	14931	14936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386752008
120	NC_017740	ATT	2	6	15051	15056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752008
121	NC_017740	TAT	2	6	15152	15157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752008
122	NC_017740	ACA	2	6	15252	15257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386752008
123	NC_017740	CGG	2	6	15306	15311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386752008
124	NC_017740	GTT	2	6	15328	15333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752008
125	NC_017740	ATC	2	6	15464	15469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386752008
126	NC_017740	GGT	2	6	15658	15663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386752008
127	NC_017740	ATT	3	9	15753	15761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752008
128	NC_017740	TTG	2	6	15768	15773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752008
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130	NC_017740	TTG	2	6	16252	16257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752009
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