MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 00-7128 chromosome

Total Repeats: 865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017737	TTGTAA	2	12	867	878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386748728
2	NC_017737	CCCCTA	2	12	4645	4656	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386748733
3	NC_017737	GTTTTT	2	12	6200	6211	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386748734
4	NC_017737	TTATTT	2	12	6904	6915	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386748735
5	NC_017737	TGGAGC	2	12	7332	7343	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386748735
6	NC_017737	TTTCAG	2	12	7889	7900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748735
7	NC_017737	CAAGCG	2	12	9245	9256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386748736
8	NC_017737	AGCCTA	2	12	18561	18572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386748744
9	NC_017737	TGAAAT	2	12	19626	19637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748746
10	NC_017737	AACCCT	2	12	22092	22103	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386748749
11	NC_017737	AATCGT	2	12	23395	23406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748750
12	NC_017737	ATTTTG	2	12	26341	26352	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748752
13	NC_017737	AATTTT	2	12	28114	28125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748752
14	NC_017737	TGTTAT	2	12	32639	32650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748756
15	NC_017737	AGCCCT	2	12	40057	40068	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386748765
16	NC_017737	CAATGC	2	12	42465	42476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386748769
17	NC_017737	CATTAG	2	12	44332	44343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748770
18	NC_017737	GGGTTA	2	12	44631	44642	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386748770
19	NC_017737	GCTATT	2	12	45905	45916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748770
20	NC_017737	GAATTG	2	12	47668	47679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748771
21	NC_017737	TAGAAG	2	12	48023	48034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386748771
22	NC_017737	TTAGAA	2	12	63447	63458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748782
23	NC_017737	GTTTCA	2	12	65100	65111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748783
24	NC_017737	TGGGTG	2	12	69035	69046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386748788
25	NC_017737	TGCATT	2	12	69686	69697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748788
26	NC_017737	AGTGAT	2	12	73488	73499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748791
27	NC_017737	TAGATG	2	12	78944	78955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748798
28	NC_017737	AAAGGC	2	12	79805	79816	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386748799
29	NC_017737	TTTATA	2	12	81291	81302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748802
30	NC_017737	ACCATA	2	12	84689	84700	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386748804
31	NC_017737	CTCCAA	2	12	86895	86906	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386748807
32	NC_017737	AGATTT	2	12	88329	88340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386748808
33	NC_017737	AAAAGA	2	12	95190	95201	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748816
34	NC_017737	GTAATG	2	12	96755	96766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748818
35	NC_017737	TCTAGC	2	12	99086	99097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386748818
36	NC_017737	CTTCTA	2	12	99237	99248	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748818
37	NC_017737	TCTTTC	2	12	99665	99676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748819
38	NC_017737	ACAATC	2	12	102647	102658	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386748822
39	NC_017737	TCATTC	2	12	104016	104027	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748824
40	NC_017737	CTCTTT	2	12	105073	105084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748824
41	NC_017737	AGCTAT	2	12	105170	105181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748824
42	NC_017737	CAATGC	2	12	106204	106215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386748825
43	NC_017737	TTTATT	2	12	110631	110642	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386748829
44	NC_017737	CTATTT	2	12	118399	118410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386748835
45	NC_017737	CTCCTG	2	12	121148	121159	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386748837
46	NC_017737	TGTTTA	2	12	124257	124268	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748843
47	NC_017737	GGAATA	2	12	126599	126610	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386748846
48	NC_017737	TTATCT	2	12	128777	128788	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386748851
49	NC_017737	TGCTCT	2	12	134142	134153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386748864
50	NC_017737	CAGAAC	2	12	135229	135240	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386748866
51	NC_017737	ACAAAA	2	12	136070	136081	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386748867
52	NC_017737	CTTACT	2	12	137420	137431	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748868
53	NC_017737	AAAATA	2	12	138179	138190	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386748869
54	NC_017737	TTAGAA	2	12	151905	151916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748884
55	NC_017737	AAGCCA	2	12	155084	155095	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386748886
56	NC_017737	TAATGC	2	12	156283	156294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748886
57	NC_017737	TGCTTA	2	12	157363	157374	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748886
58	NC_017737	TACAAT	2	12	157550	157561	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386748886
59	NC_017737	TAAGCC	2	12	161358	161369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386748892
60	NC_017737	AAACCA	2	12	161371	161382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748892
61	NC_017737	CCTAAA	2	12	161464	161475	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386748892
62	NC_017737	CTTATG	2	12	163947	163958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748894
63	NC_017737	AAAATC	2	12	170634	170645	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386748901
64	NC_017737	CATCTT	2	12	173032	173043	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748903
65	NC_017737	TTCAAT	2	12	177075	177086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386748908
66	NC_017737	ATAAGA	2	12	179100	179111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386748910
67	NC_017737	AATAAA	2	12	180479	180490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386748913
68	NC_017737	TAAAAA	2	12	182316	182327	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386748915
69	NC_017737	AAAGAA	2	12	182836	182847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748915
70	NC_017737	TAAAGA	2	12	200096	200107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386748931
71	NC_017737	CAAATC	2	12	200494	200505	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386748932
72	NC_017737	AAGAAA	2	12	207911	207922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748938
73	NC_017737	TTGCAT	2	12	207953	207964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748938
74	NC_017737	GCTTAG	2	12	208336	208347	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386748939
75	NC_017737	TTAAGC	2	12	210296	210307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748940
76	NC_017737	TTTGTC	2	12	210331	210342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386748940
77	NC_017737	TAGAGA	2	12	211233	211244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386748941
78	NC_017737	GTGATT	2	12	212582	212593	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386748942
79	NC_017737	TCACTA	2	12	213233	213244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748943
80	NC_017737	CATTAG	2	12	213939	213950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748943
81	NC_017737	CAATAT	2	12	214308	214319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386748943
82	NC_017737	GTATAA	2	12	215814	215825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748944
83	NC_017737	TCTTTT	2	12	220964	220975	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386748949
84	NC_017737	TTTTTA	2	12	221016	221027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386748949
85	NC_017737	TCTTTC	2	12	221647	221658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748949
86	NC_017737	ATTTAT	2	12	224098	224109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748952
87	NC_017737	ATTTTT	2	12	227270	227281	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386748955
88	NC_017737	CTTCAT	2	12	227353	227364	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748955
89	NC_017737	GCCAGA	2	12	228669	228680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386748956
90	NC_017737	TGTGCC	2	12	233137	233148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386748959
91	NC_017737	GTATTT	2	12	234934	234945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748961
92	NC_017737	TGATTA	2	12	236743	236754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386748964
93	NC_017737	CCTATG	2	12	239038	239049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386748967
94	NC_017737	AAAATC	2	12	243555	243566	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386748970
95	NC_017737	GAAAAA	2	12	244478	244489	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748970
96	NC_017737	TTAGAA	2	12	244715	244726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748970
97	NC_017737	GACAAA	2	12	246074	246085	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386748970
98	NC_017737	AAAAAG	2	12	246761	246772	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748970
99	NC_017737	CCATGC	2	12	249940	249951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386748973
100	NC_017737	CAAATT	2	12	251463	251474	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386748974
101	NC_017737	ATTTCA	2	12	251491	251502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386748974
102	NC_017737	GTGCAA	2	12	252871	252882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386748977
103	NC_017737	AAATTG	2	12	255782	255793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748979
104	NC_017737	CAAAAG	2	12	256596	256607	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386748980
105	NC_017737	ATACTA	2	12	261131	261142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386748983
106	NC_017737	TTGAGC	2	12	261340	261351	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386748983
107	NC_017737	ATTTTG	2	12	262522	262533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748983
108	NC_017737	TCATTT	2	12	263535	263546	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386748984
109	NC_017737	TTCTAA	2	12	264029	264040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386748984
110	NC_017737	CTTTAA	2	12	264397	264408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386748984
111	NC_017737	TCAGCA	2	12	267601	267612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386748986
112	NC_017737	ATGACA	2	12	271162	271173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386748990
113	NC_017737	TGAGCG	2	12	272713	272724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386748991
114	NC_017737	TGATTT	2	12	273437	273448	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748992
115	NC_017737	GATTGC	2	12	273956	273967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386748992
116	NC_017737	TTAGAA	2	12	278127	278138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748995
117	NC_017737	GCCCTA	2	12	278292	278303	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386748995
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