MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 1155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017668	TTGAAA	2	12	2324	2335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386712345
2	NC_017668	GAAGAC	2	12	8618	8629	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386712350
3	NC_017668	ACTGGA	2	12	14132	14143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712354
4	NC_017668	ATACGA	2	12	20254	20265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712359
5	NC_017668	TTACCG	2	12	27482	27493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386712368
6	NC_017668	TATTAG	2	12	30822	30833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712370
7	NC_017668	ATTGGC	2	12	31654	31665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386712371
8	NC_017668	GCAAAA	2	12	39381	39392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386712377
9	NC_017668	ATCAAA	2	12	46795	46806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386712382
10	NC_017668	CGGAAG	2	12	65826	65837	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712404
11	NC_017668	GGATCA	2	12	67818	67829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712406
12	NC_017668	GTGTAG	2	12	68410	68421	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386712407
13	NC_017668	AACAGG	2	12	68476	68487	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386712407
14	NC_017668	ATTGGA	2	12	73899	73910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712411
15	NC_017668	AAAAAC	2	12	75594	75605	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386712412
16	NC_017668	ATTTGA	2	12	77666	77677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712415
17	NC_017668	AGAAAA	2	12	79964	79975	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386712418
18	NC_017668	GTACTT	2	12	86406	86417	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386712422
19	NC_017668	GGAACG	2	12	88012	88023	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712424
20	NC_017668	TGTCGG	2	12	90501	90512	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386712426
21	NC_017668	AGAGTC	2	12	91758	91769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712426
22	NC_017668	TGAACT	2	12	95836	95847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386712431
23	NC_017668	GGAAAA	2	12	97115	97126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712433
24	NC_017668	GTGGCG	2	12	110737	110748	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386712435
25	NC_017668	GAAGGA	2	12	112796	112807	50 %	0 %	50 %	0 %	386712438
26	NC_017668	GCAGGA	2	12	114898	114909	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712438
27	NC_017668	ATTCAA	2	12	118225	118236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386712441
28	NC_017668	CCTGCG	2	12	118375	118386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386712441
29	NC_017668	TGAAAA	2	12	123616	123627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386712445
30	NC_017668	CCCAGG	2	12	124394	124405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386712446
31	NC_017668	TGAAGA	2	12	127327	127338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712452
32	NC_017668	AAAAGT	2	12	127663	127674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386712452
33	NC_017668	TGGTCT	2	12	130164	130175	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386712456
34	NC_017668	AGAAAT	2	12	134757	134768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386712458
35	NC_017668	CGAAGT	2	12	137633	137644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712459
36	NC_017668	CTGGTA	2	12	138415	138426	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386712459
37	NC_017668	TCTGGA	2	12	142311	142322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386712464
38	NC_017668	ATTCGT	2	12	143808	143819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386712465
39	NC_017668	ATCGTT	2	12	150087	150098	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386712478
40	NC_017668	ATGACA	2	12	150410	150421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712480
41	NC_017668	ATTGAA	2	12	151200	151211	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386712481
42	NC_017668	TAAAGG	2	12	151310	151321	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712481
43	NC_017668	CCGTTT	2	12	151884	151895	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386712483
44	NC_017668	AAAGAA	2	12	155860	155871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386712489
45	NC_017668	AAACAA	2	12	156368	156379	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386712491
46	NC_017668	AGAGAA	2	12	162080	162091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712499
47	NC_017668	ACAGAA	2	12	162969	162980	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386712501
48	NC_017668	AAAGAA	2	12	165808	165819	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386712504
49	NC_017668	GAAGAT	2	12	167204	167215	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712505
50	NC_017668	GGAAGA	2	12	167430	167441	50 %	0 %	50 %	0 %	386712506
51	NC_017668	GCTTCT	2	12	168685	168696	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386712507
52	NC_017668	TCATAT	2	12	169173	169184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386712508
53	NC_017668	GCCTGG	2	12	169275	169286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386712508
54	NC_017668	GATATT	2	12	177088	177099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712510
55	NC_017668	ATTTCA	2	12	178008	178019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386712511
56	NC_017668	CAAGAA	2	12	181866	181877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386712516
57	NC_017668	TGAAAG	2	12	186517	186528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712518
58	NC_017668	AGAGGA	2	12	186539	186550	50 %	0 %	50 %	0 %	386712518
59	NC_017668	GCTGTT	2	12	190860	190871	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386712521
60	NC_017668	GCAGGA	2	12	196036	196047	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712527
61	NC_017668	ATTTTC	2	12	199456	199467	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386712529
62	NC_017668	TAAGGA	2	12	200308	200319	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712530
63	NC_017668	AGGGCA	2	12	200335	200346	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712530
64	NC_017668	CCTTTC	2	12	204160	204171	0 %	50 %	0 %	50 %	386712534
65	NC_017668	ATCAAT	2	12	204240	204251	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386712534
66	NC_017668	ATGGAG	2	12	210731	210742	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386712540
67	NC_017668	ATTGAT	2	12	231787	231798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712558
68	NC_017668	AAATAA	2	12	235616	235627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386712560
69	NC_017668	CTTGCC	2	12	236097	236108	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386712560
70	NC_017668	GCGCTT	2	12	238175	238186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712562
71	NC_017668	CGTTCA	2	12	238279	238290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386712562
72	NC_017668	TTAAGT	2	12	243907	243918	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712567
73	NC_017668	TAAGCT	2	12	252608	252619	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386712572
74	NC_017668	TCACTT	2	12	254552	254563	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386712574
75	NC_017668	TCTTTA	2	12	257100	257111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386712576
76	NC_017668	GCAAAG	2	12	258955	258966	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386712578
77	NC_017668	AGAGCG	2	12	259171	259182	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712578
78	NC_017668	GTGGAA	2	12	259194	259205	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386712578
79	NC_017668	CAGCGT	2	12	260839	260850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386712579
80	NC_017668	CTTCAC	2	12	262643	262654	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386712582
81	NC_017668	GAAAAA	2	12	268617	268628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386712589
82	NC_017668	CATATT	2	12	271237	271248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386712593
83	NC_017668	AAGTTG	2	12	273995	274006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712597
84	NC_017668	CGCAAG	2	12	275918	275929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712599
85	NC_017668	CGCAAG	2	12	276740	276751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712600
86	NC_017668	AGAGGT	2	12	279511	279522	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386712604
87	NC_017668	AAGACC	2	12	283995	284006	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386712610
88	NC_017668	ATCGAA	2	12	286058	286069	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712612
89	NC_017668	TGACTT	2	12	288868	288879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386712616
90	NC_017668	TTAATA	2	12	298339	298350	50 %	50 %	0 %	0 %	386712626
91	NC_017668	CCATTT	2	12	299643	299654	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386712626
92	NC_017668	TTTGAA	2	12	299797	299808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712627
93	NC_017668	TGAAGA	2	12	307003	307014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712638
94	NC_017668	ATGAAG	2	12	307554	307565	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712638
95	NC_017668	GAAGTT	2	12	309712	309723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712641
96	NC_017668	CAGGTA	2	12	312020	312031	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712641
97	NC_017668	TGTTTT	2	12	312832	312843	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386712642
98	NC_017668	CCTTAT	2	12	313483	313494	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386712643
99	NC_017668	TTGAAT	2	12	315191	315202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712644
100	NC_017668	GCAATA	2	12	316801	316812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712646
101	NC_017668	AAAAGC	2	12	316848	316859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386712646
102	NC_017668	AAAATG	2	12	318163	318174	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386712646
103	NC_017668	TGAAGG	2	12	328780	328791	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386712654
104	NC_017668	GATCAA	2	12	335203	335214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712659
105	NC_017668	ATCTTG	2	12	336964	336975	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386712660
106	NC_017668	CGATAT	2	12	349245	349256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386712674
107	NC_017668	CCAAGT	2	12	353416	353427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386712678
108	NC_017668	GCAACA	2	12	355157	355168	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386712680
109	NC_017668	TAAATA	2	12	362246	362257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712686
110	NC_017668	TTCAGG	2	12	365780	365791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386712691
111	NC_017668	ATAGCG	2	12	375497	375508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712699
112	NC_017668	ACGGTG	2	12	377806	377817	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386712703
113	NC_017668	GTTGCG	2	12	384826	384837	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386712712
114	NC_017668	ACAGGT	2	12	389963	389974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712716
115	NC_017668	ATGGCT	2	12	395556	395567	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386712720
116	NC_017668	CATTTT	2	12	396423	396434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386712721
117	NC_017668	TTTAGA	2	12	399469	399480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712725
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447	NC_017668	GCAGAC	2	12	1580630	1580641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386713870
448	NC_017668	AACTGA	2	12	1581108	1581119	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386713870
449	NC_017668	ACGCTC	2	12	1589229	1589240	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386713877
450	NC_017668	GTGATC	2	12	1603654	1603665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386713896
451	NC_017668	CCCTTC	2	12	1604138	1604149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386713898
452	NC_017668	GGTCCT	2	12	1604297	1604308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386713898
453	NC_017668	AAATAG	2	12	1611928	1611939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386713905
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