MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 chromosome

Total Repeats: 14347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017733	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745527
2	NC_017733	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745527
3	NC_017733	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745527
4	NC_017733	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745527
5	NC_017733	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745528
6	NC_017733	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745528
7	NC_017733	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745528
8	NC_017733	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745528
9	NC_017733	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745529
10	NC_017733	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386745529
11	NC_017733	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745529
12	NC_017733	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745529
13	NC_017733	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386745529
14	NC_017733	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745529
15	NC_017733	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745529
16	NC_017733	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745530
17	NC_017733	TTG	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745530
18	NC_017733	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745530
19	NC_017733	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745530
20	NC_017733	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745530
21	NC_017733	TGA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745531
22	NC_017733	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386745531
23	NC_017733	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745531
24	NC_017733	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745531
25	NC_017733	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745531
26	NC_017733	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745532
27	NC_017733	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745532
28	NC_017733	CTA	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745532
29	NC_017733	CAG	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386745532
30	NC_017733	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745532
31	NC_017733	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386745532
32	NC_017733	AAT	2	6	4626	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745533
33	NC_017733	ATT	2	6	5421	5426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745534
34	NC_017733	TGG	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745534
35	NC_017733	TTG	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
36	NC_017733	TTA	2	6	5848	5853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745534
37	NC_017733	GTG	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745534
38	NC_017733	CAA	2	6	5985	5990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745534
39	NC_017733	GTT	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
40	NC_017733	AGT	2	6	6146	6151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745534
41	NC_017733	CAG	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386745534
42	NC_017733	CTT	2	6	6512	6517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745534
43	NC_017733	CGT	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745534
44	NC_017733	TAG	9	27	6539	6565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745534
45	NC_017733	TTA	2	6	6574	6579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745534
46	NC_017733	TGT	2	6	6594	6599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
47	NC_017733	TTG	2	6	6660	6665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
48	NC_017733	GTT	2	6	6729	6734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
49	NC_017733	TTG	2	6	6801	6806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
50	NC_017733	CCG	2	6	6863	6868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745534
51	NC_017733	GCT	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745534
52	NC_017733	GTT	2	6	7008	7013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
53	NC_017733	CAT	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745535
54	NC_017733	GCC	2	6	7505	7510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745535
55	NC_017733	TCT	2	6	7566	7571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
56	NC_017733	AAT	2	6	7664	7669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745535
57	NC_017733	CTT	2	6	7672	7677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
58	NC_017733	CAT	2	6	7762	7767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745535
59	NC_017733	ATG	2	6	7815	7820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745535
60	NC_017733	TCA	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745535
61	NC_017733	CCG	2	6	7893	7898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745535
62	NC_017733	CTT	2	6	7912	7917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
63	NC_017733	CCG	2	6	7921	7926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745535
64	NC_017733	CAT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745535
65	NC_017733	GTG	2	6	8148	8153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745535
66	NC_017733	TTC	2	6	8228	8233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
67	NC_017733	TGA	2	6	8236	8241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745535
68	NC_017733	CCG	2	6	8247	8252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745535
69	NC_017733	CAC	2	6	8348	8353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386745535
70	NC_017733	GAT	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745535
71	NC_017733	GGA	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386745535
72	NC_017733	CTT	2	6	8602	8607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
73	NC_017733	TCT	2	6	8712	8717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
74	NC_017733	TGA	2	6	8755	8760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745535
75	NC_017733	CTT	2	6	8833	8838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
76	NC_017733	CAG	2	6	8884	8889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386745535
77	NC_017733	CTT	2	6	8911	8916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
78	NC_017733	TCT	2	6	9268	9273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745536
79	NC_017733	CTT	2	6	9350	9355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745536
80	NC_017733	GAT	3	9	9438	9446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745536
81	NC_017733	TCT	2	6	9466	9471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745536
82	NC_017733	CTA	2	6	9482	9487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745536
83	NC_017733	TTG	2	6	9908	9913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745537
84	NC_017733	GAA	2	6	9924	9929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745537
85	NC_017733	TTA	2	6	10103	10108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745537
86	NC_017733	AGA	2	6	10118	10123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745537
87	NC_017733	ACC	2	6	10126	10131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386745537
88	NC_017733	AAG	2	6	10159	10164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745537
89	NC_017733	ATT	2	6	10192	10197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745537
90	NC_017733	CAT	2	6	10373	10378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745537
91	NC_017733	GTG	2	6	10407	10412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745537
92	NC_017733	ATG	2	6	10687	10692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745537
93	NC_017733	AGA	2	6	11165	11170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745537
94	NC_017733	TTG	2	6	11178	11183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745537
95	NC_017733	GAC	2	6	11265	11270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386745537
96	NC_017733	TTA	3	9	11286	11294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745537
97	NC_017733	TTG	2	6	11343	11348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745537
98	NC_017733	TGT	2	6	11529	11534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745538
99	NC_017733	ACG	2	6	11691	11696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386745538
100	NC_017733	TGT	2	6	11697	11702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745538
101	NC_017733	AAG	2	6	11856	11861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745538
102	NC_017733	TTG	2	6	12033	12038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745538
103	NC_017733	TGG	3	9	12267	12275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745538
104	NC_017733	GAA	3	9	12284	12292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745538
105	NC_017733	AGA	2	6	12388	12393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745538
106	NC_017733	TTA	2	6	12698	12703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745539
107	NC_017733	GAA	2	6	12715	12720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745539
108	NC_017733	GTT	2	6	12782	12787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745539
109	NC_017733	ATT	2	6	12805	12810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745539
110	NC_017733	CGC	2	6	12957	12962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745539
111	NC_017733	CAA	2	6	13053	13058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745539
112	NC_017733	ACC	2	6	13181	13186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386745539
113	NC_017733	GGT	2	6	13323	13328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745539
114	NC_017733	TTG	2	6	13331	13336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745539
115	NC_017733	AGA	3	9	13383	13391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745539
116	NC_017733	AGT	2	6	13445	13450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745539
117	NC_017733	GTG	2	6	13807	13812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745540
118	NC_017733	GAA	2	6	13898	13903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745541
119	NC_017733	ATT	2	6	14085	14090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745541
120	NC_017733	GAA	2	6	14224	14229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745542
121	NC_017733	AAC	2	6	14230	14235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745542
122	NC_017733	ATG	2	6	14249	14254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745542
123	NC_017733	TGG	2	6	14405	14410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745542
124	NC_017733	CAA	2	6	14434	14439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745542
125	NC_017733	AAG	2	6	14495	14500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745542
126	NC_017733	ATT	2	6	14819	14824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745542
127	NC_017733	GCT	2	6	15042	15047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745542
128	NC_017733	ACC	2	6	15257	15262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386745542
129	NC_017733	ATT	2	6	15380	15385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745542
130	NC_017733	AAG	2	6	15413	15418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745542
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